Sample Processing Methods Impacts on Rumen Microbiome

The standardization of collection and processing methods for rumen samples is crucial to reduce the level of errors that may affect the analysis and interpretation of the data. The aim of this study was to compare two processing methods and their impacts on the microbial community composition analysis, from material that was either immediately frozen or samples that were stored as cell pellets after removing the supernatant prior to freezing. Eight rumen-fistulated Brahman steers received chloroform as an antimethanogenic compound for 21 days. Rumen fluid samples (60 mL per animal) were collected using a probe covered with two layers of cheesecloth at 3 h post feeding at day 0 prior-treatment (control period) and day 21 of treatment. One sub-set of samples were placed in dry ice and stored at −80°C (Method 1) for subsequent DNA extraction, while a second subset of samples was centrifuged, the supernatant removed and the microbial pellet and rumen contents placed in dry ice and stored at −80°C (Method 2) prior to DNA extractions. Phylogenetic based methods (Illumina Miseq) targeting the 16S rRNA gene were used to characterize the bacterial and archaeal communities from both collection methods for the control and treatment periods. The results from this study showed that the chloroform treatment was significantly different for all beta diversity measures regardless of the processing method used. Significant differences in the relative abundances of some bacteria and archaea, such as Elusimicrobia, Fibrobacteres, Lentisphaerae, Spirochaetes, and Verrucomicrobia and Methanomassiliicoccaceae, were observed at higher levels in the Method 2. These microbial populations are known to have fragile cell wall structures and are susceptible to cell lysis. Regardless of the processing method used, both identified the key microbial groups and can be used to compare the relative shifts in the rumen microbiome between treatments. However, immediately freezing samples might alter the abundance of material from species that are more readily lysed and will not be suitable for studies that aim to assign absolute abundance values to these species within the rumen

Mitigating the carbon footprint and improving productivity of ruminant livestock agriculture using a red seaweed

Ruminants are responsible for a large proportion of agricultural greenhouse gas emissions in the form of methane. This can be managed. It is a global initiative to increase productivity of the livestock sector to meet a growing population, but with emphasis on decreasing enteric methane to achieve emissions targets. We investigated the marine red macroalga (seaweed) Asparagopsis taxiformis as a feed ingredient to fundamentally eliminate enteric methane in beef cattle fed a high grain diet and provide evidence of improved livestock production performance. Asparagopsis was included in the feed of Brahman-Angus cross steers at 0.00%, 0.05%, 0.10%, and 0.20% of feed organic matter. Emissions were monitored in respiration chambers fortnightly over 90 d of treatment, steers were weighed weekly prior to feeding, feed intake monitored daily, rumen fluid samples collected in conjunction with respiration chambers for assessment of rumen function, feces were collected for bromoform residue analysis, and meat, organ, and fat were collected post slaughter for residue analysis and sensory evaluation. Steers receiving 0.10% and 0.20% Asparagopsis demonstrated decreased methane up to 40% and 98%, and demonstrated weight gain improvements of 53% and 42%, respectively. There was no negative effect on daily feed intake, feed conversion efficiencies, or rumen function, and no residues or changes in meat eating quality were detected. Commercial production of Asparagopsis could create new economies, and with low inclusion rates of this seaweed in ruminant diets the industry has the potential to revolutionize management of greenhouse gas emissions across the ruminant livestock sector with complementary benefits to the environment, and economy of the wider agriculture sector

El fútbol de salón como estrategia para mejorar la convivencia escolar de los estudiantes del grado Quinto A de la Institución Educativa Alianza del municipio de San Andrés de Sotavento, Córdoba.

La presente investigación es pertinente y necesaria porque se utilizaría el futsal como una estrategia para mejorar la convivencia de los estudiantes del grado quinto (5º) de la Institución Educativa Alianza y al mismo tiempo se estaría fortaleciendo las capacidades, destrezas y habilidades motrices como la fuerza, resistencia, velocidad, flexibilidad, coordinación, equilibrio, potencia y agilidad entre otras.This research is pertinent and necessary because futsal would be used as a strategy to improve the coexistence of students in the fifth (5th) grade of the Alianza Educational Institution and at the same time the capacities would be strengthened, motor skills and abilities such as strength, endurance, speed, flexibility, coordination, balance, power and agility among others

Stand density management diagrams of Eucalyptus Viminalis: predicting stem volume, biomass and canopy cover for different production purposes

Stand density management diagrams (SDMD) provide a guide for forest density management taking into account stands attributes such as trees´ diameter or volume. One of the most common species planted in Pampean plains of Argentina is Eucalyptus viminalis for multiple objectives: solid wood use or firewood in local markets, pulp for cellulose industry and to provide services for agriculture and cattle raising (windbreaks or cattle refuge). The objective of this study was to gather the available production information /inventory data and to develop a first SDMD for estimating standing volume, biomass and canopy cover of E. viminalis as a tool for forest managers aiming at different plantation purposes. Data to develop the SDMD were obtained from 161 plots, distributed along a climate and soil gradient. We also generated two predictive equations capable of estimating dominant height from the diameter of the trees as well as canopy cover from stand basal area. As an example of application, the SDMD was used to estimate the wood production of three alternative systems: a) an unmanaged plantation (simulating a common practice in the region), b) a mixed production system such as an agroforestry system, and c) a plantation that maximizes wood biomass or volume production.Estación Experimental Agropecuaria BarilocheFil: Gyenge, Javier. INTA. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Tandil. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Técnicas; ArgentinaFil: Lupi, Ana Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto De Investigación Suelos; ArgentinaFil: Ferrere, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Agencia de Extensión Rural 9 de Julio; ArgentinaFil: Milione, Germán Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Técnicas. Instituto de Hidrología de Llanuras Dr. Eduardo Jorge Usunoff (IHLLA); ArgentinaFil: Martinez Meier, Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experiemental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Caballe, Gonzalo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experiemental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Dominguez Daguer, Diego. Ministerio de Agroindustria de la Nación. Subsecretaría de Desarrollo Foresto Industrial; ArgentinaFil: Fernandez, María Elena. INTA. Estación Experiemental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Tandil. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

An Antimethanogenic Nutritional Intervention in Early Life of Ruminants Modifies Ruminal Colonization by Archaea

The aim of this work was to study whether feeding a methanogen inhibitor from birth of goat kids and their does has an impact on the archaeal population colonizing the rumen and to what extent the impact persists later in life. Sixteen goats giving birth to two kids were used. Eight does were treated (D+) with bromochloromethane after giving birth and over 2 months. The other 8 goats were not treated (D−). One kid per doe in both groups was treated with bromochloromethane (k+) for 3 months while the other was untreated (k−), resulting in four experimental groups: D+/k+, D+/k−, D−/k+, and D−/k−. Rumen samples were collected from kids at weaning and 1 and 4 months after (3 and 6 months after birth) and from does at the end of the treating period (2 months). Pyrosequencing analyses showed a modified archaeal community composition colonizing the rumen of kids, although such effect did not persist entirely 4 months after; however, some less abundant groups remained different in treated and control animals. The different response on the archaeal community composition observed between offspring and adult goats suggests that the competition occurring in the developing rumen to occupy different niches offer potential for intervention

Methanogen Diversity in Indigenous and Introduced Ruminant Species on the Tibetan Plateau

Host factors are regarded as important in shaping the archaeal community in the rumen but few controlled studies have been performed to demonstrate this across host species under the same environmental conditions. A study was designed to investigate the structure of the methanogen community in the rumen of two indigenous (yak and Tibetan sheep) and two introduced domestic ruminant (cattle and crossbred sheep) species raised and fed under similar conditions on the high altitude Tibetan Plateau. The methylotrophic Methanomassiliicoccaceae was the predominant archaeal group in all animals even though Methanobrevibacter are usually present in greater abundance in ruminants globally. Furthermore, within the Methanomassiliicoccaceae family members from Mmc. group 10 and Mmc. group 4 were dominant in Tibetan Plateau ruminants compared to Mmc. group 12 found to be highest in other ruminants studied. Small ruminants presented the highest number of sequences that belonged to Methanomassiliicoccaceae compared to the larger ruminants. Although the methanogen community structure was different among the ruminant species, there were striking similarities between the animals in this environment. This indicates that factors such as the extreme environmental conditions and diet on the Tibetan Plateau might have a greater impact on rumen methanogen community compared to host differences

¿Qué calidad de madera produciremos en el futuro?, un análisis sobre los desafíos de integrar valor adaptativo y tecnológico ante un clima cambiante

La madera cumple funciones de transporte y almacenamiento de agua, nutrientes y carbohidratos, fundamentales para la sobrevivencia de las especies leñosas frente a variaciones del ambiente. La densidad de la madera, una propiedad emergente de las características anatómicas (proporción de lúmenes y paredes celulares), se relaciona con la capacidad de conducción de agua en el xilema, siendo una variable clave en la arquitectura hidráulica de la planta. Sirve de soporte mecánico y es materia prima para la industria, con lo cual se constituye en una variable de gran valor tecnológico, cobrando relevancia para los procesos de producción, creación, diseño e implementación de productos para el agregado de valor en origen. Se suele afirmar que la densidad permite identificar la calidad de una madera en relación a su uso final: estimar su dureza, porosidad, comportamiento frente a esfuerzos mecánicos, cambios dimensionales, calidad de acabados y rendimiento de distintos procesos industriales, entre otros.Estación Experimental Agropecuaria BarilocheFil: Martinez Meier, Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Sergent, Anne Sophie Marie. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Dalla Salda, Guillermina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Caballe, Gonzalo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experiemental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Rozenberg, Philippe. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA); FranciaFil: Fernandez, María Elena. INTA. Estación Experiemental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Tandil. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

¿Qué calidad de madera produciremos en el futuro?: Los desafíos de integrar el valor adaptativo y tecnológico de la madera en un clima cambiantes

La madera cumple funciones de transporte y almacenamiento de agua, nutrientes y carbohidratos, fundamentales para la sobrevivencia de las especies leñosas frente a variaciones del ambiente. La densidad de la madera, una propiedad emergente de las características anatómicas (proporción de lúmenes y paredes celulares), se relaciona con la capacidad de conducción de agua en el xilema, siendo una variable clave en la arquitectura hidráulica de la planta. Sirve de soporte mecánico y es materia prima para la industria, con lo cual se constituye en una variable de gran valor tecnológico, cobrando relevancia para los procesos de producción, creación, diseño e implementación de productos para el agregado de valor en origen. Se suele afirmar que la densidad permite identificar la calidad de una madera en relación a su uso final: estimar su dureza, porosidad, comportamiento frente a esfuerzos mecánicos, cambios dimensionales, calidad de acabados y rendimiento de distintos procesos industriales, entre otros.Fil: Martinez Meier, Alejandro Gabriel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Sergent, Anne Sophie. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Dalla Salda, Guillermina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Caballe, Gonzalo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Patagonia Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Carlos de Bariloche. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones Forestales y Agropecuarias Bariloche; ArgentinaFil: Rozenberg, Philippe. Institut National de la Recherche Agronomique; FranciaFil: Fernandez, Maria Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentin

Nuevas herramientas para desarrollar propuestas de manejo de plantaciones de eucaliptos en la provincia de Buenos Aires

Este diagrama de manejo surge a partir de la información recabada por varios grupos de investigación, de datos publicados en revistas científicas e inclu- so, de material inédito. La información necesaria para construir este diagrama fue el número de individuos por hectárea (densidad del rodal1) y su tamaño (diá- metro estándar a la altura de 1,30 m o altura al pecho). A esto se le sumó la capacidad de estimar el volumen y la bio- masa, así como también, la cobertura aérea generada por el dosel arbóreo. Con esta información se construyó el diagrama de densidad cuyo principal objetivo fue el de poder estimar la cantidad de madera en pie o cosechada en cada momento (pudiendo valorarse el producto econó- micamente), así como también, el grado de cobertura arbórea para poder diagra- mar manejos de sistemas mixtos de pro- ducción como los silvopastoriles.EEA BalcarceFil: Gyenge, Javier. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Tandil; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Técnicas; ArgentinaFil: Lupi, Ana Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto De Investigación Suelos; ArgentinaFil: Ferrere, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Agencia de Extensión Rural 9 de Julio; ArgentinaFil: Milione, Germán Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Técnicas. Instituto de Hidrología de Llanuras Dr. Eduardo Jorge Usunoff (IHLLA); ArgentinaFil: Martinez Meier, Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Caballé, Gonzalo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Grupo de Ecología Forestal; ArgentinaFil: Domínguez Daguer, Diego. Ministerio de Agroindustria de la Nación. Subsecretaría de Desarrollo Foresto Industrial; ArgentinaFil: Fernandez, María Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Tandil; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

CSA06 Computing, Software and Analysis challenge at the Spanish Tier-1 and Tier-2 sites

This note describes the participation of the Spanish centres PIC, CIEMAT and IFCA as Tier-1 and Tier-2 sites in the CMS CSA06 Computing, Software and Analysis challenge. A number of the facilities, services and workflows have been demonstrated at the 2008 25% scale. Very valuable experience has been gained running the complex computing system under realistic conditions at a significant scale. The focus of this note is on presenting achieved results, operational experience and lessons learnt during the challenge