Análisis de la expresión génica de cinco enzimas involucradas en el pardeamiento del fruto tras el corte en manzano

Esta investigación es parte del proyecto de I+D+i PID2019-108081, financiado por MCIN/ AEI /10.13039/501100011033 y el grupo consolidado de investigación A12 del Gobierno de AragónPublishe

Identificación de la presencia de oídio (Erysiphe necator) en racimos de uva mediante imágenes hiperespectrales

El oídio (Erysiphe necator) está considerado mundialmente como una de las enfermedades fúngicas más importantes en la vid, causante de daños significativos sobre el cultivo. Estos incluyen la pérdida de rendimiento y la depreciación de la calidad del vino o de la uva.La susceptibilidad de las cepas al oídio depende de la variedad y de las condiciones ambientales en las que se desarrolle el cultivo, pudiendo afectar a cualquier órgano verde de la planta (brotes, hojas y racimos). La infección inicial, en focos aislados y apenas perceptibles visualmente, dificulta la detección de la enfermedad en fases tempranas. Así pues, suelen ser los agricultores los encargados de detectar los síntomas más evidentes de la enfermedad, que no aparecen hasta etapas intermedias o tardías de la misma. Por tanto, el poder disponer de técnicas que permitan detectar la enfermedad de manera fiable antes de que se manifiesten los síntomas visibles supone un importante avance.En los últimos años, las tecnologías de sensores ópticos han demostrado ser una efectiva herramienta de análisis para la evaluación de la calidad e inocuidad en productos agroalimentarios. Por ello, el objetivo de este trabajo es evaluar la utilidad de la tecnología de imágenes hiperespectrales (HSI) para detectar la presencia de oídio en racimos de uva.Para ello, se recogieron 30 racimos de uva de la variedad Mazuelo procedentes de un viñedo de Azagra (Navarra): 15 racimos afectados por oídio y otros 15 libres de esta enfermedad. Los racimos se escanearon en laboratorio con una cámara hiperespectral (Xeva 1.7-320-100Hz, Xenics) de resolución 320x256 píxeles, acoplada a un espectrógrafo (ImSpector N17E, Specim) sensible en el rango NIR de 900-1700 nm. Las imágenes adquiridas fueron normalizadas y segmentadas, obteniendo así información espectral y espacial de cada muestra. Esta información se utilizó para desarrollar modelos discriminantes por mínimos cuadrados parciales (PLS-DA), aplicando diferentes pretratamientos espectrales, para conseguir diferenciar pixeles sanos de pixeles con oídio en los racimos. Los mejores resultados se obtuvieron aplicando la combinación de pretratamientos Suavizado, Variable Normalizada Estándar (SNV) y Centrado Medio (MC), con un porcentaje de acierto del 85,3% en la validación cruzada del modelo y una correcta clasificación e identificación de pixeles en la validación. Los resultados preliminares obtenidos sugieren la posibilidad de utilizar la tecnología HSI para la detección de oídio en racimos de uva

Genetic diversity of the Spanish apple genetic resources using SSRs

The Spanish Program of Plant Genetic Resources integrates, among others, the collections located at Public University of Navarre, Centro de Investigaciones Agrarias de Mabegondo, Cabildos (Tenerife, La Palma and Gran Canaria), University of Lleida, Estación Experimental de Aula Dei-CSIC and CITA of Aragon. Those collections include mainly local cultivars from their respective regions, covering most of the Spanish apple-growing areas. Though some previous studies about the genetic variability of apple genetics resources from Spain were already performed, a complete analysis is needed in order to evaluate the complete diversity of Malus spp. in Spain. For doing that, the Spanish Government funded the project ¿Harmonization of the methodology of characterization, assessment of genetic diversity and definition of the core collection of the apple germplasm conserved in Spanish genebanks¿. In total, we have evaluated 1206 accessions using standardized methodologies, with SSR markers and morphological descriptors. SSR fingerprinting was performed with 13 SSR markers. SSR profiles were obtained independently and allele sizes were compared using a common set of cultivars selected as references. Results showed 601 genotypes for 1206 accessions. Most of the genotypes (438) were identified only in one accession. The other 163 genotypes were repeated in two to 81 accessions (involving 767 accessions in total). The harmonization of morphological descriptors will allow us to determine if the accessions with the same genotype are synonymies or closely related individuals. Results of this study highlight the interest of coordinated actions in order to optimize the management of germplasm collections and to evaluate the complete genetic diversity of Malus spp. in Spain.Peer Reviewe

Nature-based strategies to regenerate the functioning and biodiversity of vineyards

16 páginas.- 2 figuras.- 1 Box.- 138 referenciasGrapevine is one of the most important perennial fruit crops worldwide. Historically, vineyards were compatible with soil conservation practices and multitrophic biodiversity, but vineyards are now generally eroded and biologically impoverished, making them more susceptible to pests and diseases. However, the idiosyncrasy of the wine sector places wine growers in a unique position to lead the adoption of a range of sustainable management strategies and, thus, to pioneer a wider transformation of the agricultural sector. In this article, we provide an overview of nature-based management strategies that may be used for the regeneration of the functioning and biodiversity of vineyards and that may also lead to improved plant nutrition, grape berry quality and the suppression of pathogens and pests. These strategies include the use of microbial and nonmicrobial biostimulants, fertilization with organic amendments as well as foliar fertilization with nature-based products, the use of cover crops and the reintegration of livestock in vineyards, especially sheep. We will also pay special attention to the implementation of circular economy in the vineyard in relation to the previously mentioned management strategies and will also discuss the importance of considering all these aspects from a holistic and integrative perspective, rather than taking them into account as single factors. Assuming the integral role of soils in the functioning of agroecosystems, soils will be considered transversally across all sections. Finally, we will argue that the time is now ripe for innovation from the public and private sectors to contribute to the sustainable management of vineyards while maintaining, or even improving, the profit margin for farmers and winemakers.This review article is, in part, the result of a workshop (I Jornadas ‘Suelos Vivos’ para la regeneración de la vida en suelos de viñedos gaditanos; https://suelosvivos.es/i-jornadas-suelos-vivos/) carried out within the context of the ‘Suelos Vivos’ Regional Operational Group of the EIP-Agri, which was celebrated between 23 and 24 March 2023 in Puerto Real, Cádiz. Raúl Ochoa-Hueso was supported by the Ramón y Cajal programme from the MICINN (RYC-2017 22032), by the Spanish Ministry of Science and Innovation for the I + D + i project PID2019-106004RA-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033, by the Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) y la Consejería de Transformación Económica, Industria, Conocimiento y Universidades of the Junta de Andalucía (FEDER Andalucía 2014-2020 Objetivo temático ‘01 - Refuerzo de la investigación, el desarrollo tecnológico y la innovación’): P20_00323 (FUTUREVINES), and by the Fondo Europeo Agrícola de Desarrollo Rural (FEADER) through the ‘Ayudas a Grupos operativos de la Asociación Europea de Innovación (AEI) en materia de productividad y sostenibilidad agrícolas’, Referencia: GOPC-CA-20-0001. Manuel Delgado-Baquerizo acknowledges support from TED2021-130908B-C41/AEI/10.13039/501100011033/Unión Europea NextGenerationEU/PRTR and from the Spanish Ministry of Science and Innovation for the I + D + i project PID2020-115813RA-I00 funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033. Cristina Lazcano acknowledges support from the California Department of Food and Agriculture (21-0433-021-SF) and the Foundation for Food and Agriculture Research (FFAR, CA21-SS-0000000193). Lilia Serrano-Grijalva thanks the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme who funded her work under the Marie Skłodowska-Curie Grant Agreement No. 890874Peer reviewe

Genetic diversity of the Spanish apple genetic resources using SSRs: abstract

PublishedPoster number 6

Definición del núcleo optimizado de la colección de conservación del manzano español

5 Pags.- 1 Tabl.Este trabajo tiene como objetivo determinar la estrategia más adecuada para la selección del conjunto mínimo de accesiones (núcleo optimizado) que represente eficientemente la variación genética del manzano conservado en las colecciones españolas. Este núcleo optimizado mediante criterios genéticos constituirá la base de la colección nuclear de conservación, que podrá ser complementado con accesiones seleccionadas por otros criterios (morfo-fisiológicos, agronómicos, valor histórico, etc.). Se ha evaluado la eficiencia de estrategias de selección por búsqueda local estocástica avanzada (ASLS) que diferían tanto por el tamaño final del núcleo como por la combinación (y peso relativo) de las medidas de distancia genética y riqueza alélica a optimizar. Las estrategias empleadas han proporcionado núcleos optimizados con grandes diferencias en la diversidad conservada, así como en el nivel de representación de la estructura genética general. Teniendo en cuenta el uso principal de la colección nuclear, la estrategia que ofrece un mejor equilibrio entre representatividad y adecuación al uso es la que combina la optimización de la distancia media entre cada accesión de la colección y la entrada en el núcleo más cercana con el índice de Shannon y la recuperación de alelos.Este trabajo ha sido financiado por los proyectos INIA RF2011-00017-C05-00 y RTA2015-00052-C02-00Peer reviewe

Development of a standardized methodology for phenotypical characterizations in apple

4 Pags.- 2 Tabls. Articles derived from XIV EUCARPIA Symposium on Fruit Breeding and Genetics (Bologna,Italy. June 14-18 2015) . The definitive version is available at: http://www.actahort.org/index.htmThe description of phenotypic traits in apple cultivars is generally performed using internationally agreed descriptors such as UPOV guidelines, which defines for each trait several states of expression. However, it is not always possible to classify a cultivar unambiguously using those guidelines, because in practice the states are not clearly enough defined or the example cultivars are not always available in the collections. This work presents the results of a harmonization project performed by the teams responsible of the main apple germplasm collections in Spain. The objective was to develop a standardized method for the 57 traits included in the TG/14/9 UPOV guidelines for apple characterization, defining their states of expression in a clear and unambiguous way for Spanish germplasm. Phenotypic data collected for more than 1,600 accessions from Spanish collections were used and the method to define each state depended on the type of expression. For quantitative traits the number of states and their limits were defined according to the variability that exists within and between accessions. For qualitative traits, high-resolution images clearly depicting each state were selected. A standardized characterization protocol for the 57 traits of apple germplasm has been provided, enabling to comparing properly the phenotypes of Spanish genetic resources.This Project has been funded by the Spanish Ministry of Science and Innovation/National Institute for Agricultural and Food Research and Technology (RF2011- 00017-C05-00).Peer reviewe

Development of a standardized methodology for phenotypical characterizations in apple

1 pag.This work presents the results of a harmonization project performed by the teams responsible of the main apple germplasm collections in Spain. The objective was to develop a standardized method for the 57 traits included in the TG/14/9 UPOV guidelines for apple characterization, defining their states of expression in a clear and unambiguous way for Spanish germplasm.Peer reviewe