Identificação de duplicatas em acessos de mandioca coletados na Região Norte do Brasil por meio de marcadores microssatélites

Duplicates are common in germplasm banks and their identification is needed to facilitate germplasm bank management and to reduce maintenance costs. The aim of this work was to identify duplicates of cassava from a germplasm bank in Eastern Amazon, which had been previously characterized both morphological and agronomically. In order to be genotyped with 15 microsatellite loci, 36 accessions were selected. These accessions were classified into 13 groups of similar morpho-agronomical characteristics. All loci were polymorphic, and 75 alleles were identified, with an average of five alleles per loci and HE = 0.66. There were determined 34 pairs of genotypes with identical multiloci profiles and the probability of genetic identity was 1.1x10-12 with probability of exclusion of 99.9999%. Among these duplicates, there are accessions sampled on different years and places, but with different names and accessions with the same name sampled in different places and years. The study identified genotypes that are grown in different places and that have been maintained over the years by local farmers.FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e PesquisasCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoEMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaDuplicatas costumam ocorrer em bancos de germoplasma e a sua identificação é necessária para facilitar o manejo dos bancos ativos de germoplasma (BAGs) e diminuir custos de manutenção. O objetivo deste trabalho foi identificar duplicatas de mandioca determinadas previamente pela caracterização morfo-agronômica, em um BAG da Amazônia Oriental. Foram selecionados 36 acessos que se agrupavam em 13 grupos de similaridade morfo-agronômica para serem genotipados com 15 locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, sendo obtidos 75 alelos, com média de cinco alelos por loco e HE = 0,66. Foram encontrados 34 pares de genótipos que apresentaram perfis multilocos idênticos e a probabilidade de identidade genética foi de 1,1x10-12 com probabilidade de exclusão de 99,9999%. Entre essas duplicatas, estão materiais coletados em épocas e locais diferentes, e com diferentes denominações e acessos com o mesmo nome coletados em diferentes locais e anos. O estudo identificou genótipos que vem sendo cultivados em diferentes locais e que vêm sendo mantidos pelos agricultores ao longo dos anos.SILVA, D. T. Universidade Federal do Par

Identification of duplicates of cassava accessions sampled on the North Region of Brazil using microsatellite markers

Duplicatas costumam ocorrer em bancos de germoplasma e a sua identificação é necessária para facilitar o manejo dos bancos ativos de germoplasma (BAGs) e diminuir custos de manutenção. O objetivo deste trabalho foi identificar duplicatas de mandioca determinadas previamente pela caracterização morfo-agronômica, em um BAG da Amazônia Oriental. Foram selecionados 36 acessos que se agrupavam em 13 grupos de similaridade morfo-agronômica para serem genotipados com 15 locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, sendo obtidos 75 alelos, com média de cinco alelos por loco e HE = 0,66. Foram encontrados 34 pares de genótipos que apresentaram perfis multilocos idênticos e a probabilidade de identidade genética foi de 1,1x10-12 com probabilidade de exclusão de 99,9999%. Entre essas duplicatas, estão materiais coletados em épocas e locais diferentes, e com diferentes denominações e acessos com o mesmo nome coletados em diferentes locais e anos. O estudo identificou genótipos que vem sendo cultivados em diferentes locais e que vêm sendo mantidos pelos agricultores ao longo dos anos.201

Caracterização molecular de cassavas 'doces' ( Manihot esculenta ) de um banco de germoplasma na Amazônia Oriental Brasileira

Genetic variability of a set of 81 accessions of 'sweet' cassavas (Manihot esculenta) collected mostly in the North region of Brazil was investigated with nine microsatellite loci. All loci were polymorphic, with mean of 6.33 alleles per locus. Analyses indicated that 35 multiloci profiles were represented by a single accession, and 46 showed non-unique profiles, represented by eleven genotypes. Forty-six different multiloci profiles were detected. Most of the putative duplicated accessions were collected in different locations. After the removal of putative duplicated genotypes, genetic parameters were estimated and expected heterozygosity was high (HE=0.73), indicating genetic variability. Structure analysis of this set of 'sweet' cassavas divided the 46 genotypes into two clusters (K=2), and a few genotypes had mixed ancestry. Results indicated the habit of exchange of materials among farmers of the North region of Brazil, and the genetic variability to be exploited in genetic breeding efforts.FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e PesquisasCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoEMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaA variabilidade genética de um conjunto de 81 acessos de mandioca 'doce' (Manihot esculenta) coletados principalmente na região Norte do Brasil foi investigada com nove locos microssatélites. Todos os locos foram polimórficos, com média de 6,33 alelos por loco. Análises indicaram que 35 perfis multiloci foram representados por um único acesso, e 46 apresentaram perfis não exclusivos, representados por onze genótipos. Quarenta e seis perfis multiloci diferentes foram detectados. A maioria dos supostos acessos duplicados foram coletados em diferentes locais. Após a remoção dos genótipos duplicados putativos, os parâmetros genéticos foram estimados e a heterozigosidade esperada foi alta (EH = 0,73), indicando variabilidade genética. A análise estrutural deste conjunto de mandiocas "doces" dividiu os 46 genótipos em dois grupos (K = 2), e alguns genótipos tinham ancestralidade mista. Os resultados indicaram o hábito de troca de materiais entre os agricultores da região Norte do Brasil e a variabilidade genética a ser explorada nos esforços de melhoramento genético.RAMALHO, G. F. R; LÍGIA, C. G. P. Universidade Federal do Par