First report of raspberry bushy dwarf virus infecting raspberry in Argentina

In 2014-2015, raspberry (Rubus idaeus) cv. Autum bliss plants with dwarfism and foliar chlorosis were observed in commercial fields in parallel 42° in the Patagonia region of Argentina. Symptoms were similar to those observed in raspberry infected by Raspberry bushy dwarf virus (RBDV) in the USA (Ellis et al., 2005; Martin et al., 2013). A survey was conducted to determine if RBDV was also present in Argentinian raspberry fields. Transmission electron microscope observations of leaf dip preparations revealed the presence of spherical particles of 30 nm, resembling those of virus members of the genus Ideaovirus. RBDV was detected in 88 of the 130 plants (68%) tested using double-antibody sandwich ELISA with a specific polyclonal antiserum (Bioreba AG, Switzerland). RNA was extracted with Spectrum™ Plant Total RNA Kit (Sigma-Aldrich, USA) and tested by RT-PCR using a pair of specific primers to the capsid protein gene (Wang et al., 2008). Expected fragments of 825 bp were obtained and custom-sequenced in both directions (Macrogen, Korea). Nucleotide BLAST analysis of the complete sequence obtained (GenBank accession No. KY308191) showed 97% identity at the nucleotide level with virus isolates from Slovenia, Belarus, Switzerland and Japan (EU796088, FR687356, FR687358, AB948216, respectively). To our knowledge, this is the first report of RBDV infecting raspberry in Argentina. Further research is needed to determine the distribution of this virus in the country and its effects on raspberry plant production.Instituto de Patología VegetalFil: Dal Zotto, Angelica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Cardozo, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia De Extensión Rural El Bolsón; ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Cobelo, Claudia Mónica. nstituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Agencia De Extensión Rural El Bolsón; Argentin

Caracterización de Xylella fastidiosa a partir de materiales vegetales y cepas aisladas de olivo (Olea europaea L.) e implementación de un sistema de diagnóstico serológico en Argentina

Xylella fastidiosa está considerada plaga cuarentenaria de importancia global por el grave impacto económico y social que ocasiona en cultivos de importancia agrícola. El objetivo de este trabajo fue aislar y caracterizar cepas bacterianas y muestras vegetales infectadas con X. fastidiosa de plantas de olivo (Olea europaea L.) e implementar un sistema de diagnóstico serológico para su detección. Para la caracterización molecular se utilizó el sistema de tipificación multilocus de secuencias (MLST). Se logró el aislamiento de la bacteria desde olivo y se determinó que todos los materiales caracterizados corresponden a X. fastidiosa subespecie pauca ST69, un grupo genético solo presente en Argentina. Se elaboraron reactivos serológicos fundamentales para la puesta a punto de técnicas de diagnóstico. Con la técnica DAS ELISA se logró un sistema de diagnóstico rápido, robusto y económico, permitiendo resolver la ausencia de disponibilidad continua de reactivos serológicos específicos para X. fastidiosa.Xylella fastidiosa is considered a quarantine pest of global significance due to the severe economic and social damage it causes on most valuable crops. The objective of this work was to isolate and characterize bacterial strains of infected with X. fastidiosa of olive (Olea europaea L.) samples and implement a serological diagnostic system for their detection. For the molecular characterization, the multilocus sequence typing system (MLST) was used. The isolation of the bacterium from the olive tree was achieved and it was determined that all materials characterized correspond to X. fastidiosa subsp. pauca ST69, a genetic subgroup that has been detected only in Argentina. An antiserum was produced and serological diagnosis systems were adjusted. A solid, fast and economical diagnostic method DAS ELISA system was achieved, solving the continuous lack of availability of serological reagents for X. fastidiosa.Fil: Tolocka, Patricia Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabián José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Guzmán, F. A.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Mattio, Maria Fernanda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Nome, C. F.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Ortega, Leandro Ismael. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Paccioretti, M. A.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Roca, Monica Esther María. Ministerio de Agricultura, Ganadería, Pesca y Alimento. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria; Argentina. Universidad Nacional de La Rioja; ArgentinaFil: Otero, M. L.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Haelterman, Raquel Mercedes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentin

Fatality rate and predictors of mortality in an Italian cohort of hospitalized COVID-19 patients

Clinical features and natural history of coronavirus disease 2019 (COVID-19) differ widely among different countries and during different phases of the pandemia. Here, we aimed to evaluate the case fatality rate (CFR) and to identify predictors of mortality in a cohort of COVID-19 patients admitted to three hospitals of Northern Italy between March 1 and April 28, 2020. All these patients had a confirmed diagnosis of SARS-CoV-2 infection by molecular methods. During the study period 504/1697 patients died; thus, overall CFR was 29.7%. We looked for predictors of mortality in a subgroup of 486 patients (239 males, 59%; median age 71 years) for whom sufficient clinical data were available at data cut-off. Among the demographic and clinical variables considered, age, a diagnosis of cancer, obesity and current smoking independently predicted mortality. When laboratory data were added to the model in a further subgroup of patients, age, the diagnosis of cancer, and the baseline PaO2/FiO2 ratio were identified as independent predictors of mortality. In conclusion, the CFR of hospitalized patients in Northern Italy during the ascending phase of the COVID-19 pandemic approached 30%. The identification of mortality predictors might contribute to better stratification of individual patient risk

Prospección fitosanitaria en sistemas productivos hortícolas del cinturón verde de Córdoba (CVC).

La producción hortícola de la zona periurbana de la Ciudad de Córdoba (Cinturón Verde de Córdoba-CVC) se encuentra en franco retroceso. Unas de sus principales limitantes son las enfermedades y plagas, cuyo manejo adecuado y eficiente depende de la correcta identificación del organismo causal. En un trabajo interdisciplinario e interinstitucional, se realizó un relevamiento fitopatológico en fincas de productores fruti-hortícolas del CVC con diferentes planteos productivos. Como resultado, se identificaron los agentes causales de las enfermedades fúngicas y virales más frecuentes, como así también la entomofauna vinculada a la producción hortícola en el CVC. La información sistematizada será puesta a disposición de los productores a través de cartillas con fotos e información biológica y técnica, que constituya una herramienta útil para la identificación y manejo adecuado de los diferentes agentes biológicos.Instituto de Patología VegetalFil: Pastor, Silvina Estela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Arguello Caro, Evangelina Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Di Feo, Liliana Del Valle. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perez Grosso, Tomas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Pérez, A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Prado, A. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Narmona, L. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Scifo, A. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Serra, G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Fichetti, P. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Barbero, G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Alemandri, Vanina Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Rodriguez Pardina, Patricia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Zanini, Andrea Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zanini, Andrea Alejandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Dal Zotto, Angelica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Benitez, Roger Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi. Agencia De Extensión Rural Córdoba; Argentin

Analysis of 12X-chromosomal short tandem repeats in North-West italian population by means of two multiplex PCRs

Twelve X-chromosomal short tandem repeat (STR) markers were typed by means of two multiplex PCR systems. Multiplex I included DXS6789, HumARA, GATA172D05, DXS101, DXS8378, and DXS8377; multiplex II comprised DXS7132, DXS6800, DXS6803, DXS7424, HPRTB, and DXS10011. Allelic frequencies for these loci were determined in a North-West Italian population sample (n = 140; 70 females and 70 males)

Acetabular de-escalation in hip revision

Background: The idea of ‘‘de-escalation’’ (DE) indicates an arthroplasty revision performed by changing a revision component by a primary component. Aim of this study is to verify if this technique can represent an option in case of cage or ring failure. Methods: We observed five cases of revision hip cage loosening with complete allograft consolidation. This group of patients were revised with use of a primary cup and were specifically followed in ours institutions offices. Patients were clinically and radiologically followed every 6 months for the next two years and then annually Results: At final follow-up (15-2 years, mean 6 years) four patients (80%) showed a good recovery of their levels of activity. The mean Harris hip score improved from 20 points (range,7-38 points) preoperatively to 48 points (range, 16-88 points). At final radiological follow-up acetabular components were radiographically stable at the last follow-up. One patient (20%) at two years follow-up, was unable to walk without crutchies due to hip pain. X-rays showed cup loosening in all three zones. Patient was dissatisfied. Primary cup was revised with a Burch Schneider cage. Conclusions: De-escalation technique is a surgical option to consider in case of young patients, limited number of previous revisions and more than three years survivorship of loosened acetabular cage. (www.actabiomedica.it)

Orthotospovirus disease epidemic: molecular characterization and incidence in peanut crops

Argentina is one of the main peanut (Arachis hypogaea L.) exporting countries with the major peanut-growing area located in the province of Córdoba. During the 2015–2016 growing season, severe outbreaks of an orthotospovirus-like disease occurred in a number of commercial peanut fields. The aim of this work was to determine the prevalence of orthotospoviruses and their incidence in peanut. In DAS-ELISA, all samples collected from symptomatic plants reacted with antisera to groundnut ringspot virus/tomato chlorotic spot virus (GRSV/TCSV) and tomato spotted wilt virus (TSWV). RT-PCR was performed with a single pair of primers for conserved regions of the GRSV, TCSV and TSWV nucleoprotein (N) genes, and digestion with restriction enzymes, allowed the identification of the pathogen asGRSV. The results were confirmed by sequencing of the N gene. Diseased peanut plants were observed in 30 out of 81 surveyed fields located in the north-central region of the peanut-growing area. In that region, the disease incidence was evaluated in four commercial fields, recorded values from 3% to 47.25% with a mean disease incidence of 18.69%. Our study reported for the first time a significant outbreak of GRSV in peanut in Argentina and provide information on the occurrence and distribution of some Orthotospovirus species.Instituto de Patología VegetalFil: De Breuil, Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Dottori, Carolina Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Bejerman, Nicolas Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal (IPAVE); Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentin

Orthotospovirus disease epidemic: molecular characterization and incidence in peanut crops

Argentina is one of the main peanut (Arachis hypogaea L.) exporting countries with the major peanut-growing area located in the province of Córdoba. During the 2015–2016 growing season, severe outbreaks of an orthotospovirus-like disease occurred in a number of commercial peanut fields. The aim of this work was to determine the prevalence of orthotospoviruses and their incidence in peanut. In DAS-ELISA, all samples collected from symptomatic plants reacted with antisera to groundnut ringspot virus/tomato chlorotic spot virus (GRSV/TCSV) and tomato spotted wilt virus (TSWV). RT-PCR was performed with a single pair of primers for conserved regions of the GRSV, TCSV and TSWV nucleoprotein (N) genes, and digestion with restriction enzymes, allowed the identification of the pathogen as GRSV. The results were confirmed by sequencing of the N gene. Diseased peanut plants were observed in 30 out of 81 surveyed fields located in the north-central region of the peanut-growing area. In that region, the disease incidence was evaluated in four commercial fields, recorded values from 3% to 47.25% with a mean disease incidence of 18.69%. Our study reported for the first time a significant outbreak of GRSV in peanut in Argentina and provide information on the occurrence and distribution of some Orthotospovirus species.Fil: de Breuil, Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma | Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma; ArgentinaFil: Dottori, Carolina Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Bejerman, Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma | Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma; ArgentinaFil: Nome, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma | Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma; ArgentinaFil: Giolitti, Fabián José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma | Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola. Grupo Vinculado Catedra de Estadística y Biometría de la Facultad de Ciencias Agropecuarias de la Universidad Nacional de Córdoba al Ufyma; ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentin