Identificazione di due polimorfismi mitocondriali utili alla discriminazione tra <em>Martes martes</em> e <em>Martes foina</em>

La famiglia Mustelidae è presente sul territorio italiano con 7 specie autoctone (<em>Meles meles</em>, <em>Mustela erminea</em>, <em>M. nivalis</em>, <em>M. putorius</em>, <em>Lutra lutra</em>, <em>Martes foina</em>, <em>M. martes</em>) ed una naturalizzata (<em>Mustela vison</em>). In tassonomia, variazioni morfologiche e morfometriche, spesso a carattere "locale", possono invalidare i tradizionali metodi di diagnosi utilizzati nell'attribuzione specifica. Inoltre criteri di discriminazione legati a caratteristiche corporee macroscopiche non sono applicabili nel caso in cui si disponga unicamente di resti quali peli, depositi fecali, tracce ematiche ecc. Nell'ambito dei mustelidi sono noti fenomeni di sovrapposizione dei caratteri diagnostici che rendono problematica l'identificazione delle specie, come nel caso di <em>M. martes</em> e <em>M. foina</em>. Negli ultimi anni l'identificazione di polimorfismi genetico-molecolari a scopo tassonomico ha permesso di dirimere numerosi casi incerti. In questo lavoro sono presentati i dati preliminari di uno studio volto ad identificare polimorfismi discriminanti le due specie di mustelidi considerate. L'analisi è stata condotta con enzimi di restrizione applicati ad una regione del genoma mitocondriale. Parte della sequenza del gene citocromo b (cyt b) è stata amplificata con PCR e <em>primers</em> universali, ottenendo un frammento di circa 360 bp. Gli enzimi di restrizione impiegati nell'analisi sono stati scelti in accordo con profili di digestione teorici, ricavati con un apposito software a partire da sequenze di cyt b di <em>M. martes</em> e <em>M. foina</em> presenti in banche dati. A seguito della digestione sequenziale con gli enzimi Hae III e Bgl I, il profilo elettroforetico generato mostra la presenza di una banda di circa 180 bp negli individui appartenenti alla specie <em>M. martes</em> e di due bande distinte di circa 130 e 230 bp negli esemplari di <em>M. foina</em>. Il campione da noi considerato comprende 14 esemplari provenienti da varie località della penisola italiana; in base a criteri tradizionali, 8 animali sono stati inizialmente identificati come martore e 6 come faine. L'analisi dei polimorfismi mitocondriali proposti ha evidenziato come, in realtà, due delle martore considerate siano faine "genetiche". Resta comunque la necessità di verificare il metodo proposto su un campione più ampio

Molecular evidence for introgression and loss of genetic variability in Salmo (trutta) macrostigma as a result of massive restocking of Apennine populations (Northern and Central Italy)

We assessed structural gene variation (allozymes and mtDNA) of brown trout to evaluate the genetic variability of Apennine stream populations (Northern and Central Italy) and the possibility of introgression by alien genomes after massive restocking with hatchery strains (Atlantic stocks). Genetic variability within and between Apennine populations was extremely low in our samples. Only two allozyme loci were polymorphic and mean heterozygosity was also reduced compared to other brown trout populations. Allelic frequencies determined for both loci were similar to the ones detected in the corresponding hatchery spawners. The reduction or total absence of the Mediterranean nuclear (LDH-5) and mitochondrial (16S rDNA) diagnostic markers suggests the domestic origin of most populations, and the introgression effects carried out by non-native genomes. From a taxonomic point of view, a clear differentiation emerges among basins placed on opposite sides of the Apennine chain (Tyrrhenian and Adriatic regions). In particular, the presence of Mediterranean genotypes and haplotypes characterizing Salmo (trutta) macrostigma is sporadic along the eastern Apennine side, adding additional doubts on the original presence and wide distribution of this salmonid along the Adriatic side of the mountain chain. In spite of conservation programs devoted to preservation of local genetic characteristics of S. t. macrostigma, massive restocking practices with hatchery strains obtained by a few spawners is the major cause of significant ‘founder effect’ and ‘inbreeding depression’ even in Apennine regions

Chlorophyll fluorescence of tropical tree species in a semi-deciduous forest gap Fluorescência da clorofila de espécies arbóreas tropicais em uma clareira de floresta semidecídua

The characterization of different ecological groups in a forest formation/succession is unclear. To better define the different successional classes, we have to consider ecophysiological aspects, such as the capacity to use or dissipate the light energy available. The main objective of this work was to assess the chlorophyll fluorescence emission of tropical tree species growing in a gap of a semi-deciduous forest. Three species of different ecological groups were selected: Croton floribundus Spreng. (pioneer, P), Astronium graveolens Jacq. (early secondary, Si), and Esenbeckia febrifuga A. Juss. (late secondary, St). The potential (Fv/Fm) and effective (deltaF/Fm') quantum efficiency of photosystem II, apparent electron transport rate (ETR), non-photochemical (qN) and photochemical (qP) quenching of fluorescence were evaluated, using a modulated fluorometer, between 7:30 and 11:00 h. Values of Fv/Fm remained constant in St, decreasing in P and Si after 9:30 h, indicating the occurrence of photoinhibition. Concerning the measurements taken under light conditions (deltaF/Fm', ETR, qP and qN), P and Si showed better photochemical performance, i.e., values of deltaF/Fm', ETR and qP were higher than St when light intensity was increased. Values of qN indicated that P and Si had an increasing tendency of dissipating the excess of energy absorbed by the leaf, whereas the opposite was found for St. The principal component analysis (PCA), considering all evaluated parameters, showed a clear distinction between St, P and Si, with P and Si being closer. The PCA results suggest that chlorophyll fluorescence may be a potential tool to differentiate tree species from distinct successional groups.<br>A caracterização dos diferentes grupos ecológicos envolvidos nos processos de formação/sucessão florestal é ainda pouco precisa. Para melhor distinção das classes sucessionais deve-se levar em consideração aspectos ecofisiológicos, como a capacidade de aproveitamento da energia luminosa. O objetivo deste trabalho foi acessar a emissão da fluorescência da clorofila de espécies arbóreas tropicais crescendo em uma clareira de floresta semidecídua. Foram selecionadas três espécies de diferentes grupos ecológicos: Croton floribundus Spreng. (pioneira, P), Astronium graveolens Jacq. (secundária inicial, Si) e Esenbeckia febrifuga A. Juss. (secundária tardia, St). A eficiência quântica potencial (Fv/Fm) e efetiva (deltaF/Fm') do fotossistema II, a taxa aparente de transporte de elétrons (ETR) e os coeficientes de extinção fotoquímica (qP) e não-fotoquímica (qN) da fluorescência da clorofila foram avaliados, utilizando um fluorômetro modulado, entre 7h30 e 11h. Os valores de Fv/Fm permaneceram constantes em St, diminuindo em P e Si a partir das 9h30, indicando a ocorrência de fotoinibição. Entretanto, nas medidas realizadas na presença de luz (deltaF/Fm', ETR, qP e qN), P e Si apresentaram melhor desempenho fotoquímico, ou seja, com o aumento da intensidade luminosa os valores de DF/Fm', ETR e qP foram superiores aos valores de St. Os valores de qN indicaram que P e Si possuem a tendência crescente de dissipar o excesso de energia, sendo observado o contrário em St. A análise de componentes principais (PCA), considerando todos parâmetros avaliados, mostrou clara distinção entre St, P e Si, sendo estas últimas espécies mais próximas. Os resultados dessa análise evidenciam a fluorescência da clorofila como uma ferramenta potencial para diferenciar espécies arbóreas de grupos sucessionais distintos

Molecular phylogeny of the blind cavefish Phreatichthys andruzzii and Garra barreimiae within the family Cyprinidae

The phylogenetic relationships of two cavefish, Phreatichthys andruzzii and Garra barreimiae, belonging to the family Cyprinidae, were investigated by sequencing the mitochondrial cytochrome b gene. These cavefish species are native to Somalia (eastern Africa) and Oman (southeastern Arabian peninsula), respectively, and so far no molecular support to their taxonomy and phylogenetic position was ever provided. The analysis of cytochrome b sequences showed that the species are monophyletic taxa, closely related to each other and to other species of the genus Garra. Molecular clock calculations allowed to date the origin of these hypogaean species back to the Plio-Pleistocene and support the hypothesis that African cyprinids originated from Miocenic immigrations of Asian ancestors