17 research outputs found

    Arquitetura de um Mecanismo para Busca Especializada na Web

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    O desenvolvimento acelerado da Internet e o aumento de conteúdos digitais disponíveis conduziram o desenvolvimento de mecanismos de busca que facilitassem a recuperação de informações na Web. Entretanto, estes mecanismos apresentam limitações principalmente quando se trata da recuperação de conteúdos especializados. Dados geográficos não são encontrados na Web por mecanismos convencionais, pois tais mecanismos não estão preparados para evidenciar este conteúdo. Neste contexto, este trabalho apresenta uma arquitetura para acesso e recuperação de dados geográficos na Web, discorrendo sobre suas principais características, arquitetura, tecnologias envolvidas e performance

    geospatial data in the

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    a specialized search engine to discove

    GeoDiscover – a specialized search engine to discover geospatial data in the Web

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    The fast development of the internet and the growth of digital contents available led to the development of search engines that facilitate the recovery of information in the Web. However, these engines have limitations mainly when recovering specialized contents. Geospatial data are created by local governments, companies and people, but these data arent available in a systematized way. In this context, this paper presents a specialized search engine to access and recover geospatial data in the Web, focusing on its main characteristics, architecture, technologies and performance.Pages: 3-1

    Molecular characterization of enteroinvasive Escherichia coli ipa genes by PCR-RFLP analysis Caracterização molecular do gene ipa de Escherichia coli enteroinvasora pela análise de PCR- RFLP

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    In this study, polymorphism in ipa genes was found in five out of nine EIEC serotypes studied. When SalI and HindII were used in RFLP-PCR assays many EIEC serotypes showed polymorphism in ipaB and ipaD. On the other hand, no polymorphism was observed in ipaA and ipaC in these strains. The polymorphism present in EIEC strains is serotype-dependent, since restriction patterns were conserved amongst strains belonging to the same serotype. When IpaB deduced amino acid sequences of S. flexneri M90T and FBC124-13 were compared, ten amino acids changes could be observed mainly in the amino-terminal region. The deduced EIEC IpaD amino-acid sequence presented 91% similarity with the Shigella strain. In this case, amino acid changes were spread out through the whole structure, except in the carboxyl-terminal region.<br>No presente estudo, foi encontrado polimorfismo no gene ipa em cinco sorotipos de EIEC, de nove estudados. Quando enzimas de restrição SalI e HindII foram utilizadas no ensaio de PCR-RFLP, amostras de EIEC apresentaram polimorfismo em ipaB e ipaD. Por outro lado, não foram observados polimorfismos nos genes ipaA e ipaC nestas cepas, quando diversas enzimas de restrição foram utilizadas. O polimorfismo presente em cepas de EIEC é sorotipo-dependente, uma vez que os padrões de restrição foram conservados entre as cepas pertencentes ao mesmo sorotipo. Quando a seqüência deduzida de aminoácidos de IpaB de S. flexneri M90T e FBC124-13 foram comparadas, mudanças foram observadas em dez aminoácidos na região amino-terminal. A seqüência deduzida de aminoácidos de IpaD de EIEC apresentou similaridade de 91% com a cepa de Shigella. Neste caso, mudanças de aminoácidos ocorreram em toda a estrutura da molécula de IpaD, exceto na região carboxi-terminal

    &lt;b&gt;&lt;i&gt;Plesiomonas shigelloides&lt;/i&gt;: um enteropatógeno emergente?&lt;/b&gt;

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    &lt;p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0pt; line-height: normal; text-align: justify; mso-layout-grid-align: none;"&gt; &lt;i&gt;Plesiomonas shigelloides&lt;/i&gt; é um bacilo Gram-negativo, pertencente à família &lt;i&gt;Enterobacteriaceae&lt;/i&gt;, isolado de água doce e salgada, de peixes de água doce, mariscos e de inúmeros tipos de animais. Suspeita-se que a maioria das infecções humanas causadas por &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt;, seja veiculada pela água, pois a bactéria está presente em águas não tratadas que são usadas para beber, águas recreacionais ou água para lavar alimentos que são consumidos sem cozimento ou aquecimento. A ingestão de &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt; não causa sempre doença no animal hospedeiro, mas o microrganismo pode permanecer temporariamente como membro transitório não infeccioso da microbiota intestinal. A bactéria é isolada de fezes de pacientes com diarréia, mas algumas vezes também de fezes de indivíduos sem sintomas. A doença causada por &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt; é a gastrenterite, que normalmente é auto-limitante, com febre, calafrio, dor abdominal, náusea, diarréia ou vômito. Em casos graves, as fezes diarréicas podem ser verde-amareladas, espumosas e com presença de sangue. A bactéria pode também causar infecções extra-intestinais. Ademais, pode produzir toxinas e ser invasora. As características utilizadas para considerar &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt; como um enteropatógeno não são totalmente convincentes. Embora seja isolada de pacientes com diarréia e incriminada em vários surtos epidêmicos envolvendo água e alimentos contaminados, não foi possível identificar em muitas amostras de &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt;, associadas com infecções gastrintestinais, um mecanismo de virulência definitivo. Palavras-chave: &lt;i&gt;P. shigelloides&lt;/i&gt;; enteropatógeno; gastrenterite; diarréia; infecções extra-intestinais. &lt;/p&gt

    Plesiomonas shigelloides: Um enteropatógeno emergente?

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    Plesiomonas shigelloides is a Gram-negative rod-shaped bacterium, of the family Enterobacteriaceae, which has been isolated from freshwater and salt water, freshwater fish, shellfish and many species of animals. Most human P. shigelloides infections are suspected to be waterborne. The organism can be found in untreated water used as drinking water, in recreational water, or in water used to rinse food that is consumed without cooking or heating. The ingestion of P. shigelloides does not always cause illness in the host animal, and the organism may be present temporarily as a transient, noninfectious member of the intestinal flora. It has been isolated from the stools of patients with diarrhea,but it is also sometimes isolated from healthy individuals. P. shigelloides has been implicated in gastroenteritis, usually a self-limiting disease characterized by fever, chills, abdominal pain, nausea, diarrhea or vomiting; in severe cases the diarrhea may be yellowish-green, foamy and tinged with blood. The bacteria may also cause extra-intestinal infection. Furthermore, it can produce toxins and may be invasive. The evidence in favor of considering P. shigelloides as an enteropathogen is not totally convincing. Although it has been isolated from patients with diarrhea and incriminated in some outbreaks involving contaminated water and food, it was not possible, in many P. shigelloides samples associated with gastrointestinal infections, to identify a definite mechanism of virulence.Plesiomonas shigelloides é um bacilo Gram-negativo, pertencente à família Enterobacteriaceae, isolado de água doce e salgada, de peixes de água doce, mariscos e de inúmeros tipos de animais. Suspeita-se que a maioria das infecções humanas causadas por P. shigelloides, seja veiculada pela água, pois a bactéria está presente em águas não tratadas que são usadas para beber, águas recreacionais ou água para lavar alimentos que são consumidos sem cozimento ou aquecimento. A ingestão de P. shigelloides não causa sempre doença no animal hospedeiro, mas o microrganismo pode permanecer temporariamente como membro transitório não infeccioso da microbiota intestinal. A bactéria é isolada de fezes de pacientes com diarréia, mas algumas vezes também de fezes de indivíduos sem sintomas. A doença causada por P. shigelloides é a gastrenterite, que normalmente é auto-limitante, com febre, calafrio, dor abdominal, náusea, diarréia ou vômito. Em casos graves, as fezes diarréicas podem ser verde-amareladas, espumosas e com presença de sangue. A bactéria pode também causar infecções extra-intestinais. Ademais, pode produzir toxinas e ser invasora. As características utilizadas para considerar P. shigelloides como um enteropatógeno não são totalmente convincentes. Embora seja isolada de pacientes com diarréia e incriminada em vários surtos epidêmicos envolvendo água e alimentos contaminados, não foi possível identificar em muitas amostras de P. shigelloides, associadas com infecções gastrintestinais, um mecanismo de virulência definitivo. Palavras-chave: P. shigelloides; enteropatógeno; gastrenterite; diarréia; infecções extra-intestinais

    Prevalence and virulence properties of Vibrio cholerae non-O1, Aeromonas spp. and Plesiomonas shigelloides isolated from Cambe Stream (State of Parana, Brazil)

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    The incidence of Vibrio cholerae, Aeromonas spp, and Plesiomonas shigelloides was determined in Rater samples from Cambe Stream. The samples were collected from seven different sites. The serogroups, virulence markers and drug resistance profiles were also evaluated. Twelve. Aer. hydrophila, 12 Aer. caviae, eight Aer. sobria, seven Ple. shigelloides and two V. cholerae non-O1 were isolated. They belonged to different serogroups and all produced haemolysis in different assays. Five of the Aeromonas strains and one of V, cholerae non-O1 were positive for enterotoxin activity. Haemagglutination and its inhibition, using erythrocytes of different origins, was variable for Aeromonas spp and V. cholerae, while none of the Plt. shigelloides haemagglutinated in association with any type of erythrocyte. All isolates exhibited multiple drug resistance. These results indicate that the occurrence of V. cholerae non-O1, Aeromonas spp, and Ple. shigelloides, in water used for vegetable irrigation, human recreation and animal consumption, among others, represents a potential risk for humans
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