Transcriptome Analysis of Root Development in Wheat \u3cem\u3e Triticum Aestivum\u3c/em\u3e Using High Throughtput Sequencing Technologies

Root provides plant water, nutrients and anchorage from soil. Most our knowledge of molecular mechanisms of root development is from the dicot model plant Arabidopsis, but very few studies have done in monocot crop systems like rice, maize, and wheat. We are studying very short root (VSR) phenotype in wheat, and lack of a sequenced reference genome in wheat prompted us to sequence and assemble the root transcriptome of the reference cultivar Chinese Spring (CS). A root transcriptome was assembled from the sequenced reads generated from root tip and the mature root tissues of CS. Approximately 169 million reads were successfully assembled into ~91K transcripts coding for functional proteins. Of these ~91K transcripts, 1,728 were differentially expressed in root tip as compared to the rest of the mature tissues. Generation of the root reference transcriptome and the availability of a reasonable reference genome sequence for wheat enabled us to analyze the gene expression in the long root (LR) and VSR. A total of 4,412 genes were differentially expressed in the VSR compared to the LR root tips. A significant portion of the differentially expressed genes functioning in the hormonal responses, regulation of transcription, defense response, reactive oxygen species (ROS), abiotic stress response, lignin biosynthesis, calcium signaling, and autophagy pathways were induced. In addition, several negative regulators of cell proliferation, including homologs of the BIGBROTHER E3 ubiquitin ligase, and negative regulators of root cell elongation, such as genes encoding the FERONIA kinases and a RALF peptide hormone, were also up-regulated in VSR. Consistent with this, a large number of genes for chromatin replication and protein syntheses, including those coding for histones and ribosomal proteins, and cell wall remodeling enzymes, were down-regulated in VSR. The ROS and lignin accumulation in the VSR were further validated by histochemical staining. This research revealed several molecular mechanisms of root development, based on which a working model was proposed to explain the VSR development. Although the related pathways identified in Arabidopsis may play a similar role in wheat, the VSR phenotype is probably governed by a unique mechanism that may be cereal- or wheat-specific

HUBUNGAN KETERLIBATAN PEMAKAI, KEMAMPUAN TEKNIK PERSONAL, DUKUNGAN MANAJEMEN PUNCAK, SERTA PROGRAM DIKLAT TERHADAP KINERJA SISTEM INFORMASI AKUNTANSI (SIA) DI PG. WATOETOELIS SIDOARJO

Penelitian ini dilakukan di PG Watoetoelis Sidoarjo. Fenomena yang berkaitan dengan kinerja sistem informasi akuntansi di PG Watoetoelis Sidoarjo adalah mayoritas karyawan tidak mengerti cara mengoperasikan cara mengoperasikan sistem tersebut sehingga kinerja tidak maksimal, sistem informasi yang ada tidak sesuai dengan sistem yang beroperasi di perusahaan, biaya yang dikeluarkan untuk pembuatan sistem informasi lebih besar dari daripada manfaat yang didapat, sistem yang dibuat tidak sesuai dengan ukuran perusahaan dilihat dari operasi perusahaan tersebut sehingga perusahaan mengalami kerugian karena biaya yang dikeluarkan terlalu besar dimana dengan sistem informasi yang sederhana juga dapat memenuhi kebutuhan sistem informasi perusahaan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh keterlibatan pemakai, kemampuan teknik personal, dukungan manajemen puncak,program pelatihan dan pendidikan terhadap kinerja sistem informasi akuntansi di PG Watoetoelis Sidoarjo. Data yang digunakan adalah data primer yaitu data dikumpulkan melalui pembagian kuesioner kepada seluruh kepala divisi dan wakil kepala divisi di PG. Watoetoelis yang berjumlah 32 orang yang menjadi sampel. Skala pengukuran yang digunakan adalah likert dengan teknik pengukuran dengan jenjang 1-5. Teknik pengambilan sampel menggunakan sampling jenuh atau sensus yaitu teknik penentuan sampel bila semua anggota populasi digunakan sebagai sampel. Teknik analisis yang digunakan adalah Partial Least Square (PLS) untuk mengetahui pengaruh keterlibatan pemakai, kemampuan teknik personal, dukungan manajemen puncak, program pelatihan dan pendidikan terhadap kinerja sistem informasi akuntansi di PG Watoetoelis Sidoarjo. Hasil pengujian dalam penelitian ini menunjukkan bahwa keterlibatan pemakai dan kemampuan teknik personal tidak berpengaruh signifikan terhadap kinerja sistem informasi akuntansi di PG Watoetoelis Sidoarjo, sedangkan dukungan manajemen puncak dan program pelatihan dan pendidikan berpengaruh signifikan terhadap kinerja sistem informasi akuntansi di PG Watoetoelis Sidoarjo. Kata Kunci: Keterlibatan Pemakai, Kemampuan Teknik Personal, Dukungan Manajemen Puncak dan Program Pelatihan Dan Pendidika