Personalized Trust Management in Decision Making: A Dynamic Clustering Approach

This paper presents a personalized approach for distributed trust management by employing the k-means range algorithm, a combination of the partitional k-means clustering algorithm with orthogonal range search concepts. The aim of this approach is to aid the human or computer agent in organizing information from multiple sources into clusters according to its “trust features”. Thus the agent can perform complicated trust assessments in real-time situations and cooperate with decision-making software to assist in purchasing activities. We conclude by discussing the implications and advantages of this approach in trust management in traditional and mobile e-commerce applications

Synthesis Cost-Optimal Targeted Mutant Protein Libraries

Protein variant libraries produced by site-directed mutagenesis are a useful tool utilized by protein engineers to explore variants with potentially improved properties, such as activity and stability. These libraries are commonly built by selecting residue positions and alternative beneficial mutations for each position. All possible combinations are then constructed and screened, by incorporating degenerate codons at mutation sites. These degenerate codons often encode additional unwanted amino acids or even STOP codons. Our study aims to take advantage of annealing based recombination of oligonucleotides during synthesis and utilize multiple degenerate codons per mutation site to produce targeted protein libraries devoid of unwanted variants. Toward this goal we created an algorithm to calculate the minimum number of degenerate codons necessary to specify any given amino acid set, and a dynamic programming method that uses this algorithm to optimally partition a DNA target sequence with degeneracies into overlapping oligonucleotides, such that the total cost of synthesis of the target mutant protein library is minimized. Computational experiments show that, for a modest increase in DNA synthesis costs, beneficial variant yields in produced mutant libraries are increased by orders of magnitude, an effect particularly pronounced in large combinatorial libraries

Improved Algorithms for Approximate String Matching (Extended Abstract)

The problem of approximate string matching is important in many different areas such as computational biology, text processing and pattern recognition. A great effort has been made to design efficient algorithms addressing several variants of the problem, including comparison of two strings, approximate pattern identification in a string or calculation of the longest common subsequence that two strings share. We designed an output sensitive algorithm solving the edit distance problem between two strings of lengths n and m respectively in time O((s-|n-m|)min(m,n,s)+m+n) and linear space, where s is the edit distance between the two strings. This worst-case time bound sets the quadratic factor of the algorithm independent of the longest string length and improves existing theoretical bounds for this problem. The implementation of our algorithm excels also in practice, especially in cases where the two strings compared differ significantly in length. Source code of our algorithm is available at http://www.cs.miami.edu/\~dimitris/edit_distanceComment: 10 page

Παράκτια ηλεκτρική διασύνδεση πλοίων στους λιμένες της Ρόδου

Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο--Μεταπτυχιακή Εργασία. Διεπιστημονικό-Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) “Παραγωγή και Διαχείρηση Ενέργειας

The effect of newer, biological disease-modifying antirheumatic drugs on risk factors for cardiovascular disease in patients with rheumatoid arthritis

Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic inflammatory disease of unknown etiology that mainly affects the synovium. Methotrexate (MTX) is the cornerstone of treatment. If the goal of treatment is not achieved with csDMARDs (conventional synthetic disease modifying antirheumatic drugs), when there are poor prognostic factors, the addition of a bDMARD (biological DMARD) should be considered. Inflammation plays an important role in the onset and progression of the atherosclerotic process. The purpose of this study is to evaluate the effect of bDMARDs on risk factors for cardiovascular disease in Greek RA patients. The study was performed in the outpatient clinics of the rheumatology clinic of the University General Hospital of Ioannina. All patients met the ACR / EULAR 2010 classification criteria for the disease. Informed consent was obtained from both patients and controls and the study protocol was approved by the Institutional Ethics Committee. A total of 70 patients who met the above criteria were admitted. Thirty one healthy volunteers who were used as a control group before starting bDMARDs were also included. Upon admission to the study, all patients underwent: demographic data recording, physical examination-assessment of disease activity, complete laboratory test, imaging test-ultrasound of common carotid arteries. Patients were already receiving MTX or (Leflunomide) LFN and prednisone at constant doses throughout the study. They started taking a biological agent after a failure of clinical and laboratory improvement with a combination of at least two csDMARDs. Serum lipid levels of patients were measured at baseline, 3 months and 6 months after the initiation of the biological agent. The levels of HDL-C, TC, TG, LDL-C, ApoA1, ApoB, Lp(a), CRP, ESR were measured. Levels of anti-oxLDL (autoantibodies against oxidized LDL and cIMT (carotid intima-media thickness) were assessed before and 6 months after the administration of bDMARDs. In this study, it was observed that patients with RA are more likely to develop atherosclerosis even if they are under therapy with csDMARDs. Comparison with healthy controls revealed higher levels of cIMT and lower levels of total cholesterol and HDL-C cholesterol for the group of patients, which is associated with high disease activity. After initiation of a bDMARD and without hypolipidemic therapy, a more favorable lipid profile was observed, involving an increase in HDL-C and ApoA1 levels with a concomitant decrease in cIMT, which constitutes an index of subclinical atherosclerosis. The titer of anti-oxLDL was also reduced. After 6 months of follow-up, the two categories of biological agents (anti-TNF and non anti-TNF) had a similar effect on inflammatory markers, lipids and cIMT. In conclusion, hyperlipidemia as a modifiable cardiovascular risk factor is an attractive target for cardiovascular risk management in RA. Early intervention and control of disease activity using bDMARDs can reduce the risk of atherosclerosis and cardiovascular events.Η ρευματοειδής αρθρίτιδα (ΡΑ) αποτελεί μία συστηματική φλεγμονώδη νόσο άγνωστης αιτιολογίας που προσβάλλει κυρίως τον αρθρικό υμένα των διαρθρώσεων. Η μεθοτρεξάτη (ΜΤΧ) αποτελεί τον ακρογωνιαίο λίθο της θεραπείας. Εάν ο στόχος θεραπείας δεν επιτευχθεί με csDMARDs (conventional synthetic disease modifying antirheumatic drugs), όταν υπάρχουν κακοί προγνωστικοί παράγοντες, θα πρέπει να εξεταστεί η προσθήκη bDMARD (biologic DMARD). Η φλεγμονή έχει αποδειχθεί ότι παίζει σημαντικό ρόλο στην έναρξη και την εξέλιξη της αθηροσκληρωτικής διαδικασίας. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι η μελέτη Ελλήνων ασθενών με ΡΑ, οι οποίοι τίθενται σε θεραπεία με νεότερους βιολογικούς παράγοντες. Πιο συγκεκριμένα, η μελέτη αυτή επικεντρώνεται στην καταγραφή της επίδρασης των φαρμάκων αυτών στους παράγοντες κινδύνου για την εμφάνιση καρδιαγγειακής νόσου. Η μελέτη διενεργήθηκε στα εξωτερικά ιατρεία της ρευματολογικής κλινικής του Πανεπιστημιακού Γενικού Νοσοκομείου Ιωαννίνων (ΠΓΝΙ). Συμπεριελήφθησαν ασθενείς που πληρούσαν τα κριτήρια κατάταξης των ACR/EULAR 2010 για τη ΡΑ. Εισήχθησαν συνολικά 70 ασθενείς που πληρούσαν τα ανωτέρω κριτήρια. Συμπεριελήφθησαν επίσης 31 υγιείς εθελοντές που χρησιμοποιήθηκαν ως ομάδα ελέγχου πριν την έναρξη bDMARD. Κατά την είσοδό τους στη μελέτη, σε όλους τους ασθενείς πραγματοποιήθηκε: καταγραφή δημογραφικών δεδομένων, φυσική εξέταση-εκτίμηση βαρύτητας της νόσου, πλήρης εργαστηριακός έλεγχος, απεικονιστικός έλεγχος-υπέρηχος κοινών καρωτίδων. Οι ασθενείς ελάμβαναν ήδη ΜΤΧ ή λεφλουνομίδη (LFN) και πρεδνιζόνη σε σταθερές δόσεις σε όλη τη διάρκεια της μελέτης. Ξεκίνησαν τη λήψη βιολογικού παράγοντα ύστερα από αποτυχία κλινικοεργαστηριακής βελτίωσης με συνδυασμό τουλάχιστον δύο csDMARDs. Μετρήθηκαν τα επίπεδα των λιπιδίων στον ορό των ασθενών κατά την αρχική εκτίμηση, 3 μήνες και 6 μήνες μετά την έναρξη του βιολογικού παράγοντα. Μετρήθηκαν τα επίπεδα HDL-C, TC, TG, LDL-C, ApoA1, ApoB, Lp(α), CRP, ΤΚΕ. Τα επίπεδα των anti-oxLDL (αυτοαντισώματα έναντι οξειδωμένης LDL) και o cIMT (carotid intima-media thickness) εκτιμήθηκαν πριν και 6 μήνες μετά την έναρξη bDMARD. Στη μελέτη αυτή παρατηρήθηκε ότι οι ασθενείς με ΡΑ είναι πιθανό να παρουσιάζουν εξέλιξη της αρτηριοσκλήρυνσης ακόμα και αν βρίσκονται υπό θεραπεία με csDMARDs. Η σύγκριση με υγιείς μάρτυρες αποκάλυψε υψηλότερα επίπεδα cIMT και χαμηλότερα επίπεδα ολικής χοληστερόλης και HDL-C χοληστερόλης για την ομάδα των ασθενών, πριν τη χορήγηση bDMARD, γεγονός που σχετίζεται με υψηλή ενεργότητα της νόσου. Μετά την έναρξη bDMARD και χωρίς την προσθήκη υπολιπιδαιμικής αγωγής, παρατηρείται ένα ευνοϊκότερο λιπιδαιμικό προφίλ που περιλαμβάνει αύξηση της HDL-C και ApoA1 με ταυτόχρονη μείωση του cIMT, που αποτελεί δείκτη αθηρωμάτωσης. Επίσης, μειώθηκε ο τίτλος των anti-oxLDL. Μετά από παρακολούθηση 6 μηνών, οι δύο κατηγορίες βιολογικών παραγόντων (αντι-TNF και non αντι-TNF) είχαν παρόμοια επίδραση στους δείκτες φλεγμονής, στα λιπίδια και στο cIMT. Εν κατακλείδι, η υπερλιπιδαιμία ως τροποποιήσιμος παράγοντας καρδιαγγειακού κινδύνου αποτελεί ελκυστικό στόχο για τη διαχείριση καρδιαγγειακού κινδύνου στη ΡΑ. Η έγκαιρη παρέμβαση και ο έλεγχος της ενεργότητας της νόσου χρησιμοποιώντας bDMARDs μπορεί να μειώσει τον κίνδυνο αθηροσκλήρωσης και καρδιαγγειακών εκδηλώσεων σε ασθενείς με ΡΑ

Σχεδιασμός και κατασκευή υποστηρικτικού ρομποτικού γαντιού για την ενίσχυση και αποκατάσταση της λειτουργίας της άκρας χείρας σε άτομα μετά από εγκεφαλικό επεισόδιο

Κάθε χρόνο τα εγκεφαλικά επεισόδια πλήττουν ένα τεράστιο αριθμό ατόμων. Ως αποτέλεσμα, πολλοί επιζώντες έχουν χάσει μερικές από τις δυνατότητές τους που είναι απαραίτητες για την ολοκλήρωση καθημερινών δραστηριοτήτων. Οι επαναλαμβανόμενες κινήσεις των χεριών, αποτελούν συνήθη τεχνική αποκατάστασης της λειτουργικότητας και της βελτίωσης της δύναμης του χεριού. Για να διευκολυνθεί η αποκατάσταση μέσω των επαναλαμβανόμενων κινήσεων, σχεδιάστηκε ένα ρομποτικό γάντι, που οι ασθενείς θα μπορούν να φορούν και να χρησιμοποιούν, προκειμένου να βοηθήσει στην κίνηση και το συντονισμό των ασκήσεων πιασίματος, να ενισχύσει και να διευκολύνει τη λειτουργικότητα της άκρας χείρας, καθώς και τις καθημερινές ανάγκες των ασθενών. Στο πρώτο μέρος της εργασίας θα αναφερθούν τα κύρια χαρακτηριστικά των εγκεφαλικών επεισοδίων, οι παράγοντες κίνδυνου, τα συμπτώματα, τα διαγνωστικά μέσα και η ιατρική τους αντιμετώπιση. Επίσης γίνεται εισαγωγή στην ανατομία του χεριού, στις πλακέτες Arduino και στους σερβοκινητήρες. Το δεύτερο μέρος της εργασίας επικεντρώνεται στην λεπτομερή περιγραφή του τρόπου και των μεθόδων που χρησιμοποιήθηκαν για τον σχεδιασμό και την κατασκευή του πρότυπου αυτού γαντιού. Το γάντι αποτελείται από ένα σύστημα καλωδίων, συνδεδεμένα με τα δάχτυλα του ασθενή. Η ενεργοποίηση των καλωδίων πραγματοποιείται μέσω ενός σερβοκινητήρα που είναι τοποθετημένος σε βάση που προσαρμόζεται στον καρπό και ασκεί τάση στα καλώδια, ώστε να ανοίγει και να κλείνει το χέρι. Ο έλεγχος του, πραγματοποιείται μέσω ενός μικρολεγκτής Arduino, με κατάλληλο λογισμικό και την χρήση διακοπτών, που επιτρέπουν την άμεση θέση και τον έλεγχο της δύναμης των δακτύλων και της λαβής.Stroke affects a vast amount of people every year. As a result, many survivors have at least partially lost some of their abilities which are necessary to complete everyday activities. Repetitive hand movements are a common technique for restoring functionality and improving hand strength. To facilitate recovery through repetitive movements, a robotic glove was designed, that patients can wear and use, to aid in movement and coordination of gripping exercises, enhance and facilitate the functionality of the hand, as well as patients’ daily needs. The first part of the paper focuses on the main features of strokes, the risk factors, the symptoms, the diagnostic tools and their medical treatment. Thera are also introduced features such as, anatomy of the hand, Arduino boards and servomotors. The second part of the paper focuses on the detailed description of the methods used to design and manufacture this prototype glove. The glove consists of a cable system connected to the patient's fingers. Cables are activated through a servo motor, that is mounted on a base that fits the wrist and tensions the wires, to open and close the hand. The control is carried out through an Arduino microcontroller, with suitable software and the use of switches, that allow the direct position and control of the fingers and the strength of the hand grip