Comparación de ecuaciones para ajustar curvas de crecimiento de vacas Holstein, Jersey y Jersey x Holstein en pastoreo

The objective of the study was to compare the goodness of fit of four nonlinear equations to describe the growth curves of Jersey, Holstein, and Jersey x Holstein cows in grazing. The Brody, Gompertz, von Bertalanffy, and Logistic equations were fitted to the data (n= 2,315) on weight and age of Jersey (n= 54), Holstein (n= 6) and Jersey x Holstein (n= 30) cows. For each animal, genotype and equation, the parameters A, b and k that generated the best-fit growth curves were estimated. In each of the four equations compared, parameter A corresponds to the upper asymptote of the curve and estimates the ‘mature weight’ of the animal, parameters b and k represent the integration constant and the maturation rate. For the growth curves of Jersey cows and Jersey x Holstein crosses, the Gompertz and von Bertalanffy equations produced the best fit. In contrast, the Logistic equation had the best fit for the growth curves of Holstein, followed closely by the Gompertz and von Bertalanffy equations. Under the management and feeding conditions of the animals in this study, the growth curves of the females of the three genotypes studied can be fitted with the von Bertalanffy equation.El objetivo del estudio fue comparar la bondad de ajuste de cuatro ecuaciones no lineales para describir las curvas de crecimiento de vacas Jersey, Holstein, y Jersey x Holstein en pastoreo. Las ecuaciones de Brody, Gompertz, von Bertalanffy, y Logística se ajustaron a los datos (n= 2,315) de peso y edad de vacas Jersey (n= 54), Holstein (n= 6) y Jersey x Holstein (n= 30). Para cada animal, genotipo y ecuación, se estimaron los parámetros A, b y k que produjeron las curvas de crecimiento de mejor ajuste. En cada una de las cuatro ecuaciones comparadas, el parámetro A corresponde a la asíntota superior de la curva y estima el ‘peso maduro’ del animal, los parámetros b y k representan la constante de integración y la tasa de maduración. Para las curvas de crecimiento de las vacas Jersey y las cruzas de Jersey x Holstein, las ecuaciones de Gompertz y de von Bertalanffy produjeron el mejor ajuste. En contraste, la ecuación Logística tuvo el mejor ajuste para las curvas de crecimiento de Holstein, seguida muy de cerca por las ecuaciones de Gompertz y von Bertalanffy. En las condiciones de manejo y alimentación de los animales en este estudio, las curvas de crecimiento de las hembras de los tres genotipos estudiados pueden ajustarse con la ecuación de von Bertalanffy

Estimación de masa de forraje en una pradera mixta por aprendizaje automatizado, datos del manejo de la pradera y meteorológicos satelitales

Measuring forage mass (FM) in the pasture, prior to grazing, is critical to determining the daily allocation of forage in pastoral animal production systems. FM is estimated by cutting forage in known areas, using allometric equations, or with the use of remote sensors (RS); however, the accuracy and practicality of the different methods for estimating FM is variable. The objective was to obtain predictive models using environmental and pasture management variables to predict FM. Regression models were fitted to estimate FM based on variables of pasture management (PM) or measurements obtained by RS, such as reflectance, air temperature, and rainfall. A mixed pasture grazed by beef cattle was studied for three years. With 80 % of data, models were built by ordinary least squares (OLS) or by machine  learning (ML) algorithms.  The remaining 20 % of the data was used to validate the models using the coefficient of determination and average bias between estimated and observed values. The base model of study was the relationship between pasture height before grazing and FM, this model was fitted using OLS; the r2 was 0.43. When models that included PM variables were fitted, the r2 was 0.45 for OLS and 0.63 for ML. When fitting models with PM and RS variables, the r2 was 0.71 for OLS and 0.96 for ML. ML-fitted model ensembles reduced the bias of FM estimates of the examined pasture. Overall, ML models better represented the relationship between pasture height before grazing and FM than OLS models, when fitted with pasture management variables and RS information. ML models can be used as a tool for daily decision-making in pastoral production systems.Medir la masa de forraje (MF) en la pradera, antes del pastoreo, es fundamental para determinar la asignación diaria de forraje en sistemas pastoriles de producción animal. La MF se estima por corte de forraje en áreas conocidas, utilizando ecuaciones alométricas, o con el uso de sensores de percepción remota (PR); sin embargo, la exactitud y practicidad de los distintos métodos para estimar la MF, es variable. El objetivo fue obtener modelos predictivos usando variables ambientales y del manejo de la pradera para predecir la MF. Se ajustaron modelos de regresión para estimar la MF con base en variables del manejo de la pradera (MP) o mediciones obtenidas por PR, como reflectancia, temperatura del aire y lluvia. Por tres años se estudió una pradera mixta pastoreada con bovinos productores de carne. Con 80 % de datos se modeló por mínimos cuadrados  ordinarios  (OLS)  o por algoritmos de aprendizaje  automatizado  (ML). El 20 % restante de los datos se utilizó para validar los modelos usando el coeficiente de determinación y el sesgo promedio entre valores estimados y observados. El modelo base de estudio fue la relación entre la altura de la pradera antes del pastoreo y la MF de este modelo se ajustó usando OLS; la r2 fue 0.43. Cuando se ajustaron modelos que incluyeron variables del MP, la r2 fue 0.45 para OLS y 0.63 para ML. Al ajustar modelos con variables de MP y PR, la r2 fue 0.71 para OLS y 0.96 para ML. Los ensambles de modelos ajustados con ML redujeron el sesgo de estimados de MF de la pradera examinada. En general, los modelos de ML representaron mejor la relación entre altura de la pradera antes del pastoreo y MF que los de modelos de OLS, al ajustarlos con variables de manejo de la pradera y con información de PR. Los modelos de ML pueden usarse como herramienta para la toma de decisiones diaria en sistemas productivos pastoriles

Caracterización técnica, social y económica de las empresas del hato bovino jersey de registro en México

In México, there are no studies whose purpose has beencharacterizing the production units with registered cattle herds.These studies are important because they allow designingsuccessful genetic improvement programs and the transfer oftheir results to commercial producers. The objective of thisstudy was to characterize registered Jersey herds in México.A questionnaire was applied to all of the members of theAsociación Mexicana de Criadores de Ganado Jersey de Registro,and descriptive statistics were obtained. The registered Jerseycattle population in México is small (approximately 4000animals), it is distributed primarily in the central area of thecountry, and most of the herds (85%) have a recent origin(since 1995). Selection in the herds is scarce, activities forgenetic improvement are focused on identifying the animalsand collecting productive records; therefore, genetic progressis primarily through semen and animal imports, generatingtechnical and economic dependency on other countries. In spiteof having national genetic evaluations of the animals, theircommercialization by farmers is not the main activity, which iswhy the transfer of outstanding genetic material to commercialproducers is scarce. The installed capacity in animals, lands,and infrastructure and equipment is sufficient to implementgenetic improvement programs. Jersey cattle producers have inaverage 15 years of schooling and 24 in cattle-raising.En México no se dispone de estudios cuyo propósito haya sido lacaracterización de las unidades de producción con hatos de bovinosde registro. Estos estudios son importantes, ya que permitendiseñar programas de mejoramiento genético exitosos y la transferenciade sus resultados a productores comerciales. El objetivode este estudio fue caracterizar los hatos Jersey de registro enMéxico. Se aplicó un cuestionario a la totalidad de los miembrosde la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Jersey deRegistro y se obtuvieron estadísticos descriptivos. La poblaciónde bovinos Jersey de registro en México es pequeña (aproximadamente4000 animales), se distribuye principalmente en elcentro del país y la mayoría de los hatos (85%) tienen un origenreciente (a partir de 1995). La selección en los hatos es escasa,las actividades de mejoramiento genético se enfocan a identificarlos animales y recolectar registros productivos; por lo que elprogreso genético es principalmente vía importaciones de semeny animales, generando dependencia técnica y económica de otrospaíses. A pesar de contar con evaluaciones genéticas nacionalesde los animales, su comercialización por criadores no es la actividadprincipal, por lo que la transferencia de material genéticosobresaliente a productores comerciales es escasa. La capacidadinstalada en animales, terrenos, e infraestructura y equipo es suficientepara implementar programas de mejoramiento genético.Los criadores de bovinos Jersey tienen en promedio 15 años deescolaridad y 24 de experiencia en la cría de bovinos

Comparación de definiciones de grupos contemporáneos en la evaluación genética de bovinos Suizo Europeo

Six alternatives of contemporary group (CG) definition for the genetic evaluation of weaning weight of Braunvieh cattle in Mexico were evaluated. Different alternatives of CG definition were formed by combining three minimum CG sizes (3, 7 or 10 records) and its consideration either as a fixed or random effect. The models included the direct and maternal genetic effects, their covariance, and permanent environment as random effects, and the linear and quadratic effects of cow age at calving as a covariate. The CG were formed by combining the effects of year and season of birth, calf's rearing condition, herd, and calf sex. The six alternatives of CG definition were compared using the descriptive statistics of the predicted breeding values and their accuracies, (co)variances and genetic parameters, and both the correlation between the predicted breeding values, and between their corresponding accuracies. On average, the accuracies of the direct genetic effects were slightly higher when CG was considered fixed than when it was fitted as random effect. For the maternal genetic effects there was no difference. The highest accuracies were obtained with a CG size of at least seven records. For both, the direct and maternal genetic effects, the CG size of seven records produced the highest heritability estimates, regardless of CG being fitted as fixed or random effect. The best alternative of contemporany group definition was a minimum of seven records and its inclusion as a fixed effect in the model for the genetic evaluation of this breed in Mexico.Se evaluaron seis alternativas para definir grupos contemporáneos (GC) en la evaluación genética nacional para peso al destete de bovinos Suizo Europeo en México. Los GC se formaron mediante la combinación de tres tamaños mínimos (3, 7 ó 10 registros) y su consideración como efecto fijo o aleatorio. Los modelos incluyeron los efectos aleatorios: genético directo y materno, su covarianza, y ambiente permanente. Además, se consideraron los efectos lineal y cuadrático de la covariable edad de la vaca al parto. Los GC se formaron combinando los efectos de año y época de nacimiento, condición de crianza, hato y sexo de la cría. Las seis alternativas de GC se compararon mediante: estadísticos descriptivos de los valores genéticos predichos y sus exactitudes, (co)varianzas y parámetros genéticos, y asociaciones entre los valores genéticos predichos, y entre las exactitudes correspondientes. Para los efectos genéticos directos, los promedios de exactitud fueron ligeramente mayores considerando GC como aleatorio en lugar de fijo, mientras que para los efectos genéticos maternos no hubo diferencias. Las exactitudes mayores se obtuvieron con un mínimo de siete registros por GC. Tanto para efectos genéticos directos como maternos, los estimadores de heredabilidad más altos se observaron con el tamaño mínimo de siete registros por GC, independientemente si los análisis lo consideraron como efecto fijo o aleatorio. La mejor alternativa de definición de grupos contemporáneos fue considerar un mínimo de siete registros y su inclusión como efecto fijo en los análisis genéticos para esta raza en México

Effects of Bos taurus gene percentage on reproductive performance of crossbred cows in the humid tropics of mexico

El objetivo fue determinar el porcentaje óptimo de genes Bos taurus (BT) para edad al primer parto (EPP), días al primer servicio (DPS), días abiertos (DA) e intervalo entre partos (IEP) de vacas cruzadas. La información analizada se originó de 1,704 lactancias completas de 677 vacas desde 100 % Bos indicus (BI) hasta 100 % BT de un rancho lechero típico mexicano de Tabasco.The objective of the present study was to determine the best possible percentage of Bos taurus (BT) genes on age-at-first-calving (AFC), days to first post-partum service (DFPS), days open (DO) and calving interval (CI) in crossbred cows. Data was collected in a typical commercial dairy farm of Tabasco

Análisis de pedigrí en la determinación de la diversidad genética de poblaciones bovinas para carne mexicanas

The objective of this study was to evaluate genetic diversity of seven Mexican beef cattle populations, using pedigree analyses. The analyses were carried out with the Endog software, using information of the registered animals on national herd-book of each breed. The size of the populations studied were: Angus (AN)= 73,271; Black Brangus (BN)= 68,474; Red Brangus (BR)= 12,925; Hereford (HE)= 13,248; Limousin (LI)= 53,221; Salers (SA)= 14,065; and Braunvieh (SE)= 184,788. In general, the populations showed important improvements in pedigree integrities for the more recent 10 yr, with comparative parameters to other published in cattle populations. The generation interval varied among breeds from 5.1 to 7.2 yr. The average inbreeding and relatedness coefficients were relatively low in the different populations (0.9-4.2 and 0.3-6.5 %, respectively); although increases of these indicators during the 10 more recent years were detected in some breeds (BN, BR and HE). The effective population size of studied populations fluctuated between 24 and 192, with values lower than 50 in BR and SA. The parameters related with probability of gene origin indicated that the unbalanced contribution of founders, the bottlenecks and genetic drift have had an important effect on the current populations with the consequent losses in genetic diversity. It is recommended to continue or adopt mating strategies that minimize inbreeding and the intensive use of few animals to maintain genetic variability in future generations, and to increase the genetic diversity through the strategical use of genes from other countries.El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad genética de siete poblaciones de bovinos para carne en México, mediante análisis de sus pedigríes. Los análisis se realizaron con el programa Endog, utilizando información de los animales inscritos en el libro genealógico nacional de cada raza. Los tamaños de los pedigríes estudiados fueron: Angus (AN)= 73,271; Brangus Negro (BN)= 68,474; Brangus Rojo (BR)= 12,925; Hereford (HE)= 13,248; Limousin (LI)= 53,221; Salers (SA)= 14,065; y Suizo Europeo (SE)= 184,788. En general, las poblaciones mostraron mejoras importantes en la integridad de sus pedigríes en los 10 años más recientes, con parámetros comparables a los publicados en otras poblaciones de bovinos. El intervalo generacional varió de 5.1 a 7.2 años entre razas. Los coeficientes de consanguinidad y de relación genética aditiva promedio fueron relativamente bajos en las diferentes poblaciones (0.9-4.2 y 0.3-6.5 %, respectivamente); aunque en algunas razas (BN, BR y HE) se detectaron incrementos de estos indicadores en los 10 años más recientes. El tamaño efectivo de población fluctuó entre 24 y 192, con valores menores que 50 en BR y SA. Los parámetros relacionados con la probabilidad de origen de los genes indican que las contribuciones desbalanceadas de los animales fundadores, los cuellos de botella y la deriva genética, han tenido un efecto importante en las poblaciones actuales, con la consecuente pérdida de diversidad genética. Se recomienda continuar o adoptar estrategias de apareamiento que minimicen la consanguinidad, y el uso intensivo de pocos animales para mantener la variabilidad genética de futuras generaciones, así como ampliar la diversidad genética mediante el uso estratégico de genes provenientes de otros países.

Clustering COVID-19 ARDS patients through the first days of ICU admission. An analysis of the CIBERESUCICOVID Cohort

Background Acute respiratory distress syndrome (ARDS) can be classified into sub-phenotypes according to different inflammatory/clinical status. Prognostic enrichment was achieved by grouping patients into hypoinflammatory or hyperinflammatory sub-phenotypes, even though the time of analysis may change the classification according to treatment response or disease evolution. We aimed to evaluate when patients can be clustered in more than 1 group, and how they may change the clustering of patients using data of baseline or day 3, and the prognosis of patients according to their evolution by changing or not the cluster.Methods Multicenter, observational prospective, and retrospective study of patients admitted due to ARDS related to COVID-19 infection in Spain. Patients were grouped according to a clustering mixed-type data algorithm (k-prototypes) using continuous and categorical readily available variables at baseline and day 3.Results Of 6205 patients, 3743 (60%) were included in the study. According to silhouette analysis, patients were grouped in two clusters. At baseline, 1402 (37%) patients were included in cluster 1 and 2341(63%) in cluster 2. On day 3, 1557(42%) patients were included in cluster 1 and 2086 (57%) in cluster 2. The patients included in cluster 2 were older and more frequently hypertensive and had a higher prevalence of shock, organ dysfunction, inflammatory biomarkers, and worst respiratory indexes at both time points. The 90-day mortality was higher in cluster 2 at both clustering processes (43.8% [n = 1025] versus 27.3% [n = 383] at baseline, and 49% [n = 1023] versus 20.6% [n = 321] on day 3). Four hundred and fifty-eight (33%) patients clustered in the first group were clustered in the second group on day 3. In contrast, 638 (27%) patients clustered in the second group were clustered in the first group on day 3.Conclusions During the first days, patients can be clustered into two groups and the process of clustering patients may change as they continue to evolve. This means that despite a vast majority of patients remaining in the same cluster, a minority reaching 33% of patients analyzed may be re-categorized into different clusters based on their progress. Such changes can significantly impact their prognosis

Effect of milk yield, number of calving and calving season on the resumption of postpartum ovarian activity in Hoistein cows

El objetivo fue evaluar el efecto de la producción de leche acumulada hasta el día 50 posparto (PL50), el número (NP) y época (EP) de parto sobre los intervalos para la aparición del primer folículo dominante (FD), la aparición del primer cuerpo lúteo (CL), el tiempo para completar la involución uterina (¡U), y la probabilidad de ovulación del primer FD. En vacas Hoistein con diferente NP que parieron en invierno o primavera en Tlahualilo, Durango, México. Ni la EP ni el NP afectaron los días a la aparición del primer FD (α =0,05). Sin embargo, el primer FD en vacas con alta PL50 se presentó dos días más tarde que en las de baja PL50 (13,6 vs 11,9 días; P<0,05). El NP, la EP y la PL50 no afectaron (α =0,05) la probabilidad de ovulación del primer FD. Sin embargo, las vacas con mejor condición corporal al parto fueron más aptas (OR = 9,0; P<0,05) que las de condición corporal pobre para desencadenar la ovulación del primer FD. La PL50 no afectó la aparición del primer CL después del parto (α=0,05); sin embargo, las vacas de cuatro o más partos presentaron un primer CL más tarde (P<0,05) que las de menor NP. Las vacas que parieran en invierno presentaron un primer CL más tarde que las que parieron en primavera (20 vs 16 días; P<0,01). Sin embargo, las vacas paridas en primavera requirieron más días que las paridas en invierno para completar la IU (36 vs 32 días; P<0,05). Se concluye que el crecimiento folicular ovárico no es el principal factor limitarte para el reinicio de la actividad ovárica posparto en vacas Holsteir manejadas en las condiciones del presente experimento.548 - 558BimestralThe objective of the study was to evaluate the effect of accumulated milk yield from calving to day 50 of lactation (MY50), number (NC) and season (SG) of calving on the intervals from calving to the appearance of the first dominant follicle (DF), the appearance of the first corpus luteum (CL), the time to completion of uterine involution (UI), and the probability of ovulation of the first DF in Holstein cows calving in spring or winter in a commercial dairy farm in Tlahualilo, Durango, México. Neither SO nor NO affected the appearance of the first DF (α =0.05). However, cows with higher MY50 presented the first DF two days latter than cocas with low MY50 (13.6 vs 11.9 days; P<0.05). The effects of NO, SO, and MY50 did not affect the probability of ovulation of the first DF (α =0.05). However, cows with higher body condition score at calving (BCS X3.6 units) were more likely (OR = 9.0; P<0.05) to achieve ovulation in the first DF than cows with lower BCS. The appearance of the first CL after calving was not affected by MY50; however, cows with four or more calvings showed their first CL later (P<0.05) than younger cows. Likewise, cows calving in winter showed their first CL later than those calving in spring (20 vs 16 days; P<0.01). However, cows calving in spring required longer time intervals to complete their UI (36 vs 32 days; P<0.05). It is concluded that follicular growth is not the main limiting factor to the resumption of postpartum ovarian activity in Holstein cows managed under the conditions of the present experiment