Rice Farming and Chinese Civilization: Renovation of Integrated Studies of Rice-based Civilizations

金沢大学国際文化資源学研究センター本年度は、広富林遺跡出土人骨69点、良渚遺跡出土人骨20点、田螺山遺跡出土人骨15点、河姆渡遺跡出土人骨5点から歯エナメル質粉末を採取し、ストロンチウム同位体比に基づいた移入者の識別を試みた。昨年度では、広富林の良渚文化期及びスウタク文化期で女性のみが移入者であることが示されてきたが、場所が大きく異なるものの良渚遺跡の良渚文化期でも女性のみが移入個体であった。一方、同一地質帯であるが、時代が古い田螺山・河姆渡は男女ともに移入個体と評価される個体は検出されなかった。この様に、約5000年以上前の女性が選択的に移入していたという科学的なデータに基づいた証拠は、世界においても最古の事例と言え、極めて重要な発見と言える。さらに、歯エナメル質の酸素・炭素同位体比を測定し、酸素同位体比が極めて低く、黄河以北の文化圏から直接的にヒトが移入してきている可能性が示された。この低い酸素同位体比を示す個体は、炭素同位体比が非常に重く、C4植物を主食とする文化圏の人々が持つ同位体比の範囲に収まった。中国において主食として利用されているC4植物として雑穀類のアワが有名である。ストロンチウム・酸素・炭素同位体比の結果は、遠距離地域出身の人が、直接的に長江下流域に移動し、移動した地で亡くなったというライフヒストリーを表している。従来の考古学では、物の流れでは直接的に遠方からの移入を示すことができていなかったが、直接的にヒトの長距離移動を復元した例は、東アジアにおいて本研究が初出となった。これらの結果は、日本人類学会及び文化財科学会で学会発表し、両学会発表賞を得た。現在、海外学術誌へ投稿準備を進めている。研究課題/領域番号:16H00743, 研究期間(年度):2016-04-01 – 2018-03-3

Reconstruction of Horse Breeding in Asuka/Fujiwara Period Using Isotope Geochemistry

学位の種別:課程博士University of Tokyo(東京大学

Rice Farming and Chinese Civilization: Renovation of Integrated Studies of Rice-based Civilizations

金沢大学新学術創成研究機構本年度は、Sr精製装置の流路部分における調整と、装置操作のためのGUIプログラムの開発を進めた。当初の開発計画ではマイクロ流路を用いたOn-Chipタイプのプラスチックマイクロ流路を使用することになっていたが、マイクロ流路の内径ではSrの分離効率が悪いことがわかり、内径をより大きくすることで改善した。10サンプル同時精製のために流路改善を実施し、一定圧力による緩衝液フローの調整を行った。この装置を用いて、遺跡出土の歯エナメル質の前処理を実施し、Sr精製物を得た。従来法の自重落下タイプのアフィニティクロマトグラフィーよりも迅速に前処理が可能となり、現地における多検体のSr精製が可能になる見通しがついた。実際に現地において本装置を使用する際に、高温多湿・低温低湿環境下での極限環境使用の可能性も考慮する必要があるため、多様な条件を考慮した精製効率の検討を進めた。研究課題/領域番号:18H04177, 研究期間(年度):2018-04-01 – 2020-03-31出典：研究課題「IoT技術を用いた超小型歯エナメル質自動前処理装置の開発とその応用」課題番号18H04177（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-18H04177/）を加工して作

First molecular data of the Borneo Banteng Bos Javanicus lowi from Sabah, Borneo

Phylogenetic relationships among three subspecies of banteng, Burma banteng Bos javanicus birmanicus in mainland Southeast Asia, Javan banteng Bos javanicus javanicus in Java, and Bornean banteng Bos javanicus lowi in Borneo, and the presence/absence of interbreeding between wild Bornean banteng and domestic cattle in Sabah, Malaysia, were investigated by partial sequences of cytochrome b and D-loop of mitochondrial DNA. The results show that genetic distance of the Bornean banteng are relatively close to the gaur Bos gaurus/gayal Bos frontalis (the cytochrome b, 0.004–0.025; the D-loop, 0.012–0.021) followed by Burma banteng (the cytochrome b, 0.027–0.035; the D-loop, 0.040–0.045), and kouprey Bos sauveli (the cytochrome b, 0.031–0.035; the D-loop, 0.037–0.042). There are much greater distances between Bornean banteng and domestic cattle, Bos taurus and Bos indicus (the cytochrome b, 0.059–0.076; the D-loop, 0.081–0.090). These results suggest that the Bornean banteng diverged genetically from other banteng subspecies and that the wild Bornean banteng from this study are pure strain and have high conservation value

First molecular data on Bornean banteng Bos javanicus lowi (Cetartiodactyla, Bovidae) from Sabah, Malaysian Borneo

Phylogenetic relationships among three subspecies of banteng, Burma banteng Bos javanicus birmanicus in mainland Southeast Asia, Javan banteng Bos javanicus javanicus in Java, and Bornean banteng Bos javanicus lowi in Borneo, and the presence/absence of interbreeding between wild Bornean banteng and domestic cattle in Sabah, Malaysia, were investigated by partial sequences of cytochrome b and D-loop of mitochondrial DNA. The results show that genetic distance of the Bornean banteng are relatively close to the gaur Bos gaurus/gayal Bos frontalis (the cytochrome b, 0.004–0.025; the D-loop, 0.012–0.021) followed by Burma banteng (the cytochrome b, 0.027–0.035; the D-loop, 0.040–0.045), and kouprey Bos sauveli (the cytochrome b, 0.031–0.035; the D-loop, 0.037–0.042). There are much greater distances between Bornean banteng and domestic cattle, Bos taurus and Bos indicus (the cytochrome b, 0.059–0.076; the D-loop, 0.081–0.090). These results suggest that the Bornean banteng diverged genetically from other banteng subspecies and that the wild Bornean banteng from this study are pure strain and have high conservation value

Ancient Jomon genome sequence analysis sheds light on migration patterns of early East Asian populations

Anatomically modern humans reached East Asia more than 40,000 years ago. However, key questions still remain unanswered with regard to the route(s) and the number of wave(s) in the dispersal into East Eurasia. Ancient genomes at the edge of the region may elucidate a more detailed picture of the peopling of East Eurasia. Here, we analyze the whole-genome sequence of a 2,500-year-old individual (IK002) from the main-island of Japan that is characterized with a typical Jomon culture. The phylogenetic analyses support multiple waves of migration, with IK002 forming a basal lineage to the East and Northeast Asian genomes examined, likely representing some of the earliest-wave migrants who went north from Southeast Asia to East Asia. Furthermore, IK002 shows strong genetic affinity with the indigenous Taiwan aborigines, which may support a coastal route of the Jomon-ancestry migration. This study highlights the power of ancient genomics to provide new insights into the complex history of human migration into East Eurasia

遺跡出土馬のゲノムワイド解析に基づく日本列島馬の起源と交雑史に関する研究

金沢大学人間社会研究域附属国際文化資源学研究センター本研究は日本列島において古くから飼育されてきた家畜馬の起源と系統の一端を解明することを目的として、現生日本在来馬および遺跡出土馬からゲノムデータを取得し、分子系統解析と他地域との混血の影響の可視化を試みた。古墳時代・古代・中世・近世・近代における遺跡出土馬の全ゲノムデータから日本列島馬の遺伝的ヒストリーを初めて評価した。さらに、ロシア沿海州・モンゴル・中国の遺跡出土馬のゲノムデータを取得し、各地域からの遺伝的寄与について評価を行った。The goal of this study was to clarify the origins and genealogy of domestic horses that have been bred in the Japanese archipelago since the past. We obtained genomic data from eight Japanese native horses and horse remains excavated from archaeological sites, and carried out molecular phylogenetic analysis and visualized the effects of admixture with other regions. Genomic data from horse remains in the Kofun, Nara, medieval, early modern, and modern periods allowed us to evaluate the genetic affinities between horses in the Japanese archipelago. In addition, we obtained genomic data of horse remains excavated from archaeological sites in Primorsky Region, Russia, Mongolia and China, and evaluated the genetic contribution from each region.研究課題/領域番号:18H00755, 研究期間(年度):2018-04-01 – 2021-03-31出典：「遺跡出土馬のゲノムワイド解析に基づく日本列島馬の起源と交雑史に関する研究」研究成果報告書　課題番号18H00755（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/ja/report/KAKENHI-PROJECT-18H00755/18H00755seika/）を加工して作