Avaliação preliminar da PCR em tempo real na detecção de fatores de virulência de Escherichia coli patogênica em aves

A caracterização de cepas patogênicas de Escherichia coli em aves pode ser realizada pela detecção de fatores de virulência (iss, iutA, iroN, ompT e hlyF) através da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). O objetivo do presente trabalho foi desenvolver uma metodologia mais prática e rápida para detecção dos mesmos fatores através da PCR em tempo real (qPCR). Foram analisados através da nova técnica 112 isolados de E. coli previamente caracterizados por PCR convencional. Até o momento, verificou-se 100% de concordância na análise de iroN, ompT e hlyF. Observou-se, porém, uma grande incidência de falsos resultados positivos na detecção de iss e iutA. O presente trabalho indica que a técnica de qPCR apresenta um grande potencial na caracterização de isolados de E. coli

Performance of direct immunofluorescence assay for the detection of human metapneumovirus under clinical laboratory settings

ABSTRACT INTRODUCTION: Human metapneumovirus (hMPV) is an emergent human respiratory pathogen. This study aimed to evaluate the performance of direct immunofluorescence (DIF) to detect hMPV in a clinical laboratory setting. METHODS: Nasopharyngeal aspirate samples (448) of children and adults with respiratory illness were used to detect hMPV by using DIF and real time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) assays. RESULTS: In all, 36 (8%) samples were positive by DIF and 94 (21%) were positive by qRT-PCR. Direct immunofluorescence specificity was 99% and sensitivity was 38%. CONCLUSIONS: DIF is not very sensitive under clinical laboratory settings

Oseltamivir-resistant influenza A(H1N1)pdm09 virus in southern Brazil

The neuraminidase (NA) genes of A(H1N1)pdm09 influenza virus isolates from 306 infected patients were analysed. The circulation of oseltamivir-resistant viruses in Brazil has not been reported previously. Clinical samples were collected in the state of Rio Grande do Sul (RS) from 2009-2011 and two NA inhibitor-resistant mutants were identified, one in 2009 (H275Y) and the other in 2011 (S247N). This study revealed a low prevalence of resistant viruses (0.8%) with no spread of the resistant mutants throughout RS