7 research outputs found

    Détection rapide des carbapénémases et des bactéries ESKAPEEc

    Get PDF
    Introduction. Carbapenems have been the ultimate antibiotics for the treatment of infections caused by multidrug-resistant bacteria. However, recently, carbapenems-resistant bacteria have emerged significantly. The objective of the study was the identification of ESKAPEEc bacteria and rapid detection of carbapenemase production. Materials and methods. We tried a novel rapid test methodology that detects some carbohydrates metabolization associated with bacterial growth in the presence of imipenem. The formation of acid metabolites is evidenced by a color change of a pH indicator. Results. Carbapenemase production is phenotypically demonstrated in carbapenem-resistant bacterial strains. In the study, carbapenemase production was detected within 3 hours, and identification of ESKAPEEc bacteria was completed within 4 hours by carbohydrate metabolism. Conclusions. In conclusion, our cost-effective technique may provide a practical solution for the determination of multi-drug resistance by using the fermentation metabolism in bacteria.Introduction. Les carbapénèmes sont les antibiotiques de dernière génération pour le traitement des infections causées par des bactéries multirésistantes. Cependant, récemment, des bactéries résistantes aux carbapénèmes ont émergé de manière significative. L’objectif de l’étude. Nous visons une étude préliminaire pour l’identification des souches pathogènes de la bactérie ESKAPEEc et la détection rapide de la production de carbapénémase. Matériel et méthodes. Nous avons essayé une nouvelle méthodologie de test rapide qui détecte la métabolisation de certains glucides associée à la croissance bactérienne en présence d’imipénème. La formation de métabolites acides est mise en évidence par un changement de couleur d’un indicateur de pH. Résultats. La production de carbapénémase est phénotypiquement démontrée dans des souches bactériennes résistantes aux carbapénèmes. Dans l’étude, la production de carbapénémase a été détectée dans 3 heures et l’identification des bactéries ESKAPEEc a été achevée dans 4 heures par le métabolisme des glucides. Conclusions. Cette technique rentable peut fournir une solution pratique pour la détermination de la résistance multi-médicamenteuse en utilisant le métabolisme de fermentation chez les bactéries

    Kan kültürlerinden izole edilen difteri-dışı corynebacterium suşlarının biyofilm oluşturması ve antimikrobiyal duyarlılıkları: Türkiye’deki ilk bildirim

    Get PDF
    Objective: Non-diphtheriae Corynebacterium strains have been recognized as important pathogens after decades of confusion regarding their microbiological classification and clinical significance. The aim of this study was to identify non-diphtheriae Corynebacterium strains and the prevalence of biofilm formation and antimicrobial resistance. Method: In total, 126 non-diphtheriae Corynebacterium strains were isolated from blood cultures of inpatients with bacteremia in our hospital between January 2015 and January 2020. Blood cultures were analyzed with the Bactec-9120 system. Strains were identified using MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Germany). Antimicrobial susceptibilities were determined using the Kirby-Bauer disk diffusion method on a Mueller-Hinton agar and evaluated according to EUCAST standards. Biofilm formation was assessed with the Congo Red Agar method. Results: Corynebacterium striatum and Corynebacterium matruchotii were the most prevalent with 29 and 26 isolates, respectively. Biofilm production was detected in 62.06% (18/29) of C. striatum, in 53.8% (14/26) of C. matruchotii, in 50% (9/18) of Corynebacterium afermentans, 50% (6/12) of Corynebacterium amycolatum, and in 46% (7/15) of Corynebacterium jeikeium strains. Among the five most prevalent strains, we found a high biofilm rate of 54%. The resistance rates to penicillin, clindamycin, ciprofloxacin, rifampicin, tetracycline, and gentamicin were 91.2%, 87.3%, 79.3%, 56.3%, 45.2%, and 39.6%, respectively. All 126 strains were susceptible to vancomycin and linezolid. Conclusion: Non-diphtheriae Corynebacterium strains isolated from blood cultures of hospitalized patients with bacteremia may have multidrug resistance and the ability to produce biofilm. These results emphasize the importance of identifying strains and determining their antimicrobial susceptibility and biofilm production potential.Amaç: Difteri-dışı Corynebacterium suşları, mikrobiyolojik sınıflandırmaları ve klinik önemi ile onlarca yıllık kafa karışıklığının ardından önemli patojenler olarak kabul edilmiştir. Bu çalışmanın amacı, difteri-dışı Corynebacterium suşlarının tür tayinin yapılması, biyofilm oluşumu ve antimikrobiyal direnç prevalansını araştırmaktır. Yöntem: Ocak 2015-Ocak 2020 tarihleri arasında hastanemizde yatarak tedavi gören bakteriyemili hastaların kan kültürlerinden difteri olmayan 126 Corynebacterium suşu izole edildi. Kan kültürleri Bactec-9120 sistemi ile analiz edildi. Suşların tanımlanması MALDI-TOF MS (Bruker Daltonics, Almanya) kullanılarak yapıldı. Antimikrobiyal duyarlılıklar Mueller-Hinton agarda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle belirlendi ve EUCAST standartlarına göre değerlendirildi. Biyofilm oluşumu Congo Red Agar yöntemi ile değerlendirildi. Bulgular: Difteri-dışı Corynebacterium suşları arasında Corynebacterium striatum ve Corynebacterium matruchotii sırasıyla 29 ve 26 izolatla en yaygın suşlardı. Biyofilm üretimi C. striatum suşlarında %62,06 (18/29), C. matruchotii suşlarında %53,8 (14/26), Corynebacterium afermentans suşlarında %50 (9/18), Corynebacterium amycolatum suşlarında %50 (6/12) ve Corynebacterium jeikeium suşlarında %46 (7/15) olarak tespit edilmiştir. Çalışmanın en sık izole edilen ilk beş suşunda, %54 gibi yüksek bir biyofilm oranı bulduk. Penisilin, klindamisin, siprofloksasin, rifampisin, tetrasiklin ve gentamisine direnç oranları sırasıyla %91,2, %87,3, %79,3, %56,3, %45,2 ve %39,6 olarak tespit edildi. 126 suşun tamamı vankomisin ve linezolide duyarlıydı. Sonuç: Bu sonuçlar, hastanede yatan bakteriyemili hastaların kan kültürlerinden izole edilen Corynebacterium suşlarının biyofilm oluşturma yeteneğiyle birlikte çoklu-ilaç direnci gösterdiklerini ve kontaminasyon olarak göz ardı edilmemesi için, tür tayini ve antibiyotik duyarlılığının belirlenmesinin önemini vurgulamaktadır

    Hidden Danger: Superbug escherichia coli isolated from urine isolates of outpatient women with uncomplicated urinary tract infection

    Get PDF
    BACKGROUND/AIMSEscherichia coli (E. coli) is responsible for the vast majority of uncomplicated bacterial urinary tract infection (UTI) cases in women. The high ability of the isolates to develop antimicrobial resistance makes the treatment difficult. In this study, we investigated the presence of plasmid-medial ed quinolone resistance (PMQR) genes in E. coli isolates and their relationship with extended-spectrum beta-lactomoses (ESBL).MATERIAL and METHODSA total of 300 E. coli isolates from urine specimens of women, including 108 ESBL producers and 192 non-ESBL producers, were analyzed. The ESBL production was examined using the E-test ESBL strips, and the carbapenemase activity was examined using the CarbaNP test. The presence of PMQR genes (qnrA, qnrB, qnrS, and aac (6')-lb)among urine isolates was investigated using polymerase chain reaction. Conjugation experiments were performed to detect the horizontal transferability of the PMQR-positive plasmid.RESULTSAmong the ESBL-EC isolates, ciprofloxacin resistance was determined at 69%. Eight isolates were resistant to carbapenems. The aac(6')-lb-crvariant was found in 40% of ciprofloxacin-resistant E. coli isolates. None of the isolates harbored the qnrA, qnrB, or qnrS gene. The transferability was 14% for aac(6)-lb-cr. The MICs of transconjugonts showed increased resistance to fluoroquinolones compared with the recipient E. coli-153AzR.CONCLUSION: This study showed that the frequency of PMQR genes in ESBL-producing superbug E. coli isolates reduced therapeutic options for treating community-acquired UTIs in affected women and that a careful use of antibiotics is very important

    İstanbul’da yaşayan sağlıklı çocuklarda potansiyel patojen bakterilerin nazofarengeal taşıyıcılığın araştırılması

    Get PDF
    Aim: The purpose of this study was to determine the prevalence of nasopharyngeal carriage of potentially pathogenic bacteria (especially Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis) in healthy 1-7 years old children and risk factors affecting it.Methods: A total of four hundred forty-five healthy children (1-7 years old) from the European side of Istanbul (10 different units) were included in this cross-sectional study. Isolated microorganisms were identified by standard laboratory methods and the results were evaluated. Risk factors affecting the prevalence of nasopharyngeal carriage were also evaluated.Results: In the study, 139 (31.2%) of the samples were positive. S. pneumoniae two (0.4%), H. influenzae 50 (11.2%); of them type b 10 (2.2%), H. parainfluenzae 10 (2.2%), M. catarrhalis 14 (3.1%), S. aureus 35 (7.9%), Group A beta hemolytic streptococci (Streptococcus pyogenes) 13 (2.9%), Group B streptococci (S. agalactiae) 18 (4.0%), Non A Non B streptococci 16 (3.6%) were detected. The results obtained from different sites (places) were found to be variable in terms of pathogen density.Conclusion: Nasopharyngeal carriage rates found in our study were generally lower than in some studies on this subject. However, when the samples taken from different places were evaluated one by one, it was seen that the colonization rate reached 45.9% in crowded and poor building properties (small, poorly ventilated, unhealthy buildings). The highest rate of H. influenzae carriage in the 2-3 age group was 33.3%. In this study, crowded and unhealthy school environments and low maternal education level have been determined as risk factors for increased nasopharyngeal carriage rate. Results of such studies vary depending on the region, sample frequency, individual and social factors. Further studies are needed in order to achieve healthier results.Amaç: Bu çalışmada sağlıklı 1-7 yaş çocuklarda (Streptococcuspneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis başta olmak üzere) potansiyel patojen bakterilerin nazofaringeal taşıyıcılık prevalansının ve bunu etkileyen risk faktörlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Bu kesitsel çalışmaya İstanbul Avrupa yakasından(10 farklı birimden) 1-7 yaş grubu toplam dört yüz kırk beş sağlıklı çocuk dahil edildi. İzole edilen mikroorganizmalar standart laboratuvar yöntemleri ile tanımlanarak elde edilen sonuçlardeğerlendirildi. Ayrıca, nazofaringeal taşıyıcılık prevalansınıetkileyen risk faktörleri değerlendirildi.Bulgular: Çalışılan örneklerin 139’u (%31,2) pozitifti. S.pneumoniae iki (%0,4), H. influenzae 50 (%11,2); bunlardan tip b 10 (%2,2), Haemophilus parainfluenzae 10 (%2,2), M. catarrhalis 14 (%3,1), S. aureus 35 (%7,9), A grubu β hemolitik streptokok (Streptococcus pyogenes) 13 (%2,9), B Grubu streptokok (S. agalactiae) 18 (%4,0), Non A Non B streptokok16 (%3,6) oranlarında tespit edildi. Farklı yerlerden elde edilen sonuçlarda, patojen yoğunluğunun ve çeşitliliğinin değişken olduğu görüldü. Sonuç: Çalışmamızda tespit edilen nazofaringeal taşıyıcılık oranları bu konuda yapılmış bazı çalışmalara göre düşük bulundu. Ancak örnek alınan farklı kurumlar tek tek değerlendirildiğinde, mevcudu fazla ve bina özellikleri kötü olan yerlerde (kalabalık, küçük, havalandırılması iyi yapılamayan, sağlıksız binalar) oranın%45,9’a kadar ulaştığı görüldü. H. influenzae taşıyıcılığında ise2-3 yaş grubunda en yüksek oranı %33,3 olarak tespit edildi. Bu tür çalışmaların sonuçları bölgeye, örnekleme sıklığına, bireysel ve sosyal faktörlere göre değişiklik göstermektedir. Daha sağlıklı sonuçlara ulaşmak için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.Istanbul Universit

    Distribution of blaOXA genes in Acinetobacter baumannii strains: A multicenter study

    Get PDF
    Acinetobacter cinsi içerisinde hastane enfeksiyonlarının en önemli etkeni Acinetobacter baumannii’dir. Bu gram-negatif kokobasil, antimikrobiyal tedavide kullanılan çoğu antibiyotiğe dirençli olup aynı zamanda karbapenemlere de direnç geliştirme kapasitesindedir. Bu çalışmanın amacı, A.baumannii’nin OXA alt grupları için multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) kiti tasarlamak ve Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanan A.baumannii izolatlarında OXA alt gruplarının dağılımını araştırmaktır. Çalışmaya, çeşitli illerdeki (Afyonkarahisar, Ankara, Bolu, Elazığ, Erzurum, Isparta, İstanbul, Kahramanmaraş, Konya, Sakarya, Van) 13 üniversite ve devlet hastanesinin mikrobiyoloji laboratuvarlarında, 2008-2011 tarihleri arasında izole edilen toplam 834 A.baumannii klinik izolatı dahil edilmiştir. İzolatlar, konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemler [Vitek2 (bioMerieux, ABD) ve Phoenix (BD Diagnostic, MD)] kullanıla- rak tanımlanmış; duyarlılık testleri otomatize sistemler ve disk difüzyon yöntemiyle yapılmıştır. Tüm örnek- lere blaOXA-51-like, blaOXA-23-like ve blaOXA-58-like genleri için qPCR uygulanmış; ayrıca, blaOXA-24-like geni araştırılmasında konvansiyonel PCR yöntemi kullanılmıştır. Çalışmamızda saptanan antibiyotik direnç oranları; amoksisilin-klavulanat için %96.8, siprofloksasin için %86.8, gentamisin için %74.7, amikasin için %71.7, sefaperazon-sulbaktam için %73.5, imipenem için %72.1 ve meropenem için %73 olarak izlenmiştir. Altı yüz iki (%72.2) izolat hem imipenem hem de meropeneme dirençli bulunmuştur. A.baumannii izolatları için en etkili antibiyotiğin, %100 duyarlılık oranı ile kolistin olduğu görülmüştür. İzolatların tümünde bla-geni pozitif bulunmuş; ancak blaOXA-24-like geni hiçbir izolatta gösterilememiştir. Toplam blaOXA-23- OXA-51-like ve blaOXA-58-like gen pozitiflikleri sırasıyla %53.7 ve %12.5 olarak saptanmıştır. Karbapeneme dirençli izolike latların blaOXA-23-like ve blaOXA-58-like gen pozitiflikleri ise sırasıyla %74.4 ve %17.3 olarak tespit edilmiştir. Yir- mi beş izolat hem blaOXA-23-like hem de blaOXA-58-like gen pozitifliği göstermiştir. blaOXA-24-like hariç, karbapeneme dirençli izolatların tamamında OXA tipi genler saptanmıştır. Çalışmaya katılan merkezlerin blaOXA-23- ve blaOXA-58-like gen pozitiflik oranları farklı bulunmuştur. Ek olarak, çalışma sürecinde blaOXA-58-like gen like pozitifliği azalırken, blaOXA-23-like gen pozitifliği ile birlikte karbapenem direncinin arttığı belirlenmiştir. So- nuç olarak, karbapenemler dahil antimikrobiyal tedavide kullanılan çoğu antibiyotiğe yüksek direnç gös- teren A.baumannii izolatlarının kolistine duyarlılığı devam etmektedir. Hem blaOXA-23-like hem de blaOXA-58- genleri karbapeneme dirençli A.baumannii klinik izolatlarında oldukça yaygın olmakla birlikte, yıllar için- like deki blaOXA-23-like pozitif izolatların artışı dikkat çekicidir. Günümüzde, hastane kaynaklı enfeksiyonların ön- lenmesi için dirençli bakterilerin hızlı tanısında, multipleks qPCR en uygun yöntemdir. Bu çalışmada geliştirilen multipleks qPCR kiti karbapeneme dirençli A.baumannii klinik izolatlarında blaOXA-23-like, blaOXA-58-like ve blaOXA-51-like genlerinin hızlı tanısı ve sıklığının ortaya konmasında yararlı olabilir.Acinetobacter baumannii is the most important agent of nosocomial infections within the Acinetobac- ter genus. This gram-negative coccobacillus is intrinsically resistant to many antibiotics used in antimic- robial therapy, and capable of developing resistance including carbapenems. The objective of this study was to develop a multiplex real time polymerase chain reaction (qPCR) kit for OXA subgroups in A.ba- umannii, and to investigate the distribution of OXA subgroups in A.baumannii strains isolated from ge- ographically different regions of Turkey. A total of 834 A.baumannii clinical isolates collected from diffe- rent state and university medical centers in 13 provinces (Afyonkarahisar, Ankara, Bolu, Elazig, Erzurum, Isparta, Istanbul, Kahramanmaras, Konya, Sakarya, Van) between 2008-2011, were included in the study. The isolates were identified by conventional methods and automated systems [Vitek2 (bioMeri- eux, ABD) and Phoenix (BD Diagnostic, MD)]. The susceptibility profiles of the isolates were studied with automated systems and standard disc diffusion method. All samples were subjected to qPCR to detect blaOXA-51-like, blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes. A conventional PCR method was also used to detect bla- gene. The resistance rates observed during the study period were as follows: 96.8% for amo- OXA-24-like xicillin-clavulanate, 86.8% for ciprofloxacin, 74.7% for gentamicin, 71.7% for amikacin, 73.5% for ce- faperozone-sulbactam, 72.1% for imipenem and 73% for meropenem. Six hundred and two (72.2 %) isolates were resistant to both imipenem and meropenem. Colistin was found to be the most effective antibiotic against A.baumannii isolates with 100% susceptibility rate. All isolates were positive for blaOXA- gene, however blaOXA-24-like gene could not be demonstrated in any isolate. Total positivity rates of 51-like blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes were found as 53.7% and 12.5%, respectively, while these rates we- re 74.4% and 17.3% in carbapenem-resistant isolates, respectively. Twenty-five isolates were positive for both blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes. All of the carbapenem-resistant isolates have OXA type genes with the exception of blaOXA-24-like gene. The positivity rates for blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes vari- ed for each center. In addition, there was a decrease in the frequency of blaOXA-58-like gene, however both blaOXA-23-like gene and carbapenem resistance rates increased during the study period. In conclusion, high rates of resistance to carbapenems were also remarkable but A.baumannii strains keep on sensiti- vity to colistin. Both blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes were shown to be widespread in carbapenem- resistant A.baumannii clinical isolates. However, blaOXA-23-like gene positive strains were increased throug- hout the study. Currently, multiplex qPCR is the best way for rapid diagnosis of resistant bacteria for pre- vention of hospital-acquired infections. The multiplex qPCR kit developed in this study could be useful for rapid diagnosis and identify the frequencies of blaOXA-23-like, blaOXA-51-like and blaOXA-58-like genes in car- bapenem-resistant A.baumannii clinical isolates

    Distribution of blaOXA genes in Acinetobacter baumannii strains: A multicenter study

    No full text
    Acinetobacter cinsi içerisinde hastane enfeksiyonlarının en önemli etkeni Acinetobacter baumannii’dir. Bu gram-negatif kokobasil, antimikrobiyal tedavide kullanılan çoğu antibiyotiğe dirençli olup aynı zamanda karbapenemlere de direnç geliştirme kapasitesindedir. Bu çalışmanın amacı, A.baumannii’nin OXA alt grupları için multipleks gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) kiti tasarlamak ve Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanan A.baumannii izolatlarında OXA alt gruplarının dağılımını araştırmaktır. Çalışmaya, çeşitli illerdeki (Afyonkarahisar, Ankara, Bolu, Elazığ, Erzurum, Isparta, İstanbul, Kahramanmaraş, Konya, Sakarya, Van) 13 üniversite ve devlet hastanesinin mikrobiyoloji laboratuvarlarında, 2008-2011 tarihleri arasında izole edilen toplam 834 A.baumannii klinik izolatı dahil edilmiştir. İzolatlar, konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemler [Vitek2 (bioMerieux, ABD) ve Phoenix (BD Diagnostic, MD)] kullanıla- rak tanımlanmış; duyarlılık testleri otomatize sistemler ve disk difüzyon yöntemiyle yapılmıştır. Tüm örnek- lere blaOXA-51-like, blaOXA-23-like ve blaOXA-58-like genleri için qPCR uygulanmış; ayrıca, blaOXA-24-like geni araştırılmasında konvansiyonel PCR yöntemi kullanılmıştır. Çalışmamızda saptanan antibiyotik direnç oranları; amoksisilin-klavulanat için %96.8, siprofloksasin için %86.8, gentamisin için %74.7, amikasin için %71.7, sefaperazon-sulbaktam için %73.5, imipenem için %72.1 ve meropenem için %73 olarak izlenmiştir. Altı yüz iki (%72.2) izolat hem imipenem hem de meropeneme dirençli bulunmuştur. A.baumannii izolatları için en etkili antibiyotiğin, %100 duyarlılık oranı ile kolistin olduğu görülmüştür. İzolatların tümünde bla-geni pozitif bulunmuş; ancak blaOXA-24-like geni hiçbir izolatta gösterilememiştir. Toplam blaOXA-23- OXA-51-like ve blaOXA-58-like gen pozitiflikleri sırasıyla %53.7 ve %12.5 olarak saptanmıştır. Karbapeneme dirençli izolike latların blaOXA-23-like ve blaOXA-58-like gen pozitiflikleri ise sırasıyla %74.4 ve %17.3 olarak tespit edilmiştir. Yir- mi beş izolat hem blaOXA-23-like hem de blaOXA-58-like gen pozitifliği göstermiştir. blaOXA-24-like hariç, karbapeneme dirençli izolatların tamamında OXA tipi genler saptanmıştır. Çalışmaya katılan merkezlerin blaOXA-23- ve blaOXA-58-like gen pozitiflik oranları farklı bulunmuştur. Ek olarak, çalışma sürecinde blaOXA-58-like gen like pozitifliği azalırken, blaOXA-23-like gen pozitifliği ile birlikte karbapenem direncinin arttığı belirlenmiştir. So- nuç olarak, karbapenemler dahil antimikrobiyal tedavide kullanılan çoğu antibiyotiğe yüksek direnç gös- teren A.baumannii izolatlarının kolistine duyarlılığı devam etmektedir. Hem blaOXA-23-like hem de blaOXA-58- genleri karbapeneme dirençli A.baumannii klinik izolatlarında oldukça yaygın olmakla birlikte, yıllar için- like deki blaOXA-23-like pozitif izolatların artışı dikkat çekicidir. Günümüzde, hastane kaynaklı enfeksiyonların ön- lenmesi için dirençli bakterilerin hızlı tanısında, multipleks qPCR en uygun yöntemdir. Bu çalışmada geliştirilen multipleks qPCR kiti karbapeneme dirençli A.baumannii klinik izolatlarında blaOXA-23-like, blaOXA-58-like ve blaOXA-51-like genlerinin hızlı tanısı ve sıklığının ortaya konmasında yararlı olabilir.Acinetobacter baumannii is the most important agent of nosocomial infections within the Acinetobac- ter genus. This gram-negative coccobacillus is intrinsically resistant to many antibiotics used in antimic- robial therapy, and capable of developing resistance including carbapenems. The objective of this study was to develop a multiplex real time polymerase chain reaction (qPCR) kit for OXA subgroups in A.ba- umannii, and to investigate the distribution of OXA subgroups in A.baumannii strains isolated from ge- ographically different regions of Turkey. A total of 834 A.baumannii clinical isolates collected from diffe- rent state and university medical centers in 13 provinces (Afyonkarahisar, Ankara, Bolu, Elazig, Erzurum, Isparta, Istanbul, Kahramanmaras, Konya, Sakarya, Van) between 2008-2011, were included in the study. The isolates were identified by conventional methods and automated systems [Vitek2 (bioMeri- eux, ABD) and Phoenix (BD Diagnostic, MD)]. The susceptibility profiles of the isolates were studied with automated systems and standard disc diffusion method. All samples were subjected to qPCR to detect blaOXA-51-like, blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes. A conventional PCR method was also used to detect bla- gene. The resistance rates observed during the study period were as follows: 96.8% for amo- OXA-24-like xicillin-clavulanate, 86.8% for ciprofloxacin, 74.7% for gentamicin, 71.7% for amikacin, 73.5% for ce- faperozone-sulbactam, 72.1% for imipenem and 73% for meropenem. Six hundred and two (72.2 %) isolates were resistant to both imipenem and meropenem. Colistin was found to be the most effective antibiotic against A.baumannii isolates with 100% susceptibility rate. All isolates were positive for blaOXA- gene, however blaOXA-24-like gene could not be demonstrated in any isolate. Total positivity rates of 51-like blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes were found as 53.7% and 12.5%, respectively, while these rates we- re 74.4% and 17.3% in carbapenem-resistant isolates, respectively. Twenty-five isolates were positive for both blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes. All of the carbapenem-resistant isolates have OXA type genes with the exception of blaOXA-24-like gene. The positivity rates for blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes vari- ed for each center. In addition, there was a decrease in the frequency of blaOXA-58-like gene, however both blaOXA-23-like gene and carbapenem resistance rates increased during the study period. In conclusion, high rates of resistance to carbapenems were also remarkable but A.baumannii strains keep on sensiti- vity to colistin. Both blaOXA-23-like and blaOXA-58-like genes were shown to be widespread in carbapenem- resistant A.baumannii clinical isolates. However, blaOXA-23-like gene positive strains were increased throug- hout the study. Currently, multiplex qPCR is the best way for rapid diagnosis of resistant bacteria for pre- vention of hospital-acquired infections. The multiplex qPCR kit developed in this study could be useful for rapid diagnosis and identify the frequencies of blaOXA-23-like, blaOXA-51-like and blaOXA-58-like genes in car- bapenem-resistant A.baumannii clinical isolates
    corecore