Analyzing similarities in genome sequences

This article investigates aspects of similarity between complete sequences of mitochondrial DNA by determining the distribution of the relative frequencies of words with different lengths and the characteristics of their relevance throughout the sequences. The degree of similarity is obtained by comparing the distances between words contained within these sequences. Our results indicate that the best groupings among different species depend on the lengths of words and their respective relative frequencies. We also observed that the longer the word the more consistent the grouping between the sequences becomes. The application of our results, together with the perspective of analyzing DNA sequences belonging to a single biological species, may be important for the construction of phylogenetic trees, which are appropriate structures for understanding the evolutionary history of the species

Barreiras às novas formas de coordenação no agrossistema do caju na região nordeste, Brasil Barriers to new coordination forms in the cashew nut agricultural system in northeast of Brazil

Embora a produção brasileira de amêndoa de castanha-de-caju tenha crescido nos anos 2000, sua participação no mercado internacional reduziu-se, revelando perda de competitividade desse agrossistema. A produtividade na produção rural é baixa e subsiste uma antiquada estrutura de governança das relações entre produtores, intermediários e processadores de castanha em casca. Novas formas de coordenação estão sendo testadas, mas ainda não foram capazes de substituir a antiga. O objetivo desse artigo é identificar o conjunto de barreiras à transformação dessa estrutura. O referencial teórico adotado encontra-se fundamentalmente na Economia de Custos de Transação. Para investigação empírica, adotou-se o método de pesquisa rápida (rapid appraisal), compreendendo entrevistas junto a uma amostra não probabilística de agentes da cadeia nos estados do Ceará, Piauí e Rio Grande do Norte. Os resultados mostram que há resiliência da estrutura de governança antiga, a qual está assentada na funcionalidade e capacidade de reação dos intermediários. Assim, a estratégia de mudança cautelosa das empresas processadoras é, por um lado, racional diante de grandes incertezas, e, por outro, lenta diante das transformações do mercado internacional.<br>Although the Brazilian production of cashew nuts has increased in the years 2000, its international market-share has decreased revealing competitiveness loss of this agri-system. Agricultural yields are low and a traditional governance structure among farmers, intermediaries, and cashew nut processing industries still subsists. New coordination forms have been tested, but they have not been able to substitute the old one. The objective of this article is the identification of barriers to the changes of this structure. The Economy of Transaction Cost is the theoretical approach adopted. For empirical investigation, a rapid appraisal method was adopted comprising interviews with stakeholders in the states of Ceará, Piauí, and Rio Grande do Norte. The results showed that resilience is remarkable in the old structure, which is underpinned in the functionality and capacity of reaction of intermediaries. Therefore, the cautious strategy adopted by the cashew nut processing industries is, on one hand, rational in the face of uncertainties, and, on the other hand, slow in the face of the international market changes

Displasia craniometafisária: relato de caso Craniometaphyseal dysplasia: case report

Apresentamos um caso de uma criança com dois anos e oito meses de idade,acometida pela forma recessiva da displasia craniometafisária. São enfatizados os achados clínico-radiológicos, bem como seus principais diagnósticos diferenciais, baseados em dados de breve revisão literária.<br>We report a case of a 2 years and 8 months-old child with the recessive form of craniometaphyseal dysplasia. Clinical and radiological features as well as the main differential diagnosis are discussed and compared with data from a brief literature review

Fluxo biológico do fósforo no metabolismo de suínos alimentados com dietas contendo fitase Biological P flow on metabolism of pigs fed diets containg phytase

A pesquisa foi conduzida para avaliar o fluxo biológico do P em suínos, na fase de crescimento, alimentados com dietas à base de milho, farelo de soja, farelo de arroz desengordurado e óleo de soja, isentas de P inorgânico e suplementadas com níveis crescentes de fitase (253, 759, 1.265 e 1.748 UF/kg de dieta), e destacar o melhor nível de utilização da enzima, usando modelos matemáticos. O modelo utilizado foi determinístico e compartimental, em que o trato gastrintestinal (C1), o plasma C2, os ossos (C3) e os tecidos moles (ossos, coração, figado, rins e músculos), estudados em conjunto (C4), representaram os compartimentos. Foram utilizados dados de metabolismo e cinética do P nos tecidos, obtidos pela técnica de diluição isotópica. Os parâmetros estimados foram: absorção, retenção, P endógeno que retorna ao trato gastrintestinal, P dietético absorvido, incorporação, reabsorção, balanço de P, P proveniente do osso, dos tecidos moles e do total absorvido que retorna ao trato gastrintestinal. o modelo biomatemático utilizado mostrou-se eficiente em explicar o fluxo do fósforo no organismo de suínos em crescimento. A fitase interferiu no fluxo biológico do P do compartimento C1 para o C3 e no refluxo dos compartimentos C3 e C4 para o C1. O nível 759 UF/kg de ração disponibilizou mais eficientemente o fósforo orgânico para o metabolismo dos suínos.<br>The study was conducted to evaluate the biological flow of P in pigs fed diets based on corn, soybean meal, defatted rice bran (DRB) and soybean oil, with increasing phytase levels (253, 759, 1265 and 1748 PU/kg of diet), using mathematics models. The model was deterministic and compartimental, in which the gastrintestinal tract (GIT) (C1), the plasma C2, the bones (C3) and the soft tissues (liver, heart, kidney and muscle) (C4) represented the compartments. Metabolism data and kinetics of P in tissues were used in the model, obtained by the isotopic dilution technique. The parameters used were: absorption, retention, endogenous P that return to the gastrintestinal tract (GIT), dietary absorbed P, accretion, reabsorption, balance of P in bone and soft tissues and P from total absorbed that returned the GIT. The biomathematical model used is adequate to explain the P flow in growing pig. The phytase enzyme interfere in biological flow of P from compartment C1 to C3 and with the output flow of P from compartment C3 and C4 to C1. The level of 759 PU of phytase in diet of growing pig availability more efficientily the organic phosphorus for the pigs metabolism

Atresia of the gastrointestinal tract: imaging evaluation

A wide spectrum of congenital anomalies may affect the gastrointestinal tract at any level from the esophagus to the anus. Atresia is an important cause of gastrointestinal obstruction with high morbidity rate in neonates. Different pathogenetic mechanisms could cause this malformation and the two classical explanations are: a defect of recanalization of the intestinal tube or an interruption of blood supply during intrauterine life. The authors present a literature review with an iconographic essay of imaging findings in children with gastrointestinal atresia.Um amplo espectro de anomalias congênitas pode afetar qualquer nível do trato gastrintestinal, do esôfago ao ânus. A atresia é uma importante causa de obstrução gastrintestinal, com alta taxa de morbidade em recém-natos. Há diversos mecanismos patológicos possíveis para explicar esta malformação e duas explicações clássicas de sua gênese são um defeito de recanalização do tubo intestinal ou uma interrupção no suprimento sanguíneo durante a vida intra-uterina. Os autores fazem uma revisão da literatura com ensaio iconográfico dos achados de imagem em crianças com atresia do trato gastrintestinal.UNIFESP-EPM Departamento de Diagnóstico por ImagemColégio Brasileiro de Radiologia e Diagnóstico por ImagemIrmandade Santa Casa de Misericórdia de São Paulo Departamento de Diagnóstico por ImagemUniversidade Federal de Goiás Departamento de Cirurgia e Urologia PediátricaUNIFESP, EPM, Depto. de Diagnóstico por ImagemSciEL