Análise da variabilidade ambiental da chuva no município de Chapada Gaúcha, Minas Gerais.

Os objetivos deste estudo são: i) verificar a variabilidade anual e mensal da chuva, e ii) avaliar a ocorrência do Índice de Precipitação Padronizada, nas escalas de tempo de três (SPI-3) e doze (SPI-12) meses, no município de Chapada Gaúcha, MG. Foi utilizada uma série de 26 anos (1990-2015) de dados de precipitação coletados numa propriedade rural. O SPI-3 representou os trimestres de janeiro a março, abril a junho, julho a setembro e, outubro a dezembro, e o SPI-12 representou os meses de janeiro a dezembro. A análise descritiva e exploratória da série temporal de chuva permitiram identificar a ocorrência de chuvas inferiores as medianas nos meses de janeiro e novembro, e que a estação chuvosa ocorre entre os meses de outubro a março, indicando uma baixa variabilidade temporal mensal da chuva no município. Entretanto, a utilização do índice SPI para diferentes escalas permitiu identificar que existe o predomínio da classe "próximo da normal" na distribuição trimestral (SPI-3) e anual (SPI-12). Na escala trimestral (SPI-3), considerando o período entre julho e setembro, houve o maior número de eventos da classe "extremamente seco"

Rapid and high throughput molecular identification of diverse mosquito species by igh resolution melting analysis

Mosquitoes are a diverse group of invertebrates, with members that are among the most important vectors of diseases. The correct identification of mosquitoes is paramount to the control of the diseases that they transmit. However, morphological techniques depend on the quality of the specimen and often unavailable taxonomic expertise, which may still not be able to distinguish mosquitoes among species complexes (sibling and cryptic species). High resolution melting (HRM) analyses, a closed-tube, post-polymerase chain reaction (PCR) method used to identify variations in nucleic acid sequences, has been used to differentiate species within the Anopheles gambiae and Culex pipiens complexes. We validated the use of PCR-HRM analyses to differentiate species within Anopheles and within each of six genera of culicine mosquitoes, comparing primers targeting cytochrome b (cyt b), NADH dehydrogenase subunit 1 (ND1), intergenic spacer region (IGS) and cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) gene regions. HRM analyses of amplicons from all the six primer pairs successfully differentiated two or more mosquito species within one or more genera (Aedes (Ae. vittatus from Ae. metallicus), Culex (Cx. tenagius from Cx. antennatus, Cx. neavei from Cx. duttoni, cryptic Cx. pipiens species), Anopheles (An. gambiae s.s. from An. arabiensis) and Mansonia (Ma. africana from Ma. uniformis)) based on their HRM profiles. However, PCR-HRM could not distinguish between species within Aedeomyia (Ad. africana and Ad. furfurea), Mimomyia (Mi. hispida and Mi. splendens) and Coquillettidia (Cq. aurites, Cq. chrysosoma, Cq. fuscopennata, Cq. metallica, Cq. microannulatus, Cq. pseudoconopas and Cq. versicolor) genera using any of the primers. The IGS and COI barcode region primers gave the best and most definitive separation of mosquito species among anopheline and culicine mosquito genera, respectively, while the other markers may serve to confirm identifications of closely related sub-species. This approach can be employed for rapid identification of mosquitoes

High-Resolution Melting Analysis as a Powerful Tool to Discriminate and Genotype Pseudomonas savastanoi Pathovars and Strains

Pseudomonas savastanoi is a serious pathogen of Olive, Oleander, Ash, and several other Oleaceae. Its epiphytic or endophytic presence in asymptomatic plants is crucial for the spread of Olive and Oleander knot disease, as already ascertained for P. savastanoi pv. savastanoi (Psv) on Olive and for pv. nerii (Psn) on Oleander, while no information is available for pv. fraxini (Psf) on Ash. Nothing is known yet about the distribution on the different host plants and the real host range of these pathovars in nature, although cross-infections were observed following artificial inoculations. A multiplex Real-Time PCR assay was recently developed to simultaneously and quantitatively discriminate in vitro and in planta these P. savastanoi pathovars, for routine culture confirmation and for epidemiological and diagnostical studies. Here an innovative High-Resolution Melting Analysis (HRMA)-based assay was set up to unequivocally discriminate Psv, Psn and Psf, according to several single nucleotide polymorphisms found in their Type Three Secretion System clusters. The genetic distances among 56 P. savastanoi strains belonging to these pathovars were also evaluated, confirming and refining data previously obtained by fAFLP. To our knowledge, this is the first time that HRMA is applied to a bacterial plant pathogen, and one of the few multiplex HRMA-based assays developed so far. This protocol provides a rapid, sensitive, specific tool to differentiate and detect Psv, Psn and Psf strains, also in vivo and against other related bacteria, with lower costs than conventional multiplex Real-Time PCR. Its application is particularly suitable for sanitary certification programs for P. savastanoi, aimed at avoiding the spreading of this phytopathogen through asymptomatic plants

Índice de precipitação padronizada para a condição climática do município de Chapada Gaúcha, MG.

As secas podem ser diagnosticadas, com base em uma série histórica de dados meteorológicos, por meio de índices quantificadores de secas e análises estatísticas. Esses índices diagnosticam, a partir de equações empíricas, os períodos de seca ou umidade em uma área pontual ou regional. A utilização de índices para quantificar a seca se faz necessária para determinar a intensidade, a duração e a frequência em que essa anomalia ocorre. Dessa forma, esse trabalho teve o objetivo de determinar o Índice de Precipitação Padronizada (SPI) para o município de Chapada Gaúcha, MG. Foram utilizados dados de precipitação, de uma série de 26 anos, coletados numa propriedade rural presente nesse município. Observou-se que a frequência dos eventos ocorridos nas escalas de tempo de três, seis, nove e doze meses foi maior na classe próxima ao normal. Pode-se afirmar que, o índice SPI foi capaz de identificar os períodos secos, normais e úmidos para a condição climática do município de Chapada Gaúcha, MG