Assessing the importance of a self-generated detachment process in river biofilm models

1. Epilithic biofilm biomass was measured for 14 months in two sites, located up- and downstream of the city of Toulouse in the Garonne River (south-west France). Periodical sampling provided a biomass data set to compare with simulations from the model of Uehlinger, Bürher and Reichert (1996: Freshwater Biology, 36, 249–263.), in order to evaluate the impact of hydraulic disturbance. 2. Despite differences in application conditions (e.g. river size, discharge, frequency of disturbance), the base equation satisfactorily predicted biomass between low and high water periods of the year, suggesting that the flood disturbance regime may be considered a universal mechanism controlling periphyton biomass. 3. However modelling gave no agreement with biomass dynamics during the 7-month long low water period that the river experienced. The influence of other biomass-regulating factors (temperature, light and soluble reactive phosphorus) on temporal biomass dynamics was weak. 4. Implementing a supplementary mechanism corresponding to a temperature-dependent self-generated loss because of heterotrophic processes allowed us to accurately reproduce the observed pattern: a succession of two peaks. This case study suggests that during typical summer low water periods (flow stability and favourable temperature) river biofilm modelling requires self-generated detachment to be considered

Note technique et d'expertise (version courte) : « Indice Diatomique Antilles : Vers l'IDA-2 (10-04-2019)

Fiche techniqueL'évaluation de l'état écologique (EEE) des cours d'eau des Antilles Françaises, comme celle des pays de l'Europe continentale et des autres DOM, doit être réalisée en conformité avec la Directive Communautaire sur l'Eau (DCE). Cependant, le contexte biogéographique particulier des Antilles, qui comporte de nombreuses espèces de diatomées tropicales inconnues en métropole, a nécessité la mise en place d'un programme spécifique de recherche-développement de 4 à 5 ans qui a conduit, en 2014, à la mise en place de l'IDA. Cet indice, passé dans le domaine réglementaire via l'Arrêté Evaluation du 27 Juillet 2015, est maintenant utilisé en routine dans le cadre des réseaux de surveillance et donne des résultats d'évaluation plutôt satisfaisants. Cependant, suite au premier programme, la connaissance des assemblages naturels locaux manquait encore d'un peu de recul historique et, dans des séquences bioclimatiques particulières (ex : 2018), il est possible de trouver des effectifs significatifs d'espèces nouvelles ou trop peu connues, qui n'avaient pas été prises en compte dans le calcul de l'indice et qui viennent altérer la confiance dans les résultats de certains calculs indiciels. La présente note d'expertise en version raccourcie, établie à la demande de l'Office de l'Eau de la Martinique, fait un point actualisé des problèmes rencontrés qui, comme pour toute méthode biologique récente, conduisent à recommander dès que possible une actualisation de cet indice permettant, grâce au recul-données plus important actuellement disponible, la prise en compte d'un nombre accru d'espèces indicielles. Comme indiqué, le re-versionnage pourrait être réalisé : 1) en procédant à l'identique par rapport à la première démarche d'élaboration, ce qui conduirait à un IDA-2 fonctionnant à nouveau sur un principe de fonctionnement composite ; ou alors, 2) à s'orienter vers une logique de bio-indication plutôt multi-métrique, récemment utilisée pour établir les 2 nouveaux indices diatomiques de Nouvelle-Calédonie (2017) et de Guyane (début 2019). Sur la base d'une quantité de travail comparable, l'alternative envisagée aurait l'avantage pour les décideurs et gestionnaires d'être plus scientifiquement actuelle et d'ouvrir sur des possibilités de diagnostic très directement en phase avec l'évaluation d'état écologique réalisée. La fin de la note aborde le calage dans le temps des réalisations au cas où cette action puisse se mettre en place en 2020

Note technique et d'expertise « Indice Diatomique Antilles : Vers l'IDA-2 (29-03-2019)

Fiche techniqueL'évaluation de l'état écologique (EEE) des cours d'eau des Antilles Françaises, comme celle des pays de l'Europe continentale et des autres DOM, doit être réalisée en conformité avec la Directive Communautaire sur l'Eau (DCE). Cependant, le contexte biogéographique particulier des Antilles, qui comporte de nombreuses espèces de diatomées tropicales inconnues en métropole, a nécessité la mise en place d'un programme spécifique de recherche-développement de 4 à 5 ans qui a conduit, en 2014, à la mise en place de l'IDA. Cet indice, passé dans le domaine réglementaire via l'Arrêté Evaluation du 27 Juillet 2015, est maintenant utilisé en routine dans le cadre des réseaux de surveillance et donne des résultats d'évaluation plutôt satisfaisants. Cependant, suite au premier programme, la connaissance des assemblages naturels locaux manquait encore d'un peu de recul historique et, dans des séquences bioclimatiques particulières (ex : 2018), il est possible de trouver des effectifs significatifs d'espèces nouvelles ou trop peu connues, qui n'avaient pas été prises en compte dans le calcul de l'indice et qui viennent altérer la confiance dans les résultats de certains calculs indiciels. La présente note détaillée fait un point actualisé des problèmes rencontrés qui, comme pour toute méthode biologique récente, conduisent à recommander dès que possible une actualisation de cet indice permettant, grâce au recul-données plus important actuellement disponible, la prise en compte d'un nombre accru d'espèces indicielles. Comme indiqué, le re-versionnage pourrait être réalisé : 1) en procédant à l'identique par rapport à la première démarche d'élaboration, ce qui conduirait à un IDA-2 fonctionnant à nouveau sur un principe de fonctionnement composite ; ou alors, 2) à s'orienter vers une logique de bio-indication plutôt multi-métrique, récemment utilisée pour établir les 2 nouveaux indices diatomiques de Nouvelle-Calédonie (2017) et de Guyane (début 2019). Sur la base d'une quantité de travail comparable, l'alternative envisagée aurait l'avantage pour les décideurs et gestionnaires d'être plus scientifiquement actuelle et d'ouvrir sur des possibilités de diagnostic très directement en phase avec l'évaluation d'état écologique réalisée

Evaluation de la qualité de l'eau de la Garonne par référence spéciale aux indices diatomique et chironomidien

Les diatomées de l'épilithon et les chironomidés du benthos ont été utilisés pour évaluer l'impact de pollutions sur la Garonne par les effluents d'une papeterie (Saint Gaudens) et par les rejets d'origine domestique et industrielle (Toulouse). L'indice chironomidien (ICh) est plus stable dans le temps et paraît refléter la qualité globale moyenne de la rivière. L'indice diatomique (IPS) fluctue dans le temps et reflète plus précisément les impacts ponctuels des pollutions. Les valeurs moyennes de l'IPS sont légèrement supérieures à celles de l'ICh mais les deux indices réagissent d'une manière similaire à une dégradation de la qualité de l'eau. Des mesures biologiques complémentaires doivent être envisagées pour une appréciation plus fidèle de la qualité des systèmes lotiques

Programme d'Etude et de Recherche 2009-2012 : mise au point d'un indice de bio-indication de la qualité de l'eau des cours d'eau antillais à partir des diatomées. Guide méthodologique pour la mise en oeuvre de l'Indice Diatomées Antillais, volume 2 : Fiches taxons indiciels de l'IDA (Version du 27/05/2014)

As part of the obligation to implement the WFD in the French overseas departments, a research and development program, aiming at setting-up a diatom index for the ecological status assessment of the streams of the French West Indies, was initiated And financed by the Water Offices and the DEALs of Martinique and Guadeloupe, with financial support from ONEMA. This program was carried out by the Asconit-Irstea consortium, which also self-financed part of it from 2009 to 2011. In order to solve some improvement points identified on the basis of the first version of IDA, the initial program was supplemented by new data acquisitions covering 2012 and 2013, some of them issued from the traditional sampling campaigns of the monitoring networks currently in place, others being more targeted in order to clarify certain insufficiently detailed aspects, including a more precise approach to clarify the ecology of the Nitzschia inconspicua (NINC) species in the West Indies. These acquisitions of additional data provided an opportunity to supplement the taxonomic lists and to consolidate the ecological information acquired on the taxa sufficiently found in Guadeloupe and Martinique during the 5 years covered by field campaigns. The methodological guide helping to support the good IDA practice consists of 2 complementary documents. The Volume 1: "Methodological and iconological guide" contains: - the main elements relating to the biology and ecology of diatoms, useful for understanding the operating principles of the diatomic bio-indication in general, and of this new index in particular, - a summary of the different steps of development of the IDA, - the methodology developed to calculate this index, - the taxonomic data acquired during this Research-Development program, which may prove useful for the determination of the diatom species sampled in the French West Indies. Elements related to the classification of species found during our study include a glossary, an original diatom determination key, the iconological positioning of the taxa found in the study, and a practical system of small summary tables indicating the reference of photographic plates where one can find the taxon in this first and in the 2nd volume. - finally, Volume 1 includes 94 iconological and iconographic plates allowing to present the photographs acquired on most of the taxa encountered during the study. The present Volume 2, for its part, is a collection of taxa-cards containing the iconographic, chorological and auto-ecological information about the taxa sufficiently encountered during the study and involved in the calculation of the new diatomic index of the Antilles (IDA). The 2 volumes of this methodological guide therefore synthesize all the information needed for the implementation of the new IDA by water managers and public contractors.Dans le cadre de l'obligation de mise en application de la DCE dans les DOM, un programme de Recherche-Développement visant à mettre en place un indice diatomique pour l'évaluation d'état des cours d'eau des Antilles Françaises a été initié et financé par les Offices de l'Eau et les DEAL de Martinique et de Guadeloupe, avec un appui financier de l'ONEMA. Ce programme a été réalisé par le consortium Asconit - Irstea, qui en a également autofinancé une partie, de 2009 à 2011. Afin de résoudre quelques points perfectibles repérés sur la base de la première version d'IDA, ce programme initial a été complété par de nouvelles acquisitions de données en 2012 et 2013, certaines acquises dans le cadre des campagnes classiques d'échantillonnages des réseaux de surveillance actuellement en place, d'autres plus ciblées visant à préciser certains points insuffisamment renseignés dont une approche plus précise de l'écologie de l'espèce Nitzschia inconspicua (NINC) aux Antilles. Ces acquisitions de données additionnelles ont donné l'occasion de compléter les listes taxonomiques et de consolider l'information écologique acquise sur les taxons suffisamment trouvés en Guadeloupe et Martinique lors de ces 5 années couvertes par des campagnes de terrain. Le guide méthodologique venant appuyer la bonne pratique de l'IDA est constitué de 2 documents complémentaires. Le Volume 1: "Guide méthodologique et iconologique", contient : - les principaux éléments relatifs à la biologie et l'écologie des diatomées, utiles à la compréhension des principes de fonctionnement de la bio-indication diatomique en général, et de ce nouvel indice en particulier, - le résumé des étapes de la mise au point de l'indice, - la méthodologie élaborée pour calculer cet indice, - les données taxonomiques acquises au cours de ce programme de Recherche-Développement, qui pourront se révéler utiles à la détermination des espèces de diatomées échantillonnées aux Antilles. Les éléments concernant la classification des espèces trouvées lors de notre étude comprennent un glossaire, une clé de détermination originale des diatomées, le positionnement iconologique des taxons trouvés lors de l'étude, ainsi qu'un système pratique de petits tableaux récapitulatifs indiquant la référence des planches photographiques ou on peut trouver le taxon dans ce premier et dans le 2ème volume. - enfin, il inclut 94 planches iconologiques et iconographiques permettant de présenter les clichés acquis sur la plupart des taxons rencontrés au cours de l'étude. Le présent Volume 2, pour sa part, est un recueil de planches contenant notamment les éléments taxonomiques, iconographiques, chorologiques et auto-écologiques des taxons suffisamment rencontrés en cours d'étude et qui interviennent au dans le calcul du nouvel indice diatomique des Antilles (IDA). Les 2 volumes du présent guide méthodologique synthétisent donc toutes les informations utiles à la mise en oeuvre du nouvel IDA par les gestionnaires de l'eau et les intervenants de Marchés Publics

Evaluation de l'état écologique des cours d'eau de Guyane : Un nouvel indice diatomique pour la Guyane Française (l'IDGF): Rapport final (V1 du 30-04-2019)

The Water Framework Directive (WFD) requires European Union Member States to monitor the ecological quality of their water bodies through the study of key biological compartments in the aquatic environment. French Guiana is an Overseas Department (DOM) located in the Amazonian part of South America. Despite its geographical remoteness, this department is a European territory like all the other French overseas departments and is therefore subject to the requirements of the WFD. Previous works over the past decade, notably on the diatom compartment, have led to the development of several new biological indexes specifically adapted to the biogeographic conditions (geological substrates, climate, local fauna and flora) of each of these overseas territories. However, work progressed at a slower rate on the diatoms of French Guiana, due to the particular natural conditions that lead to very specific and still largely unknown diatomic communities. Since no more appropriate system was available, an evaluation system based on a local adaptation of the Specific Polluosensitivity Index (SPI) has been previously set up to access the ecological state of French Guiana's watercourses (see the French Evaluation Decree of 27 July 2015), despite obvious weaknesses linked to the biogeographical mismatch of the ecological profiles of many taxa (based on the worldwide scale) inside this index. However, the regular increase in the quantity of data gathered through Guianese monitoring networks over the past 9 years, as well as the progress made on diatom taxonomy, allowed the development of the 2017-2018 present study leading to the development of the new French Guiana Diatom Index (FGDI or IDGF in French). Inspired by the experience of previous diatomic indices developed in other French overseas departments, a methodology adapted to the Guianese context has been developed based on (i) a reduction in the number of taxa taken into account in diatom communities and on (ii) the search for warning taxa in a multimetric approach. This approach leads to a WFD-compatible index (which integrates deviation from regional references) providing results that are relevant, according to the opinion of local experts, and consistent with the natural context and anthropogenic activities encountered in French Guiana. The French Guiana Diatom Index thus produced is a first version, stabilized in its conception but perfectible in the years to come, notably by the acquisition of more data: 1) under intermediate anthropogenic impact (where little information was available in this first study); 2) in fluvial lentic zones; 3) as well as by the continuation of calibration works for the relevant evaluation of the sites under intermittent haline influence. The improvement of the index's response stability and the resolution of its perfectible aspects are directly linked to the incrementation of new data coming from the future WFD monitoring networks, but also to the acquisition of additional data specifically acquired for a better illustration of the above described.La Directive Cadre sur l'Eau (DCE) impose aux états membres de l'Union Européenne un suivi de la qualité écologique de leurs masses d'eau via l'étude de compartiments biologiques clés du milieu aquatique. La Guyane Française est un Département d'Outre-Mer (DOM) situé dans la partie Amazonienne de l'Amérique du sud. Ce département, malgré son éloignement, est un territoire européen comme tous les autres DOM et est donc soumis aux prescriptions de la DCE. Les travaux de la dernière décennie, notamment sur le compartiment diatomique, ont mené à l'élaboration de plusieurs nouveaux indices biologiques spécifiquement adaptés aux conditions biogéographiques (substrats géologiques, climat, faune et flore locale) de chacun de ces territoires ultramarins. Cependant, la conception d'un indice diatomique spécifique à la Guyane a connu une progression plus lente, du fait des conditions naturelles particulières qui mènent à des cortèges diatomiques très spécifiques et encore fortement méconnus. En l'absence d'un dispositif plus adapté, un système réglementaire d'évaluation basé sur une adaptation locale de l'IPS a été mis en place pour mesurer l'État Écologique des cours d'eau de Guyane (cf. Arrêté Évaluation du 27 Juillet 2015), malgré des faiblesses évidentes liées au décalage biogéographique du profil de beaucoup de taxons de l'IPS, établis à partir de données mondiales. Cependant, l'augmentation progressive des référentiels capitalisés dans le cadre des réseaux de suivi Guyanais sur ces 9 dernières années, ainsi que les progrès réalisés sur la taxonomie, ont rendu possible la réalisation de la présente étude 2017-2018 visant à l'élaboration d'un nouvel Indice Diatomique pour la Guyane Française (IDGF). En tirant les enseignements adéquats des précédents indices diatomiques élaborés dans d'autres DOM-COM, une méthodologie adaptée au contexte Guyanais a été développée en se basant (i) sur une réduction du nombre de taxons pris en compte dans les assemblages et (ii) sur la recherche de taxons d'alerte dans une optique multimétrique. Cette approche a permis la conception d'un indice qui présentant une évaluation écologique compatible avec les préconisations de la DCE (notion d'écart à une référence régionale) et donnant des résultats pertinents, selon l'avis des experts locaux, et cohérents par rapport au contexte naturel et aux activités anthropiques rencontrés en Guyane. L'indice Diatomique de Guyane Française ainsi produit est une première version stabilisée dans sa conception mais perfectible dans les années à venir, notamment par l'acquisition de plus de données : 1) en conditions d'altération intermédiaires (où très peu d'informations ont pu être mobilisées dans cette première étude), 2) en zones lentiques fluviales, ainsi que 3) par la poursuite de travaux de calibration pour l'évaluation pertinente des sites subissant des influences halines intermittentes. L'amélioration de la stabilité de réponse de l'indice et la résolution de ses aspects perfectibles sont directement liés à l'incrémentation de nouvelles données issues des futurs réseaux de suivis DCE, mais aussi à l'acquisition de données complémentaires spécifiquement acquises pour mieux illustrer des situations environnementales particulières précitées

Mise au point de l'IDGF pour l'évaluation de l'état écologique des cours d'eau de Guyane Française

National audienceLa Directive Cadre sur l'Eau (DCE) impose aux états membres de l'Union Européenne un suivi de la qualité écologique de leurs masses d'eau utilisant différents compartiments biologiques-clés du milieu aquatique. Cette obligation doit aussi s'appliquer dès que possible dans certains territoires ultramarins des Pays-Membres, dont les DOM Français. La Guyane Française, située en zone équatoriale dans la partie Amazonienne de l'Amérique du Sud, est donc soumise à cette obligation. Cependant, une difficulté locale particulière se pose ici pour la mise au point d'outils de bio-indication, du fait de son isolement vis-à-vis d'autres zones équatoriales qui a occasionné un fort endémisme et un important déficit de connaissance des espèces locales. Sur le plan local, les cours d'eau sont officiellement évalués depuis début 2016 à partir d'un dispositif d'évaluation diatomique transitoire reposant sur une adaptation locale de l'IPS (Coste, 1982), indice diatomique mondial dont certains profils spécifiques se trouvent en décalage avec les conditions locales et dont d'autres, pour raison de fort endémisme, n'existent pas forcément (avec un recours fréquent à l'utilisation du profil au genre). Le présent programme, mené dans le cadre d'un partenariat entre Irstea et les Bureaux d'Etude Asconit (tombé depuis en faillite) et Hydreco Guyane, avec le soutien de l'AFB, de l'Office de l'Eau Guyane et de la DEAL Guyane, avait donc pour but de mettre au point un nouvel indice diatomique adapté aux conditions particulières de Guyane, à partir de jeux de données abiotiques et diatomiques acquis localement. Des doublets de données acquises entre les années 2012 et 2017 sur 189 sites différents, dans le cadre des réseaux de surveillance et d'études particulières, ont ainsi servi à la prise de connaissance des gradients abiotiques présents sur les systèmes naturels de ce département, ainsi des gradients de pollution occasionnés par différentes activités anthropiques (agriculture, urbanisation, pollutions domestiques et industrielles, foresterie, carrières, orpaillage...). La présente communication vise à faire le point avec l'ONB et le Ministère de l'Ecologie / Direction de l'Eau, de la démarche d'élaboration suivie pour la genèse du nouvel outil indiciel (l'Indice Diatomique de Guyane Française, ou IDGF) produit dans le cadre de cu programme "Mise au point d'un nouvel indice diatomique pour les cours d'eau de Guyane" (Fiche-Action AFB-Irstea N° 87 (2017-2018), à partir de données strictement issues de Guyane. Cette réunion a par ailleurs l'objectif d'organiser les opérations utiles pour le transfert de ce nouvel outil vers le domaine opérationnel, dans le cadre d'une nouvelle Fiche-Action ONB-INRAE N°3 : "Transfert Opérationnel de l'IDGF" (2019-2021). En tirant les enseignements des démarches d'élaboration des précédents indices diatomiques mis en place dans le contexte d'autres DOM-COM (Réunion, Antilles, Nouvelle-Calédonie), une méthodologie efficiente et bien adaptée au contexte Guyanais a été développée en se basant sur : 1) une réduction du nombre de taxons pris en compte dans les assemblages (sur 1648 taxons différents identifiés au cours de ce programme, 446 taxons "indiciels" sont effectivement pris en compte dans le calcul du nouvel IDGF) et 2) la recherche de taxons d'alerte, qui ont pu être sélectionnés à l'aide du logiciel TITAN vis-à-vis de 11 mono-gradients environnementaux (DBO5, PO4, NO3, NH4 etc...). L'outil mobilise et agrège les résultats des métriques unitaires de réponse des communautés diatomiques aux 11 paramètres abiotiques susceptibles de subir une altération en liaison avec les différentes catégories d'impacts anthropiques rencontrés en Guyane. Sa formulation finale est donc multimétrique. Outre la mesure de la déviation d'état écologique telle que requise par la mise en application de la DCE, la construction de cet indice ouvre vers une utilisation directe pour le diagnostic plus détaillé d'impact(s) anthropique(s), à partir d'une utilisation cohérente de la même information que celle utilisée pour l'évaluation. Selon l'avis des experts locaux, ce nouvel outil donne des résultats cohérents et plus pertinents que l'IPS par rapport au contexte naturel et aux activités anthropiques rencontrés en Guyane

Evaluation de l'état écologique des cours d'eau de Guyane : L'indice Diatomique pour la Guyane Française (IDGF)

International audienceLa Directive Cadre sur l'Eau (DCE) impose aux états membres de l'Union Européenne un suivi de la qualité écologique de leurs masses d'eau via l'étude de compartiments biologiques clés du milieu aquatique. La Guyane Française est un Département d'Outre-Mer (DOM) situé dans la partie Amazonienne de l'Amérique du sud. Ce département, malgré son éloignement, est un territoire européen comme tous les autres DOM et est donc soumis aux prescriptions de la DCE. Les travaux de la dernière décennie, notamment sur le compartiment diatomique, ont mené à l'élaboration de plusieurs nouveaux indices biologiques spécifiquement adaptés aux conditions biogéographiques (substrats géologiques, climat, faune et flore locale) de chacun de ces territoires ultramarins. Cependant, la conception d'un indice diatomique spécifique à la Guyane a connu une progression plus lente, du fait des conditions naturelles particulières qui mènent à des cortèges diatomiques très spécifiques et encore fortement méconnus. En l'absence d'un dispositif plus adapté, un système réglementaire d'évaluation basé sur une adaptation locale de l'IPS a été mis en place pour mesurer l'État Écologique des cours d'eau de Guyane (cf. Arrêté Évaluation du 27 Juillet 2015), malgré des faiblesses évidentes liées au décalage biogéographique du profil de beaucoup de taxons de l'IPS, établis à partir de données mondiales. Cependant, l'augmentation progressive des référentiels capitalisés dans le cadre des réseaux de suivi Guyanais sur ces 9 dernières années, ainsi que les progrès réalisés sur la taxonomie, ont rendu possible la réalisation de la présente étude 2017-2018 visant à l'élaboration d'un nouvel Indice Diatomique pour la Guyane Française (IDGF). En tirant les enseignements adéquats des précédents indices diatomiques élaborés dans d'autres DOM-COM, une méthodologie adaptée au contexte Guyanais a été développée en se basant (i) sur une réduction du nombre de taxons pris en compte dans les assemblages et (ii) sur la recherche de taxons d'alerte dans une optique multimétrique. Cette approche a permis la conception d'un indice qui présente une évaluation écologique compatible avec les préconisations de la DCE (notion d'écart à une référence régionale) et donne des résultats pertinents, selon l'avis des experts locaux, et cohérents par rapport au contexte naturel et aux activités anthropiques rencontrés en Guyane

Evaluation de l'état écologique des cours d'eau de Guyane : L'indice Diatomique pour la Guyane Française (IDGF)

National audienceLa Directive Cadre sur l'Eau (DCE) impose aux états membres de l'Union Européenne un suivi de la qualité écologique de leurs masses d'eau via l'étude de compartiments biologiques clés du milieu aquatique, cette obligation ayant aussi force d'application dans certains territoires ultramarins des Pays-Membres, dont les DOM Français. La Guyane Française, située en zone équatoriale dans la partie Amazonienne de l'Amérique du Sud, est soumise à cette obligation. Cependant, il se pose ici une difficulté particulière pour la mise au point d'outils de bio-indication, du fait de son isolement d'autres zones équatoriales ayant conduit à un fort endémisme et à un déficit de connaissance des espèces locales. Sur le plan diatomique, les cours d'eau sont officiellement évalués depuis début 2016 à partir d'un dispositif transitoire reposant sur une adaptation locale de l'IPS (Coste, 1982), indice diatomique mondial dont certains profils spécifiques se trouvent en décalage avec les conditions locales, et dont d'autres n'existent pas forcément pour les nombreuses espèces endémiques (avec un recours fréquent à l'utilisation du profil au genre). Le présent programme, mené dans le cadre d'un partenariat entre Irstea et les Bureaux d'Etude Asconit (tombé depuis en faillite) et Hydreco Guyane, avec l'appui de l'AFB, de l'Office de l'Eau Guyane et de la DEAL Guyane, avait donc pour but de mettre au point un nouvel indice diatomique adapté aux conditions particulières de Guyane, à partir de jeux de données abiotiques et diatomiques acquis localement. Des doublets de données acquises sur 189 sites dans le cadre des réseaux de surveillance et d'études particulières, entre les années 2012 et 2017 ont ainsi servi à la prise de connaissance des gradients abiotiques présents sur les systèmes naturels de ce département, ainsi des gradients de pollution occasionnés par différentes activités anthropiques (agriculture, urbanisation, pollutions domestiques et industrielles, foresterie, carrières, orpaillage...). La présente communication vise à présenter aux partenaires locaux de Bassin, à l'occasion d'une mission terrain sur place de la diatomiste Anne Eulin (Hydreco Guyane), la démarche d'élaboration qui a été suivie, ainsi que le nouvel outil indiciel (l'Indice Diatomique de Guyane Française, ou IDGF) produit dans le cadre de ce programme, à partir de données strictement issues de Guyane. En tirant les enseignements des démarches d'élaboration des précédents indices diatomiques produits pour d'autres DOM-COM (Réunion, Antilles, Nouvelle-Calédonie), une méthodologie efficiente et bien adaptée au contexte Guyanais a été développée en se basant sur : 1) une réduction du nombre de taxons pris en compte dans les assemblages (partant de 1648 taxons différents identifiés au cours du programme, 446 taxons indiciels ont été effectivement pris en compte dans le nouvel IDGF) et 2) la recherche de taxons d'alerte, sélectionnés à l'aide du logiciel TITAN vis-à-vis de 11 mono-gradients environnementaux (DBO5, PO4, NO3, NH4 etc...). L'outil mobilise et agrège les résultats des métriques unitaires de réponse des communautés diatomiques aux 11 paramètres abiotiques susceptibles de subir une altération du fait des différentes catégories d'impacts anthropiques rencontrés en Guyane. Sa formulation finale est donc multimétrique. Outre la mesure de la déviation d'état écologique telle que requise par la mise en application de la DCE, la construction de cet indice ouvre vers une utilisation directe pour le diagnostic plus détaillé d'impact(s) anthropique(s), à partir d'une utilisation cohérente de la même information que celle utilisée pour l'évaluation. Selon l'avis des experts locaux, ce nouvel outil donne des résultats pertinents et cohérents par rapport au contexte naturel et aux activités anthropiques rencontrés en Guyane

Un nouvel indice multimétrique pour l'évaluation de l'état écologique des cours d'eau de Guyane Française basé sur les diatomées benthiques

International audienceThe Water Framework Directive (WFD) requires European Union Member States to monitor the ecological quality of their water bodies through the responses of key biological compartments to anthropogenic alteration in the aquatic environment. French Guiana is a French overseas department located in the Amazonian part of South America. Despite its geographical remoteness, this department is a European territory like all the other French overseas departments and is therefore subjected to the requirements of the WFD. Previous work over the past decade, especially on benthic diatoms, have led to the development of several new biological indices specifically adapted to the biogeographic conditions (geological substrates, climate, local fauna and flora) of each of these overseas territories. However, work has progressed at a slower rate on the diatoms of French Guiana, due to the particular natural conditions that lead to very specific and still largely unknown diatomic communities. Since no convenient local system was available, an evaluation system based on a local adaptation of a generalist diatom index (SPI) has been previously set up to assess the ecological state of French Guiana's watercourses, despite obvious weaknesses linked to the biogeographical mismatch of the ecological profiles of many taxa. The increase in the quantity of data gathered through Guyanese monitoring networks over the past 9 years, as well as the progress made on diatom taxonomy, allowed the development of the new French Guiana Diatomic Index (FGDI) presented in this paper. A methodology adapted to the Guyanese context has been developed based on (i) a reduction in the number of taxa taken into account in diatom communities and on (ii) the search for alert taxa in a multimetric approach. The FGDI allows a relevant and consistent ecological status evaluation of French Guiana's streams based on benthic diatoms following the WFD framework and, due to its multimetric construction, it also allows a comprehensive ecological diagnosis which will be of great benefit for water managers