Optimización del tiempo de esterilización de soportes basados en suelo y compost en la producción de inoculentes para leguminosas

Se elaboraron tres soportes consistentes en una mezcla de suelo y compost, y se sometieron a tres tratamientos de esterilización fraccionada en autoclave en dos días consecutivos. La eficiencia de los tratamientos de esterilización se evaluó monitoreando la disminución en las poblaciones de hongos y bacterias mediante recuentos estándar en placa. La esterilización de todos los soportes se logró mediante un tratamiento por 45 minutos el primer día y 30 minutos el segundo día

Optimización del tiempo de esterilización de soportes basados en suelo y compost en la producción de inoculentes para leguminosas

Three soil-compost based carrriers were elaborated and autoclaved by three different treatments of fractionated sterilization in two consecutive days. The efficiency of the sterilization treatments was evaluated monitoring the reduction in bacterial and fungi populations by standard plate count methods. Sterilization of all carriers was possible by the treatment of 45 minutes the first day and 30 minutes the second day.Se elaboraron tres soportes consistentes en una mezcla de suelo y compost, y se sometieron a tres tratamientos de esterilización fraccionada en autoclave en dos días consecutivos. La eficiencia de los tratamientos de esterilización se evaluó monitoreando la disminución en las poblaciones de hongos y bacterias mediante recuentos estándar en placa. La esterilización de todos los soportes se logró mediante un tratamiento por 45 minutos el primer día y 30 minutos el segundo día

Characterization of Rhizobium grahamii extrachromosomal replicons and their transfer among rhizobia

Background: Rhizobium grahamii belongs to a new phylogenetic group of rhizobia together with Rhizobium mesoamericanum and other species. R. grahamii has a broad-host-range that includes Leucaena leucocephala and Phaseolus vulgaris, although it is a poor competitor for P. vulgaris nodulation in the presence of Rhizobium etli or Rhizobium phaseoli strains. This work analyzed the genome sequence and transfer properties of R. grahamii plasmids. Results: Genome sequence was obtained from R. grahamii CCGE502 type strain isolated from Dalea leporina in Mexico. The CCGE502 genome comprises one chromosome and two extrachromosomal replicons (ERs), pRgrCCGE502a and pRgrCCGE502b. Additionally, a plasmid integrated in the CCGE502 chromosome was found. The genomic comparison of ERs from this group showed that gene content is more variable than average nucleotide identity (ANI). Well conserved nod and nif genes were found in R. grahamii and R. mesoamericanum with some differences. R. phaseoli Ch24-10 genes expressed in bacterial cells in roots were found to be conserved in pRgrCCGE502b. Regarding conjugative transfer we were unable to transfer the R. grahamii CCGE502 symbiotic plasmid and its megaplasmid to other rhizobial hosts but we could transfer the symbiotic plasmid to Agrobacterium tumefaciens with transfer dependent on homoserine lactones. Conclusion: Variable degrees of nucleotide identity and gene content conservation were found among the different R. grahamii CCGE502 replicons in comparison to R. mesoamericanum genomes. The extrachromosomal replicons from R. grahamii were more similar to those found in phylogenetically related Rhizobium species. However, limited similarities of R. grahamii CCGE502 symbiotic plasmid and megaplasmid were observed in other more distant Rhizobium species. The set of conserved genes in R. grahamii comprises some of those that are highly expressed in R. phaseoli on plant roots, suggesting that they play an important role in root colonization.Instituto de Biotecnologia y Biologia Molecula

Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T

Rhizobium tibeticum was originally isolated from root nodules of Trigonella archiducis-nicolai grown in Tibet, China. This species is also able to nodulate Medicago sativa and Phaseolus vulgaris. The whole-genome sequence of the type strain, R. tibeticum CCBAU85039T, is reported in this study.Facultad de Ciencias Exacta

Genome sequence of the symbiotic type strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T

Rhizobium tibeticum was originally isolated from root nodules of Trigonella archiducis-nicolai grown in Tibet, China. This species is also able to nodulate Medicago sativa and Phaseolus vulgaris. The whole-genome sequence of the type strain, R. tibeticum CCBAU85039T, is reported in this study.Fil: Torres Tejerizo, Gonzalo Arturo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Wibberg, Daniel. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Winkler, Anika. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Ormeño Orrillo, Ernesto. Universidad Nacional Agraria La Molina; PerúFil: Martínez Romero, Esperanza. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: Niehaus, Karsten. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Pühler, Alfred. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Kalinowski, Jörn. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Lagares, Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Schlüter, Andreas. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Pistorio, Mariano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentin

Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T

Rhizobium tibeticum was originally isolated from root nodules of Trigonella archiducis-nicolai grown in Tibet, China. This species is also able to nodulate Medicago sativa and Phaseolus vulgaris. The whole-genome sequence of the type strain, R. tibeticum CCBAU85039T, is reported in this study.Facultad de Ciencias Exacta

Modificación del caldo extracto de levadura manitol para la producción a mediana escala de inoculantes para leguminosas

El caldo extracto de levadura manitol (LM), un medio ampliamente utilizado para el cultivo de rizobios, fue modificado para reducir su costo y utilizarlo en la producción a mediana escala de inoculantes para leguminosas. Los dos ingredientes más costosos, el extracto de levadura y el manitol, fueron reducidos o reemplazados con substratos más económicos. Se pudo reducir la concentración de extracto de levadura a 0,05 g/L sin afectar el crecimiento cuando se agregó 1,1 g/L de ácido glutámico o glutamato de sodio grado alimento. El manitol pudo ser substituido por 12,5 g/L de glicerina grado farmacéutico para las cepas de Bradyrhizobium o por 10 g/L de azúcar grado alimento para las cepas de Rhizobium. No se alteraron las propiedades simbióticas de las cepas cultivados en los medios modificados

Genetic characterization of rice endophytic bacteria (Oryza sativa L.) with antimicrobial activity against Burkholderia glumae

El objetivo del presente estudio fue aislar y seleccionar bacterias endofíticas de arroz capaces de inhibir al fitopatógeno Burkholderia glumae THT, así como caracterizarlas por su genética y bioquímica. También se buscó caracterizar la diversidad genética y los factores de virulencia presentes en cepas de B. glumae y de Burkholderia gladioli, otro patógeno de arroz, aisladas de campo. Se colectaron plantas de arroz en 4 departamentos del norte de Perú, y tras la desinfección de tejidos se aislaron bacterias endofíticas por cultivo en agar soya tripticasa (30 °C; 48 h) y en medio selectivo (pH 4,5; 41 °C; 72 h). Se evaluó la actividad antimicrobiana frente a B. glumae THT, la producción de sideróforos y la resistencia a la toxoflavina, toxina producida por este agente. La identificación molecular se realizó mediante BOX-PCR y secuenciación del gen 16S ARNr. Además, se determinó la producción de enzimas extracelulares y se efectuaron ensayos de motilidad y sensibilidad/resistencia a bactericidas. Se aislaron 189 bacterias endofíticas, de las cuales solo 9 presentaron actividad antimicrobiana contra B. glumae THT, sobresaliendo Burkholderia vietnamiensis TUR04-01, B. vietnamiensis TUR04-03 y Bacillus aryabhattai AMH12-02. Estas cepas produjeron sideróforos y al menos el 55,5% fueron resistentes a la toxoflavina. Por otro lado, 17 de las cepas de B. glumae y B. gladioli aisladas se agruparon en 9 perfiles BOX-PCR, 16 de ellas presentaron similitud con B. glumae LMG2196T (100%) y una con B. gladioli NBRC13700T (99,86%). Hubo elevada diversidad de acuerdo al origen geográfico y se encontraron factores de virulencia. En conclusión, se hallaron cepas del género Bacillus y Burkholderia que podrían ser agentes de biocontrol contra B. glumae