Desarrollo y evaluación de un método racional y no destructivo para la toma de muestras de maderas blandas utilizadas en análisis químicos

ABSTRACT Wood has been a natural resource widely used by mankind. Particularly, conifer wood is important because of its ecology, economy and geographic distribution in comparison with others taxa. Usage of different timber species is based on the evaluation of their physical properties and also on the analysis of their main chemical properties. Thus, in order to achieve good chemical determinations, it is required an optimal methodology for sample collection of wood (SCW) in standing trees. This kind of methodologies are scarce, moreover just a few of them consider ahead of time the amount of wood needed for chemical analysis (rational sample collection) and at that at the same time they are a nondestructive sample collection (without cutting down trees). For that reason, the aim of this study was to develop a new methodology which describe SCW of conifers in a rational and nondestructive way. This SCW methodology was evaluated in Abies religiosa along of different sampling sites and consists of four steps: 1) To define the amount of wood needed; 2) To determine the basic density of wood (main parameter in the precision of subsequent calculations); 3) To estimate the volume to extract and 4) To take samples of wood in field. Our results showed that with this methodology we obtained greater amount of A. religiosa wood than the needed without showing significant differences (P>0.05) between sampling sites. In conclusion, this methodology was successful for this conifer, however future studies are required in order to determine if it can be applied in other softwood species.RESUMEN La madera ha sido un recurso natural ampliamente utilizado por la humanidad. Particularmente, la madera de coníferas destaca por su importancia ecológica, económica y distribución geográfica en comparación con otros taxa. Algunos usos de las diferentes especies maderables se basan en la evaluación de sus propiedades físicas, así como en el análisis de sus principales propiedades químicas. Para esto último, es deseable una metodología óptima para la toma de muestra de madera (TMM) en árboles en pie. Estas metodologías son escasas y pocas consideran anticipadamente en conjunto, tanto la cantidad necesaria de madera para las determinaciones químicas (toma de muestra racional) como también una toma de muestra no destructiva (sin talar los árboles). Por esta razón el objetivo del presente estudio fue desarrollar una metodología paso a paso que describa la TMM de coníferas de forma racional y no destructiva. La metodología TMM se evaluó en Abies religiosa a lo largo de diferentes sitios de muestreo y consiste en cuatro pasos: 1) Definir la cantidad de madera necesaria; 2) Determinar la densidad básica de la madera (parámetro más importante en la precisión de posteriores cálculos); 3) Calcular el volumen a extraer y 4) Tomar las muestras de madera en campo. Los resultados mostraron que la cantidad de madera de A. religiosa obtenida con la metodología fue mayor a la necesaria, sin presentar diferencias significativas (P ˃ 0.05) entre los sitios de muestreo. En conclusión, la metodología fue exitosa para esta conífera, sin embargo, se requieren estudios posteriores para determinar si podrá aplicarse en otras especies de maderas de coníferas

Microscopy-based chromosome conformation capture enables simultaneous visualization of genome organization and transcription in intact organisms

Eukaryotic chromosomes are organized in multiple scales, from nucleosomes to chromosome territories. Recently, genome-wide methods identified an intermediate level of chromosome organization, topologically associating domains (TADs), that play key roles in transcriptional regulation. However, these methods cannot directly examine the interplay between transcriptional activation and chromosome architecture while maintaining spatial information. Here we present a multiplexed, sequential imaging approach (Hi-M) that permits simultaneous detection of chromosome organization and transcription in single nuclei. This allowed us to unveil the changes in 3D chromatin organization occurring upon transcriptional activation and homologous chromosome unpairing during awakening of the zygotic genome in intact Drosophila embryos. Excitingly, the ability of Hi-M to explore the multi-scale chromosome architecture with spatial resolution at different stages of development or during the cell cycle will be key to understanding the mechanisms and consequences of the 4D organization of the genome. Cardozo Gizzi et al. developed Hi-M, a multiplexed imaging-based approach to detect 3D chromatin folding in single cells within intact Drosophila embryos. The ability of Hi-M to detect the spatial organization of cells enabled measurement of changes in TAD organization during early embryogenesis and upon transcriptional activation.Fil: Cardozo Gizzi, Andres Mauricio. Instituto Universitario de Ciencias Biomédicas de Córdoba; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Université Montpellier II; FranciaFil: Cattoni, Diego Ignacio. Université Montpellier II; Francia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; ArgentinaFil: Fiche, Jean-Bernard. Centre de Biochimie Structurale; FranciaFil: Espínola, Sergio Martín. Centre de Biochimie Structurale; FranciaFil: Gurgo, Julián Roberto. Centre de Biochimie Structurale; FranciaFil: Messina, Olivier. Centre de Biochimie Structurale; FranciaFil: Houbron, Christophe. Centre de Biochimie Structurale; FranciaFil: Ogiyama, Yuki. Institute Of Human Genetics; FranciaFil: Papadopoulos, Giorgio L.. Institute Of Human Genetics; FranciaFil: Cavalli, Giacomo. Institut de Génétique Humaine, Cnrs Umr 9002; Francia. Institute Of Human Genetics; FranciaFil: Lagha, Mounia. Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier; FranciaFil: Nollmann, Marcelo. Centre de Biochimie Structurale; Franci