Identification of cell-of-origin breast tumor subtypes in inflammatory breast cancer by gene expression profiling

Inflammatory breast cancer (IBC) is an aggressive form of locally advanced breast cancer with high metastatic potential. Most patients have lymph node involvement at the time of diagnosis and 1/3 of the patients have distant metastases. In a previous study, we demonstrated that IBC is a distinct form of breast cancer in comparison with non-IBC. The aim of this study was to investigate the presence of the different molecular subtypes in our data set of 16 IBC and 18 non-IBC specimen. Therefore, we selected an ‘intrinsic gene set’ of 144 genes, present on our cDNA chips and common to the ‘intrinsic gene set’ described by Sorlie et al. [PNAS, 2003]. This set of genes was tested for performance in the Norway/Stanford data set by unsupervised hierarchical clustering. Expression centroids were then calculated for the core members of each of the five subclasses in the Norway/Stanford data set and used to classify our own specimens by calculating Spearman correlations between each sample and each centroid. We identified the same cell-of-origin subtypes in IBC as those already described in non-IBC. The classification was in good agreement with immunohistochemical data for estrogen receptor protein expression and cytokeratin 5/6 protein expression. Confirmation was done by an alternative unsupervised hierarchical clustering method. The robustness of this classification was assessed by an unsupervised hierarchical clustering with an alternative gene set of 141 genes related to the cell-of-origin subtypes, selected using a discriminating score and iterative random permutation testing. The contribution of the different cell-of-origin subtypes to the IBC phenotype was investigated by principal component analysis. Generally, the combined ErbB2-overexpressing and basal-like cluster was more expressed in IBC compared to non-IBC, whereas the combined luminal A, luminal B and normal-like cluster was more pronounced in non-IBC compared to IBC. The presence of the same molecular cell-of-origin subtypes in IBC as in non-IBC does not exclude the specific molecular nature of IBC, since gene lists that characterize IBC and non-IBC are entirely different from gene lists that define the different cell-of-origin subtypes, as evidenced by principal component analysis.Peer Reviewedhttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/44236/1/10549_2005_Article_9015.pd

Les colites chroniques inclassées (une forme particulière de maladie inflammatoire chronique de l'intestin)

Les maladies inflammatoires chroniques intestinales (MICI) sont rares mais non exceptionnelles. On peut les scinder en deux grandes entités nosologiques : la maladie de Crohn (MC) et la Rectocolite Hémorragique (RCH). Sur des arguments cliniques, endoscopiques, anatomopathologiques ou biologiques, le clinicien s'attache à classer chaque cas en MC ou RCH. Cependant, pour 1 à 2% des cas, le type de la colite inflammatoire reste indéterminé et on parle alors de colite chronique inclassée (CCI). Le cas clinique étudié dans cette thèse est original car il s'est présenté successivement sous l'apparence d'une MC, d'une RCH puis à nouveau comme une MC. Sont discutés dans cette thèse les moyens du diagnostic différentiel des MICI et leurs formes intermédiaires.ROUEN-BU Médecine-Pharmacie (765402102) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Maladie de Crohn compliquée de syndrome de grêle court, traité par nutrition parentérale à domicile (caractéristiques des patrients et facteurs de gravité associés)

Introduction : Le syndrome de grêle court (SGC) nécessitant une nutrition parentérale à domicile (NPAD) est une complication rare de la maladie de Crohn (MC). Son incidence, ses caractéristiques, ses facteurs associés et son pronostic au cours de la MC sont mal connus. Le but de cette étude était de déterminer les caractéristiques épidémiologiques et cliniques du SGC associé à la MC. Méthodes : Tous les dossiers des malades, atteints de MC compliquée de SGC (grêle résiduel 1 an, suivis dans un centre agréé de NPAD entre 1986 et 2004, ont été étudiés. Les caractéristiques de la MC, l'ensemble des traitements médicaux et chirurgicaux ont été analysés. Résultats : 38 malades (18 F, 20 H) ont été inclus. L'atteinte initiale de la MC était grêlique (21%), iléocolique (68%) ou colique (11%), associée à des lésions anopérinéales (LAP) d'emblée dans 32% des cas. 55% étaient fumeurs. La date du diagnostic de MC était med [ext] 1981 [1960-2004], l'incidence du SGC n'a pas diminué avec le temps (1,4/an entre 1986 et 1995 et 2,2/an entre 1996 et 2006). Le délai de survenue du SGC après le diagnostic de MC était de 15 (2-32) ans. Le nombre moyen de résections du grêle était de 3[1-8] par patient. La longueur totale reséquée était de 160 cm [40-330], celle de grêle résiduel de 80 cm [0-190]. La longueur de grêle initiale (L réséquée + L résiduelle) était de 260 [160-340] cm. La chirurgie en urgence (20% des cas) et/ou pour une complication perforative (35.5% des cas) était associée à une longueur réséquée plus grande (61 [5-250) vs 35 [5-120] cm, p=0,0003). La MC a eu une évolution phénotypique rapide, 24% des patients développant une sténose dans un délai de 1 an [0-15], et 76% une perforation dans un délai de 2 ans [0-I S]. L'évolution rapide du phénotype était associée à un délai plus court de survenue du SGC. Les autres facteurs associés au SGC étaient un tabagisme actif ou des LAP au diagnostic de MC et une longueur de grêle initiale plus courte (p=0,025). Globalement, 58% des patients ont reçu un immunosuppresseur (IS), 16% un anti TNF avant la survenue du SGC. La mise sous IS avant SGC a augmenté avec le temps (86% après vs 42% avant 1981 ; p<0.025). Sous NPAD, le pronostic reste sévère. 6 décès sont survenus dans un délai de 4.5 [1-19] ans après le début de la NPAD, liés à la MC (n=2), à la NPAD (n=2) ou de cause intercurrente (n=2). La sévérité évolutive de la MC sous NPAD a justifié la mise sous IS (n=5) ou anti TNF (n=6) et des réinterventions dans 7 cas (3 amputations rectales, 2 résections du grêle et 2 chirurgies de LAP). Conclusion : Notre étude montre que le SGC est une complication rare mais grave de la MC. Son incidence ne diminue pas malgré l'utilisation plus fréquente des IS et des anti-TNF. Les conditions de réalisation de la chirurgie (urgence, complications) semblent jouer un rôle mineur dans la survenue du SGC qui semble avant tout liée à la sévérité évolutive de la MC.ROUEN-BU Médecine-Pharmacie (765402102) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Evaluation non invasive de l'atteinte hépato-biliaire de patients adultes atteints de mucoviscidose

La mucoviscidose est secondaire à la mutation d'un gène du bras long du chromosome 7 codant pour la protéine CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator). impliquée dans les mouvements des ions chlorure au niveau des cellules épithéliales de l'organisme. La cirrhose biliaire focale est la lésion pathognomonique de l'atteinte hépato-biliaire liée à la mucoviscidose. Les complications liées à l'hypertension portale, représentent à l'heure actuelle la 2ème cause de mortalité chez ces patients après l'insuffisance respiratoire. L'évaluation de l'atteinte hépato-biliaire chez ces patients reposait jusqu'alors sur l'échographie abdominale, l'endoscopie digestive haute et exceptionnellement soir l'analyse histologique du foie. Objectifs : Le but de notre étude était d'évaluer l'atteinte hépato-hiliaire d'une cohorte d'adultes atteints de mucoviscidose. par 4 méthodes non invasives les tests hépatiques, la mesure du FibroMètre®, la mesure de l'élasticité du foie par le FibroScan® et l'IRM hépato-bilio-pancréatique. Matériels et méthodes : Nous avons proposé à la majorité des patients adultes atteints de mucoviscidose suivis dans le Service de Pneumologie du CHU de Rouen. de participer à cette étude menée entre Juillet 2009 et Juillet 2010. Tous les patients ont bénéficié d'un bilan biologique comportant des tests hépatiques, le calcul du FibroMètre® et dune mesure de l'élasticité du foie par le FibroScan®. Une partie des patients ont eu une IRM hépato-bilio-pancréatique. Résultats : Quarante neuf patients ont signé le consentement. Quarante quatre patients ont eu un FibroScan® interprétable (TDR > 60% et IQR<30%). Vingt six patients ont eu l'IRM. Notre étude a montré que 51% et 22,4% des patients avaient respectivement- au moins 1 et 2 explorations anormales sur les 4 réalisées. Au moins 2 enzymes hépatiques étaient anormales chez 12.2% des patients. Une fibrose hépatique au moins modérée était suggérée par le FibroMètre® chez chez 12,2% et par le FibroScan® chez 18,2% des patients. Les anomalies hépato-biliaires détectées en IRM chez 53,8% des patients étaient une dysmorphie hépatique (27%), une hypertension portale (31%) et une cholangiopathie (19%). Il n'y avait pas de liaison significative entre les différentes méthodes d'exploration. Conclusion : Le point fort de notre étude était la comparaison de l'analyse morphologique du foie et des voies biliaires par l'IRM, aux méthodes d'exploration de la fibrose hépatique. L'absence de liaison significative retrouvée entre I'IRM et les différents tests d'évaluation de la fibrose hépatique. FibroScan® et FibroMètre®, suggère que ces explorations sont complémentaires et que l'intérêt de leur association mérite d'être étudié sur un plus grand nombre de malades.ROUEN-BU Médecine-Pharmacie (765402102) / SudocSudocFranceF

ETUDE DE LA SYNTHESE PROTEIQUE INTESTINALE A L'AIDE D'ISOTOPES STABLES CHEZ L'HOMME

PARIS7-Bibliothèque centrale (751132105) / SudocSudocFranceF

PRISE EN CHARGE DU PATIENT DENUTRI A DOMICILE PAR LE MEDECIN GENERALISTE (ASPECTS PRATIQUES ET REGLEMENTAIRES)

RENNES1-BU Santé (352382103) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Gastrointestinal: Fistulae in Crohn's disease.

International audienc