Bioremediation of Wastewaters of Sugarcane Biorefineries

In addition to sugar, sugarcane biorefineries emerge as the integration of different sugarcane industries and produce several wastes and wastewaters that are disposed into the environment. In biorefineries and other facilities, these wastes are used to produce several chemicals, including bioplastics and bioethanol. However, these industries use a greater amount of fresh water and their effluents, which have high amounts of solids and are released mostly into water or used for crop irrigation. Inadequately treated and indiscriminately disposing and discharging of effluents to the environment contributes to a greater risk of pollution of soils and waters. Therefore, to minimize the side effects, control the environmental burden, grow the beneficiaries of waste, and sustain a healthy environment for the future, proper management of industrial wastes is important

Tarımsal Üretimde Yararlanılan Trichoderma Ürünleri ve Metabolitleri

Fitopatojenik ajanların sebep olduğu bitki hastalıklarıyla, önemli ölçüde ürün kayıpları meydana gelmektedir. Dünya üzerindeki birçok ülkede,  tarımda pestisit uygulamalarını ve bağımlılığını azaltacak, tüketici ve çevre güvenliğini arttıracak yasal yaptırımlar uygulanmaya başlamıştır. Yönetmelikler ile integre zararlı düzenlemesinin uygulamaya konulmasını teşvik edecek gerekli şartların oluşumuna ve aynı zamanda ticari ürünlerin güvenliğinin sağlanmasına da çalışılmaktadır. Trichoderma spp. mikrobiyal biyokontrol ajanı olarak en yaygın kullanılan ve çalışılan funguslar arasındadır. Trichoderma ürünleri, biyopestisit, biyofungusit, biyoinokulant, biyo-stimulant, biyodekompoze edici, biyofertilize edici ve bitki büyüme teşvikleyicileri olarak kullanılmaktadır. Yararlı etkileri için bitkilerle muamele edilmelerinin altında yatan başlıca mekanizmalar;  mikoparazitizm veya hiperparazitizm, antibiyozis, kompetisyon, hücre duvarlı litik enzim aktivitesi, bitki büyümesinin arttırılması, toprakta bulunan besin elementlerinin kazanımı ve bitki savunma cevaplarının indüklenmesi olarak sayılabilir. Bu derlemede, tarımsal üretimde yararlanılan Trichoderma türleri ve başlıca sekonder metabolitleri ile fungal patojenler veya bitkiler ile arasındaki interaksiyonlar üzerine odaklanılmıştır

Progresses on Metagenomic Airbiome Studies

The term microbiome refers to the collective genome of the microbial communities living in various environments/habitats, and recently, the understanding of microbiome have been significantly enhanced by metagenomic studies. The data at hand regarding marine and soil-related microbial communities is much more than that of the air, which is typically not colonized, and the number of publications sharp contrasts to those of air. Aerosols of biological origin (bioaerosols) are a subset of atmospheric particulate matter (PM), which are emitted directly from the biosphere into the atmosphere, and play a vital role in the system of theEarth, particularly in the interactions between atmosphere, biosphere, climate and public health. However, these particles could either be the direct cause of epidemics of infectious diseases or noninfectious diseases (e.g. hypersensitivity to aeroallergens). These bioparticles emitted by humans or re-suspended from surfaces in indoor environments are also challenging for infection control and safety. It is estimated that humans emit approximately 106 particles per hour into the surrounding air under seated conditions. The sources, abundance, composition and effects of bioaerosols and the atmospheric microbiome are not yet well characterized; however, there is a continually increasing number of published studies. In this review, current progresses and conducted studies on airborne metagenomics were described and the health effects of aerosols to global perspective were overviewed

Trichoderma-based Products and Metabolites Used in Agricultural Production

Fitopatojenik ajanların sebep olduğu bitki hastalıklarıyla, önemli ölçüde ürün kayıpları meydana gelmektedir. Dünya üzerindeki birçok ülkede, tarımda pestisit uygulamalarını ve bağımlılığını azaltacak, tüketici ve çevre güvenliğini arttıracak yasal yaptırımlar uygulanmaya başlamıştır. Yönetmelikler ile integre zararlı düzenlemesinin uygulamaya konulmasını teşvik edecek gerekli şartların oluşumuna ve aynı zamanda ticari ürünlerin güvenliğinin sağlanmasına da çalışılmaktadır. Trichoderma spp. mikrobiyal biyokontrol ajanı olarak en yaygın kullanılan ve çalışılan funguslar arasındadır. Trichoderma ürünleri, biyopestisit, biyofungusit, biyoinokulant, biyo-stimulant, biyodekompoze edici, biyofertilize edici ve bitki büyüme teşvikleyicileri olarak kullanılmaktadır. Yararlı etkileri için bitkilerle muamele edilmelerinin altında yatan başlıca mekanizmalar; mikoparazitizm veya hiperparazitizm, antibiyozis, kompetisyon, hücre duvarlı litik enzim aktivitesi, bitki büyümesinin arttırılması, toprakta bulunan besin elementlerinin kazanımı ve bitki savunma cevaplarının indüklenmesi olarak sayılabilir. Bu derlemede, tarımsal üretimde yararlanılan Trichoderma türleri vebaşlıca sekonder metabolitleri ile fungal patojenler veya bitkiler ile arasındaki interaksiyonlar üzerine odaklanılmıştır.Phytopathogenic agents cause considerable crop losses incurred by plant diseases worldwide. The most goverments in World, have started to implement legislative mandates in order to reduce the pesticide applications and dependency in agriculture and increase the environmental and consumers safety. By implementing integrated pest management [IPM], it is aimed to establish the necessary conditions to employ these practices. Trichoderma is among the best known and widely used fungal genera as biocontrol agent. Products of Trichoderma and itself, are promoted as bio-pesticide, bio-fungicide, bio-inoculant, bio-stimulant, bio-decomposer, bio-fertilizer, plant growth stimulator. Main mechanisms underlying its beneficial properties are; mycoparasitism, hyperparasitism, antibiosis, competition, cell wall lytic enzymes, enhancement of plant growth, acquisiton of soil nutrients, induction of plant defense responses. In this review, we focused on the Trichoderma and its secondary metabolites that are used in agriculture and their interactions between phytopathogens and plants

Colonial and morphological characteristics of some Aspergillus Fr.: Fr. Species isolated from vineyards in Manisa and İzmir provinces (Turkey)

Five Aspergillus Fr.:Fr. species and 3 varieties were described from the point of view of colonial and morphological characteristics. These species and varietes are isolated from soil, grape and sultana raisins from vineyards in Manisa and Izmir provinces (Turkey). These are as follows: A. flavofurcatus Bat. ;amp; H.Maia, A. heteromorphus Bat. ;amp; H.Maia, A. pulverulentus (McAlpine) Wehmer, A. unguis (Emile-Weil ;amp; L.Gaudin) Thom ;amp; Raper, A. viridinutans Ducker ;amp; Thrower, A. foetidus Thorn ;amp; Raper var. pallidus (Nakaz., Simo ;amp; A.Watan.) Raper ;amp; Fennell, A. foetidus Thorn ;amp; Raper var. acidus (Nakaz., Simo and A.Watan.) Raper ;amp; Fennell and A. nidulans (Eidam) G.Winter var. acristatus Fennell ;amp; Raper. The final 2 are cited for the first time in Turkey.Bu çalışmada beş Aspergillus Fr:Fr türü ve üç varyetesi koloni ve morfolojik özellikleri bakımından tanımlanmıştır. Bu tür ve varyeteler Manisa ve izmir illerindeki sultani cinsi üzüm bağı toprakları ile yaş ve kuru üzümlerden izole edilerek tanımlanmışlardır. Bunlar; A. flavofurcatus Bat. ; H.Maia, A. heteromorphus Bat. ; H.Maia, A. pulveru/entus (McAlpine) Wehmer, A. unguis (Emile-Weil ; L.Gaudin) Thom ; Raper, A. viridinutans Ducker ; Thrower, A. foetidus Thom ; Raper var. pallidus (Nakaz., Simo ; A.Watan.) Raper ; Fennell, A. foetidusTnom ; Raper var. acidus (Nakaz., Simo ; A.Watan.) Raper ; Fennell ve A. nidulans (Eidam) G.Winter var. acristatus Fennell ; Raper'dır. Belirtilen son iki tür Türkiye mikoflorası için ilk kez belirtilmektedir