Population modeling of early COVID-19 epidemic dynamics in French regions and estimation of the lockdown impact on infection rate

We propose a population approach to model the beginning of the French COVID-19 epidemic at the regional level. We rely on an extended Susceptible-Exposed-Infectious-Recovered (SEIR) mechanistic model, a simplified representation of the average epidemic process. Combining several French public datasets on the early dynamics of the epidemic, we estimate region-specific key parameters conditionally on this mechanistic model through Stochastic Approximation Expectation Maximization (SAEM) optimization using Monolix software. We thus estimate basic reproductive numbers by region before isolation (between 2.4 and 3.1), the percentage of infected people over time (between 2.0 and 5.9% as of May 11 th , 2020) and the impact of nationwide lockdown on the infection rate (decreasing the transmission rate by 72% toward a R e ranging from 0.7 to 0.9). We conclude that a lifting of the lockdown should be accompanied by further interventions to avoid an epidemic rebound

Evaluation des déversements de pluies d'orage et de leurs effets sur un petit ruisseau périurbain, le Peugue

Objective of the three-year monitoring study on the Peugue, which started in 1996, was to understand the effects of wet weather flows and runoff pollutants on the Peugue ecosystem from upstream to downstream, in order to design an optimal management program for flood protection while maintaining protection for the Peugue ecosystem, and then to develop a transposable general methodology for measuring the effects of stormwater on the aquatic ecosystem. During rainfall events, the Peugue river is used as a separate stormwater sewer system. The basin drains a 676-ha semi-urban area. In the upstream part of this catchment, the residential development is new and sparse with many wooded areas. Housing becomes more and more dense in the downstream part. The descriptive linear approach of the Peugue stream allowed the highlighting of various basic elements relative to the functioning of this system. On a hydrological level, the inertia of the flow related to the rain is weak. The flow variations (measured at Le Burck) are significant and sudden, able to pass in one hour from a few tens of l/s to more than one m3/s. From the whole of the analytical results obtained, the physicochemical quality of the Peugue water arises strongly degrading from upstream to downstream. The metal contents of the sediments are in the same order of magnitude as those measured on surface corings carried out in the laying-up of Bourgailh basin. Macrophyte index results are in good coherence with the results of physicochemical quality of water. This is particularly well illustrated between Peugue and its affluent. More generally, a good correlation between the various biological (macrophytes, diatoms) and physico-chemical parameters and the various discharges indexed is registered

Brucella beta 1,2 cyclic glucan is an activator of human and mouse dendritic cells

Bacterial cyclic glucans are glucose polymers that concentrate within the periplasm of alpha-proteobacteria. These molecules are necessary to maintain the homeostasis of the cell envelope by contributing to the osmolarity of Gram negative bacteria. Here, we demonstrate that Brucella beta 1,2 cyclic glucans are potent activators of human and mouse dendritic cells. Dendritic cells activation by Brucella beta 1,2 cyclic glucans requires TLR4, MyD88 and TRIF, but not CD14. The Brucella cyclic glucans showed neither toxicity nor immunogenicity compared to LPS and triggered antigen-specific CD8(+) T cell responses in vivo. These cyclic glucans also enhanced antigen-specific CD4(+) and CD8(+) T cell responses including cross-presentation by different human DC subsets. Brucella beta 1,2 cyclic glucans increased the memory CD4(+) T cell responses of blood mononuclear cells exposed to recombinant fusion proteins composed of anti-CD40 antibody and antigens from both hepatitis C virus and Mycobacterium tuberculosis. Thus cyclic glucans represent a new class of adjuvants, which might contribute to the development of effective antimicrobial therapies

Revue sur les techniques de contrôle des plantes aquatiques

The various available aquatic plant control methods, whether mecanical, chemical, biological methods or habitat manipulations are reviewed. Their respective use in France are also described. / Les diverses méthodes de contrôle des plantes aquatiques disponibles, mécaniques, chimiques, biologiques et manipulations des habitats sont passées en revue. Leurs utilisations respectives en France sont également présentées

Surveillance des sols dans l'environnement par télédétection et systèmes d'information géographiques = Monitoring soils in the environment with remote sensing and GIS

Le potentiel d'infiltration des sols constitue un des paramètres essentiels intervenant dans les modèles hydrodynamiques décrivant le comportement des nappes. Classiquement, l'estimation de ce potentiel d'infiltration est basée sur la paramétrisation d'une cartographie pédologique des sols, mais celle-ci est souvent non disponible et serait beaucoup trop lourde à mettre en oeuvre en sus des campagnes de prospection hydrogéologique. Dans ces circonstances, le BRGM a jugé essentiel de tester les possibilités offertes par la télédétection satellitaire. L'objectif est d'aboutir à une cartographie des états de surface des sols fondée sur des relations entre états de surfaces et potentiels d'infiltration. Le résultat est alors directement intégrable dans les processus de modélisation hydrogéologiques. La zone test choisie est située à 100 km au nord de Gaborone, où le BRGM était intervenu, à l'aide d'une campagne hydrogéologique complète, pour contribuer à l'approvisionnement en eau de la capitale du Botswana. Cette zone où l'archive hydrogéologique est importante (géophysique, géochimie, géologie structurale et nombreux forages) offre en outre l'avantage de présenter une couverture végétale faible et donc de montrer assez directement l'état minéral des sols. L'approche par télédétection s'appuie sur une classification supervisée des images Landsat. Les résultats des classifications ont permis de préciser les interprétations des spatiocartes en terme d'états de surface ; les interprétations sont étalonnées sur le terrain afin d'établir une cartographie de leur potentiel d'infiltration (202 points de contrôle). Les résultats cartographiques sont intégrés au modèle hydrodynamique MARTHE. Pour estimer le potentiel de la cartographie par télédétection, la comparaison est faite avec un produit cartographique de référence établi par le modèle MARTHE. (Résumé d'auteur

Distribution de Ludwigia en France : étude des causes de l'expansion récente en Camargue

The current distribution of Ludwigia uruguayensis and L.peploides has been given by a litterature survey and by a national survey. A recent growth of the geographic distribution of these two species, especially along the Atlantic front, has been observed. The commercialization as ornamental species seems to be the main cause of implantation in several regions where the species then multiply by cuttings along the river streams. The results of an experiment show that the L.grandiflora production is extremely influenced by drought and salinity (within the rnge 0 to 10g/l). The current management of the Camargue marshes, which tends to drastically reduce the salinity and summer drought, might explain the recent growth of L.grandiflora in Camargue. / La distribution actuelle de Ludwigia uruguayensis et L. peploides a été établie à partir de l'étude de la littérature et par une enquête nationale. Les deux espèces montrent une extension récente de leur distribution géographique particulièrement le long de la façade atlantique. La commercialisation comme espèce ornementale semble être responsable de l'implantation dans plusieurs régions où les espèces se propagent ensuite principalement par voie végétative le long des cours d'eau. Les résultats d'une expérience montrent que la production de L. grandiflora est très affectée par la sécheresse et la salinité (dans la gamme 0 à 10 g/l.). La gestion actuelle des marais de Camargue qui vise à réduire fortement la salinité et la sécheresse estivale semble pouvoir expliquer l'expansion récente de L. grandiflora en Camargue