Colonization and virulence factors of methicillin resistant Staphylococcus aureus in a pediatric population in Montería, Colombia

Introducción: Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) puede colonizar el cuer- po humano, con mayor frecuencia en las fosas nasales, pero también en las manos, el periné y la faringe. Además, se ha propuesto que la colonización puede ser un factor de riesgo para adquirir infecciones futuras. Objetivo: determinar la prevalencia y las características microbiológicas y moleculares del SARM en una población infantil sana. Metodología: se hizo un estudio descriptivo transversal para determinar la tasa de coloni- zación nasal por SARM en 150 niños pertenecientes a 13 hogares infantiles de la ciudad de Montería. Los aislamientos se hicieron a partir de hisopados nasales y faríngeos, se identifica- ron mediante pruebas microbiológicas convencionales y se confirmaron y caracterizaron por métodos moleculares. Resultados: la tasa de colonización por SARM fue del 9,3% (14/150). El 62,5% de los aislamien- tos portaban el SCCmec subtipo IVc; 87,5% de los aislamientos presentaron los genes que codifican para PVL y Sek, mientras que 81,2% portaban el gen bsaB. Conclusión: el porcentaje de colonización hallado es uno de los más altos reportados para la población infantil de la región Caribe colombiana, y los aislamientos presentaron factores de virulencia relacionados con cuadros clínicos agresivos.Introduction: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is able to colonize the human body, most frequently the nostrils, but also the hands, peri-neum and throat. Such colonization has been propo-sed as a risk factor to acquire future infections. Objective: To determine the prevalence, and the mi-crobiological and molecular characteristics of MRSA in healthy children. Methodology: A cross-sectional descriptive study was done of 150 children from 13 day care centers in Mon-tería, Colombia. Nasal and throat swabs were obtai-ned. The isolates were dentified and characterized by microbiological and molecular methods. Results: The MRSA colonization rate was 9.3% (14/150). 62.5% of the isolates carried the subtype IVc of SCCmec, and 87.5% had the genes encoding for PVL and Sek, while 81.2% carried the gene bsaB. Conclusion: The percentage of colonization found is one of the highest reported among children from the Colombian Caribbean region, and the isolates have virulence factors that have been associated with an aggressive clinical course

Factores ambientales en la transmisión del SARS-CoV-2/COVID 19: panorama mundial y colombiano

Introducción: diversas investigaciones han intentado establecer el impacto de algunos parámetros meteorológicos y de calidad del medio ambiente en la transmisión del SARS-CoV-2, tomando en consideración las características geográficas de cada país y con el fin de mitigar el avance de la enfermedad mediante el control de esos factores. Objetivo: analizar la evidencia existente sobre la posible relación entre factores ambientales y la morbilidad y mortalidad por SARS-CoV-2/COVID-19 en el panorama mundial y colombiano. Metodología: se realizó una revisión exhaustiva de la literatura científica en las bases de datos electrónicas. Además, se analizó el impacto de algunas variables ambientales y la gravedad de los casos de COVID-19 durante el período del 8 de abril al 29 de juliode 2020 en la ciudad Bogotá. Resultados: el análisis correlacional entre la ocupación de camas UCIs en Bogotá con los factores ambientales como temperatura, las concentraciones de PM2.5, O3, NO, NO2 y CO mostraron una relación inversamente significativa. Entre tanto, se presentó una correlación positiva entre los niveles de óxidos de nitrógeno (NO/NO2) y el monóxido de carbono (CO). Algunos de estos resultados posiblemente están relacionados con los efectos de la cuarentena impuesta por el gobierno local. Conclusión: a nivel mundial existe suficiente evidencia para relacionar algunas condiciones y parámetros ambientales con un aumento en la morbilidad y mortalidad por COVID-19. Las evidencias a nivel nacional aún son escasas.Introducción: diversas investigaciones han intentado establecer el impacto de algunos parámetros meteorológicos y de calidad del medio ambiente en la transmisión del SARS-CoV-2, tomando en consideración las características geográficas de cada país y con el fin de mitigar el avance de la enfermedad mediante el control de esos factores. Objetivo: analizar la evidencia existente sobre la posible relación entre factores ambientales y la morbilidad y mortalidad por SARS-CoV-2/COVID-19 en el panorama mundial y colombiano. Metodología: se realizó una revisión exhaustiva de la literatura científica en las bases de datos electrónicas. Además, se analizó el impacto de algunas variables ambientales y la gravedad de los casos de COVID-19 durante el período del 8 de abril al 29 de julio de 2020 en la ciudad Bogotá. Resultados: el análisis correlacional entre la ocupación de camas UCIs en Bogotá con los factores ambientales como temperatura, las concentraciones de PM2.5, O3, NO, NO2 y CO mostraron una relación inversamente significativa. Entre tanto, se presentó una correlación positiva entre los niveles de óxidos de nitrógeno (NO/NO2) y el monóxido de carbono (CO). Algunos de estos resultados posiblemente están relacionados con los efectos de la cuarentena impuesta por el gobierno local. Conclusión: a nivel mundial existe suficiente evidencia para relacionar algunas condiciones y parámetros ambientales con un aumento en la morbilidad y mortalidad por COVID-19. Las evidencias a nivel nacional aún son escasas.Introduction: several investigations have attempted to establish the impact of some meteorological and environmental parameters on the transmission of SARS-CoV-2, considering each country’s geographical characteristics and seeking to mitigate the disease’s advancement by controlling these factors. Objective: Analyze the evidence on the possible relationship between environmental factors, morbidity, and mortality due to SARS-CoV-2/COVID-19, both globally and within Colombia. Methodology: A comprehensive review of the scientific literature was carried out in the electronic databases. Additionally, the impact of some environmental variables and the severity of COVID-19 cases were analyzed during the period from April 8 to July 29, 2020, for the city of Bogotá. Results: The correlational analysis between the ICU admission rates in Bogotá and the environmental factors like temperature, PM2.5, O3, NO, NO2 y CO levels, and ozone concentration showed an inversely significant relationship. Meanwhile, there was a positive correlation between the levels of nitrogen oxides (NO/NO2) and carbon monoxide (CO). Some of these results could be related to the effects of the quarantine imposed by local governments. Conclusion: Globally, there is enough evidence to link environmental conditions and parameters with increased morbidity and mortality for COVID-19. Evidence at the national level is still scarce

Micronucleus frequency and exposure to chemical mixtures in three Colombian mining populations

La industria minera colombiana ha experimentado un crecimiento significativo. Dependiendo de la escala y del mineral extraído, se generan mezclas químicas complejas que impactan la salud de las poblaciones ocupacionalmente expuestas y de las comunidades cercanas a los proyectos mineros. Cada vez hay más evidencias que sugieren que la inestabilidad cromosómica (CIN) es un vínculo importante entre el desarrollo de ciertas enfermedades y la exposición a mezclas complejas. Para comprender mejor los efectos de la exposición a mezclas complejas realizamos un estudio de biomonitorización en 407 individuos sanos de cuatro zonas: tres situadas en municipios que explotan sistemas mineros de diferente escala y una zona de referencia sin actividad minera. Se analizaron sistemas de minería a gran, mediana y pequeña escala en Montelíbano (Córdoba), minería artesanal y de pequeña escala (MAPE) en Nechí (Antioquia) y un sistema de minería cerrada en Aranzazu (Caldas). El área de referencia sin actividad minera se estableció en Montería (Córdoba). La ICP-MS midió la exposición multielemental en el cabello, y la NIC se evaluó mediante la técnica de micronúcleos en bloque de citocinesis (MNBN). La exposición a mezclas de elementos químicos fue comparable en trabajadores y residentes de las zonas mineras, pero significativamente superior en comparación con los individuos de referencia. En Montelíbano, el aumento de las frecuencias de MNBN se asoció con la exposición combinada a Se, Hg, Mn, Pb y Mg. Este patrón distintivo difirió significativamente de otras áreas. Específicamente, en Nechí, Cr, Ni, Hg, Se, y Mg emergieron como los principales contribuyentes a las frecuencias elevadas de MNBN. Por el contrario, una combinación de Hg y Ni desempeñó un papel en el aumento de MNBN en Aranzazu. Curiosamente, el Se se correlacionó consistentemente con el aumento de las frecuencias de MNBN en todas las áreas mineras activas. Los elementos químicos en Montelíbano muestran un rango más amplio en comparación con otras zonas mineras, reflejando las características de la minería de alto impacto y a gran escala en la zona. Esta investigación proporciona información valiosa sobre los efectos de la exposición a mezclas químicas, subrayando la importancia de emplear este enfoque en la evaluación del riesgo de las comunidades, especialmente las de las zonas residenciales. © 2023 Los autoresThe Colombian mining industry has witnessed significant growth. Depending on the scale and mineral extracted, complex chemical mixtures are generated, impacting the health of occupationally exposed populations and communities near mining projects. Increasing evidence suggests that chromosomal instability (CIN) is an important link between the development of certain diseases and exposure to complex mixtures. To better understand the effects of exposure to complex mixtures we performed a biomonitoring study on 407 healthy individuals from four areas: three located in municipalities exploiting different-scale mining systems and a reference area with no mining activity. Large, medium, and small-scale mining systems were analyzed in Montelibano (Córdoba), artisanal and small-scale mining (ASGM) in Nechí (Antioquia), and a closed mining system in Aranzazu (Caldas). The reference area with no mining activity was established in Montería (Córdoba). ICP-MS measured multi-elemental exposure in hair, and CIN was evaluated using the cytokinesis-block micronucleus technique (MNBN). Exposure to mixtures of chemical elements was comparable in workers and residents of the mining areas but significantly higher compared to reference individuals. In Montelibano, increased MNBN frequencies were associated with combined exposure to Se, Hg, Mn, Pb, and Mg. This distinct pattern significantly differed from other areas. Specifically, in Nechí, Cr, Ni, Hg, Se, and Mg emerged as the primary contributors to elevated frequencies of MNBN. In contrast, a combination of Hg and Ni played a role in increasing MNBN in Aranzazu. Interestingly, Se consistently correlated with increased MNBN frequencies across all active mining areas. Chemical elements in Montelibano exhibit a broader range compared to other mining zones, reflecting the characteristics of the high-impact and large-scale mining in the area. This research provides valuable insights into the effects of exposure to chemical mixtures, underscoring the importance of employing this approach in the risk assessment of communities, especially those from residential areas. © 2023 The Author

Colonization and virulence factors of methicillin resistant Staphylococcus aureus in a pediatric population in Montería, Colombia

Introduction: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is able to colonize the human body, most frequently the nostrils, but also the hands, perineum and throat. Such colonization has been proposed as a risk factor to acquire future infections. Objective: To determine the prevalence, and the microbiological and molecular characteristics of MRSA in healthy children. Methodology: A cross-sectional descriptive study was done of 150 children from 13 day care centers in Montería, Colombia. Nasal and throat swabs were obtained. The isolates were identified and characterized by microbiological and molecular methods. Results: The MRSA colonization rate was 9.3% (14/150). 62.5% of the isolates carried the subtype IVc of SCCmec, and 87.5% had the genes encoding for PVL and Sek, while 81.2% carried the gene bsaB. Conclusion: The percentage of colonization found is one of the highest reported among children from the Colombian Caribbean region, and the isolates have virulence factors that have been associated with an aggressive clinical course

Nuclear factor erythroid 2 – related factor 2 and its relationship with cellular response in nickel exposure: a systems biology analysis

Background: Nickel and nickel-containing compounds (NCC) are known human carcinogens. However, the precise molecular mechanisms of nickel-induced malignant transformation remain unknown. Proposed mechanisms suggest that nickel and NCC may participate in the dual activation/inactivation of enzymatic pathways involved in cell defenses against oxidative damage, where Nuclear factor-erythroid 2 related factor 2 (Nrf2) plays a central role. Methods: For assessing the potential role of proteins involved in the Nrf2-mediated response to nickel and NCC exposure, we designed an interactome network using the STITCH search engine version 5.0 and the STRING software 10.0. The major NCC-protein interactome (NCPI) generated was analyzed using the MCODE plugin, version 1.5.1 for the detection of interaction modules or subnetworks. Main centralities of the NCPI were determined with the CentiScape 2.2 plugin of Cytoscape 3.4.0 and main biological processes associated with each cluster were assessed using the BiNGO plugin of Cytoscape 3.4.0. Results: Water-soluble NiSO4 and insoluble Ni3S2 were the most connected to proteins involved in the NCPI network. Nfr2 was detected as one of the most relevant proteins in the network, participating in several multifunctional protein complexes in clusters 1, 2, 3 and 5. Ontological analysis of cluster 3 revealed several processes related to unfolded protein response (UPR) and response to endoplasmic reticulum (ER) stress. Conclusions: Cellular response to NCC exposure was very comparable, particularly concerning oxidative stress response, inflammation, cell cycle/proliferation, and apoptosis. In this cellular response, Nfr2 was highly centralized and participated in several multifunctional protein complexes, including several related to ER-stress. These results add evidence on the possible Ni2+ induced – ER stress mainly associated with insoluble NCC. In this scenario, we also show how protein degradation mediated by ubiquitination seems to play key roles in cellular responses to Ni

New Scenarios of Chagas Disease Transmission in Northern Colombia

Chagas disease (CD) is a systemic parasitic infection caused by the flagellated form of Trypanosoma cruzi. Córdoba department, located in the Colombian Caribbean Coast, was not considered as a region at risk of T. cruzi transmission. In this article, we describe the first acute CD case in Salitral village in Sahagún, Córdoba, confirmed by microscopy and serological tests. Our results draw attention to a new scenario of transmission of acute CD in nonendemic areas of Colombia and highlight the need to include CD in the differential diagnosis of febrile syndromes in this region

Venn diagram showing the frequency of manifestations and their combinations in the individuals with severe malaria (N = 50).

Venn diagram showing the frequency of manifestations and their combinations in the individuals with severe malaria (N = 50).</p

Cytokine and chemokine concentration by laboratory parameters in the entire study cohort population.

The median and interquartile ranges of the molecules are shown. Concentration in pg/ml. Total subjects (n = 156), severe malaria (n = 50), non-severe malaria (n = 56), healthy controls (n = 50).*Only infected subjects (n = 106).</p

Cytokine concentrations in patients with different laboratory parameters that determine severity in <i>P</i>. <i>vivax</i> malaria.

Severe thrombocytopenia (ST) (platelets ≤ 50,000/uL), mild/moderate thrombocytopenia (M/Mild) (50,000–150,000 platelets/uL). Glutamic-oxaloacetic transaminase (GOT) / Glutamic-pyruvic transaminase (GPT) above 40 U/L. The graphis in this figure include only patients with severe malaria. No significant differences were found in the levels of other cytokines (panel described in Table 1) not included in the figure.</p

Fig 4 -

Correlation of clinical parameters and cytokine levels in patients with A) non-severe and B) severe P. vivax malaria. The spot at the intersections between the variables indicates a correlation with p <0.05. The size and color of the spot is proportional to the strength of the correlation, blue for positive correlations and red for negative correlations (scale on the right). Epi_mal, previous malaria episodies; Par_count; parasite count; Hg; hemoglobin, Hto; hematocrit; Eryth, erythrocytes; Leu, leukocytes; Neu, neutrophils; Lymp, Lymphocytes; Mono, monocytes; Eos, Eosinophils; Bas, Basophils; Plate, platelets; Gly, glycemia; Creat, creatinine; T_Bilirubin, Total bilirubin; D_Bilirubin, direct bilirubin; GPT, Glutamic-pyruvic transaminase; GOT Glutamic-oxaloacetic transaminase.</p