Nod-Like Receptors: Cytosolic Watchdogs for Immunity against Pathogens

In mammals, tissue-specific sets of pattern-recognition molecules, including Nod-like receptors (NLR), enable concomitant and sequential detection of microbial-associated molecular patterns from both the extracellular and intracellular microenvironment. Repressing and de-repressing the cytosolic surveillance machinery contributes to vital immune homeostasis and protective responses within specific tissues. Conversely, defective biology of NLR drives the development of recurrent infectious, autoimmune and/or inflammatory diseases by failing to mount barrier functions against pathogens, to tolerate commensals, and/or to instruct the adaptive immune response against microbes. Better decoding microbial strategies that are evolved to circumvent NLR sensing will provide clues for the development of rational therapies aimed at curing and/or preventing common and emerging immunopathologies

Tetraphenylethylene-based glycoclusters with aggregation-induced emission (AIE) properties as high-affinity ligands of bacterial lectins

International audienceTetraphenylethylene (TPE) is fluorescent through aggregation induced emission (AIE) in water. Herein, TPE was used as the core of glycoclusters that target the bacterial lectins LecA and LecB of Pseudomonas aeruginosa. Synthesis of these TPE-based glycoclusters was accomplished by using azide-alkyne "click" chemistry. The AIE properties of the resulting glycoclusters could be readily verified, but imaging could not be pursued due to the overlap of the fluorescence signals from cells and bacteria. Nonetheless, the glycoclusters displayed nanomolar affinities toward LecA and LecB. Further evaluation in a cell-based anti-adhesive assay highlighted a limited decrease in adhesion (20%) for the fucosylated glycocluster. This confirmed that these TPE-based glycoclusters are indeed LecA and LecB high-affinity ligands. Nevertheless, the hypotheses involving their application in imaging or anti-adhesive therapy could not be verified

Growth of Yersinia pseudotuberculosis in human plasma: impacts on virulence and metabolic gene expression

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>In man, infection by the Gram-negative enteropathogen <it>Yersinia pseudotuberculosis </it>is usually limited to the terminal ileum. However, in immunocompromised patients, the microorganism may disseminate from the digestive tract and thus cause a systemic infection with septicemia.</p> <p>Results</p> <p>To gain insight into the metabolic pathways and virulence factors expressed by the bacterium at the blood stage of pseudotuberculosis, we compared the overall gene transcription patterns (the transcriptome) of bacterial cells cultured in either human plasma or Luria-Bertani medium. The most marked plasma-triggered metabolic consequence in <it>Y. pseudotuberculosis </it>was the switch to high glucose consumption, which is reminiscent of the acetogenic pathway (known as "glucose overflow") in <it>Escherichia coli</it>. However, upregulation of the glyoxylate shunt enzymes suggests that (in contrast to <it>E. coli</it>) acetate may be further metabolized in <it>Y. pseudotuberculosis</it>. Our data also indicate that the bloodstream environment can regulate major virulence genes (positively or negatively); the <it>yadA </it>adhesin gene and most of the transcriptional units of the pYV-encoded type III secretion apparatus were found to be upregulated, whereas transcription of the pH6 antigen locus was strongly repressed.</p> <p>Conclusion</p> <p>Our results suggest that plasma growth of <it>Y. pseudotuberculosis </it>is responsible for major transcriptional regulatory events and prompts key metabolic reorientations within the bacterium, which may in turn have an impact on virulence.</p

Performance de la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF dans l'identification des bactéries anaérobies impliquées en pathologie humaine

LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF

Réponse immunitaire de la muqueuse intestinale à l'agression par Yersinia pseudotuberculosis

REG3beta est une lectine de type C soluble qui joue un rôle dans l'immunité innée et la pathogenèse des maladies inflammatoires, mais son rôle exact reste mal compris. Dans cette thèse, nous décrivons une nouvelle fonction de cette protéine dans la régulation de l'inflammation et de la défense de l'hôte. Bien que l'expression de REG3beta est à la fois induite au cours d'une colite ou d'une infection entérique, son absence est associée à une baisse de l'élimination des bactéries et une augmentation des lésions inflammatoires de l'intestin. La libération de REG3beta est assujettie à la reconnaissance par TLR2 (mais pas par NOD2) de la flore commensale. Ainsi, nous avons constaté que cette protéine est essentielle dans la protection contre Yersinia pseudotuberculosis et ceux par l'engagement de la voie de signalisation dépendant de TLR2 (mais pas celle sous la dépendance de Nod2). REG3beta contribue à l'afflux de neutrophiles dans la muqueuse et est nécessaire pour optimiser l'expression d'un ensemble d'autres médiateurs de l'inflammation, dont RELMbeta (resistin-like molecule beta). Finalement, de par son implication dans la promotion de l'inflammation et la résolution d'une infection bactérienne, REG3beta est un pivot de la régulation de l'immunité intestinale dans le dialogue qu'entretiennent l'épithélium et la flore commensale.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF

Evaluation du potentiel de l'UF-1000i® à mesurer l'action antibactérienne des antibiotiques en milieu liquide (application à des isolats cliniques multi-résistants de Pseudomonas aeruginosa)

Certains auteurs ont décrit in vitro à l aide de courbe de bactéricidie en milieu liquide, une capacité de certains antibiotiques, caractérisés par leurs concentrations minimales inhibitrices (CMI) élevée envers la bactérie causale et répondus résistants sur l antibiogramme, à diminuer quand même l inoculum lorsqu ils sont associés. Mais, l étude de ces associations en milieu liquide est lourde sur le plan technique, coûteux à implémenter et n est donc pas disponible en routine de laboratoire. Nous avons évalué si l automate d analyse urinaire UF-1000i® de Sysmex- BioMérieux pouvait être détourné de son usage premier qui est de dénombrer par fluorocytométrie en flux les bactéries et les cellules présentes dans les urines pour effectuer des courbes de bactéricidie. Nous avons ainsi mesuré la faisabilité de cette nouvelle approche en étudiant en premier temps l action d antibiotique sur des souches bactériennes multi-sensibles et dans un second temps plusieurs associations d antibiotiques connues pour être ou non efficaces sur des souches infectantes de Pseudomonas aeruginosa multi-résistantes. Sur les souches ayant des CMI basses aux antibiotiques, il sous-estime le pouvoir bactéricide réel des antibiotiques et ne peut en aucun cas être considéré comme un équivalent de la méthode de référence. En revanche, son utilisation pour l étude d associations d antibiotiques sur des souches de P.aeruginosa multirésistants est plus encourageante puisqu il nous a permis de confirmer l efficacité ou non de certaines associations d antibiotiques connues comme tel dans la littérature. En outre, l inefficacité de l association est déjà visible dès la 3ème heure indiquant au clinicien les associations à éviter. La quantification de l inoculum bactérien prend quelques secondes au lieu de 24 à 48 heures pour la technique de référence. La facilité de manipulation permet de tester plus d associations avec l UF1000i® comparé à la méthode de référence ouvrant des alternatives thérapeutiques. Cette analyse est applicable à tout laboratoire possédant l UF1000i®.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF

Mise au point d'une méthode de quantification (PCR en temps réel) de la production de deux peptides anti-microbiens, les cryptidines -1 et -4, dans la muqueuse intestinale de la souris

LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Etude de la pharmacocinétique de l'association pipéracilline-tazobactam en utilisation intra-veineuse continue chez l'enfant neutropénique fébrile (analyse préliminaire des données pharmacocinétiques)

Dans les infections sévères et chez les patients immunodéprimés, la perfusion continue de b-lactamines après administration d une dose de charge semble être un moyen d optimiser les paramètres pharmacodynamiques et pharmacocinétiques de cette famille d antibiotique. Cette approche permet de maintenir une concentration d antibiotique au dessus de la concentration minimale inhibitrice (CMI) jusqu à 100% du temps avec un taux résiduel de plus de 4 à 6 fois la CMI des bactéries visées. Peu de données existent chez l enfant pour la perfusion continue d antibiotiques. C est pourquoi, une étude clinique a été débutée dans le service d onco-pédiatrie du CHRU de Lille pour évaluer les performances de l association pipéracilline-tazobactam avec ce mode d administration dans la neutropénie fébrile post-chimiothérapie de l enfant. Le choix de la posologie de la perfusion continue et de la dose de charge ont été établies à partir de données de la littérature recueillies chez des enfants septiques mais non neutropéniques ; l objectif choisi était de 6 fois la CMI pendant 100% du temps. La posologie de 300 mg/kg/j de pipéracilline après une dose de charge de 150, 100 ou 50 mg/kg a été choisie et un suivi par dosage de pipéracilline effectué. Le présent travail de thèse s est proposé d analyser les 21 premiers dosages. Nos résultats révèlent que l objectif de 100% du temps passé au dessus de 6 fois la CMI était non atteint pour 4 patients sur 6, 9 patients sur 11 et 4 patients sur 4 pour les trois groupes dose de charge de 150, 100 et 50 mg/kg respectivement. Ces résultats sont en dessous des valeurs des modèles prédictifs publiés dans la littérature. En utilisant les équations de pharmacocinétique du modèle monocompartimental, nous avons objectivé une diminution du volume de distribution et une augmentation de la clairance de la pipéracilline dans notre population d enfants neutropéniques. Un modèle statistique performant de prévision des concentrations sériques de pipéracilline, a ainsi été généré grâce à des simulations de Monte Carlo. Cette approche nous permet de dire la posologie de 300 mg/kg/j semble adapté pour que la concentration de pipéracilline soit de 100% du temps au dessus de 4 fois la CMI des bactéries visées. En revanche, une augmentation à 350-400 mg/kg/j semble requise pour que la concentration de pipéracilline soit de 100% du temps au dessus de 6 fois la CMI. Dans tous les cas, une dose de charge de 100 ou 150 mg/kg/jour peut être recommandée.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF