Construction d'une ontologie du droit communautaire

National audienceCe papier décrit une méthode de construction d'une ontologie du droit communautaire. La méthode repose sur la construction de micro-ontologies à partir de directives du droit communautaire en utilisant la méthode TERMINAE augmentée d'un processus d'alignement sur une ontologie générique du droit. L'ontologie est ensuite élaborée à l'aide d'un processus de fusion de micro-ontologies

Construction d'une ontologie du domaine HSE

National audienceDans cet article, nous présentons un travail de construction d'une ontologie du domaine de la réglementation Hygiène-Sécurité-Environnement (HSE) concernant les installations industrielles. Ce travail a été mené selon deux approches : l'utilisation de nomenclatures et d'interviews d'experts du domaine pour aider à la compréhension des notions du domaine et à leur conceptualisation et l'utilisation d'outils d'analyse de textes à travers la méthode Terminae, permettant de repérer les concepts dans les textes. La complémentarité des deux approches permet de construire une conceptualisation sémantiquement correcte et couvrant le corpus utilisé

Modélisation ontologique de processus dans le domaine de la veille épidémiologique

Session "Posters"National audienceDans ce papier, nous proposons une modélisation ontologique des processus de la veille sur les maladies infectieuses. Nous montrons l'intérêt de formaliser les aspects dynamiques des connaissances du domaine de la veille. Cette modélisation est menée sur trois niveaux : i) conceptuel modélisant des processus de la veille, de la veille sur les maladies infectieuses et de la propagation d'une maladie infectieuse ; ii) semi-formel correspondant à l'élaboration de patrons de processus pour faciliter la réutilisation des modèles conceptuels de?finis, et iii) formel correspondant à la formalisation des patrons élaborés. Ces patrons sont traduits dans le langage PSL pour rendre opérationnelle leur réutilisation et raisonner sur les modèles définis. La pertinence de la réutilisation des patrons est testée dans le domaine de l'épidémiologie de la bilharziose. Notre travail s'inscrit dans une approche de modélisation par spécification de la veille épidémiologique et constitue un apport à la mise en place des systèmes de veille. Une autre contribution est de participer aux travaux dans le domaine des ontologies des processus en prenant en compte les spécificités des phénomènes épidémiologiques

Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

oogo : Ontologie des Outils utiles à la Gestion d'Ontologies

National audienceCet article présente, oogo, une ontologie ayant pour objectif la description des outils utiles à la gestion d'ontologies. A l'origine, ce travail répondait à une demande qui était de présenter à des chercheurs et/ou des industriels des outils utilisables pour élaborer une ontologie de domaine et si nécessaire leur permettre de les sélectionner en fonction de leurs besoins. Une ontologie nous a semblé constituer la forme la plus adaptée pour délivrer cette information. Le modèle conceptuel la structurant est fondé sur le cycle classique de construction d'ontologies commun à toutes méthodologies. Les activités afférentes à la construction d'ontologies servent de guide à la présentation des fonctionnalités les plus utiles de ces outils. Les scénarios d'usage sont construits à partir des besoins des acteurs intervenant autour d'une ontologie. Un état de l'art relatif à chaque catégorie d'outils sous tend la construction du modèle conceptuel de oogo

Construction d'une ontologie modulaire pour l'univers de la cuisine numérique

Session 1 : Construction, peuplement et exploitation d'ontologiesNational audienceDans cet article, nous présentons le cadre méthodologique adopté pour construire l'ontologie modulaire de la cuisine numérique en justifiant le choix de la modularité. Puis nous présentons les différents modèles construits à partir des connaissances acquises auprès des experts du domaine. Nous discutons également les choix effectués pour définir les primitives représentées afin d'être en phase avec le périmètre de l'ontologie. Une fois les modèles de connaissances construits nous présentons notre réflexion sur le choix du langage à utiliser afin d'être au plus près des besoins de raisonnement à produire avec l'ontologie. Nous présentons la manière dont les flux rdf sont engendrés par programmes. Nous abordons également la façon dont les différentes versions de l'ontologie sont gérées

Exploitation linguistique d'une ontologie générique

National audienceL'article présente l'exploitation linguistique d'une ontologie générique lors de sa réutilisation. Le processus auquel nous nous référons est celui de la construction semi-automatique d'une nouvelle ontologie de domaine à partir de textes en s'alignant au fil de l'élaboration sur une ontologie générique de référence. Les éléments linguistiques de l'ontologie générique sont extraits et analysés pour aider à la mise en correspondance des termes en corpus avec les concepts et les rôles qui la composent et réaliser le processus d'alignement