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    Produção de celulose bacteriana: identificação do Operon bcs e produção de biofilme celulósico por Chromobacterium violaceum

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    Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro TecnolĂłgico. Programa de PĂłs-graduação em Engenharia QuĂ­mica.ExopolissacarĂ­deos (EPS) sĂŁo os principais constituintes de biofilme bacteriano. Esses polĂ­meros, componentes da matriz extracelular bacteriana, tĂȘm despertado grande interesse em aplicaçÔes industriais e na ĂĄrea mĂ©dica. Entretanto, tĂȘm sido associado com mecanismos de combate bacteriano. A celulose tem sido identificada como um dos EPS da matriz extracelular produzido por vĂĄrias espĂ©cies de bactĂ©rias durante a formação de biofilmes. A bactĂ©ria Gram-negativa Chromobacterium violaceum, linhagem ATCC 12472, teve seu genoma recentemente seqĂŒenciado pelo Brazilian National Genome Project Consortion. A anĂĄlise do genoma da C. violaceum mostrou a presença de genes relacionados Ă  biossĂ­ntese de celulose, atĂ© entĂŁo desconhecidos. Neste trabalho, analisou-se a estrutura e organização dos genes diretamente envolvidos na biossĂ­ntese de celulose, e buscou-se evidĂȘncias experimentais da presença de celulose na matriz extracelular do biofilme formado por esta bactĂ©ria. A metodologia empregada envolveu o uso de ferramentas de bioinformĂĄtica que exploram informaçÔes do seu genoma, como estrutura dos genes, elementos de regulação, domĂ­nios e motivos conservados. Ensaios laboratoriais foram utilizados para se obter evidĂȘncias experimentais das informaçÔes genĂŽmicas. Estas estratĂ©gias permitiram determinar a existĂȘncia de um operon que compreende cinco genes estruturais codificando as proteĂ­nas e enzimas do complexo celulose sintase, como tambĂ©m propor uma via metabĂłlica de biossĂ­ntese de celulose a partir de glicose. Identificaram-se ainda 43 ORFs (open reading frames) com domĂ­nio GGDEF normalmente associado Ă  atividade de sĂ­ntese de diguanilmonofosfato cĂ­clico (c-di-GMP) a partir de duas molĂ©culas de guanosina trifosfato (GTP). A molĂ©cula c-di-GMP funciona como um componente regulatĂłrio de diversas atividades celulares, entre elas a ativação da sĂ­ntese de celulose. Experimentalmente foi analisado o produto do biofilme formado durante o cultivo de C. violaceum em meio Luria Bertani (LB), culturas estĂĄtica e agitada. Os resultados obtidos sugerem a presença de celulose como componente do biofilme

    Desenvolvimento de novos biomateriais baseados em celulose bacteriana para aplicaçÔes biomédicas e de engenharia de tecidos

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    Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro TecnolĂłgico, Programa de PĂłs-Graduação em Engenharia QuĂ­mica, FlorianĂłpolis, 2008.Membranas porosas constituĂ­das de nanofibras de celulose bacteriana foram produzidas pela bactĂ©ria Gluconacetobacter hansenii ATCC 23769, quando cultivada em um meio de cultura apropriado e sob circunstĂąncias estĂĄticas. A formação in situ dos poros foi desenvolvida com o uso de moldes adequados. As propriedades fĂ­sico-quĂ­micas da membrana de celulose bacteriana, tais como o grau de cristalinidade e a deformação Ă  tração nĂŁo foram alteradas significativamente apĂłs a formação dos poros. Sugere-se que as membranas assim constituĂ­das de microporos podem ser Ășteis para aplicaçÔes de engenharia de tecidos, que exigem elevadas taxas de oxigenação ou que exigem atraso da contração tecidual. Estruturas tridimensionais em forma de hidrogel de celulose bacteriana foram produzidas utilizando a bactĂ©ria G. hansenii em culturas sob condiçÔes agitadas e meio de cultivo apropriado. Estas estruturas, com geometria esferĂłide, elipsĂłide ou ovĂłide, sĂŁo compostas por uma massa gelatinosa, em forma de "cocoon", envolvida por uma membrana densa. HidrogĂ©is macroscĂłpicos tridimensionais vascularizados de celulose bacteriana foram desenvolvidos atravĂ©s das condiçÔes previamente descritas, utilizando-se moldes para a formação de vasos. A massa gelatinosa estĂĄ envolvida por uma membrana elĂĄstica. No seu interior foram produzidos canais que podem simular vasos sanguĂ­neos. Um compĂłsito constituĂ­do de celulose bacteriana e acemanana foi preparado atravĂ©s do cultivo da bactĂ©ria G. hansenii em meio de cultivo suplementado com acemanana, um polissacarĂ­deo proveniente da planta Aloe barbadensis Miller. Esse compĂłsito tambĂ©m apresenta uma estrutura tridimensional gelatinosa, composta por nanofibras de celulose e acemanana dispersas leatoriamente, envolvido por uma densa membrana externa. O grande diferencial deste biomaterial Ă© a incorporação da acemanana nas nanofibras de celulose, com possĂ­veis benefĂ­cios terapĂȘuticos da acemanana. A estrutura quĂ­mica da celulose favorece a sĂ­ntese de hidroxiapatita na sua superfĂ­cie, transformando-a num biomaterial com propriedades possĂ­veis de promover a recuperação de tecidos Ăłsseos e cartilaginosos. Uma estrutura hidrogel tridimensional multicamada composta de celulose bacteriana e hidroxiapatita foi produzida atravĂ©s de mineralização de hidroxiapatita na superfĂ­cie das nanofibras de celulose. Foi observado que a hidroxiapatita foi depositada na superfĂ­cie e estĂĄ homogeneamente distribuĂ­da nas nanofibras de celulose. Os estudos reportados neste trabalho ampliam o potencial de aplicação da celulose bacteriana, sobretudo de biomateriais derivados da plataforma tridimensional obtida em culturas hidrodinamicamente controladas.Porous, nanofibrous bacterial cellulose membranes were produced by the bacterium Gluconacetobacter hansenii ATCC 23769. The bacterium was cultivated in an appropriate culture medium under static conditions. In situ pore formation was attained through the use of adequate pin templates. Physico-chemical properties of BC membranes, like degree of crystallinity, swelling and tensile strength were not significantly altered after pore formation. Microporous membranes could be useful for applications in repairing tissues, which require high oxygenation rates or wound contracture delay. Three-dimensional bacterial cellulose hydrogels were produced using the bacterium G. hansenii in agitated appropriate culture. The structures exhibit a rough ellipsoid geometry and are composed by a gelatinous mass involved by a denser membrane, which resembles a "cocoon". Macroscopic vascular three-dimensional bacterial cellulose hydrogels were produced by the same conditions previously described, using appropriate templates for vessels formation. The vessels, that simulate blood vessels, were formed in the inner part of the hydrogel. Three-dimensional bacterial cellulose hydrogels acemannan composite material was produced by supplementing the culture medium with acemannan, which is a polysaccharide extracted from Aloe barbadensis Miller. The composite exhibits a three-dimensional hydrogel structure composed of cellulose and acemannan fibers bonded together, random dispersed in the gel and enclosed by a dense external membrane. This new biomaterial is a potential candidate for medical applications due to the therapeutic properties of acemannan. The chemical structure of the cellulose nanofibers favors the nucleation of hydroxyapatite on their surface, which indicates the potential of cellulosehydroxyapatite composites for applications in tissue engineering for cartilaginous and bone tissue regeneration. A three-dimensional multilayer structure comprised of bacterial cellulose and hydroxyapatite was produced through mineralization of hydroxyapatite on the surface of the cellulose nanofibers. The hydroxyapatite particles were deposited and homogeneously distributed over the surface of the fibers. The studies reported in this work extend the potential of bacterial cellulose, especially of biomaterials derived from the three-dimensional bacterial cellulose based platform obtained with hydrodynamically controlled cultures

    PRODUÇÃO DE CELULOSE BACTERIANA A PARTIR DE DIFERENTES SUBSTRATOS

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    A celulose bacteriana em biopolĂ­mero com caracterĂ­sticas especiais que o torna aplicĂĄvel na manufatura de artefatos de aplicação mĂ©dica, bem como suporte estrutural para a engenharia de tecidos. O presente trabalho objetivou avaliar a produção de celulose bacteriana por Gluconoacetobacter hansenii a partir de trĂȘs substratos carbĂŽnicos, glicose glicerol e manitol. Para isto a bactĂ©ria foi cultivada em meios contendo cada um dos substratos separadamente, na concentração de 25 g/l. A produção de celulose foi avaliada a partir da pesagem do biopolĂ­mero que cresceu na superfĂ­cie do caldo de cultivo, foi acompanhada durante 14 dias. Os resultados mostraram que houve produção de celulose a partir dos trĂȘs substratos estudados, sendo esta que na presença de glicerol ocorreu a maior conversĂŁo de substrato em produto, com um rendimento de 36 g de celulose/ 100g de substrato. Os resultados sĂŁo promissores tendo em vista que atualmente o glicerol Ă© um substrato de baixo custo o que contribui para o decrĂ©scimo do custo de produção final deste biopolĂ­mero com diversas aplicaçÔes biomĂ©dicas

    Obtaining and characterization of bacterial cellulose synthesized by Komagataeibacter hansenii from alternative sources of nitrogen and carbon

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    This work aimed to obtain and characterize bacterial cellulose (BC) membranes obtained by cultivating Komagataeibacter hansenii ATCC 23769 using mannitol, glucose, fructose, lactose, glycerol, inulin, and sucrose as carbon sources, and corn steep liquor and Prodex LacÂź as alternative sources of nitrogen. The formation of the BCÂŽs gelatinous membrane was monitored for 12 days under static conditions and a temperature of 30 ÂșC. After purification, the membranes were dried and characterized by thermogravimetric analysis (TGA), Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR), and scanning electron microscopy (SEM). The highest BC concentrations were found in the culture medium containing Prodex LacÂź as the source of nitrogen. Among sugars, fructose and mannitol presented the best results. TGA analyzes indicate that all membranes have similar thermal behavior. The FTIR results show that the chemically synthesized membranes are equivalent to the structures cited in the literature. The micrographs obtained by SEM showed that the medium might influence BCÂŽs morphology, but in general, all presented nanofibers, an essential feature in the membrane. Thus, the BC membranes synthesized in this study proved that the BC production using low-cost alternative means is feasible. The material obtained meets the expected thermal, physical, and chemical properties.Keywords: Bacterial cellulose, corn steep liquor, Prodex LacÂź, nitrogen sources, carbon sources

    Bacterioplankton Activity in a Meso-eutrophic Subtropical Coastal Lagoon

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    The aim of this study was to investigate whether the bacterioplankton activity in the meso-eutrophic Conceição Lagoon would increase significantly under allochthonous inputs of inorganic nutrients and organic carbon. Abundance and biomass of bacterioplankton were evaluated under three treatments: light (14 h light/10 h dark), complete darkness (dark-control), and nutrient (C + N + P—dark, 100 : 10 : 1) enrichments during 72 h. Nutrient enrichments promoted a significant increase in abundance (maximum of 19.0 ×109 cells·L−1 in the first 32 hours) and biomass of the heterotrophic bacterioplankton, which induced the formation of large clusters. Bacterial biomass remained constant in the non-enriched incubations (dark-control and light). Bacterial growth rates were significantly higher after nutrient additions (1.35 d−1), followed by control (0.79 d−1), and light (0.63 d−1) treatments, which were statistically equal (p>0.05). Bacterial production rates were also significantly higher under nutrient additions (1.28 d−1), compared to the control and light (0.50 d−1 and 0.44 d−1, respectively), demonstrating that bacterial growth and production in this meso-eutrophic lagoon are under an immediate “bottom-up” regulation, followed by a potential top-down effect. These facts reinforce the urgency on improving the local wastewater management plan in order to prevent further expansion of anoxic waters
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