Morpho-molecular characterization and pathogenicity of Phytophthora spp. associated with cacao (Theobroma cacao L.)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2018.A podridão-parda (Phytophthora spp.) é considerada fator limitante para produção de cacau (Theobroma cacao L.) devido à alta incidência da doença em frutos nos campos de cultivo. Além disso, o patógeno pode induzir sintomas de cancro nos ramos. Nesse contexto, o objetivo desse trabalho foi identificar as espécies de Phytophthora associadas ao cacaueiro sob diferentes sistemas de cultivos na região Sul do estado da Bahia. Amostras de frutos e ramos sintomáticos, solo e serapilheira foram coletadas nos sistemas de produção cabruca, agroflorestal, consórcio cacau/coco e pleno sol. Isolados de Phytophthora spp. foram obtidos em meio seletivo BDA-PARP. DNA total foi extraído a partir de culturas monohifais, e utilizado como molde para amplificação e sequenciamento de diferentes regiões genômicas (B-TUB, COXII, EF1α, ITS e HSP90). Testes de patogenicidade e agressividade foram realizados em diferentes clones de cacau (CCN51, FB206, PS1319, VB1151 e MP01-104). As análises filogenéticas realizadas revelaram a presença de duas espécies infectando o cacau nos quatro sistemas de cultivos avaliados, um sendo P. palmivora e a outra uma provável espécie nova a ser descrita. Este é o primeiro relato de Phythophthora sp. causando a podridão-parda em cacaueiro. Dentre os diferentes clones testados, Phytophthora sp. demostrou ser mais agressivo que P. palmivora, uma variação fisiológica intraespecífica para o crescimento micelial também foi observado e Phytophthora sp. mais uma vez se mostrou superior, apresentando a maior taxa de crescimento indendentemente dos meios de cultivo testados .Brown rot (Phytophthora spp.) is considered a limiting factor for cocoa production (Theobroma cacao L.) due to the high incidence of disease in fruits in field crops. Besides, the pathogen can induce canker symptoms in the branches. In this context, the objective of this work was to identify the Phytophthora species associated to cocoa under different cultivation systems in the southern region of Bahia state. Samples of fruits and symptomatic branches, soil and litter were collected in cabruca, agroforestry, cocoa / coconut consortium and full sun cultivation systems. Isolates from Phytophthora spp. were obtained on PDA-PARP selective medium. Total DNA was extracted from monohifal cultures and used as template for amplification and sequencing of different genomic regions (B-TUB, COXII, EF1α, ITS and HSP90). Pathogenicity and aggressiveness tests were performed on different cocoa clones (CCN51, FB206, PS1319, VB1151 and MP01-104). Phylogenetic analyzes revealed the presence of two species infecting cocoa in the four evaluated systems, one identified as P. palmivora and the another one can probable be a new species to describe. This is the first time that Phythophthora sp. is reported causing brown rot in cocoa. Among the different tested clones, Phytophthora sp. was more aggressive than P. palmivora, a variation physiologic intraspecific for mycelial growth was also observed and Phytophthora sp. once again superior was shown, presenting the largest tax of growth no matter what kind of culture medium tested

THERMAL VARIATION FOR GROWTH OF ZOOSPORES OF Albugo spp.

The objective of this work was to identify the time of the thermal shock that promotes the greater release of zoospores/sporangia. The experiments were carried out with five treatments, varying the thermal variation time (20', 30', 40', 50' and 60') of sporangia suspension of 7.105 sporangia mL-1 under 5 °C temperature. The incidence of sporangia germinated by 20 times whose It was evaluated100 units at random, using an optical microscope at 40 times magnification. The F and Tukey test were used to compare the means. The sexual phase (presence of oospores) was identified in the isolate derived from purslane. In purslane leaves (infected by Albugo portulacae) the time of 20-30' promoted a greater number of zoospores released, whereas for the isolate from amarantus (infected by A. bliti) the time of 30’ promoted statistically the highest release of zoospores; for the isolate from leaves of “jetirana” (infected by A. ipomoeae-panduratae) the time of 30-50’ promoted greater release of zoospores; and finally the isolate from “onze-horas” leaves (infected by A. portulacae) the time of 30-40’ statistically promoted the highest percentage of release of zoospores, It was demonstrating a differential behavior per host in the release of zoospores. The thermal shock time that promoted the highest amount of released zoospores (38 %) was observed for the purslane-Albugo portulacae and “onze horas”-A. portulacae pathosystem

OCORRÊNCIA DE PUCCINIA DICHONDRAE - AGENTE CAUSAL DA FERRUGEM - EM ORELHA-DE-RATO (DICHONDRA REPENS)

Orelha-de-rato (Dichondra repens – Convolvulaceae) é uma planta perene de baixo crescimento, considerada como forrageira. O trabalho teve como objetivo a identificação da ferrugem da orelha-de-rato causada por Puccinia sp. Amostras de folhas de orelha-de-rato foram coletadas no município de Bento Gonçalves, RS, exsicatadas e depositadas na coleção micológica de referência do IF Goiano Câmpus Urutaí e, posteriormente, analisadas em microscópio estereoscópico. Lâminas semi-permanentes e cortes histológicos foram realizados. Para registro dos sintomas e sinais do patógeno fez-se macro e microfotografias. A morfometria das estruturas reprodutivas foi realizada utilizando microscópio óptico. O fitopatógeno apresentou télia de coloração marrom avermelhado, hipófila e subepidérmica encontrada na face abaxial da folha, com dimensões 180-260 x 210-340 µm. Teliósporos lisos, bicelulares, com dimensões de 32,1 - (27,1) - 22,2 x 19,4 - (14,8) - 11,3 µm de coloração pardo a marrom avermelhado com papila de comprimento 7,5 - (5,0) - 2,6 µm, hialina e pedicelos filiformes e hialinos, com comprimento de 24,7 - (12,6) - 6,7 µm. Inicialmente os teliósporos jovens apresentaram-se hialinos e quando maduros se tornaram melanizados. Com base nas características descritivas da fase telial o isolado oriundo de Bento Gonçalves, RS, (2011) foi identificado como Puccinia dichondrae