Multiple logistic regressions: controlling factors in applications to soil class prediction.

Métodos mais eficazes para determinação do padrão de distribuição de classes de solo na paisagem precisam ser avaliados visando suprir a demanda por mapas de solo em escalas regional e global. Neste estudo, Regressões Logísticas Múltiplas foram utilizadas como modelos preditores em uma aplicação de Mapeamento Digital de Solos. Os modelos foram gerados utilizando um mapa de solos existente como variável dependente e atributos de terreno como variáveis independentes, o que possibilitou determinar a probabilidade de encontrar classes de solo na paisagem no primeiro e no segundo nível categórico do SiBCS. A qualidade dos mapas preditos foi verificada por meio da matriz de contingência. A classe dos Argissolos foi predita corretamente, em relação ao mapa original, em aproximadamente 85 %. As classes de solos hidromórficos (Planossolos e Gleissolos) foram preditas corretamente em 75 %. Houve confundimento dos modelos para as classes que ocupam posições muito semelhantes na paisagem. Foi verificado também que classes de solo pouco representativas na paisagem não são adequadamente espacializadas em razão da sensibilidade dos modelos logísticos à proporção relativa das amostras usadas para treinar os modelos

Identifying and correcting oblique striping in the topodata digital elevation model.

The Topodata digital elevation model (DEM) is the best DEM available for digital soil mapping (DSM) in Brazil. However, it is not ready to use. We show that the kriging interpolator used to downscale the SRTM DEM from 3 arc-seconds to 1 arc-second spatial resolution increased the double oblique striping (15º and 60º) so common to SRTM DEMs. This is because kriging is quite sensitive to outliers. Besides, the Gaussian model of spatial covariance used in the downscaling enhanced the sensitivity of kriging to outliers, thus enhancing the striping. 2D Fast Fourier Transform can be used to identify whether a destriping procedure need to be employed. The bilinear or cubic resampling methods should be used to warp Topodata DEMs because they are insensitive to the double oblique striping

Towards a genome-wide transcriptogram: the Saccharomyces cerevisiae case

A genome modular classification that associates cellular processes to modules could lead to a method to quantify the differences in gene expression levels in different cellular stages or conditions: the transcriptogram, a powerful tool for assessing cell performance, would be at hand. Here we present a computational method to order genes on a line that clusters strongly interacting genes, defining functional modules associated with gene ontology terms. The starting point is a list of genes and a matrix specifying their interactions, available at large gene interaction databases. Considering the Saccharomyces cerevisiae genome we produced a succession of plots of gene transcription levels for a fermentation process. These plots discriminate the fermentation stage the cell is going through and may be regarded as the first versions of a transcriptogram. This method is useful for extracting information from cell stimuli/responses experiments, and may be applied with diagnostic purposes to different organisms

Open legacy soil survey data in Brazil: geospatial data quality and how to improve it.

Spatial soil data applications require sound geospatial data including coordinates and a coordinate reference system. However, when it comes to legacy soil data we frequently find them to be missing or incorrect. This paper assesses the quality of the geospatial data of legacy soil observations in Brazil, and evaluates geospatial data sources (survey reports, maps, spatial data infrastructures, web mapping services) and expert knowledge as a means to fix inconsistencies. The analyses included several consistency checks performed on 6,195 observations from the Brazilian Soil Information System. The positional accuracy of geospatial data sources was estimated so as to obtain an indication of the quality for fixing inconsistencies. The coordinates of 20 soil observations, estimated using the web mapping service, were validated with the true coordinates measured in the field. Overall, inconsistencies of different types and magnitudes were found in half of the observations, causing mild to severe misplacements. The involuntary substitution of symbols and numeric characters with similar appearance when recording geospatial data was the most common typing mistake. Among the geospatial data sources, the web mapping service was the most useful, due to operational advantages and lower positional error (~6 m). However, the quality of the description of the observation location controls the accuracy of estimated coordinates. Thus, the error of coordinates estimated using the web mapping service ranged between 30 and 1000 m. This is equivalent to coordinates measured from arc-seconds to arc-minutes, respectively. Under this scenario, the feedback from soil survey experts is crucial to improving the quality of geospatial data

Transformação estável da linhagem celular BTI-Tn-5B1-4 utilizando o gene 25KFP do baculovirus AgMNPV.

bitstream/CENARGEN/29465/1/bp188.pd

Macrologística da exportação de grãos: atualidades e perspectivas dos portos do arco norte.

O Brasil vem superando anualmente seus recordes de produção agropecuária, balizando grande parte desta evolução no aumento da produção de milho e soja. Essa safra percorre trajetos complexos e sujeitos a pontos frágeis desde sua origem na produção até o seu destino no mercado nacional e internacional. Frente à degradação e à insuficiência da malha viária, as melhorias logísticas podem, em muitos casos, representar ganhos superiores aos da adoção de novas tecnologias agrícolas. Em especial, a logística direcionada para os portos do norte do país, região mais próxima dos mercados internacionais. Objetivou-se com este trabalho quantificar e qualificar os portos dos estados do Amazonas, Pará, Amapá e Maranhão, chamados de Arco Norte, de forma a verificar se a capacidade atual e futura dos mesmos será suficiente para escoar a produção brasileira de milho e soja em um cenário de levar 40% da safra para o norte. Conclui-se que a capacidade atual dos portos do Arco Norte é suficiente para o escoamento das safras frente ao cenário atual, mas demanda uma expansão se for considerado um cenário de projeções mais otimistas

Mapeamento digital de classes de solos: características da abordagem brasileira.

O solo é cada vez mais reconhecido como tendo um importante papel nos ecossistemas, assim como para a produção de alimentos e regulação do clima global. Por esse motivo, a demanda por informações relevantes e atualizadas em solos é crescente. Pesquisadores em ciência do solo estão sendo demandados a gerar informações em diferentes resoluções espaciais e com qualidade associada dentro do que está sendo chamado de Mapeamento Digital de Solos (MDS). Devido ao crescente número de trabalhos relacionados ao MDS, faz-se necessário reunir e discutir as principais características dos estudos relacionados ao mapeamento digital de classes de solos no Brasil, o que irá possibilitar uma perspectiva mais ampla dos caminhos, além de nortear trabalhos e demandas futuras. O mapeamento de classes de solos empregando técnicas de MDS é recente no país, com a primeira publicação em 2006. Entre as funções preditivas utilizadas, predomina o emprego da técnica de regressões logísticas. O fator de formação relevo foi empregado na totalidade dos estudos revisados. Quanto à avaliação da qualidade dos modelos preditivos, o emprego da matriz de erros e do índice kappa têm sido os procedimentos mais usuais. A consolidação dessa abordagem automatizada como ferramenta auxiliar ao mapeamento convencional passa pelo treinamento dos jovens pedólogos para a utilização de tecnologias da geoinformação e de ferramentas quantitativas dos aspectos de variabilidade do solo

Black soils.

Definition and description; Global distribution of hotspot; Global carbon stocks and additional carbon storage potential; Importance of black soil conservation for the provision of specific ecosystem services; General challenges and trends related to the black soils

Manual de competição de solos.

Este manual busca apresentar informações sobre as competições de solos para o público brasileiro, os procedimentos e regras usualmente empregadas, contribuindo para a sua divulgação e implementação.1. ed