Multiplex droplet digital PCR assay for detection of Flavobacterium psychrophilum and Yersinia ruckeri in Norwegian aquaculture

We report the development of ddPCR assays for single and simultaneous detection of the bacterial pathogens Flavobacterium psychrophilum and Yersinia ruckeri in water from land-based recirculation aquaculture systems (RAS), producing Atlantic salmon (Salmo salar) smolt. The method was tested and verified for use in water analyses from RAS production sites, and proved to be specific and with sensitivity 0.0011 ng DNA for F. psychrophilum and 1.24 ng for Y. ruckeri. These bacteria are important fish pathogens that have caused reoccurring salmonid infection disease in RAS. Monitoring pathogen levels in water samples could be a useful alternative surveillance strategy to evaluate operational risk assessment connected to stress factors. Water quality is essential for fish health and growth in RAS production in general, and high or increasing levels of these pathogens in the RAS water may generate an early indication of unfavourable conditions in the RAS environment, and give directions to operational actions. This approach may reduce fish mortality, reduce production loss, and offer more effective and targeted preventive measures within RAS production.publishedVersio

Effect of ultrasonic cavitation on small and large organisms for water disinfection during fish transport

Motivated by the need for additional tools to disinfect discharge water from well boats, and to prevent distribution of salmon lice, the effect of ultrasonic cavitation on the planktonic stages of the salmon louse, nauplii and copepodids, as well as marine heterotrophic bacteria, and the marine green microalgae Tetraselmis suecica, has been investigated. Survival and morphology were registered after different exposure times. Efficacy of the ultrasonic cavitation treatments varied with exposure time. A reduction in survival was registered even for the shortest exposure time (5 seconds) for both naupliar and copepodid stages of the salmon louse (36.7 ± 11.5 and 67.20 ± 7.2% survival respectively). Survival reached zero after exposure times of 20 and 60 seconds for the nauplii and copepodid stages, respectively. A reduction in 70% was observed for bacteria at all exposure times (5 to 300 s), while a reduction of 95% was observed after 300 s for algal cells. The logged energy transfer to the samples was on average 17.5 J/s. In conclusion, cavitation treatment is destructive for the planktonic stages of salmon lice, and may contribute to reduce discharge of pathogens and parasites from well boats when adapted for this purpose and combined with existing water disinfection methods.publishedVersio

Mikrobiell effekt av begroingshindrende belegg fra Brynsløkken AS

Tre produkter fra Brynsløkken AS ble undersøkt i forhold til begroingshindrende overflate mot sykdomsbakterien Moritella Viscosa. Om produktene viser seg å være begroingshindrende kan anvendelsen være stor, fra brønnbåt til lukkede merdsystemer. Belegg 1 gav en redusert dannelse av biofilm i forhold til kontroll, og kan være lovende i utvikling av begroingshindrende overflater. Bellegg 2 og 3 så ut til å binde bakterier til overflata, siden disse to beleggene gav mer biofilm enn kontroll. I produktbeskrivelsen oppgis det at belegg 2 skal binde bakterier til overflata for deretter å hindre at disse vokser videre og kontaminerer omgivelsene.Mikrobiell effekt av begroingshindrende belegg fra Brynsløkken ASACEpublishedVersio

Tensile Strength of Nylon Netting Subjected to Various Concentrations of Disinfecting Chemicals

This paper presents a study of traditional netting materials subjected to disinfecting chemicals during fish farming and treatment of net cages. A series of tests were performed in order to study the effect of various concentrations of disinfecting chemicals on the tensile strength of Raschel knitted Nylon netting materials. Simulated spill of diluted hydrogen peroxide to the jump fence during de-lousing did not affect the strength of the applied new and used knotless nylon netting samples. Hydrogen peroxide reacted with biofouling forming gas bubbles, but this did not result in reduced netting strength. The performed tests did not indicate any effect on netting strength from a simulated single, traditional bath disinfection as performed at service stations applying the disinfectant Aqua Des containing peracetic acid. However, increasing the Aqua Des concentration from 1 to 10 % resulted in a strength reduction of 3–6 %. Simulated spill of concentrated Aqua Des on the jump fence of a net with copper coating residuals resulted in a severe reduction in strength of 45 %. This strength loss was probably a consequence of chemical reaction between copper and Aqua Des, and uncoated netting did not experience any loss in strength subjected to the same chemical exposure. These findings from application of Aqua Des should also apply to other peracetic acid disinfection chemicals with trade names as for example Perfectoxid and Addi Aqua.acceptedVersio

Innspill til veileder for hygienisk design og renhold for RAS-anlegg - Struktur og innhold slik en veileder kan være

Dette dokumentet beskriver et innspill til en veileder for hygienisk design og renhold for RAS-anlegg. Dokumentet er strukturert og har innhold slik vi tenker at en veileder kan være. Forslaget er delt opp i en del for hygienisk design og en for renhold. Hver av disse har en generell del og en del som er spesifikk for RAS-anlegg. Spesifikk del består av kulepunkter med anbefalinger. For hygienisk design så er den spesifikke delen inspirert av de grunnprinsippene i hygienisk design som er relevante fra European Hygienic Engineering and Design Group (EHEDG). For renhold så er den spesifikke delen oppdelt i de sentrale typene vask; daglig renhold, vask mellom innsett, og saneringsvask.Innspill til veileder for hygienisk design og renhold for RAS-anlegg - Struktur og innhold slik en veileder kan værepublishedVersio

Evaluering av teknologi for ombordpumping av pelagisk fisk

Et forskningstokt med M/S Kings Bay ble gjennomført i nov-des 2008. Hensikten med toktet var å undersøke kvaliteten på NYG sild fanget med ringnot og pumpet om bord ved hjelp av to ulike pumpeteknologier, tradisjonell sentrifugalpumpe og en pumpe basert pa vakuum (undertrykk). Resultater og observasjoner gjort om bord og ved landanlegg tyder på at vakuumpumpen kan ha potensial til å redusere andelen skadd rundfisk sammenliknet med sentrifugalpumpen. Det forutsettes optimal utforming av håndteringssystemer om bord. Det anbefales å integrere en silkasse i vakuumpumpesystemet for å øke nedkjølingshastigheten. Temperaturloggene fra lagringstankene etter ombordtaking av fisken indikerer at nedkjølingstiden var omtrent den samme ( 4-5 timer) for vakuumpumpet og sentrifugalpumpet fisk . Vakuumpumpen gav noe høyere overlevelsesrate enn sentrifugalpumpen. I tillegg til pumpeteknologi spiller sannsynligvis andre faktorer inn som mengde fisk i nota, og tiden fisk ble holdt i nota for ombordtaking, inn på resultatet. Vakuumpumpet fisk hadde betydelig lavere andel skader på skinn sammenliknet med sentrifugalpumpet fisk . Måling av blod i pumpevann gav en rask, rimelig og kvantitativ måling av blodvann, og det antas at metoden kan brukes som en indikasjon på blod i vannet og dermed skånsomhet ved håndtering av fisken. Mengden blod i pumpevannet var under den detekterbare grensen for begge pumpeteknologiene. Mengden blod i vannet fra lagringstankene var signifikant høyere for fisk pumpet med sentrifugalpumpe sammenliknet med vakuumpumpe. Det ble ikke funnet signifikante forskjeller i andelen fileter med blodflekker eller røde haler mellom fisk fra de to pumpeteknologiene og ved ulike pumpetrykk. Den gjennomsnittlige skadefrekvensen på rund fisk etter landing var 0,1 % for vakuumpumpet fisk, mens sentrifugalpumpen gav en skadefrekvens pa henholdsvis 0, 15 og 0,18 % for de to pumpetrykkene I 15 bar og 125 bar. Trykkmålinger i pumpeslangen viste at vakuumpumpen gav et jevnt trykk med lite pulseringer. For pumpingen med sentrifugalpumpe ble noe høyere andel pulsering målt, spesielt i forbindelse med start og stopp av pumpe. Det må tas med i betraktning at andre faktorer, som hvilken del av kastet som testes, værforhold og størrelse på kastet, også spiller en rolle for resultatene.MMC Tendos og Kings BaypublishedVersio

Høytrykkspyling av notlin

Formålet med testene var å vurdere endring i styrken til notlin som folge av gjentatt høytrykkspyling. Notlin av nylon fra to forskjellige leverandører ble testet. Det ene notlinet ble testet både i ubehandlet og i impregnert tilstand, mens det andre notlinet ble kun testet i impregnert tilstand. Det ble også testet notlin med Dyneema fiber i impregnert tilstand. Forsøkene ble delt opp i to serier. I serie 1 ble antall vask variert, mens det i serie 2 ble brukt forskjellige kombinasjoner av vanntrykk og vannmengde. Testene viste en neglisjerbar endring i styrke selv etter 40 vask ved høyeste trykk og største vannmengde. Det var av tidsmessige årsaker ikke mulig å la notlinet bli begrodd mellom hver vask, men innledende forsøk gjort høsten 2009 hvor panelene var neddykket i to uker mellom hver spyling ga tilsvarende resultater.Fiskeri og havbruksnæringens forskningsfondpublishedVersio

Svekkelse av notlin på grunn av kontaktslitasje

Litteratursøk og gjennomgang av eksisterende standarder har sammen med enkle innledende forsøkt vist at det finnes ingen direkte relevante teststandarder for slitasjetesting av notlin. Det ble av den grunn utviklet et forsøksoppsett og en metodikk for å bestemme styrkereduksjon som følge av kontaktslitasje. Forsøksoppsettet og metodikken ble testet ut på notlin av nylon fra to leverandører i ubehandlet og impregnert tilstand og impregnert notlin med Dyneema. Det ble brukt samme impregnering på alt notlinet. I ubehandlet tilstand er det en markert forskjell i styrkereduksjon for nylon fra de to leverandørene. Forsøkene viste også at impregnerte nøter var mer motstandsdyktige mot gnag samtidig som impregneringen utjevnet forskjellen mellom de to nylon nøtene. Basert på de relativt få testene som ble utført ser det ut som om impregnert Dyneema notlin har noe lavere motstandsdyktighet mot gnag enn notlin av impregnert nylon. Dette kan skyldes at selv om Dyneema notlin har høyere bruddstyrke så vil motstanden mot abrasjon (gnag) være lavere siden tråden er tynnere.publishedVersio

Effect of ultrasonic cavitation on small and large organisms for water disinfection during fish transport

Motivated by the need for additional tools to disinfect discharge water from well boats, and to prevent distribution of salmon lice, the effect of ultrasonic cavitation on the planktonic stages of the salmon louse, nauplii and copepodids, as well as marine heterotrophic bacteria, and the marine green microalgae Tetraselmis suecica, has been investigated. Survival and morphology were registered after different exposure times. Efficacy of the ultrasonic cavitation treatments varied with exposure time. A reduction in survival was registered even for the shortest exposure time (5 seconds) for both naupliar and copepodid stages of the salmon louse (36.7 ± 11.5 and 67.20 ± 7.2% survival respectively). Survival reached zero after exposure times of 20 and 60 seconds for the nauplii and copepodid stages, respectively. A reduction in 70% was observed for bacteria at all exposure times (5 to 300 s), while a reduction of 95% was observed after 300 s for algal cells. The logged energy transfer to the samples was on average 17.5 J/s. In conclusion, cavitation treatment is destructive for the planktonic stages of salmon lice, and may contribute to reduce discharge of pathogens and parasites from well boats when adapted for this purpose and combined with existing water disinfection methods.publishedVersio

Effect of ultrasonic cavitation on small and large organisms for water disinfection during fish transport

Motivated by the need for additional tools to disinfect discharge water from well boats, and to prevent distribution of salmon lice, the effect of ultrasonic cavitation on the planktonic stages of the salmon louse, nauplii and copepodids, as well as marine heterotrophic bacteria, and the marine green microalgae Tetraselmis suecica, has been investigated. Survival and morphology were registered after different exposure times. Efficacy of the ultrasonic cavitation treatments varied with exposure time. A reduction in survival was registered even for the shortest exposure time (5 seconds) for both naupliar and copepodid stages of the salmon louse (36.7 ± 11.5 and 67.20 ± 7.2% survival respectively). Survival reached zero after exposure times of 20 and 60 seconds for the nauplii and copepodid stages, respectively. A reduction in 70% was observed for bacteria at all exposure times (5 to 300 s), while a reduction of 95% was observed after 300 s for algal cells. The logged energy transfer to the samples was on average 17.5 J/s. In conclusion, cavitation treatment is destructive for the planktonic stages of salmon lice, and may contribute to reduce discharge of pathogens and parasites from well boats when adapted for this purpose and combined with existing water disinfection methods.Norges ForskningsrådpublishedVersio