El análisis genético de paleo-colombianos de Nemocón, Cundinamarca proporciona revelaciones sobre el poblamiento temprano del Noroeste de Suramérica

23 páginasThe Checua site within Nemocón in the eastern Andean Region of Colombia has produced evidence of hunter-gatherer activities from 9500-8700 cal yr BP. The aim of this work was to analyze genetically the Checua group according to mitochondrial DNA HVR-I sequence data. Following strict criteria of authenticity for studies of ancient DNA, extracted DNA was amplified and sequenced for each of the human remains. Twelve of the 22 human remains from Checua were successfully assessed (54.54%) in this study. Paleo-Colombian Checua revealed the Native American haplogroups A2, B2 and C1, plus the rare haplogroup D4h3a, reported for the first time in ancient Colombia. Comparison between Paleo-American and modern Colombian genetic data demonstrates the continuity of A2, B2, and C1, and a probable discontinuity of D4h3a since prehistoric times in Colombia, if not a shortage of D4h3a records in the literature and/or databases, while D1 is present in modern Colombia. The presence of D4h3a, A2, B2, and C1 haplogroups from Colombian early Holocene burials supports genetic evidence for Paleo-American dispersals downward by the Pacific coast. Our Paleo-Colombian DNA data, along with other genetic, archaeological, and paleoenvironmental published data, allow us to bring forward an Integrated Migration Model for the early peopling of northwestern South America, which involved different movements: (1) North-to-South along the coast; (2) West-to-East across the Andean mountain ranges; (3) Riverine discovery and riverside colonization

Ancient DNA from Early Human Burials in the Argentine Puna: Insights into Burial Practices and South American Population History

Although the earliest archaeological sites in South America date to the late Pleistocene, little is known about the genetic makeup or mortuary behavior of early hunter-gatherer populations in South America. To help shed light on the burial practices of these hunter-gatherers, as well as the early population history of this region, we extracted ancient DNA from the remains of 13 individuals excavated from early and mid-Holocene archaeological sites in the southern Argentine Puna. These remains are from four locations in the Antofagasta de la Sierra region of northwestern Argentina, and date between 9200 and 3200 YBP. We sequenced 372 base pairs of the first hypervariable region of the mitochondrial DNA to define maternally-inherited genetic lineages, and analyzed a length dimorphism in the amelogenin gene to investigate the sex of each individual. We found that maternally related individuals were sometimes buried together, and several individuals exhibited a mtDNA lineage that is rare in indigenous American populations today. Our results shed light on the early population history of this region and help elucidate the genetic affinities between the prehistoric inhabitants of the Puna and other regions in South America.Fil: Bolnick, Deborah A.. Austin Community College; Estados UnidosFil: Pintar, Elizabeth. Austin Community College; Estados UnidosFil: Martinez, Jorge Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; ArgentinaFil: Díaz Matallana, Marcela. Pontificia Universidad Javeriana; ColombiaFil: Mata Miguez, Jaime. University of Texas at Austin; Estados Unidos79th Meeting for the Society for American ArchaeologyAustinEstados UnidosSociety for American Archaeolog

Ancient DNA from Early to Mid-Holocene Burials in Northwestern Argentina: Implications for Understanding the Colonization and Early Populations of South America

Archaeological evidence demonstrates that humans have been living in South America since the late Pleistocene. However, relatively little is known about the genetic diversity present in early hunter-gatherer populations on this continent, and few studies have examined ancient DNA from Pleistocene or early to mid-Holocene human remains from South America. Many questions therefore remain about the early populations of this continent and the routes of migration that were used by some of the earliest settlers.      In this study, we extracted DNA from the remains of 13 individuals unearthed at early and mid-Holocene archaeological sites in northwestern Argentina. The remains come from four locations in the Antofagasta de la Sierra region, in the southern Argentine Puna, and they date between ca. 9500-3330 cal BP. We identified mitochondrial DNA (mtDNA) haplogroups based on coding-region SNPs, and sequenced 372 base pairs of the first hypervariable region of the mtDNA to confirm haplogroup assignments and define mtDNA haplotypes. All results were confirmed through multiple independent DNA extractions and PCR amplifications. We compared the genetic lineages in these individuals with those in other ancient and contemporary populations from the Americas to help elucidate the genetic affinities between the prehistoric inhabitants of the Puna and peoples in other regions. We found that one of the most common mtDNA lineages in these ancient Argentines was haplogroup D4h3a, which is rare in indigenous Americans today but most common along the Pacific coast. Our results shed light on the early populations and routes of migration in South America.Fil: Bolnick, Deborah. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Díaz Matallana, Marcela. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Mata Miguez, Jaime. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Pintar, Elizabeth Lucia. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Martinez, Jorge Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina83rd Annual Meeting of the American Association of Physical AnthropologistsCalgaryCanadáAmerican Association of Physical Anthropologist

Visión integral para la gestión de las áreas protegidas urbanas en Colombia

In an urbanizing world, the implementation of strategies that aim for the sustainability of cities is increasingly necessary, especially of those related to the conservation of biodiversity and with a socio-ecological character. Amongst the elements that make up the green inside and near cities, there are green areas with high levels of biodiversity or relevant natural values with the potential to become protected areas. As these green areas provide ecological and social functions within the urban landscape, they require a differentiated management from an ecological, social and normative perspective that explicitly considers the context in which the cities are found. Therefore, this paper intends to be a step towards the construction of a comprehensive vision about the identity and management of urban protected areas in Colombia, so that such vision may be incorporated to the sustainability of the territory and lead to the conservation of urban biodiversity.En un mundo en urbanización, las apuestas por implementar estrategias para la sostenibilidad de las ciudades se hacen cada vez más necesarias, en especial, aquellas que tienen que ver con la conservación de la biodiversidad y su enfoque socioecológico. Entre los elementos que componen lo verde dentro y cerca de las ciudades (cobertura vegetal), existen espacios con altos niveles de biodiversidad o con valores naturales relevantes, que les confieren un gran potencial para ser áreas protegidas. Estas áreas aportan funciones ecológicas y sociales únicas dentro del paisaje urbano y regional, por lo que requieren de una gestión diferenciada desde lo ecológico y social, considerando explícitamente el contexto en el que se encuentran. Este documento pretende ser una reflexión para la construcción de una visión integral sobre la identidad y gestión de las áreas protegidas urbanas (APU) en Colombia, con el objetivo de lograr su incorporación en la sostenibilidad del territorio y la conservación de la biodiversidad urbana

High genetic diversity on a sample of pre‐Columbian bone remains from Guane territories in northwestern Colombia

Q1Q1Artículo de investigación637-649Ancient DNA was recovered from 17individuals found in a rock shelter in the district of ‘‘LaPurnia’’ (Santander, Colombia). This region is the home-land of pre-Columbian Guane, whom spread over the‘‘Rı ́o Suarez’’ to the ‘‘Rı ́o de Oro’’, and were surroundedto the west by the Central Andes, south and east by foot-hills of Eastern Andes, and north by the ‘‘Chicamocha’’river canyon. Guanes established in a region that strad-dles the Andes and the northern Amazon basin, possiblymaking it an unavoidable conduit for people moving toand from South America. We amplified mtDNA hyper-variable region I (HVI) segments from ancient boneremains, and the resulting sequences were comparedwith both ancient and modern mitochondrial hap-logroups from American and non-American populations. Samples showed a distribution of 35% for haplogroup A,41% for haplogroup B and 24% for haplogroup D. Ninehaplotypes were found in 17 samples, indicating anunusually high genetic diversity on a single site ancientpopulation. Among them, three haplotypes have notbeen previously found in America, two are shared inAsia, and one is a private haplotype. Despite geographi-cal barriers that eventually isolated them, an importantinfluence of gene flow from neighboring pre-Columbiancommunities, mainly Muiscas, could explain the highgenetic polymorphism of this community before theSpanish conquest, and argues against Guanes as being agenetic isolate

Consenso colombiano de enfermedad inflamatoria intestinal

La Enfermedad inflamatoria intestinal (EEI) es un término con el que se conocen varias entidades, las dos más importantes: la colitis ulcerativa idiopática (CUI) y la enfermedad de Crohn (EC), cuyo origen es multifactorial y se caracterizan por un fenómeno inflamatorio, crónico, recurrente, con diferentes grados de severidad del tubo digestivo; pero, además con afectación potencial de otros órganos. En la última década ha habido un renovado interés en dichas entidades, debido a un auge en medicamentos novedosos; a pesar de lo cual estas siguen siendo incurables. Lo anterior asociado a una incidencia creciente de dicha patología en nuestro país nos obliga tanto científica como moralmente a convocar a un panel de expertos para elaborar unos lineamientos básicos en el enfoque y manejo de la EEI. OBJETIVOS 1. Desarrollar un consenso adaptado a nuestro medio, basado en documentación científica de la mejor calidad disponible para el enfoque diagnóstico y el manejo médico y quirúrgico. 2. Publicar y difundir dichos lineamentos tanto a la comunidad científica como al público en general a través de foros especializados, y medios de comunicación de alta penetración. 3. Elaborar y divulgar el consenso en forma de suplemento de la Revista Colombiana de Gastroenterología, el 8 de diciembre de 2011, en medio del congreso de ACADI (Asociación Colombiana de Asociaciones del Aparato Digestivo); es el mejor homenaje que el panel multidisciplinario de expertos le puede rendir a dicho evento; pero más importante aún es el reconocimiento que se le hace a los pacientes que padecen de dicha patología en nuestro país, quienes en últimas son nuestra razón de ser. METODOLOGÍA 1. Se invitaron médicos especialistas (Clínicos y quirúrgicos), líderes de opinión e industria farmacéutica nacional, cuyo área de interés y de trabajo es la EEI. 2. Se separó y manejó independientemente desde el principio la CUI de la EC. A su vez, se dividió cada entidad por módulos, con base en el método de panel de Delphi, se nombró un coordinador por cada uno de ellos, el cual se encargó de analizar junto con su equipo la literatura, para extraer el nivel de evidencia clínica y así emitir unos conceptos preliminares. Posteriormente, todo el panel de expertos se reunió en varias jornadas y conjuntamente se revisó nuevamente la evidencia clínica y conclusiones de los diferentes módulos homogenizándolas y de una manera concertada se formularon las recomendaciones definitivas.Q4https://orcid.org/0000-0002-9219-4548Revista Nacional - Indexad

Mitochondrial DNA studies suggest a predominant lineage in the Eastern Cordillera of Colombia and a South American link for the archaics of Puerto Rico

Objetivo: Este trabajo integra información de la secuencia del ADNmt del norte de Suramérica con Puerto Rico, con el fin de comprender el poblamiento del Caribe, especialmente de los taínos. De paso, arroja información sobre hechos demográficos en la Colombia precolombina.Metodología: Se obtuvieron 59 muestras de Colombia y Venezuela, las cuales fueron analizadas junto a otras dos pertenecientes a los indios warao y disponibles en el Genbank. Se alinearon secuencias HVR-I y II (Hypervariable Region) y se compararon con el rCRS. El 93,4% de las muestras resultaron ser de origen amerindio.Resultados: Un venezolano exhibió mutaciones relacionadas con el linaje antiguo C-II de Puerto Rico, el cual se estima que arribó a Puerto Rico en la era prearahuaca. Mediante secuenciación completa del ADNmt se demostró que esta muestra, VE6, pertenece al clado americano nativo C1b.Dos personas de Colombia y Venezuela presentaban la transición 16129 que define el linaje A-VIII de Puerto Rico. Dicha transición dentro del haplogrupo A también se ha encontrado en los ciboneyes de Cuba y en otras tribus americanas. La deleción de un par de bases –498d– define el linaje B-I de Colombia (Bogotá y Villa de Leyva, Boyacá), un polimorfismo encontrado en los departamentos correspondientes a la cordillera Oriental y que se extiende al Valle del Cauca y a Panamá.Conclusión: Este linaje experimentó una expansión demográfica en la cordillera Oriental que lo llevó a expandirse geográficamente hasta Panamá. Sería recomendable ampliar el muestreo de la costa norte de Colombia y Venezuela, para encontrar más conexiones precolombinas con Puerto Rico. Además, sería conveniente verificar la distribución geográfica de 498d con un muestreo más numeroso y que cubra una zona más amplia de Colombia.Objetive: This work integrates sequencing information of mtDNA from Northern South America with Puerto Rico, to reach an understanding of the peopling of the Caribbean, especially the Tainos. At the same time, it sheds light on demographic events in the Pre-Columbian Colombia.Methodology: Fifty nine samples from Colombia and Venezuela were obtained, and then analyzed along with two others from Warao Indians available in Genbank. HVR (Hypervariable Region) I and II sequences were aligned and compared to the rCRS. Fully 93,4% of the mtDNA samples wereshown to be of Amerindian origin.  Results: A Venezuelan exhibited ancient mutations related to lineage C-II of Puerto Rico, which has been estimated to have arrived to this island in pre-Arawak times. Through complete mtDNA sequencing, it was shown that this sample, VE6, belongs to the Native American C1b clade. Two individuals from Colombia and Venezuela showed the 16129 transition that defines lineageA-VIII of Puerto Rico. This transition has also been found in the Cuban Ciboneys and in various American tribes. A one base pair deletion –498d– defines lineage B-I from Colombia (Bogotá and “Villa de Leyva”, Boyacá), a polymorphism found in the departments belonging to the Eastern cordillera and extending to the Cauca Valley and Panamá. Conclusions: This lineage went through a demographic expansion in the Eastern Cordillera that may have triggered its geographic expansion to Panamá. It would be recommendable to expand the sampling of the Northern Coast of Colombia and Venezuela to find more pre-Columbian connections with Puerto Rico. Furthermore, it would be convenient to verify the geographic distribution of 498d with a bigger sample covering a wider region of Colombia

Pre-Columbian mitochondrial DNA typing on dental remains from an individual belonging to the Paracas Culture (Perú)

El objetivo del presente trabajo fue el de deter-minar in vitro el haplogrupo de la región hipervariable I (HVR-I) del ADN mitocondrial (ADNmt) obtenido a partir de una muestra dental perteneciente a un individuo asociado a la comunidad de los Paracas, hallada por Jorge Reynolds en los años 60 del siglo XX en Ica (Perú). Gracias a esta tipificación molecular, hemos podido contribuir a la información arqueológica y antropológica ya registrada para esta población peruana de más de 2000 años de antigüedad, de-terminando su linaje materno y su vínculo con otros pobladores nativos americanos en la región.Palabras clave: Paracas, ADN mitocondrial, Ha-plogrupos, Pre-Colombino, Perú.Artículo de investigación17-24The aim of the present study was to determine in vitro the haplogroup of the hypervariable region I (HVR-I) of mitochondrial DNA (mtDNA) obtained from a dental sample belonging to an individual associated with the Paracas pre-Columbian community, which was found by Jorge Reynolds in the XXth century in Ica (Perú). We were able to contribute new and complementary information to archaeological and anthropological data already registered for this Peruvian population who lived more than 2000 years before the present, deter-mining his xmaternal lineage and linking him to other contemporary Native American peoples in the region.Key words: Paracas, mitochondrial DNA, Pre-Columbian, Haplogroups, Peru

TIPIFICACIÓN DE ADN MITOCONDRIAL PRECOLOMBINO A PARTIR DE RESTOS DENTALES DE UN INDIVIDUO PERTENECIENTE A LA CULTURA PARACAS (PERÚ)

El objetivo del presente trabajo fue el de deter-minar in vitro el haplogrupo de la región hipervariable I (HVR-I) del ADN mitocondrial (ADNmt) obtenido a partir de una muestra dental perteneciente a un individuo asociado a la comunidad de los Paracas, hallada por Jorge Reynolds en los años 60 del siglo XX en Ica (Perú). Gracias a esta tipificación molecular, hemos podido contribuir a la información arqueológica y antropológica ya registrada para esta población peruana de más de 2000 años de antigüedad, de-terminando su linaje materno y su vínculo con otros pobladores nativos americanos en la región