REBENT - Atlas de cartes d'habitats historiques - Réseau Benthique. Edition 2011

Ce document présente un atlas relativement exhaustif de cartes d’habitats concernant les façades Manche et Atlantique du littoral français : cartes historiques de peuplements benthiques à diverses échelles et de végétation marine à des échelles variant entre 1/5000 et 1/20000. Ces différentes cartes sont présentées telles qu’elles ont été publiées par leurs auteurs respectifs et aussi, dans le cas des cartes à petite échelle, en typologie européenne normalisée EUNIS1 (Version 200410). Toutes ces cartes sont disponibles sur le site Web Rebent http://www.rebent.org/ En effet, dans le cadre du projet Rebent, une compilation a permis de recenser des cartographies qui, pour la plupart, résultent de campagnes de prospection réalisées dans les années 60-70. Pendant cette période, un gros effort fut consenti pour étudier, du point de vue sédimentaire et biologique, les fonds marins de la Manche et du Golfe de Gascogne. Ces données, systématiquement intégrées à un Système d’Information Géographique et harmonisées, couvrent l’essentiel des Eaux territoriales, avec toutefois des lacunes importantes dans les très petits fonds et la zone de balancement des marée

Classification EUNIS, Système d’information européen sur la nature : Traduction française des habitats benthiques des Régions Atlantique et Méditerranée. Vol. 2. Habitats subtidaux & complexes d’habitats

Ce document est une traduction française que l’on espère transcrire au mieux les descriptions d’habitats de la classification EUNIS. Il vient compléter la traduction en français des habitats terrestres et d’eau douce réalisée par le MNHN‐SPN (Louvel et al., 2013). Il a pour objectif de faciliter l’appropriation de cette typologie par les acteurs concernés (scientifiques, gestionnaires ou bureaux d’études) et favoriser les échanges de connaissance sur la biodiversité des habitats benthiques en cohérence avec ce standard. Il s’agit dans ce document du dictionnaire de la typologie EUNIS dans sa version 2007, revue en 2012 pour des modifications des codes de la classification paléarctique et ceux de la classification des habitats marins de la Grande Bretagne. A noter que cette description reste identique pour les habitats communs à la version 2004, largement utilisée comme typologie de référence, notamment pour la cartographie d’habitats dans le cadre du Rebent. L’annexe 8.1 liste les modifications des codes et libellés par rapport à cette version. Seuls les habitats benthiques présents ou potentiellement présents en France ont été traduits. La présence en France a été déterminée par consultation des experts du domaine ainsi que des documents de référence (référentiel national, descriptifs EUNIS, Barcelone, Cartes historiques, …)

Classification EUNIS, Système d’information européen sur la nature : Traduction française des habitats benthiques des Régions Atlantique et Méditerranée. Vol. 1. Habitats Littoraux

Ce document est une traduction française que l’on espère transcrire au mieux les descriptions d’habitats de la classification EUNIS. Il vient compléter la traduction en français des habitats terrestres et d’eau douce réalisée par le MNHN‐SPN (Louvel et al., 2013). Il a pour objectif de faciliter l’appropriation de cette typologie par les acteurs concernés (scientifiques, gestionnaires ou bureaux d’études) et favoriser les échanges de connaissance sur la biodiversité des habitats benthiques en cohérence avec ce standard. Il s’agit dans ce document du dictionnaire de la typologie EUNIS dans sa version 2007, revue en 2012 pour des modifications des codes de la classification paléarctique et ceux de la classification des habitats marins de la Grande Bretagne. A noter que cette description reste identique pour les habitats communs à la version 2004, largement utilisée comme typologie de référence, notamment pour la cartographie d’habitats dans le cadre du Rebent. L’annexe 8.1 liste les modifications des codes et libellés par rapport à cette version. Seuls les habitats benthiques présents ou potentiellement présents en France ont été traduits. La présence en France a été déterminée par consultation des experts du domaine ainsi que des documents de référence (référentiel national, descriptifs EUNIS, Barcelone, Cartes historiques, …)

The Congolobe project, a multidisciplinary study of Congo deep-sea fan lobe complex: Overview of methods, strategies, observations and sampling

The presently active region of the Congo deep-sea fan (around 330 000 km2), called the terminal lobes or lobe complex, covers an area of 2500 km2 at 4700–5100 m water depth and 750–800 km offshore. It is a unique sedimentary area in the world ocean fed by a submarine canyon and a channel-levee system which presently deliver large amounts of organic carbon originating from the Congo River by turbidity currents. This particularity is due to the deep incision of the shelf by the Congo canyon, up to 30 km into the estuary, which funnels the Congo River sediments into the deep-sea. The connection between the river and the canyon is unique for major world rivers. In 2011, two cruises (WACS leg 2 and Congolobe) were conducted to simultaneously investigate the geology, organic and inorganic geochemistry, and micro- and macro-biology of the terminal lobes of the Congo deep-sea fan. Using this multidisciplinary approach, the morpho-sedimentary features of the lobes were characterized along with the origin and reactivity of organic matter, the recycling and burial of biogenic compounds, the diversity and function of bacterial and archaeal communities within the sediment, and the biodiversity and functioning of the faunal assemblages on the seafloor. Six different sites were selected for this study: Four distributed along the active channel from the lobe complex entrance to the outer rim of the sediment deposition zone, and two positioned cross-axis and at increasing distance from the active channel, thus providing a gradient in turbidite particle delivery and sediment age. This paper aims to provide the general context of this multidisciplinary study. It describes the general features of the site and the overall sampling strategy and provides the initial habitat observations to guide the other in-depth investigations presented in this special issue. Detailed bathymetry of each sampling site using 0.1 m to 1 m resolution multibeam obtained with a remotely operated vehicle (ROV) shows progressive widening and smoothing of the channel-levees with increasing depth and reveals a complex morphology with channel bifurcations, erosional features and massive deposits. Dense ecosystems surveyed in the study area gather high density clusters of two large-sized species of symbiotic Vesicomyidae bivalves and microbial mats. These assemblages, which are rarely observed in sedimentary zones, resemble those based on chemosynthesis at cold-seep sites, such as the active pockmarks encountered along the Congo margin, and share with these sites the dominant vesicomyid species Christineconcha regab. Sedimentation rates estimated in the lobe complex range between 0.5 and 10 cm yr−1, which is 2-3 orders of magnitude higher than values generally encountered at abyssal depths. The bathymetry, faunal assemblages and sedimentation rates make the Congo lobe complex a highly peculiar deep-sea habitat driven by high inputs of terrigenous material delivered by the Congo channel-levee system

High Risk of Anal and Rectal Cancer in Patients With Anal and/or Perianal Crohn’s Disease

International audienceBackground & AimsLittle is known about the magnitude of the risk of anal and rectal cancer in patients with anal and/or perineal Crohn’s disease. We aimed to assess the risk of anal and rectal cancer in patients with Crohn’s perianal disease followed up in the Cancers Et Surrisque Associé aux Maladies Inflammatoires Intestinales En France (CESAME) cohort.MethodsWe collected data from 19,486 patients with inflammatory bowel disease (IBD) enrolled in the observational CESAME study in France, from May 2004 through June 2005; 14.9% of participants had past or current anal and/or perianal Crohn’s disease. Subjects were followed up for a median time of 35 months (interquartile range, 29–40 mo). To identify risk factors for anal cancer in the total CESAME population, we performed a case-control study in which participants were matched for age and sex.ResultsAmong the total IBD population, 8 patients developed anal cancer and 14 patients developed rectal cancer. In the subgroup of 2911 patients with past or current anal and/or perianal Crohn’s lesions at cohort entry, 2 developed anal squamous-cell carcinoma, 3 developed perianal fistula–related adenocarcinoma, and 6 developed rectal cancer. The corresponding incidence rates were 0.26 per 1000 patient-years for anal squamous-cell carcinoma, 0.38 per 1000 patient-years for perianal fistula–related adenocarcinoma, and 0.77 per 1000 patient-years for rectal cancer. Among the 16,575 patients with ulcerative colitis or Crohn’s disease without anal or perianal lesions, the incidence rate of anal cancer was 0.08 per 1000 patient-years and of rectal cancer was 0.21 per 1000 patient-years. Among factors tested by univariate conditional regression (IBD subtype, disease duration, exposure to immune-suppressive therapy, presence of past or current anal and/or perianal lesions), the presence of past or current anal and/or perianal lesions at cohort entry was the only factor significantly associated with development of anal cancer (odds ratio, 11.2; 95% CI, 1.18-551.51; P = .03).ConclusionsIn an analysis of data from the CESAME cohort in France, patients with anal and/or perianal Crohn’s disease have a high risk of anal cancer, including perianal fistula–related cancer, and a high risk of rectal cancer