Elevated Humoral Immune Response to SARS-CoV-2 at High Altitudes Revealed by an Anti-RBD “In-House” ELISA

The severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) has caused a global pandemic with dramatic health and socioeconomic consequences. The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) challenges health systems to quickly respond by developing new diagnostic strategies that contribute to identify infected individuals, monitor infections, perform contact-tracing, and limit the spread of the virus. In this brief report, we developed a highly sensitive, specific, and precise “In-House” ELISA to correctly discriminate previously SARS-CoV-2-infected and non-infected individuals and study population seroprevalence. Among 758 individuals evaluated for anti-SARS-CoV-2 serology in the province of Tucumán, Argentina, we found a weak correlation between antibodies elicited against the RBD, the receptor-binding domain of the Spike protein, and the nucleocapsid (N) antigens of this virus. Additionally, we detected mild levels of anti-RBD IgG antibodies in 33.6% of individuals diagnosed with COVID-19, while only 19% showed sufficient antibody titers to be considered as plasma donors. No differences in IgG anti-RBD titers were found between women and men, neither in between different age groups ranging from 18 to 60. Surprisingly, individuals from a high altitude village displayed elevated and longer lasting anti-RBD titers compared to those from a lower altitude city. To our knowledge, this is the first report correlating altitude with increased humoral immune response against SARS-CoV-2 infection.Fil: Tomas Grau, Rodrigo Hernán. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Ploper, Diego. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Avila, Cesar Luis. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Vera Pingitore, Esteban. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Maldonado Galdeano, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Chaves, Analia Silvina. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Socias, Sergio Benjamin. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Stagnetto, Agustín. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Navarro, Silvia Adriana. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Chahla, Rossana Elena. Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud; ArgentinaFil: Aguilar López, Mónica. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Hospital de Dia Presidente Nestor Carlos Kirchner; ArgentinaFil: Llapur, Conrado Juan. Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud; ArgentinaFil: Aznar, Patricia. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Hospital de Dia Presidente Nestor Carlos Kirchner; ArgentinaFil: Alcorta, María Elena. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Hospital de Dia Presidente Nestor Carlos Kirchner; ArgentinaFil: Costas, Dardo. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Hospital de Dia Presidente Nestor Carlos Kirchner; ArgentinaFil: Flores, Isolina. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Hospital de Dia Presidente Nestor Carlos Kirchner; ArgentinaFil: Heinze, Dar. University of Boston. School of Medicine; Estados UnidosFil: Apfelbaum, Gabriela. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Mostoslavsky, Raul. Harvard Medical School; Estados UnidosFil: Mostoslavsky, Gustavo. Harvard Medical School; Estados UnidosFil: Cazorla, Silvia Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Perdigon, Gabriela del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Chehin, Rosana Nieves. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; Argentin

Long-term analysis of antibodies elicited by SPUTNIK V: A prospective cohort study in Tucumán, Argentina

Background: Gam-COVID-Vac (SPUTNIK V) has been granted emergency use authorization in 70 nations and has been administered to millions worldwide. However, there are very few peer-reviewed studies describing its effects. Independent reports regarding safety and effectiveness could accelerate the final approval by the WHO. We aimed to study the long-term humoral immune response in nay¨ve and previously infected volunteers who received SPUTNIK V. Methods: Humoral immune responses, assayed by anti-SARS-CoV-2-spike-RBD IgG ELISA and neutralization assays, were measured in 602 healthcare workers at 0, 14, 28, 60 and 180 days after receiving SPUTNIK V between December 2020 and July 2021 in Tucuman, Argentina. Findings: Seroconversion was detected in 97% of individuals after 28 days post-vaccination (dpv) (N = 405). Anti-RBD titers began to decrease after 60 dpv (N = 328), but remained detectable in 94% at 90 dpv (N = 224). At 180 dpv, anti-RDB titers persisted in 31% (N = 146). Previous infection triggered an increased immune response to the first dose and increased neutralization activity against variants of concern (VOC). Second doses in previously infected individuals further increased titers, even 90 dpv (N = 75). Basal antibody titers had more influence on postvaccination anti-RBD responses than the time elapsed between diagnosis and vaccination (N = 274). Interpretation: Data presented herein provides essential knowledge regarding the kinetics of antibodies induced by SPUTNIK V up to six months after immunization, and suggests that when considering one-dose vaccination policies for individuals with previous SARS-CoV-2 infection, serological studies to determine basal titers may be important, independent of when diagnosis occurred.Fil: Chahla, Rossana Elena. Ministerio de Salud Pública de Tucumán; ArgentinaFil: Tomas Grau, Rodrigo Hernán. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Cazorla, Silvia Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Ploper, Diego. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Vera Pingitore, Esteban. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Aguilar López, Mónica. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Aznar, Patricia. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Alcorta, María Elena. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Velez, Eva Maria del Mar. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Stagnetto, Agustín. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Avila, Cesar Luis. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Maldonado Galdeano, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Socias, Sergio Benjamin. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Heinze, Dar. University Of Boston. School Of Medicine. Center For Regenerative Medicine.; Estados UnidosFil: Navarro, Silvia Adriana. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Llapur, Conrado Juan. Ministerio de Salud Pública de Tucumán; ArgentinaFil: Costas, Dardo. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Flores, Isolina. Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Departamento Bioquimico. Laboratorio de Salud Publica.; ArgentinaFil: Edelstein, Alexis. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Kowdle, Shreyas. Icahn School of Medicine at Mount Sinai; Estados UnidosFil: Perandones, Claudia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Lee, Benhur. Icahn School of Medicine at Mount Sinai; Estados UnidosFil: Apfelbaum, Gabriela. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Mostoslavsky, Raul. Harvard Medical School; Estados UnidosFil: Mostoslavsky, Gustavo. University Of Boston. School Of Medicine. Center For Regenerative Medicine.; Estados UnidosFil: Perdigon, Gabriela del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Chehin, Rosana Nieves. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; Argentin

[Detection of human bocavirus in children from Tucuman and Santa Fe, Argentina]

A large proportion of acute respiratory tract infections (ARTI) remain without etiologic diagnosis, reason why new pathogens are investigated continuously. Human bocavirus (HBoV) was discovered in 2005, as a new member of Parvoviridae family and proposed to cause ARTI

Convalescent Plasma Therapy in SARS-COV-2 Infection, Experience in Tucumán Argentina: An Observational Study

Background: Therapies based on different drugs and corticosteroids have been employed to stop the SARS-COV-2 virus infection. The administration of convalescent plasma (CP) is other therapy used to control COVID-19 disease. Aim: To evaluate the efficacy of the CP therapy on the recovery of SARS-COV-2 infection in 189 hospitalized patients who received this treatment during July to October 2020. Material and Methods: 189 patients with COVID-19 requiring hospitalization in theIntensive Care Unit (ICU) or mechanical ventilation, from the public hospital dependent on the Health Ministry of Tucumán, Argentina, were selected to receive plasma. The Convalescent Plasma to be use in the transfusion therapy, was selected according the nucelocapside specific IgG antibody titer, measured by Abbott Architect SARS-CoV-2 assay. Results: We observed that early administration of CP, between3 to 5 days after hospitalization, to patients with moderate disease, was associated with a decrease in the mortality. In 27 patients from the Intensive Care Unit which required mechanical ventilation and 28 patients that presented several comorbidities, plasma administration was effective in 14 and 60% respectively. Conclusion: The results suggest that the favorable effect of CP would be related with the the period of time when plasma wasadministered to hospitalized patients and the severity of the disease. Early administration was a critical point to decrease the deaths of SARS-COV-2 infected patients.Fil: Chahla, Rossana. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Agote, Felicitas. No especifíca;Fil: Medici, Natalia. Hospital Eva Peron ; Gobierno de la Provincia de Tucuman;Fil: Agudo, Gabriela. Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Hosp. Centro de Salud "zenon Santillan"; ArgentinaFil: Farhat, Maria. Gobierno de la Provincia de Tucumán. Hospital Ángel Padilla; ArgentinaFil: Sandoval, María Rosario. Gobierno de la Provincia de Tucumán. Hospital Ángel Padilla; ArgentinaFil: De Gorostiza, Graciela. Gobierno de Tucumán. Sistema Provincial de Salud. Hospital de Clínicas “Presidente Dr. Nicolás Avellaneda”; ArgentinaFil: Valenzuela, Juan. No especifíca;Fil: Amicone, Nancy. Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud; ArgentinaFil: Barrenechea, Guillermo. Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud; ArgentinaFil: Aguilar, Mónica. Provincia de Tucuman. Sistema Provincial de Salud de Tucuman; ArgentinaFil: Costas, Dardo. Provincia de Tucuman. Sistema Provincial de Salud de Tucuman; ArgentinaFil: Walter, Sigler. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Toledo, Roxana. Universidad Nacional de Tucumán; ArgentinaFil: Maldonado Galdeano, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Cazorla, Silvia Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; ArgentinaFil: Chehin, Rosana Nieves. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucumán. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones en Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario; ArgentinaFil: Ploper, Diego. Universidad Nacional de Tucuman. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Gobierno de la Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud. Sistema Provincial de Salud. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet Noa Sur. Instituto de Investigaciones En Medicina Molecular y Celular Aplicada del Bicentenario.; ArgentinaFil: Vera Pingitore, Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Tomas Grau, Rodrigo Hernán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Perdigon, Gabriela del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Centro de Referencia para Lactobacilos; ArgentinaFil: Peral, Maria de Los Angeles. Provincia de Tucuman. Ministerio de Salud; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas; Argentin

Evolution of SARS-CoV-2 during the first year of the COVID-19 pandemic in Northwestern Argentina

Studies about the evolution of SARS-CoV-2 lineages in different backgrounds such as naive populations are still scarce, especially from South America. This work aimed to study the introduction and diversification pattern of SARS-CoV-2 during the first year of the COVID-19 pandemic in the Northwestern Argentina (NWA) region and to analyze the evolutionary dynamics of the main lineages found. In this study, we analyzed a total of 260 SARS-CoV-2 whole-genome sequences from Argentina, belonging to the Provinces of Jujuy, Salta, and Tucumán, from March 31st, 2020, to May 22nd, 2021, which covered the full first wave and the early second wave of the COVID-19 pandemic in Argentina. In the first wave, eight lineages were identified: B.1.499 (76.9%), followed by N.5 (10.2%), B.1.1.274 (3.7%), B.1.1.348 (3.7%), B.1 (2.8%), B.1.600 (0.9%), B.1.1.33 (0.9%) and N.3 (0.9%). During the early second wave, the first-wave lineages were displaced by the introduction of variants of concern (VOC) (Alpha, Gamma), or variants of interest (VOI) (Lambda, Zeta, Epsilon) and other lineages with more limited distribution. Phylodynamic analyses of the B.1.499 and N.5, the two most prevalent lineages in the NWA, revealed that the rate of evolution of lineage N.5 (7.9 × 10−4 substitutions per site per year, s/s/y) was a ∼40% faster than that of lineage B.1.499 (5.6 × 10−4 s/s/y), although both are in the same order of magnitude than other non-VOC lineages. No mutations associated with a biological characteristic of importance were observed as signatures markers of the phylogenetic groups established in Northwestern Argentina, however, single sequences in non-VOC lineages did present mutations of biological importance or associated with VOCs as sporadic events, showing that many of these mutations could emerge from circulation in the general population. This study contributed to the knowledge about the evolution of SARS-CoV-2 in a pre-vaccination and without post-exposure immunization period.Instituto de Patología VegetalFil: Zambrana Montaño, Romina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Zambrana Montaño, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Culasso, Andrés Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Culasso, Andrés Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Marquez, Nathalie. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Marquez, Nathalie. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Debat, Humberto Julio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Salmerón, Mariana. Laboratorio de Salud Pública; ArgentinaFil: Zamora, Ana María. Laboratorio de Salud Pública; ArgentinaFil: Ruíz de Huidobro, Gustavo. Laboratorio de Salud Pública; ArgentinaFil: Costas, Dardo. Laboratorio de Salud Pública; ArgentinaFil: Alabarse, Graciela. Laboratorio de Salud Pública; ArgentinaFil: Charre, Miguel Alejandro. Laboratorio Central de Salud Pública, San Salvador de Jujuy; ArgentinaFil: Fridman, Ariel David. Laboratorio Central de Salud Pública. San Salvador de Jujuy; ArgentinaFil: Mamani, Claudia. Laboratorio Central de Salud Pública. San Salvador de Jujuy; ArgentinaFil: Vaca, Fabiana. Laboratorio Central de Salud Pública. San Salvador de Jujuy; ArgentinaFil: Maza Diaz, Claudia. Laboratorio Central de Salud Pública. San Salvador de Jujuy; ArgentinaFil: Raskovsky, Viviana. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Lavaque, Esteban. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Lesser, Veronica. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Cajal, Pamela. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Agüero, Fernanda. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Calvente, Cintia. Hospital Señor del Milagro. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Viegas, Mariana. Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez. Laboratorio de Virología; Argentin