LEF1-AS1, long non-coding RNA, inhibits proliferation in myeloid malignancy

LEF1 antisense RNA 1 (LEF1-AS1) is an antisense long non-coding RNA encoded in the lymphoid enhancer-binding factor 1 (LEF1) locus. LEF1-AS1 is a conserved transcript dysregulated in hematopoiesis. This study aimed to functionally characterize the role of this transcript in myeloid malignancy and explore a possible regulatory effect of LEF1-AS1 upon LEF1. We show that LEF1-AS1 is highly expressed in normal hematopoietic stem cells but barely detectable in myeloid malignant cell lines. Additionally, bone marrow cells from myelodysplastic syndrome (n=12) and acute myeloid malignancy patients (n=28) expressed significantly reduced levels of LEF1-AS1 compared to healthy controls (n=15). Artificial LEF1-AS1 over-expression inhibited proliferation in HL60 and led to an upregulation of tumor suppressors p21 and p27, and reduced ERK1/2 activation. Unexpectedly, no underlying modulation of LEF1 was detected. Ectopic expression of LEF1-AS1 also inhibited proliferation in HELA, a cell line lacking endogenous expression of LEF1, supporting a LEF1-independent mechanism. Additionally, transient over-expression of LEF1-AS1 in AML patient cells also led to reduced proliferation and colony formation capacity. We used a mass spectrometry-based proteomics approach. Proteomic quantification identified the modulation of an important metabolic regulator, Fumarase, and concomitant accumulation of the metabolite fumarate23430213025FAPESP – Fundação de Amparo à Pesquisa Do Estado De São Paulo2013/17227-

Variantes genéticas en el locus 9p21 contribuyen al desarrollo de arteriosclerosis a través de la modulación de ANRIL y CDKN2A/B

Registro creado en correspondencia al grado de doctora de Ada Congrains Castillo.Los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) han identificado variantes genéticas que contribuyen al riesgo de enfermedad cardiovascular (ECV) en el locus del cromosoma 9p21. La región asociada a CVD es adyacente a los dos inhibidores de quinasas dependientes de ciclina (CDKN) 2A y 2B y los últimos exones del ARN no codificante, ANRIL. Todavía no está claro cuál de estas transcripciones o cómo están involucradas en la patogénesis de la aterosclerosis.Genome-wide association studies (GWAS) have identified genetic variants contributing to the risk of cardiovascular disease (CVD) at the chromosome 9p21 locus. The CVD-associated region is adjacent to the two cyclin dependent kinase inhibitors (CDKN)2A and 2B and the last exons of the non-coding RNA, ANRIL. It is still not clear which of or how these transcripts are involved in the pathogenesis of atherosclerosis.Japón. Programa de Promoción de Estudios Fundamentales en el Instituto Nacional de Innovación Biomédica de Japón (HR: 22-2-5), el Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología de Japón (KK: 22510211) y la Fundación NOVARTIS para la Investigación Gerontológica (KK).Tesi

Variantes genéticas en el locus 9p21 contribuyen al desarrollo de arteriosclerosis a través de la modulación de ANRIL y CDKN2A/B

Registro creado en correspondencia al grado de doctora de Ada Congrains Castillo.Los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) han identificado variantes genéticas que contribuyen al riesgo de enfermedad cardiovascular (ECV) en el locus del cromosoma 9p21. La región asociada a CVD es adyacente a los dos inhibidores de quinasas dependientes de ciclina (CDKN) 2A y 2B y los últimos exones del ARN no codificante, ANRIL. Todavía no está claro cuál de estas transcripciones o cómo están involucradas en la patogénesis de la aterosclerosis.Genome-wide association studies (GWAS) have identified genetic variants contributing to the risk of cardiovascular disease (CVD) at the chromosome 9p21 locus. The CVD-associated region is adjacent to the two cyclin dependent kinase inhibitors (CDKN)2A and 2B and the last exons of the non-coding RNA, ANRIL. It is still not clear which of or how these transcripts are involved in the pathogenesis of atherosclerosis.Este estudio fue apoyado en parte por subvenciones en ayuda del Programa de Promoción de Estudios Fundamentales en el Instituto Nacional de Innovación Biomédica de Japón (HR: 22-2-5), el Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología de Japón (KK: 22510211) y la Fundación NOVARTIS para la Investigación Gerontológica (KK).Tesi