Whole-genome sequencing for drug resistance profile prediction in Mycobacterium tuberculosis

Whole-genome sequencing allows rapid detection of drug-resistant; Mycobacterium tuberculosis; isolates. However, the availability of high-quality data linking quantitative phenotypic drug susceptibility testing (DST) and genomic data have thus far been limited. We determined drug resistance profiles of 176 genetically diverse clinical; M. tuberculosis; isolates from the Democratic Republic of the Congo, Ivory Coast, Peru, Thailand, and Switzerland by quantitative phenotypic DST for 11 antituberculous drugs using the BD Bactec MGIT 960 system and 7H10 agar dilution to generate a cross-validated phenotypic DST readout. We compared DST results with predicted drug resistance profiles inferred by whole-genome sequencing. Classification of strains by the two phenotypic DST methods into resistotype/wild-type populations was concordant in 73 to 99% of cases, depending on the drug. Our data suggest that the established critical concentration (5 mg/liter) for ethambutol resistance (MGIT 960 system) is too high and misclassifies strains as susceptible, unlike 7H10 agar dilution. Increased minimal inhibitory concentrations were explained by mutations identified by whole-genome sequencing. Using whole-genome sequences, we were able to predict quantitative drug resistance levels for the majority of drug resistance mutations. Predicting quantitative levels of drug resistance by whole-genome sequencing was partially limited due to incompletely understood drug resistance mechanisms. The overall sensitivity and specificity of whole-genome-based DST were 86.8% and 94.5%, respectively. Despite some limitations, whole-genome sequencing has the potential to infer resistance profiles without the need for time-consuming phenotypic methods

Integración Clínico-Patológica 2-ME160-201900

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 integra los conocimientos de Fundamentos Biológicos Estructura y Función y Educación Clínica y Profesional. Los estudiantes analizan los problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico la prevención y la promoción de la salud.Curso de especialidad en la carrera de Medicina de carácter teórico práctico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular busca desarrollar las competencias generales de Pensamiento Crítico en el nivel 2 y la competencia específica de Profesionalismo - Aprendizaje Autónomo en el nivel 2. Este curso brinda las bases de la práctica clínica y en los cursos siguientes se desarrolle la competencia de diagnóstico prevención y promoción

Integración Clínico-Patológica 2 - ME160 201900

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 integra los conocimientos de Fundamentos Biológicos, Estructura y Función, y Educación Clínica y Profesional. Los estudiantes analizan los problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes, el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas, con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico, la prevención y la promoción de la salud. Curso de especialidad en la carrera de Medicina, de carácter teórico práctico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular, busca desarrollar las competencias generales de Pensamiento Crítico en el nivel 2 y la competencia específica de Profesionalismo - Aprendizaje Autónomo en el nivel 2. Este curso brinda las bases de la práctica clínica y en los cursos siguientes se desarrolle la competencia de diagnóstico, prevención y promoción

Integración Clínico-Patológica 2 - ME160 - 202100

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 es un curso de especialidad en la carrera de Medicina de carácter teórico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular, el cual integra los conocimientos obtenidos en Fundamentos Biológicos, Estructura y Función y Educación Clínica y Profesional. Además añade conocimientos básicos sobre clínica y biología molecular oncológica, mediante el uso de los conocimientos previos antes mencionados. Para la adquisición del conocimiento los estudiantes analizarán problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes, el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas, con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico, la prevención y la promoción de la salud. El curso de Integración Clínico - Patológica 2 ha sido diseñado con el propósito de permitir al estudiante integrar los conocimientos relacionados a vías metabólicas, vías de señalización celular y molecular, sistema inmune, fisiología, entre otros en el campo de la oncología clínica

Integración Clínico-Patológica 2 - ME160 - 202102

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 es un curso de especialidad en la carrera de Medicina de carácter teórico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular, el cual integra los conocimientos obtenidos en Fundamentos Biológicos, Estructura y Función y Educación Clínica y Profesional. Además añade conocimientos básicos sobre clínica y biología molecular oncológica, mediante el uso de los conocimientos previos antes mencionados. Para la adquisición del conocimiento los estudiantes analizarán problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes, el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas, con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico, la prevención y la promoción de la salud. El curso de Integración Clínico - Patológica 2 ha sido diseñado con el propósito de permitir al estudiante integrar los conocimientos relacionados a vías metabólicas, vías de señalización celular y molecular, sistema inmune, fisiología, entre otros en el campo de la oncología clínica

Integración Clínico-Patológica 2 - ME160 - 202101

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 es un curso de especialidad en la carrera de Medicina de carácter teórico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular, el cual integra los conocimientos obtenidos en Fundamentos Biológicos, Estructura y Función y Educación Clínica y Profesional. Además añade conocimientos básicos sobre clínica y biología molecular oncológica, mediante el uso de los conocimientos previos antes mencionados. Para la adquisición del conocimiento los estudiantes analizarán problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes, el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas, con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico, la prevención y la promoción de la salud. El curso de Integración Clínico - Patológica 2 ha sido diseñado con el propósito de permitir al estudiante integrar los conocimientos relacionados a vías metabólicas, vías de señalización celular y molecular, sistema inmune, fisiología, entre otros en el campo de la oncología clínica

Integración Clínico-Patológica 2 - ME160 201802

El curso de Integración Clínico - Patológica 2 integra los conocimientos de Fundamentos Biológicos, Estructura y Función, y Educación Clínica y Profesional. Los estudiantes analizan los problemas médicos oncológicos desde el punto de vista de los mecanismos biológicos subyacentes, el impacto y la adaptación de los sistemas y las manifestaciones clínicas, con el fin de comprender y buscar soluciones para el diagnóstico, la prevención y la promoción de la salud. Curso de especialidad en la carrera de Medicina, de carácter teórico práctico dirigido a los estudiantes del séptimo nivel de la malla curricular, busca desarrollar las competencias generales de Pensamiento Crítico en el nivel 2 y la competencia específica de Profesionalismo - Aprendizaje Autónomo en el nivel 2. Este curso brinda las bases de la práctica clínica y en los cursos siguientes se desarrolle la competencia de diagnóstico, prevención y promoción

Procesos Biológicos 2 - ME138 201802

Curso específico de la Carrera de Medicina, de carácter teórico-práctico, que brinda herramientas necesarias para desarrollar conocimientos científicos pertinentes al campo de la Bioquímica y la Biología Molecular, utilizando metodología activa en sesiones de teoría, prácticas de laboratorio, portafolios y prácticas dirigidas. El curso de Procesos Biológicos 2 tiene como objetivo definir los fundamentos bioquímicos y moleculares que rigen el comportamiento de los seres vivos para resolver los problemas médicos, así como el desarrollo de habilidades de investigación, expresión de ideas fundamentadas, aprendizaje autónomo y trabajo en equipo, que le permitirán desarrollarse y desenvolverse en la práctica clínica y la investigación científica. Este curso contribuye al desarrollo de la competencia de Pensamiento Crítico en su nivel 1