9 research outputs found
Protein phosphatase 2Bw and protein phosphatase Z are <em>Saccharomyces cerevisiae</em> enzymes
Effect of OA-inhibitor of protein phosphatases PP1 and PP2A â on initiation of DNA replication and mitosis in Vicia faba root meristems
Phosphoglycerate Kinase B from Ram Testis. Purification, Characterisation and Comparison with the Muscle Isoenzyme
The sugarcane signal transduction (SUCAST) catalogue: prospecting signal transduction in sugarcane
EST sequencing has enabled the discovery of many new genes in a vast array of organisms, and the utility of this approach to the scientific community is greatly increased by the establishment of fully annotated databases. The present study aimed to identify sugarcane ESTs sequenced in the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) project (<A HREF="http://sucest.lad.ic.unicamp.br/">http://sucest.lad.ic.unicamp.br</A>) that corresponded to signal transduction components. We also produced a sugarcane signal transduction (SUCAST) catalogue (<A HREF="http://sucest.lad.ic.unicamp.br/private/mining-reports/QG/QG-mining.htm">http://sucest.lad.ic.unicamp.br/private/mining-reports/QG/QG-mining.htm</A>) that covered the main categories and pathways. Expressed sequence tags (ESTs) encoding enzymes for hormone (gibberellins, ethylene, auxins, abscisic acid and jasmonic acid) biosynthetic pathways were found and tissue specificity was inferred from their relative frequency of occurrence in the different libraries. Whenever possible, transducers of hormones and plant peptide signaling were catalogued to the respective pathway. Over 100 receptors were found in sugarcane, which contains a large family of Ser/Thr kinase receptors and also photoreceptors, histidine kinase receptors and their response regulators. G-protein and small GTPases were analyzed and compared to known members of these families found in mammalian and plant systems. Major kinase and phosphatase pathways were mapped, with special attention being given to the MAP kinase and the inositol pathway, both of which are well known in plants.<br>O sequenciamento de ESTs (etiquetas de sequencias transcritas) tem possibilitado a descoberta de muitos novos genes em uma ampla variedade de organismos. Um aumento do aproveitamento desta informação pela comunidade cientĂfica tem sido possĂvel graças ao desenvolvimento de base de dados contendo seqĂŒĂȘncias completamente anotadas. O trabalho aqui relatado teve como objetivo a identificação de ESTs de cana de açĂșcar seqĂŒenciadas atravĂ©s do projeto SUCEST (<A HREF="http://sucest.lad.ic.%20unicamp.br/">http://sucest.lad.ic. unicamp.br</A>) que codificam para proteĂnas envolvidas em mecanismos de transdução de sinal. NĂłs tambĂ©m preparamos um catĂĄlogo dos componentes de transdução de sinal da cana de açĂșcar (SUCAST) englobando as principais categorias e vias conhecidas (<A HREF="http://sucest.lad.ic.unicamp.%20br/private/mining-reports/QG/QG-mining.htm">http://sucest.lad.ic.unicamp. br/private/mining-reports/QG/QG-mining.htm</A>). ESTs codificadoras de enzimas envolvidas nas rotas de biossĂntese de hormĂŽnios (giberelinas, etileno, auxinas, ĂĄcido abscĂssico, ĂĄcido jasmĂŽnico) foram encontradas e sua expressĂŁo especĂfica nos tecidos foi inferida a partir de seu enriquecimento nas diferentes bibliotecas. Quando possĂvel, transmissores do sinal hormonal e da resposta a peptĂdeos produzidos pela planta foram associados a suas respectivas vias. Mais de 100 receptores foram encontrados na cana de açĂșcar, entre os quais uma grande famĂlia de receptores Ser/Thr quinase e tambĂ©m de fotoreceptores, receptores do tipo histidina quinase e seus respectivos reguladores da resposta. ProteĂnas G e GTPases pequenas foram tambĂ©m analisadas e comparadas com membros destas famĂlias jĂĄ conhecidos em mamĂferos e plantas. As vias principais que envolvem a participação de proteĂnas quinases e fosfatases foram mapeadas, em especial as vias da quinase MAP quinase e do inositol que sĂŁo bem estudadas em plantas