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    Etude de l’effet mutagène lors d’une colonisation néonatale par une souche de Escherichia coli produisant la colibactine

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    Escherichia coli (E. coli) est l’une des principales bactéries commensales primo-colonisatrices du tractus intestinal du nouveau-né. Au sein de cette espèce bactérienne ubiquitaire, certaines souches possèdent un îlot génomique pks regroupant les gènes permettant la synthèse d’une génotoxine, la colibactine. Cette toxine induit des cassures double brin de l’ADN in vitro dans des cellules eucaryotes en culture et in vivo dans les cellules intestinales. La période néonatale est une période critique au cours de laquelle l’épithélium intestinal est directement exposé à ces bactéries primo-colonisatrices. Afin d’examiner les conséquences de la colonisation néonatale par des E. coli commensales produisant la colibactine, les objectifs de cette étude ont été (1) de déterminer la fréquence de mutation dans un gène rapporteur mobilisable (cII), intégré dans le génome de cellules eucaryotes infectées par une souche de E. coli porteuse de l’îlot génomique pks; (2) de cartographier dans un modèle de colonisation néonatale les sites de contact bactéries/cellules ainsi que les cellules dont l’ADN a été endommagé. La génération de mutants cII m’a permis de montrer une augmentation significative de la fréquence de mutant chez les cellules infectées par les bactéries pks+, et de constituer une banque de gènes cII mutés dont le séquençage permet de caractériser la nature des mutations induites par la colibactine. Mon travail a également mis en évidence in vivo la distribution spatiale dynamique des dommages à l’ADN, des glandes intestinales vers l’épithélium de surface, en fonction du développement de la muqueuse intestinale. L’ensemble de ce travail pose les bases de l’étude de la mutagenèse résultant de l’acquisition néonatale d’une souche de E. coli produisant la colibactine

    Etude de l effet mutagène lors d une colonisation néonatale par une souche de Escherichia coli produisant la colibactine

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    Escherichia coli (E. coli) est l une des principales bactéries commensales primo-colonisatrices du tractus intestinal du nouveau-né. Au sein de cette espèce bactérienne ubiquitaire, certaines souches possèdent un îlot génomique pks regroupant les gènes permettant la synthèse d une génotoxine, la colibactine. Cette toxine induit des cassures double brin de l ADN in vitro dans des cellules eucaryotes en culture et in vivo dans les cellules intestinales. La période néonatale est une période critique au cours de laquelle l épithélium intestinal est directement exposé à ces bactéries primo-colonisatrices. Afin d examiner les conséquences de la colonisation néonatale par des E. coli commensales produisant la colibactine, les objectifs de cette étude ont été (1) de déterminer la fréquence de mutation dans un gène rapporteur mobilisable (cII), intégré dans le génome de cellules eucaryotes infectées par une souche de E. coli porteuse de l îlot génomique pks; (2) de cartographier dans un modèle de colonisation néonatale les sites de contact bactéries/cellules ainsi que les cellules dont l ADN a été endommagé. La génération de mutants cII m a permis de montrer une augmentation significative de la fréquence de mutant chez les cellules infectées par les bactéries pks+, et de constituer une banque de gènes cII mutés dont le séquençage permet de caractériser la nature des mutations induites par la colibactine. Mon travail a également mis en évidence in vivo la distribution spatiale dynamique des dommages à l ADN, des glandes intestinales vers l épithélium de surface, en fonction du développement de la muqueuse intestinale. L ensemble de ce travail pose les bases de l étude de la mutagenèse résultant de l acquisition néonatale d une souche de E. coli produisant la colibactine.TOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocTOULOUSE3-BU Santé-Centrale (315552105) / SudocSudocFranceF

    The Genotoxin Colibactin Is a Determinant of Virulence in Escherichia coli K1 Experimental Neonatal Systemic Infection.

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    Escherichia coli strains expressing the K1 capsule are a major cause of sepsis and meningitis in human neonates. The development of these diseases is dependent on the expression of a range of virulence factors, many of which remain uncharacterized. Here, we show that all but 1 of 34 E. coli K1 neonatal isolates carried clbA and clbP, genes contained within the pks pathogenicity island and required for the synthesis of colibactin, a polyketide-peptide genotoxin that causes genomic instability in eukaryotic cells by induction of double-strand breaks in DNA. Inactivation of clbA and clbP in E. coli A192PP, a virulent strain of serotype O18:K1 that colonizes the gastrointestinal tract and translocates to the blood compartment with very high frequency in experimental infection of the neonatal rat, significantly reduced the capacity of A192PP to colonize the gut, engender double-strand breaks in DNA, and cause invasive, lethal disease. Mutation of clbA, which encodes a pleiotropic enzyme also involved in siderophore synthesis, impacted virulence to a greater extent than mutation of clbP, encoding an enzyme specific to colibactin synthesis. Restoration of colibactin gene function by complementation reestablished the fully virulent phenotype. We conclude that colibactin contributes to the capacity of E. coli K1 to colonize the neonatal gastrointestinal tract and to cause invasive disease in the susceptible neonate
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