Interaction of Vault Particles with Estrogen Receptor in the MCF-7 Breast Cancer Cell

A 104-kD protein was coimmunoprecipitated with the estrogen receptor from the flowtrough of a phosphocellulose chromatography of MCF-7 cell nuclear extract. mAbs to this protein identified several cDNA clones coding for the human 104-kD major vault protein. Vaults are large ribonucleoprotein particles of unknown function present in all eukaryotic cells. They have a complex morphology, including several small molecules of RNA, but a single protein species, the major vault protein, accounts for >70% of their mass. Their shape is reminiscent of the nucleopore central plug, but no proteins of known function have been described to interact with them. Western blot analysis of vaults purified on sucrose gradient showed the presence of estrogen receptor co-migrating with the vault peak. The AER317 antibody to estrogen receptor coimmunoprecipitated the major vault protein and the vault RNA also in the 20,000 g supernatant fraction. Reconstitution experiments of estrogen receptor fragments with the major vault protein mapped the site of the interaction between amino acids 241 and 280 of human estrogen receptor, where the nuclear localization signal sequences are located. Estradiol treatment of cells increased the amount of major vault protein present in the nuclear extract and coimmunoprecipitated with estrogen receptor, whereas the anti-estrogen ICI182,780 had no effect. The hormone-dependent interaction of vaults with estrogen receptor was reproducible in vitro and was prevented by sodium molybdate. Antibodies to progesterone and glucocorticoid receptors were able to coimmunoprecipitate the major vault protein. The association of nuclear receptors with vaults could be related to their intracellular traffic

Highlighting chromosome loops in DNA-picked chromatin (DPC).

"Growing evidence supports the concept that dynamic intra-and inter-chromosomal links between specific loci contribute to the creation of cell type-specific gene expression profiles. Therefore, analysis of the establishment of peculiar functional correlations between sites, also distant on linear DNA, that govern the transcriptional process appears to be of fundamental relevance. We propose here an experimental approach showing that 17 beta-estradiol-induced transcription associates to formation of loops between the promoter and termination regions of hormone-responsive genes. This strategy reveals as a tool to be also suitably used, in conjunction with automated techniques, for an extensive analysis of sites shared by multiple genes for induced expression.

Immunobiologia di Janeway

Il testo Immunobiologia di Janeway è stato pensato per gli studenti dei corsi universitari, ma è così completo da essere adeguato anche come testo di riferimento per specializzandi e per gli stessi medici che praticano l’immunologia. Pur addentrandosi nel mondo della microbiologia, è chiaramente focalizzato sullo studio dell’immunologia e dei suoi principali eventi immunopatologici, quali le reazioni autoimmunitarie, le immunodeficienze, i trapianti e l’immunologia dei tumori. Questa nona edizione è stata completamente riorganizzata ed aggiornata e contiene più di cento immagini nuove. Nell’Appendice I, il Toolbox degli immunologi ha subito una totale rivisitazione, con l’aggiunta di nuove tecniche, tra cui il sistema CRISPR/Cas9 e tecniche di spettrometria di massa e di proteomica. Inoltre è stato creato un elenco di domande che serviranno agli studenti per riflettere attentamente e sintetizzare le conoscenze apprese in ogni capitolo e per preparare al meglio gli esami

Immunità innata: le prime linee di difesa

Il testo Immunobiologia di Janeway è stato pensato per gli studenti dei corsi universitari, ma è così completo da essere adeguato anche come testo di riferimento per specializzandi e per gli stessi medici che praticano l’immunologia. Pur addentrandosi nel mondo della microbiologia, è chiaramente focalizzato sullo studio dell’immunologia e dei suoi principali eventi immunopatologici, quali le reazioni autoimmunitarie, le immunodeficienze, i trapianti e l’immunologia dei tumori. Questa nona edizione è stata completamente riorganizzata ed aggiornata e contiene più di cento immagini nuove. Nell’Appendice I, il Toolbox degli immunologi ha subito una totale rivisitazione, con l’aggiunta di nuove tecniche, tra cui il sistema CRISPR/Cas9 e tecniche di spettrometria di massa e di proteomica. Inoltre è stato creato un elenco di domande che serviranno agli studenti per riflettere attentamente e sintetizzare le conoscenze apprese in ogni capitolo e per preparare al meglio gli esami

PRDM Proteins: Molecular Mechanisms in Signal Transduction and Transcriptional Regulation

biolog

Towards an Ideal In Cell Hybridization-Based Strategy to Discover Protein Interactomes of Selected RNA Molecules

RNA-binding proteins are crucial to the function of coding and non-coding RNAs. The disruption of RNA–protein interactions is involved in many different pathological states. Several computational and experimental strategies have been developed to identify protein binders of selected RNA molecules. Amongst these, ‘in cell’ hybridization methods represent the gold standard in the field because they are designed to reveal the proteins bound to specific RNAs in a cellular context. Here, we compare the technical features of different ‘in cell’ hybridization approaches with a focus on their advantages, limitations, and current and potential future applications