Genetic mapping of an apple (Malus x domestica Borkh) population for agronomic traits related to cold requirement

A macieira necessita de estímulo do frio para a queda das folhas ao final do ciclo, à dormência hibernal e a sua quebra desta. A não ocorrência adequada de frio no período do inverno resulta em brotação e florescimento irregular, resultando em desenvolvimento vegetativo e reprodutivo deficientes. Os objetivos deste trabalho foram de caracterizar indivíduos da população F1 para caracteres associados ao requerimento de frio hibernal como data de brotação e floração, construir um mapa genético de ligação em população clonal F1 e mapear QTLs associados a estes caracteres. Os genótipos da população F1 de estudo segregaram para os caracteres fenotípicos de brotação vegetativa e floração. Os mapas genéticos dos genitores ‘M13/91’ e ‘Fred Hough’ foram obtidos com 729 e 711 marcadores funcionais do tipo SNP, respectivamente. Dezessete grupos de ligação foram obtidos para cada genitor, cobrindo 1361 cM e 1066 cM para ‘M13/91’ e ‘Fred Hough’, respectivamente. As posições dos marcadores mapeados estão consistentes com o mapa consenso. Na extremidade do grupo de ligação 9, QTLs majoritários, possivelmente associados a fatores genéticos importantes para as características avaliadas, foram identificados nos mapas de ambos os genitores. Nesta região foram mapeados quatro marcadores genéticos significativamente ligados aos QTLs majoritários para brotação vegetativa e floração, explicando de 32,3% a 73,4% da variação fenotípica observada, respectivamente. Estes resultados sustentam a hipótese de que a extremidade do grupo de ligação 9 possui fatores genéticos associados ao controle do tempo de brotação e floração regulado pela exposição ao frio. Nesta região encontram-se genes de transcritos preditos com grande similaridade ao gene Flowering Locus C de Arabidopsis thaliana.Apple trees require cold stimulus for leaf shedding at the end of the growth cycle and for winter dormancy. The non-occurrence of the appropriate cold condition during the winter causes irregular sprouting and flowering, resulting in deficient vegetative and reproductive growth. This study aimed to characterize individuals from a F1 population derived from ‘Fred Hough’ and ‘M13/91’ for cold requirement associated traits, like vegetative bud burst and flowering, to develop a genetic linkage map for both genitors and identify QTLs associated with these traits. The F1 population showed segregation for time for vegetative sprouting and time for flowering. A total of 729 and 711 functional SNP type markers were used to generate a map for each parent. For both parents, 17 linkage groups were obtained; covering 1361 cM and 1066 cM for ‘M13/91’ and ‘Fred Hough’, respectively. The position of the SNP loci in the obtained maps is consistent with the genomic sequence. At the end of linkage group 9, major QTLs genetically associated with the agronomical traits evaluated were identified for both genitors. In this region of the linkage group 9, four SNP markers were significantly associated with the major QTLs for vegetative bud burst and time of flowering, explaining 32,3% to 73,4% of the total phenotypic variation observed. Our results demonstrate that the same region of linkage group 9 contains important genetic determinants for the control of time of bud burst and flowering. Moreover, assessing the genomic sequence in this region, two predicted transcripts with similarity to the Flowering Locus C from Arabidopsis thaliana were identified. 1Master o

Caracterização genética de híbridos de milho do sul do Brasil através de marcadores de RAPD

09

Confirmação de QTL para a resistência à mancha branca da folha do milho

26

Phenotypic and molecular characterization of corn hybrids released from 1980 to 2000

O acesso e o uso da variabilidade genética de uma cultura são as bases do melhoramento de plantas. Em milho, um grande e diverso pool gênico permite a manipulação de diferentes genótipos. No entanto, a diversidade genética do germoplasma tropical ainda é pouco estudada. Com o objetivo de analisar a amplitude da variabilidade genética em 15 híbridos lançados em diferentes épocas e provenientes de três diferentes empresas de sementes, foi realizada a caracterização fenotípica e molecular dos genótipos em três ambientes e em duas densidades de semeadura. A avaliação fenotípica revelou uma grande similaridade entre os híbridos, sugerindo que os programas de melhoramento têm desenvolvido genótipos com caracteres fenotípicos semelhantes. A análise molecular, por sua vez, sugere que os programas de melhoramento de milho exploram germoplasma distinto, uma vez que o dendograma mostrou um agrupamento conforme as empresas. Entretanto, apesar de o germoplasma ser distinto, é possível inferir que a pressão de seleção utilizada pelos melhoristas tem seguido a mesma linha, isto é, há uma pressão de seleção por parte das empresas em relação a caracteres, tais como estatura de planta, número de fileiras de grãos e peso de grãos, entre outros analisados no presente trabalho, o que contribuiu para a uniformidade fenotípica dos genótipos.Genetic variability is the basis of plant breeding. In corn, a large and diverse genetic pool permits manipulation of different genotypes, but the genetic diversity of tropical germplasm has been little studied. With the objective of analyzing the amplitude of the genetic variability in 15 hybrids released in different periods by three different seed companies, phenotypic and molecular characterization was carried out in three environments and at two plant densities. The phenotypic assessment showed great similarity among the hybrids, suggesting that the breeding programs have developed genotypes with similar phenotypic traits. The dendogram of the molecular analysis showed clustering according with the different companies suggesting that each corn breeding program make use of different germoplasms. However, although the germplasm was different, it could be inferred that the selection pressure used by the breeders followed the same traits such as plant height, number of rows per ear and kernel weight among others analyzed in the present study, that contributed to the phenotypic uniformity of the genotype

Variabilidade fenotípica e genética em populações naturais de Elionurus sp. Humb. e Bompl ex. Willd (capim-limão)

24

Variabilidade fenotípica e genética em populações naturais de Elionurus sp. Humb. e Bompl ex. Willd (capim-limão)

24