208 research outputs found
La Chapelle-Gonaguet – Le Pavillon
Suite à une découverte fortuite d’éléments semblant indiquer la présence de vestiges associés à une villa antique sur une propriété familiale au Pavillon, M. Chateaureynaud a pris l’attache du service régional de l’archéologie. Afin de préciser l’importance et l’extension spatiale de ce site, une prospection géophysique a donc été réalisée sur une surface totale de l’ordre de 6 200 m2. La méthode cartographique utilisée est la prospection électrique, ici utilisée pour deux profondeurs d’inves..
Impaired Embryonic Development in Mice Overexpressing the RNA-Binding Protein TIAR
TIA-1-related (TIAR) protein is a shuttling RNA-binding protein involved in several steps of RNA metabolism. While in the nucleus TIAR participates to alternative splicing events, in the cytoplasm TIAR acts as a translational repressor on specific transcripts such as those containing AU-Rich Elements (AREs). Due to its ability to assemble abortive pre-initiation complexes coalescing into cytoplasmic granules called stress granules, TIAR is also involved in the general translational arrest observed in cells exposed to environmental stress. However, the in vivo role of this protein has not been studied so far mainly due to severe embryonic lethality upon tiar invalidation.Journal ArticleResearch Support, Non-U.S. Gov'tSCOPUS: ar.jinfo:eu-repo/semantics/publishe
Epistatic study of RecN, and the links between sister chromatid cohesion and DNA repair in Escherichia coli
Afin de préserver leur niche de vie, les bactéries produisent et sécrètent des antibiotiques avec des propriétés génotoxiques. Divers processus moléculaires maintiennent l’intégrité génomique de tous les organismes vivants. Ces évènements sont primordiaux car la structure de l’ADN est endommagée en permanence par le métabolisme cellulaire (tel que le stress oxydatif ou lors de sa réplication), ou d’autres agents de l’environnement. Les antibiotiques sont utilisés pour des applications cliniques afin de traiter les infections ou le cancer. Dans le travail ici présenté, nous analysons la réponse au stress génomique (GSR) induit par deux antibiotiques génotoxiques : la Bléomycine (BLM) et la Mitomycine-C (MMC). Ces deux antibiotiques altèrent l’ADN de différentes manières tout en conduisant à des cassures doubles brins (DSB). Les DSB sont suspectées d’être la cause principale de la mort cellulaire. Les DSB sont réparées par recombinaison homologue (HR). Des études récentes ont révélé que la HR est essentielle pour survivre aux lésions causées par la BLM et la MMC. Les premiers travaux sur le sujet, ainsi que les premiers modèles présentés dans les livres d’éducation, attribuent une voie de réparation particulière, selon le type de lésion à l’ADN. La protéine RecN, induite par le régulons SOS, joue un rôle important dans la réparation de l’ADN et le traitement des lésions générées par ces deux antibiotiques. Cependant, la fonction de RecN dans ces deux processus n’est pas clairement comprise. RecN est une protéine qui joue un rôle dans la maintenance structurelle du chromosome (SMC). Elle se lie sur de l’ADN simple brin (ADNsb) (et qui peut attraper une seconde molécule d’ADN ?). In vitro, RecN stimule la ligation de molécules d’ADN. In vivo, RecN arrête la ségrégation des chromatides soeurs, et induit une compaction extrême du nucléoide. La sur-expression de RecN est toxique pour les cellules et son niveau est régulé par l’enzyme ClpXP, faisant partie du protéasome. RecN interagit avec RecA, toutes deux sont requises pour survivre aux DSB induites par l’endonucléase I-SCE 1. Elles sont généralement associées dans le même groupe épistatique. Des résultats récents suggèrent que RecA et RecN pourraient également avoir des voies d’actions distinctes, toutes deux importantes pour la réparation de l’ADN. Dans l’étude que l’on présente, nous avons utilisé à notre avantage, son implication dans le processus de réparation de deux types de lésions, pour questionner l’implication de RecN dans la réponse génomique au stress (GSR). Nous avons démontré que la dynamique des chromatides soeurs et que le changement de conformation du nucléoïde induit par RecN, est différent selon l’antibiotique utilisé. En présence de lésions induites par la MMC, RecN est requise en pre-traitement des lésions par « réparation par excision de nucléotide » (NER), et son activité sur les chromatides soeurs se manifeste tôt dans le processus de réparation. A l’inverse, en présence de lésions induites par la BLM, l’activité de RecN ne nécessite pas de traitement par le NER, et se manifeste plus tard, durant les phases de récupération. L’analyse par transposition insertion (TIS) a révélé que recN est un des rares gènes du SOS impliqué dans le GSR des deux antibiotiques. L’absence de RecN perturbe grandement le GSR, notamment par l’augmentation de la pression sur le système de réparation par excision de base (BER), tout en réduisant l’importance de la HR. L’analyse du TIS a également mis en évidence, l’implication extrême de multiples voies telles que : les pompes à efflux, la gestion du stress oxydatif, et le contrôle du cycle cellulaire, pour permettre une récupération de l’altération des dommages à l’ADN. L’activité de RecN est un point de bascule entre différentes solutions de réparation. Plus généralement, ce travail illustre que le GSR est un processus intégré que la cellule déploie pour générer les conditions de sa survie.To preserve their niche, bacteria frequently produce and secrete antibiotics with genotoxic properties. Molecular processes that maintain genomic integrity are essential for all organisms. This is necessary because DNA damage can arise during every round of genome duplications. These antibiotics have been used for clinical application to treat infections or cancers. In the present work, we analyzed the Genomic Stress Response (GSR) induced by two genotoxic antibiotics: Bleomycin (BLM) and Mitomycin C (MMC). Although MMC and BLM alter DNA in different ways, they both lead to double strand breaks (DSB). The DSBs are suspected to be the major cause of cell death repaired by homologous recombination (HR). Earlier studies revealed that HR is essential to bacteria to survive BLM and MMC toxicity. Pioneer works and recent textbooks tend to attribute a particular DNA damage response (DDR) to each type of lesions. The RecN protein, induced by the SOS regulon, appeared to play important roles in the processing and repair of DNA lesions generated by MMC and BLM. However, the function of RecN in these two repair processes is not yet understood. RecN is a structural maintenance chromosome (SMC)-like protein that binds on single strand DNA where it can catch a second DNA molecule. In vitro, RecN stimulates the ligation of DNA molecules. In vivo, RecN prevents sister chromatid segregation and promotes an extreme nucleoid compaction. RecN overexpression is toxic for the cell and its level is regulated by ClpXP proteasome. Because RecN interacts with RecA and both are equally required to survive I-SCE 1 mediated DSB, they are generally associated in the same epistatic group. However, recent data suggest that RecA and RecN may also function in genetically distinct pathways, important for the DNA repair. In the present study, we took advantage of RecN involvement in the repair of two different types of DNA lesions to investigate the GSR. We demonstrated that sister chromatid dynamics and nucleoid management by RecN differ according to the drug considered. In presence of MMC-induced lesions, RecN requires a pre-processing of the lesions by the nucleotid excision repair (NER) and its activity on sister chromatids occurs early in the repair process. By contrast, in presence of BLM-induced lesions, RecN activity does not require NER processing and occurs later in the recovery phase. Transposition insertion (TIS) analysis revealed that recN is one of the rare DDR genes involved in the GSR of both drugs. A lack of RecN significantly disturbed the GSR, by increasing notably the pressure on the base excision repair (BER) pathway, while reducing concomitantly the importance of homologous recombination. The TIS analysis also highlighted how important drug tolerance pathways such as: efflux systems, oxidative stress management and cell cycle controllers, are for successful recovery from DNA alterations. Moreover, RecN activity influences the balance between different solutions. More generally, this work illustrates that GSR is an integrated process that cells adopt to create the most appropriate conditions for their survival
Brouage a new early modern town through history, archaeology and geophyisical survey
International audienc
Apports de l'imagerie géophysique et de la photographie satellitaire et aérienne à l'étude de l'évolution géomorphologique des marais littoraux au cours de l'Holocène (application aux marais charentais)
Dans le cadre d une étude destinée à améliorer la cartographie de la variabilité des sols, l utilisation couplée de méthodes de prospection géophysique (électromagnétique, électrique et magnétique) et d imagerie multispectrale (capteurs aérien CASI et satellitaire SPOT) permet d obtenir des informations complémentaires en termes de résolution et de surface couverte. Cette approche a été développée et testée dans le but d améliorer nos connaissances sur l évolution géomorphologique récente des marais littoraux charentais, sur la façade atlantique française. Le développement d un protocole de traitement des données de prospection électromagnétique acquises en contexte de marais anthropisé a permis de corriger l influence des canaux de drainage anthropiques, qui entraine une diminution de la conductivité électrique similaire à celle des paléostructures fluvio-marines naturelles présentes sur la zone d étude. A l échelle de la parcelle, des méthodes d étude à haute résolution (géophysique, télédétection, cartographie végétale) utilisées conjointement permettent de distinguer des zones du sol présentant des contrastes d humidité et de salinité avec un degré de précision qu aucune des méthodes seules n aurait permis d atteindre. Dans le but de réaliser un changement d échelle de cette précision d information locale à une application à l échelle du paysage, un protocole d estimation de la conductivité électrique du sol à partir de l imagerie multispectrale aérienne ou satellitaire (par le biais des différentes communautés végétales) s appuyant sur l utilisation d un réseau de neurones (fonctions radiales de base) a été mis au point.In a study aiming to improve soil variability mapping, the integrated use of geophysical survey methods (electromagnetic, electrical and magnetic) and multispectral remote sensing (CASI aerial and SPOT satellite sensors) allow getting complementary data in terms of resolution and covering area. This approach was developed and tested in the aim of improving our knowledge of recent geomorphologic evolution of Western France marshlands. Spreading out a protocol of correcting electromagnetic survey data acquired in anthropic influenced marshland context allows correcting draining canals influence, which involves electrical conductivity diminishing similar to these of natural fluvio-marine palaeostructures present on the study area. At parcel s scale, high resolution study methods (geophysical surveys, remote sensing and vegetal cartography) conjointly used allow to distinguish soil areas showing moisture and salinity contrasts with precision no reached with one method used alone. In the aim of realizing scale change from local data to landscape scale application, a protocol of estimating soil electrical conductivity from aerial or satellite remote sensing (through vegetal communities) was developed, using a neural network (Radial Basis Functions).LA ROCHELLE-BU (173002101) / SudocSudocFranceF
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