73 research outputs found

    L'enherbement permanent comme alternative au travail mécanique sous les oliviers

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    Le travail mécanique au pied de l'arbre, pour contrôler l'enherbement, demande trop d'attention et d'énergie pour un résultat souvent imparfait. Les agriculteurs sont demandeurs d'alternatives fiables aux herbicides et au travail mécanique. Une flore adaptée au pied des arbres représente une solution séduisante d'autant plus qu'elle peut jouer un rôle agroécologique utile. L'expérimentation a permis de suivre le développement d'espèces couvre-sols, choisies en fonction de résultats obtenus sur d'autres vergers, et de leurs propriétés attendues (faible concurrence, port ras, étalement rapide). Certaines espèces ont des comportements adaptés aux conditions de culture de l'olivier

    Re-parametrisation of Adel-wheat allows reducing the experimental effort to simulate the 3D development of winter wheat

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    Eds. Risto Sievänen, Eero Nikinmaa, Christophe Godin, Anna Lintunen & Pekka NygrenA parameterisation of wheat architecture was developed, having high flexibility to simulate contrasted genotypes and growth conditions with a reasonably low number of parameters. Field measurements at 4-5 dates allowed to simulate crops from emergence to maturity with a good agreement between simulated and measured ground cover and GAI. Dynamics of leaf angles were shown to impact strongly ground cover

    Importance of diagnostics in epidemic and pandemic preparedness.

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    Diagnostics are fundamental for successful outbreak containment. In this supplement, 'Diagnostic preparedness for WHO Blueprint pathogens', we describe specific diagnostic challenges presented by selected priority pathogens most likely to cause future epidemics. Some challenges to diagnostic preparedness are common to all outbreak situations, as highlighted by recent outbreaks of Ebola, Zika and yellow fever. In this article, we review these overarching challenges and explore potential solutions. Challenges include fragmented and unreliable funding pathways, limited access to specimens and reagents, inadequate diagnostic testing capacity at both national and community levels of healthcare and lack of incentives for companies to develop and manufacture diagnostics for priority pathogens during non-outbreak periods. Addressing these challenges in an efficient and effective way will require multiple stakeholders-public and private-coordinated in implementing a holistic approach to diagnostics preparedness. All require strengthening of healthcare system diagnostic capacity (including surveillance and education of healthcare workers), establishment of sustainable financing and market strategies and integration of diagnostics with existing mechanisms. Identifying overlaps in diagnostic development needs across different priority pathogens would allow more timely and cost-effective use of resources than a pathogen by pathogen approach; target product profiles for diagnostics should be refined accordingly. We recommend the establishment of a global forum to bring together representatives from all key stakeholders required for the response to develop a coordinated implementation plan. In addition, we should explore if and how existing mechanisms to address challenges to the vaccines sector, such as Coalition for Epidemic Preparedness Innovations and Gavi, could be expanded to cover diagnostics

    Innovation et développement dans les systèmes agricoles et alimentaires

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    L’innovation est souvent présentée comme l’un des principaux leviers pour promouvoir un développement plus durable et plus inclusif. Dans les domaines de l’agriculture et de l’alimentation, l’innovation est marquée par des spécificités liées à sa relation à la nature, mais aussi à la grande diversité d’acteurs concernés, depuis les agriculteurs jusqu’aux consommateurs, en passant par les services de recherche et de développement. L’innovation émerge des interactions entre ces acteurs, qui mobilisent des ressources et produisent des connaissances dans des dispositifs collaboratifs, afin de générer des changements. Elle recouvre des domaines aussi variés que les pratiques de production, l’organisation des marchés, ou les pratiques alimentaires. L’innovation est reliée aux grands enjeux de développement : innovation agro-écologique, innovation sociale, innovation territoriale, etc. Cet ouvrage porte un regard sur l’innovation dans les systèmes agricoles et alimentaires. Il met un accent particulier sur l’accompagnement de l’innovation, en interrogeant les méthodes et les organisations, et sur l’évaluation de l’innovation au regard de différents critères. Il s’appuie sur des réflexions portées par différentes disciplines scientifiques, sur des travaux de terrain conduits tant en France que dans de nombreux pays du Sud, et enfin sur les expériences acquises en accompagnant des acteurs qui innovent. Il combine des synthèses sur l’innovation et des études de cas emblématiques pour illustrer les propos. L’ouvrage est destiné aux enseignants, professionnels, étudiants et chercheurs

    Study of involvement of oxidized proteins repair in resistance of reactive chlorine species in Salmonella Typhimurium

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    Lors d’une infection, les cellules immunitaires génèrent un stress oxydant afin de tuer les pathogènes. Les neutrophiles ont la particularité de générer des espèces réactives du chlore (ERC) hautement oxydantes tel que l’acide hypochloreux ou la N-Chlorotaurine (N-ChT). Ces agents oxydants ciblent principalement les protéines dont l’oxydation est délétère pour les organismes. Le contrôle de l’homéostasie rédox du protéome est donc un processus cellulaire essentiel pour les pathogènes. Mon projet de thèse a consisté à étudier l’implication d’un des systèmes gérant l’état rédox des protéines, les méthionines sulfoxydes réductases (Msr), dans le pouvoir infectieux du pathogène Salmonella Typhimurium. Tout d'abord, j’ai effectué la caractérisation biochimique de MsrP ayant la particularité d’être périplasmique. Ces travaux ont permis de lister de manière exhaustive les activités Msr présentes chez Salmonella. Ainsi, j’ai pu étudier l’implication de l’ensemble des Msr dans la résistance au stress oxydant. Mes résultats ont montré leur importance dans la résistance aux ERC et notamment celle de MsrP dans la protection de Salmonella à la N-ChT. Ensuite, la caractérisation de la régulation du gène msrP a permis de montrer que son expression est sous le contrôle du système Cpx, impliqué dans la réponse aux stress de l’enveloppe. De plus, j’ai montré que le système Cpx permet de détecter la N-ChT et ainsi de promouvoir la réparation des protéines périplasmiques. Enfin, j’ai mis en évidence que la N-ChT enclenche la réponse Cpx en altérant les lipoprotéines. Ainsi, mes travaux établissent un lien direct entre le stress oxydant et le stress de l’enveloppe chez Salmonella Typhimurium.Bacterial infection triggers oxidative stress production by immune cells leading to pathogen cell death. Neutrophils take advantage of a specific enzyme - the myeloperoxidase - to generate highly oxidizing reactive chlorine species (RCS) such as hypochlorous acid or N-Chlorotaurine (N-ChT). These oxidants mainly target proteins whose oxidation is deleterious to organisms. The control of the redox homeostasis of the proteome is therefore an essential cellular process for pathogens. My thesis project consisted in studying the involvement of one of the systems managing the redox state of proteins, the methionine sulphoxide reductases (Msr), in the pathogenicity of Salmonella Typhimurium. Previously, four Msr were characterized in Salmonella. At first, I carried out the biochemical characterization of a fifth Msr, MsrP, having the particularity of being periplasmic. This work provided an exhaustive list of the Msr activity in Salmonella. I therefore studied the involvement of all Msr in resistance to oxidative stress. My results showed their importance in resistance to RCS and in particular that MsrP is involved in the protection of Salmonella to N-ChT. Then, the characterization of the msrP gene regulation showed that its expression is under the control of the Cpx system, involved in the envelope stress response. Furthermore, I showed that Salmonella uses the Cpx system to detect N-ChT and promotes the repair of periplasmic oxidized proteins. Finally, I demonstrated that N-ChT triggers the Cpx response by altering lipoprotein. Thus, my work establishes a direct link between oxidative stress and the envelope stress response in Salmonella Typhimurium

    CN-wheat: a mechanistic structural-functional model for carbon and nitrogen metabolism in wheat

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    In a context of global change, it is necessary to identify new practices and plant characteristics determining crop production and that can be potential targets for plant breeding. This could be achieved by numerical simulation, using mechanistic and integrative models that provide a holistic view of plant functioning. However, a central difficulty lies in building a coherent view of the involved processes and how to integrate them at plant and crop level. The model proposed here, called CN-Wheat, represents a significant progress to address these issues by using a fully mechanistic approach for integration of Carbon (C) and Nitrogen (N) metabolisms within wheat plants after anthesis. CN-Wheat is defined at culm scale; the crop is represented as a population of individual culms that compete for light and soil N. Culm structure is composed of a root compartment, a set of photosynthetic organs and the grains. Each module includes structural, storage and mobile materials. Fluxes of C-N among modules take place through a common pool and/or through the transpiration flow. The modelled physiological activities are the acquisition of C and N, the synthesis and degradation of primary metabolites (sucrose, fructans, starch, amino acids, proteins and nitrates), C respiration, C-N exudation and tissue death. A central role is given to metabolite concentrations as drivers of (i) physiological activities and (ii) transfers between organs. Thus, the integration within the plant results from that all processes act in parallel on interconnected metabolite pools, which is represented as a set of differential equations, solved numerically. Model behavior was evaluated against a field experimentation with three levels of N fertilization applied at anthesis. For each N treatment, CN-Wheat accurately predicted the post-anthesis kinetics of (i) C-N distribution among organs, (ii) green areas of laminae and (iii) dry mass and N content of grains. In our simulations, when soil N was non-limiting, N in grains was ultimately determined by the availability of C for root activity. Dry matter accumulation in grains was mostly affected by photosynthetic organ lifespan which was regulated by protein turn-over and C-regulated root activity. Whereas the use of response functions to metabolite concentration is accepted for each of the processes described in the model, here we show that it can be used for an integrative modelling of the whole plant. Besides, CN-Wheat provides insights into the interplay of C-N metabolism which is expected to improve our knowledge on the regulation of plant functioning. This approach also enables to identify potential targets for plant breeding in order to improve crop production and N efficiency as well as crop adaptation to climate changes and low N agronomical practices

    La constitution interactive du corps mondain.: Journées thématiques "Inventer l'espace" (Paris, 2006).

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    Fonds audiovisuel du programme "ESCoM-AAR" (Equipe Sémiotique Cognitive et nouveaux Médias - Archives Audiovisuelles de la Recherche. Paris, France, 2000 - 2016).Les journées «Inventer l’espace» qui se sont déroulées les 19, 20 et 21 octobre 2006, s’inscrivent dans la tradition des journées thématiques organisées à la Maison des sciences de l’Homme de Paris qui réunissent des mathématiciens, des historiens et des philosophes des mathématiques autour d’un thème général comme la transversalité (1996), Dimension-dimensions (1997), Feuilletage-Quantification géométrique (2003) , Fibrés-fibrations-connexions (2005) . L’ambition pour ces journées est plus vaste puisqu’en invitant outre des mathématiciens, des physiciens, des physiologistes, des philosophes ou historiens des mathématiques, les responsables de ce colloque ont également sollicité le concours d’architectes, de sociologues et d’historiens de l’art pour interroger avec eux le questionnement spatial. Au delà de la démarche comparative sur le rôle de l’espace dans ces diverses disciplines, l'ambition ici est d’analyser les emprunts mutuels qui structurent les conceptions spatiales des diverses disciplines. Les journées «Inventer l’espace» ont été soutenues par l’équipe F2DS , le Centre Charles Morazé , les Archives Henri Poincaré (UMR CNRS 7117), l’université Nancy 2 et la Fondation Maison des Sciences de l’Homme (FMSH)
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