How many species of grey foxes (Canidae, carnivora) are there in Southern South America?

Two species of grey foxes are recognized in the Southern Cone of America: Lycalopex griseus, and L. gymnocercus, which were traditionally separated by size and some cranial differences. Morphometric analyses of the skull showed that both species could be the same and that they show clinal variation, while DNA studies based on one mitochondrial marker suggested that they belong to different species. Our objective is to evaluate the systematic status of these foxes using three mitochondrial markers (cytochrome B, cytochrome oxidase I, and control region), and a large sample covering a wide geographic range. The results indicate that there are two clades, that are not sister taxa, a finding that is more congruent with the hypothesis of two species, but their geographic distribution is not coincident with the accepted distribution of L. griseus and L. gymnocercus. Consequently, the distribution of L. griseus is extended eastern including north and center of Argentina, towards the west and south of the Paraná, Paraguay and Río de la Plata rivers. On the other hand, the clade that probably represents L. gymnocercus is restricted to the east of those rivers, except for a few specimens collected in Santa Fe, close to the Paraná river. However, an analysis of a wider sample using nuclear DNA is needed to confirm the taxonomic identity of these species of grey foxes.Dos especies de zorros grises se reconocen en el Cono Sur de América: Lycalopex griseus y L. gymnocercus, que tradicionalmente estaban separadas por tamaño y algunas diferencias craneales. Análisis morfométricos del cráneo mostraron que estas especies podrían ser una sola que muestra variación clinal, mientras que estudios de ADN basados en un marcador mitocondrial sugirieron que pertenecen a especies diferentes. Nuestro objetivo es evaluar el estado sistemático de estos zorros utilizando tres marcadores mitocondriales (citocromo B, citocromo oxidasa I y región control) y una muestra grande que cubre un amplio rango geográfico. Los resultados indican que hay dos clados, que no son taxones hermanos, un hallazgo que es más congruente con la hipótesis de dos especies, pero su distribución geográfica no es coincidente con la distribución aceptada de L. griseus y L. gymnocercus. Consecuentemente, la distribución de L. griseus se extiende hacia el este, incluyendo el norte y centro de la Argentina, hacia el este y el sur de los ríos Paraná, Paraguay y Río de la Plata. Por el otro lado, el clado que probablemente representa a L. gymnocercus está restringido hacia el este de esos ríos, excepto por algunos especímenes colectados en Santa Fe, cerca del río Paraná. Sin embargo, se necesita un análisis de una muestra más amplia que utilice ADN nuclear para confirmar la identidad taxonómica de estas especies de zorros grisesFil: Chemisquy, Maria Amelia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de Catamarca. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Secretaría de Industria y Minería. Servicio Geológico Minero Argentino. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Provincia de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja; ArgentinaFil: Prevosti, Francisco Juan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Universidad Nacional de Catamarca. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Secretaría de Industria y Minería. Servicio Geológico Minero Argentino. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja. - Provincia de La Rioja. Centro Regional de Investigaciones Científicas y Transferencia Tecnológica de La Rioja; ArgentinaFil: Martínez, Pablo. Universidade Federal de Sergipe. Campus Itabaiana; BrasilFil: Raimondi, Vanina Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia"; Argentina. Universidad de Ginebra; SuizaFil: Cabello Stom, Javier E.. Universidad San Sebastián Sede de la Patagonia; ChileFil: Acosta Jamett, Gerardo. Universidad Austral de Chile; ChileFil: Montoya Burgos, Juan Ignacio. Universidad de Ginebra; Suiz

Wild deer (Pudu puda) from Chile harbor a novel ecotype of Anaplasma phagocytophilum

[Background] Deer species play an important role in the enzootic cycles of several Anaplasma species. While in the Northern Hemisphere ticks of genus Ixodes are well recognized vectors of these intracellular bacteria, less is known regarding the biological cycles of Anaplasma spp. in South America.[Methods] Using PCR protocols and Sanger sequencing, we assessed the presence of Anaplasma spp. in blood and ticks collected on a native deer species (Pudu puda) from southern Chile.[Results] Based on phylogenetic analyses of the 16S rRNA, gltA and groEL genes and calculation of average sequence divergence for groEL, our results bring to light a novel genovariant of Anaplasma phagocytophilum (named strain “Patagonia”). The strain represents a novel ecotype within the A. phagocytophilum species complex and was detected in both P. puda and their ticks. Using a larger matrix, denser taxon sampling and outgroup, our maximum-likelihood- and Bayesian-inferred phylogenies for groEL provide an accurate picture of the topology of A. phagocytophilum ecotypes and their evolutionary relationships.[Conclusions] This is the first report of an ecotype of A. phagocytophilum in South America. Our results provide novel insight into the genetic diversity and ecology of this complex of bacterial lineages. Further studies should elucidate the enzootic cycle of A. phagocytophilum strain “Patagonia” and assess its pathogenic potential for pudues, domestic animals and humans in the region.This study was funded by the “Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (FONDECYT)” No. 11220177, and by the ANID BECAS/Scholarship Program/DOCTORADO NACIONAL/2019–21190078 and 2020–21200182. Funders had no role in the study design, data collection, analysis, preparation of the manuscript and decision to publish. The contribution of JEU was funded by the Atracción Talento de la Comunidad de Madrid Fellowship Program (REFF 2019-T2/AMB-13166).Peer reviewe