Bacterias endofitas: un nuevo campo de investigación para el desarrollo del sector agropecuario

The endophytic bacteria living within the tissues of the plants at least during part of their life cycle without causing any damage to the host, establish a symbiotic relationship where both benefit. The endophytic bacteria play a wide variety of roles as promoters of plant growth, biological control on a variety of pathogens, improve process efficiency of phytoremediation of toxic compound in the rhizosphere. These microorganisms are inexhaustible sources of over 20.000 biologically active compounds, which have a direct bearing on the performance and survival of host plants. The endophytic bacteria are reported to produce a number of metabolites such as antibiotics, secondary metabolites including some antitumor compounds and anti-inflammatory agents.Las bacterias endófitas habitan dentro de los tejidos de las plantas al menos durante una parte de su ciclo de vida sin causar daño alguno al hospedero, establecen asociación simbiótica y producen grandes beneficios para las plantas. Las bacterias endófitas cumplen una gran diversidad de funciones como promotoras de crecimiento vegetal, control biológico sobre una diversidad de fitopatógenos, mejoran la eficiencia de los procesos de fitoremediación de compuesto tóxicos en la rizósfera. Estos microorganismo son fuentes inagotable de más de 20.000 compuestos biológicamente activos, los cuales influyen de manera directa en el rendimiento y supervivencia de las plantas hospederas. Las bacterias endófitas son reportadas por producir un número de metabolitos como antibióticos, metabolitos secundarios incluyendo algunos compuestos antitumorales, agentes antiinflamatorios

Bacterias endófitas: una alternativa biologica para el control de burkholderia glumae en el cultivo del arroz en colombia.

Research common in microbial ecology have been directed toward the plantmicrobe interactions from the point of view of symbiotic and pathogenic. Endophytic bacteria reside in plant tissues mainly in intercellular, rarely in intracellular spaces and inside vascular tissues without causing symptoms of disease. The penetration in the plant can by stomates, wounds, areas of emergence by lateral roots, being that these bacteria can produce hydrolytic enzymes able to degrade the cell wall of vegetables. Recent molecular studies on endophytic diversity bacteria have revealed a large richness of species, endophytes promote plants growth and yield, suppress pathogens, may help to remove contaminants, solubilize phosphate and contribute assimilation biological nitrogen to plant.Las investigaciones más comunes en ecología microbiana, han sido orientadas a las interacciones microbio-planta desde el punto de vista simbiótico y de patogénico. Las bacterias endófitas colonizan el interior de los tejidos de las plantas, principalmente espacios intercelulares, raramente en espacios intracelulares y dentro de tejidos vasculares sin causar síntomas de enfermedad en la planta. La penetración en la planta puede ocurrir por estomas, heridas, áreas de emergencia de raíces laterales, siendo que estas bacterias pueden producir enzimas hidrolíticas capaces de degradar la pared celular de los vegetales. Estudios moleculares reciente sobre diversidad de bacterias endófitas han revelado una alta riqueza de filotipos, que promueven el crecimiento de las planta, suprimen fitopatógenos, ayudan a remover contaminantes, solubilizan fosfato y contribuyen a la asimilación biológica de nitrógeno

Presencia del hongo Thielaviopsis paradoxa causante de pudrición negra de la piña oro miel en el departamento de Sucre

Presently work consisted in the identification and confirmation of the presence of the fungus Thielaviopsis paradoxa, causing black rot of the fruit of the pineapple gold honey in the Department of Sucre. Collected fruits of pineapples with characteristic symptoms in different areas producing of the Department of Sucre. The samples were transported to the laboratory for microbiological investigations of the University of Sucre, where was isolation of the fungus in medium PDA (potato dextrose Agar) for 7 days at 25 °C, 12 h light / darkness, followed by the preparation of microculture and morphological identification of the fungus by means of optical microscopy, determining reproductive structures characteristic of the fungus and testing using taxonomic criteria. To date, it is the first report which has of this fungus as a causal agent of decay of the fruit of the variety of pineapple gold honey produced in the Department of Sucre.En el presente trabajo, consistió en la identificación y confirmación de la presencia del hongo Thielaviopsis paradoxa, causante de la pudrición negra del fruto de piña oro miel en el departamento de Sucre. Se colectaron frutos de piñas con síntomas característicos en diferentes zonas productoras del departamento de Sucre. Las muestras se transportaron al laboratorio de investigaciones microbiológicas de la Universidad de Sucre, donde se hizo aislamiento del hongo en medio PDA (Agar Papa Dextrosa) durante 7 días a 25ºC, 12h de luz / oscuridad, seguido de la preparación de microcultivo e identificación morfológica del hongo mediante microscopia óptica, determinando estructuras reproductivas características del hongo y comprobación mediante criterios taxonómicos establecidos. A la fecha es el primer reporte que tiene de este hongo como agente causal de la pudrición negra del fruto de la variedad de piña oro miel producida en el departamento de Sucre

Diversidad de bacterias endofitas asociadas a cultivo de arroz en el departamento de Cordoba-Colombia. Estudio preliminar

Endophytic bacteria living within the plant without causing damage to them. Their presence has been linked to increased crop productivity because it produces growth hormones, pathogens or antagonists can fix nitrogen. This study examined the composition of communities of cultivable endophytic bacteria associated with different tissues of four commercial varieties of rice in the department of Cordoba. For isolation technique used tissue surface disinfection, the isolation was performed on R2A agar medium. The population density (CFU / g of tissue) was performed by counting of colonies on plate. The statistical significance between population density relative to tissues and variety was made using multivariate analysis and multiple range test (Tukey). The results show that there is a population density of endophytic bacteria associated with rice plants, the abundance is related to the tissue and the variety studied. This preliminary study initiates the knowledge of these bacterial communities and functionality that might be carrying in this plant species.Las bacterias endófitas viven en el interior de las plantas sin causar daño en ellas. Su presencia ha sido relacionada con un aumento en la productividad de los cultivos debido a que produce hormonas de crecimiento, antagonistas de patógenos o pueden fijar nitrógeno. En este trabajo se estudió la composición de comunidades de bacterias endófitas cultivables asociadas a diferentes tejidos de cuatro variedades comerciales de arroz del departamento de Córdoba. Para el aislamiento se utilizó técnica de desinfección superficial de tejidos, el aislamiento se llevó a cabo en medio de cultivo agar R2A. La densidad poblacional (UFC/g de tejido) se realizó por conteo de colonias en placa. Las significancias estadísticas entre densidad poblacional, con relación a tejidos y variedad, se hizo mediante análisis multifactorial y prueba múltiple de rango (Tukey). Los resultados muestran que existe una densidad poblacional de bacterias endófitas asociadas a plantas de arroz; la abundancia está relacionada con el tejido y la variedad estudiada. Este estudio preliminar da inicio al conocimiento de esas comunidades bacterianas y la funcionalidad que puedan estar ejerciendo en esta especie vegetal

Actividad in vitro de bacterias endófitas promotoras de crecimiento asociadas con pasto colosoana en el municipio de Corozal, Sucre

The objective of study was evaluated in vitro binding activity of nitrogen and phosphate bacteria endophytic solubilizated isolated from different tissues of colosoana grass in the districts of the municipality of Corozal, Sucre Department. Collected sample of roots stems and leaves of colosoana pasture from different farms. Of each tissue previously disinfected is made isolation in the middle of cultivation of bacteria endophytic, to which is les determined it density population of bacteria endophytic by means of count in UFC / g of tissue and is carried out separation of morphs by shape, color, size and appearance in media of crops. Each isolated morphotype was evaluated in vitro binding activity of nitrogen and phosphate solubilizing specific crops media. Are observed differences significant for density population of bacteria with respect to tissue, with higher values in root (1x1011 g/ root), followed of the stem (1.82x1010 g/stem) and with leaf density sheets (1.15x1010 g/leaf). The results of the identification kit API20E confirmed the presence of bacteria endophytes Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia with ability to fix nitrogen and solubilize phosphates.El presente estudio tuvo como objetivo evaluar in vitro la actividad fijadora de nitrógeno y solubilizadora de fosfato de bacterias endófitas aisladas de diferentes de tejidos de pasto colosoana en los corregimientos del municipio de Corozal, departamento de Sucre. Se colectaron muestra de raíz, tallos y hojas de pasto colosoana. De cada tejido previamente desinfectado se realizó aislamiento en medio de cultivo para bacterias endófitas, a las cuales se les determinó la densidad poblacional por medio de conteo en UFC/ g de tejido y se separación de morfotipos por forma, color, tamaño y apariencia en medios de cultivos. A Cada morfotipo aislado se le evaluó in vitro su actividad fijadora de nitrógeno y solubilizadora de fosfato en medios de cultivos específicos. Se observaron diferencias significativas para densidad poblacional de bacterias con respecto a tejido, con mayores valores en raíz (1x1011 g/ raíz), seguida del tallo (1.82x1010 g/tallo) y menor densidad en hojas (1.15x1010 g/hoja). Los resultados de la identificación con kit API20E confirmaron la presencia de las bacterias endófitas Pseudomona aeuroginosa y Stenotrophomonas maltophilia con capacidad de fijar nitrógeno y solubilizar fosfatos

Actividad antimicrobiana de bacterias endófitas aisladas de orégano serrano (Lippia origanoides) contra Burkholderia glumae y Colletotrichum gloeosporioides

The objective of this study was to determinate endophytic diversity associated to Lippia origanoides from Sabana subregion in the Department of Sucre, Colombia and evaluate their antimicrobial activity against Colletotrichum gloeosporioides and Burkholderia glumae. Tissue surface disinfection technique was used and isolation was performed on R2A agar culture medium. Population density (CFU / g tissue) was estimated by direct counting of colonies on plate. Statistics significances between population density in relation to tissues and site, was made by multivariate analysis and multiple range test (Tukey). Endophytic bacteria that showed inhibition of pathogenic microorganisms were subjected to an extraction of secondary metabolites. The antimicrobial, antifungal and secondary metabolites test were carried out by testing confrontation and qualitative estimation. The results show that there is a population density of endophytic bacteria associated with oregano plants and abundance is related to tissues. None of the morphotypes showed antimicrobial activity for B. glumae. One morphotypes had antifungal activity against C. gloeosporioides and metabolites extraction was performed for antifungal activity from cell suspensions.El objetivo de éste estudio fue determinar la diversidad de bacterias endófitas asociadas a la especie vegetal Lippia origanoides de la subregión sabanas en el Departamento de Sucre, Colombia y evaluar su actividad antimicrobiana contra Colletotrichum gloeosporioides y Burkholderia glumae. Se utilizó la técnica de desinfección superficial de tejidos y el aislamiento se realizó en medio de cultivo agar R2A. La densidad poblacional (UFC/g de tejido) se estimó por conteo directo de colonias en placa. Las significancias estadísticas entre densidad poblacional, con relación a tejidos y sitio, se realizó mediante análisis multifactorial y prueba múltiple de rango (Tukey). Las bacterias endófitas que presentaron inhibición contra los microorganismos patógenos fueron sometidas a un proceso de extracción de metabolitos secundarios. La prueba antimicrobiana, antifúngica y de metabolitos secundarios se llevaron a cabo mediante ensayos de confrontación y estimación cualitativa. Los resultados muestran que existe una densidad poblacional de bacterias endófitas asociadas a plantas de orégano serrano y la abundancia está relacionada con el tejido. Ninguno de los morfotipos presentó actividad antimicrobiana para B. glumae. Uno de los morfotipos tuvo actividad antifúngica frente a C. gloeosporioides y se le realizó extracción de metabolitos para determinar la actividad antifúngica a partir de suspensiones celulares

Diversidad de bacterias endófitas aisladas de árbol de neem y su actividad inhibitoria contra el Colletotrichum gloesporioides causante de la antracnosis del ñame en el departamento de Sucre

The present study as had objective, test in vitro the antifungal endophytes bacteria activity present on leaves and seeds of Neem trees, found into the Sincelejo local area. The tissue samples were recollected randomly. The recollected tissues were superficially sanitized, subsequently, the isolation, counting and distinction of morphotypes of endophytes bacteria were carried out by the Serial dilution technique through the agar plate. Each isolated morphotypes was used to assess in vitro the inhibitory activity of endophytes bacteria cells against the growth of C. Gloeosporioides fungus. The activity of the endophytes bacteria against the fungus was determined by inhibition index. The results of the factorial analysis established differences between the amount of bacteria present in leaves and seeds, with higher values in leaves (1,8x1010) and with lower values in seeds (1,2x109). The in vitro assay showed inhibitory activity of endophytic bacteria on fungal mycelial growth, the results of the identification with API20E kit confirm with 99,8% identity of the bacteria species, Pseudomona aeuroginosa, Constituting an isolated endophytic bacteria of the neem tree tissues With inhibitory activity against the mycelial growth of C fungus. Gloeosporioides, causing the disease known as anthracnose of Yam crop in the Sucre department.El presente estudio tuvo como objetivo, evaluar in vitro la actividad antifúngica de bacterias endófitas presentes en hojas y semillas de árboles de neem, localizadas en el municipio de Sincelejo.  Las muestras de los tejidos fueron recolectadas aleatoriamente. Los tejidos recolectados fueron desinfectados superficialmente, posteriormente se llevó a cabo el aislamiento, conteo y separación de morfotipos de bacterias endófitas mediante técnica de dilución seriada sobre superficie del medio agar. Cada morfotipo aislado fue utilizado para evaluar in vitro la actividad inhibitoria bacterias endófitas contra el crecimiento del hongo C. gloesporioides. La actividad de las bacterias endófitas contra el hongo fue determinado mediante índice de inhibición. Los resultados del análisis factorial establecieron diferencias entre la cantidad de bacterias presentes en hojas y semillas, encontrándose mayores valores en hojas (1,8x1010) y menor con respecto a semillas (1,2x109). El ensayo in vitro mostró actividad inhibitoria de bacterias endófitas sobre el crecimiento micelal del hongo. Los resultados de la identificación con KIT API20E confirman con un 99,8 % de identidad con la especie de bacteria Pseudomona aeuroginosa, constituyéndose en una bacteria endófita aislada de tejidos de árbol de neem  con actividad inhibitoria contra el crecimiento micelal del hongo C. gloesporioides, causante de la enfermedad conocida como antracnosis del cultivo del ñame en el departamento de Sucr

Evaluación de la actividad antifúngica de melia azederach sobre aislados de colletotrichum spp

The study was to evaluate in vitro antifungal activity of leaf extract of Melia azedarach L on fungi isolated from Colletotrichum sp, which causes anthracnose disease of yam cultivation in the department of Sucre, Colombia. Total extracts were obtained in ethanol from the dried leaves of M. azederach by Soxhlet extraction method and from the extracts, were prepared with liquid-liquid splits light petroleum (E. petrol) and ethyl acetate (AcOEt). Total ethanolic extract and two fractions were prepared different concentrations (ppm) and its activity was evaluated in vitro in 4 isolates of Colletotrichum sp. Isolates that showed increased susceptibility to the extracts were C040 and C853 compared to C279 and C507 who were resistant to the activity of the extract. Greater antifungal activity was observed in total ethanol extract and ethyl acetate fraction from 50 ppm. The phytochemical screening performed in M, azederach, indicated the presence of secondary metabolites such terpenes/sterols, alkaloids, saponins, tannins and anthocyanins. This is the first draft you have in Colombia on the in vitro effect of plant extract of this plant species on the growth of fungi isolated from the genus Colletotrichum sp causing anthracnose disease of yam cultivation in the Colombian Caribbean región.El estudio consistió en evaluar in vitro la actividad antifúngica del extracto de hoja de Melia azederach L sobre aislados de hongos del género Colletotrichum sp, causante de la enfermedad de la antracnosis en el cultivo del ñame en el departamento de Sucre, Colombia. Fueron obtenidos extractos totales en etanol a partir de hojas secas de M. azederach mediante el método de extracción por Soxhlet y a partir del extracto total, se prepararon fraccionamientos líquido-líquido con éter de petróleo (E. petrol) y acetato de etilo (AcOEt). Del extracto total etanólico y las dos fracciones se prepararon diferentes concentraciones (ppm) y su actividad fue evaluada in vitro sobre 4 aislados de Colletotrichum sp. Los aislados que mostraron mayor susceptibilidad a los extractos fueron C040 y C853 con respecto a C279 y C507 quienes presentaron resistencia a la actividad del extracto. Se observó mayor actividad antifúngica con el extracto total etanólico, y la fracción acetato de etilo a partir de 50 ppm. El screening fitoquímico realizado en M. azederach, indicó presencia de metabolitos secundarios tipo terpenos/ esteroles, alcaloides, saponinas, taninos y antocianinas. Este es el primer preliminar que se tiene en Colombia sobre el efecto in vitro del extracto vegetal de esta especie de planta sobre el crecimientos de aislados de hongos del genero Colletotrichum sp causante de la enfermedad de antracnosis en el cultivo de ñame en regiones Caribeñas de Colombia

Resistencia a cadmio (Cd) de bacterias endófitas y bacterias rizosféricas aisladas a partir de Oriza sativa en Colombia

The present study had as objective to evaluate in vitro the resistance of endophytic bacteria and rizospheric bacteria to different concentrations of Cadmium.This bacteria were isolated fron different tissues of commercial rice varieties and from bacteria isolated from the rhizosphere in rice plantations of the Nechí (Antioquía) and Achí (Bolivar).  Plant growth promotion was evaluated in vitro by nitrogen fixation, phosphate solubilization and siderophores production of endophytic bacteria. Of each tissue isolated from rice plants was carried out isolation in culture medium for endophytic bacteria, and the soil samples were serially diluted in peptone water. Each sample was determined the population density by counting in CFU / g of tissue and morphotypes were separated by shape, color, size and appearance in culture media. Significant differences were observed for density population of bacteria with respect to tissue, with higher values in root (4x1011 g/root), followed of the stem (3x1010g/etem), leaf (5x109 g/ leaf), flag leaf (3x109 g/ flag leaf) and with less density in panicle (4x108 g/panicle). The results of the identification with kit API were confirmed the presence of endophytic bacteria Burkholderia cepaceae and rizospheric bacteria Pseudomona fluorescens With the ability to tolerate different concentrations of Cd, fix nitrogen, solubilize phosphates and produce siderophores.El presente estudio tuvo como objetivo evaluar in vitro la resistencia de bacterias endófitas y rizosféricas a diferentes concentraciones de Cadmio (Cd). Se evaluó in vitro la promoción de crecimiento vegetal mediante la fijación de nitrógeno, solubilización de fosfato y producción de sideróforos de bacterias endófitas aisladas de diferentes tejidos de variedades de arroz comerciales y de bacterias aisladas de la rizósfera en las plantaciones de arroz de los corregimientos de Nechí (Antioquía) y Achí (Bolívar). Se colectaron muestras de raíz, tallos y hojas de plantas de arroz y de muestras de suelo rizosférico. A cada muestra se les determinó la densidad poblacional por medio de conteo en UFC/ g de tejido y se separaron morfotipos por forma, color, tamaño y apariencia en medios de cultivos. Se observaron diferencias significativas para densidad poblacional de bacterias con respecto a tejido, con mayores valores en raíz (4x1011 g/raíz), seguida de tallo (3x1010 g/tallo), hoja (5x109 g/hoja), hoja bandera (3x109 g/hoja bandera) y menor densidad en panícula (4x108 g/panícula). Los resultados de la identificación con kit API20E confirmaron la presencia de la bacteria endófita Burkholderia cepaceae y la bacteria rizosférica Pseudomona fluorescens con capacidad de tolerar diferentes concentraciones de Cd, fijar nitrógeno, solubilizar fosfatos y producir sideróforos

Evaluación de métodos para medir la actividad inhibitoria de extractos vegetales nativos del departamento de sucre sobre bacterias y levadura patógenas

The objective of this study was to evaluate the efficiency of two methods for measuring inhibitory activity of native ethanolic extracts plant of the Department of Sucre on bacteria and yeast human pathogenic. Sampling was conducted in the municipalities of Morroa and Sincelejo. The leaves of the plants Melia azederach, Sapium sp, Jatropha gossypilia, Psidium guajava, Origanum vulgare, Melissa officinalis, Eucalyptus sp and Cymbopogon citratus were processed using the methods of percolation and Soxhlet for the extraction of the extract. Methods were tested on agar hole method (Method 1) and the sensitive disk method (method 2) to measure the inhibitory effect on Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella oxytoca, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, and Bulkolderia glumaea Zygosaccharomyces microellipsoides. The results demonstrate that the method 2 allows greater efficiency and interpretation of results with regard to method 1 where there was diffusion of the extracts in the hole, which creates interference in the measurement. This is the first work in the department of Sucre where two methods are evaluated to determine inhibitory activity of a large group of native plants on pathogenic bacteria and yeast.El objetivo del presente trabajo fue evaluar la eficiencia de dos métodos para medir actividad inhibitoria de extractos vegetales etanólicos nativos del Departamento de Sucre sobre bacterias y levadura patógenas de humanos y plantas. Los muestreos se realizaron en los municipios de Morroa y Sincelejo. Las hojas de las plantas Melia Azederach, Sapium sp, Jatropha gossypilia, Psidium guajava, Origanum vulgare Melissa officinalis, Eucalyptus sp y Cymbopogon citratus fueron procesadas utilizando los métodos de percolación y de soxhlet para la extracción de los extractos. Se evaluaron los métodos de orificio sobre agar (método 1) y el método de disco sensitivos (método 2) para medir el efecto inhibitorio sobre Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella oxytoca, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Bulkolderia glumaea y Zygosaccharomyces microellipsoides. Los resultados obtenidos demuestran que el método 2 permite una mayor eficacia e interpretación de los resultados con relación al método 1 donde se observó difusión de los extractos en el orificio, lo cual crea interferencia en la medición. Este es el primer trabajo en el departamento de Sucre donde se evalúan dos métodos para determinar actividad inhibitoria de un grupo amplio de plantas nativas sobre bacterias y levadura patógenas