Trends in the Offshore Distribution and Relative Abundance of Beaufort Sea Belugas, 1982–85 vs 2007–09

We used systematic strip-transect aerial surveys to examine the distribution and relative abundance of surfaced belugas in the offshore Beaufort Sea in late August of 1982, 1984–85, and 2007–09. Belugas were seen throughout the offshore area in both survey series, on 114 of 149 transects (76.5%). They were common over the continental shelf offshore of the Tuktoyaktuk Peninsula and within 30 km seaward of the Mackenzie River estuary, but they were also seen in most other offshore habitats surveyed. The distribution of belugas had a similar pattern in both series, but the number of surfaced belugas counted was higher in the 2000s than in the 1980s. In total, 305 belugas (145 sightings, mean group size 2.1) were observed on-transect in 20 858 km2 of surveying in the 1980s, and more than three times that number (1061) were observed in a similar area (19 829 km2) during the 2007–09 survey series (378 sightings; mean group size 2.6). Population growth alone, though probably not sufficient to explain the changes observed in relative abundance between decades, could be partly responsible for the apparent increase in belugas. The most plausible explanation is that the offshore became more attractive to belugas in the 2000s, because of either a decrease in the intensity or extent of industrial activity or changes to the marine ecosystem related to climate warming, or both.Nous avons utilisé des levés aériens systématiques par transects en bandes pour examiner la répartition et l’abondance relative des bélugas faisant surface au large de la mer de Beaufort à la fin d’août 1982, d’août 1984 à 1985 et d’août 2007 à 2009. Des bélugas ont été aperçus au large dans les deux séries de levés et ce, dans 114 des 149 transects (76,5 %). Les bélugas étaient courants au large du plateau continental de la péninsule Tuktoyaktuk ainsi que dans un rayon de 30 km du côté mer de l’estuaire du fleuve Mackenzie, bien qu’ils aient également été aperçus dans la plupart des autres habitats étudiés au large. Dans les deux séries, la répartition de bélugas se ressemblait, mais le nombre de bélugas faisant surface était plus élevé dans les années 2000 que dans les années 1980. Au total, 305 bélugas (145 observations, taille moyenne du groupe de 2,1) ont été observés dans les transects des 20 858 km2 étudiés dans les années 1980, et plus de trois fois ce nombre (1 061) ont été observés dans une aire semblable (19 829 km2) dans les années 2007 à 2009 (378 observations, taille moyenne du groupe de 2,6). L’accroissement de la population seul pourrait être responsable en partie de l’augmentation apparente du nombre de bélugas, bien que ce facteur ne suffise probablement pas à expliquer les changements observés sur le plan de l’abondance relative d’une décennie à l’autre. L’explication la plus plausible serait que les bélugas ont été davantage attirés par le secteur extracôtier dans les années 2000 soit en raison de la diminution de l’intensité ou de l’ampleur de l’activité industrielle, soit en raison des changements à l’écosystème marin attribuables au réchauffement climatique, soit en raison d’un ensemble de ces deux causes

An Emerging Pattern of Declining Growth Rates in Belugas of the Beaufort Sea: 1989–2008

Standardized, hunter-based sampling of harvested beluga whales was initiated in the three main harvesting areas of the Mackenzie River delta (Shallow Bay, Kendall Island, Kugmallit Bay) in 1980 and near Paulatuk, Northwest Territories, in 1989. Standard length and sex of landed whales have been recorded for 90 to 110 belugas per year since 1980, and ages have been determined since 1988. Hunters select larger and older belugas; males outnumbered females 2.0 to 1 between 1980 and 1989, 3.0 to 1 between 1990 and 1999, and 3.6 to 1 between 2000 and 2009. Age classes younger than 10 growth layer groups (GLGs) were essentially absent from harvests both in the Delta and near Paulatuk. Asymptotic lengths, calculated using GLG counts from teeth of 839 males and 225 females sampled over 16 seasons (1989, 1993 – 2008), were 435.3 cm (SE 2.0) for males and 380.1 cm (SE 1.8) for females. Males were 14.5% longer than females. Belugas landed in the Delta and Paulatuk were mainly mature adults (by hunter selection). Mature belugas landed by Paulatuk hunters were younger and shorter than those taken in the Delta because of age and sex segregation in the hunting areas. There was no difference in the size-at-age relationships for belugas landed at Paulatuk vs the Delta. The linear trend in size-at-age indicated a decline of 0.08% (SE 0.038%) per year, or 1.75% over the 19 year time series. The 314 male belugas landed in the Delta between 2000 and 2007 showed statistically significant differences in blubber thickness among years, but only a slight downward trend over this short period. Mean blubber was thickest in 2002 and 2003 and thinnest in 2005. The thinness of belugas in 2005, and subtle changes in growth of the belugas over the time series, may reflect ecosystem changes that have reduced the availability or quality and quantity of their prey in recent years. Further research, including isotope and fatty acid profiling, would be helpful in substantiating the declining trend in growth and elucidating the causative factors.Des échantillons standardisés provenant de pêcheurs ayant capturé des bélugas ont été prélevés dans trois lieux de capture principaux du delta du fleuve Mackenzie (baie Shallow, île Kendall et baie Kugmallit) en 1980 et près de Paulatuk, dans les Territoires du Nord-Ouest, en 1989. La longueur standard et le sexe des baleines débarquées ont été enregistrés dans le cas de 90 à 110 bélugas par année depuis 1980, et les âges ont été déterminés depuis 1988. Les pêcheurs choisissent les bélugas qui sont plus gros et plus âgés. Le nombre de mâles a dépassé le nombre de femelles dans une mesure de 2,0 contre 1 entre 1980 et 1989, de 3,0 contre 1 entre 1990 et 1999, et de 3,6 contre 1 entre 2000 et 2009. Les classes d’âge plus jeunes que dix groupes de couches d’accroissement (GCA) étaient pour ainsi dire absentes des récoltes du delta et de la proximité de Paulatuk. Les longueurs asymptotiques, calculées au moyen des dénombrements de GCA à partir des dents de 839 mâles et de 225 femelles échantillonnés au cours de 16 saisons (1989, 1993-2008) étaient de 435,3 cm (ET de 2,0) chez les mâles et de 380,1 cm (ET de 1,8) chez les femelles. Les mâles étaient plus longs que les femelles dans une mesure de 14,5 %. Les bélugas débarqués dans le delta et à Paulatuk étaient surtout des adultes en pleine maturité (en raison du choix des pêcheurs). Les bélugas adultes débarqués par les pêcheurs de Paulatuk étaient plus jeunes et moins longs que ceux capturés dans le delta en raison de la ségrégation entre les sexes et de l’âge dans les zones de pêche. Il n’y avait pas de différence dans les relations en fonction de la taille selon l’âge pour les bélugas débarqués à Paulatuk par rapport à ceux débarqués au delta. La tendance linéaire dans la taille selon l’âge a fait ressortir un déclin de 0,08 % (ET de 0,038 %) par année, soit 1,75 % pour la série temporelle de 19 ans. Les 314 bélugas mâles débarqués dans le delta entre 2000 et 2007 ont affiché d’importantes différences statistiques sur le plan de l’épaisseur du lard au fil des ans, mais seulement une faible tendance à la baisse pendant cette courte période. L’épaisseur moyenne du lard était à son point le plus élevé en 2002 et en 2003, et à son point le plus faible en 2005. La maigreur des bélugas en 2005 et les changements mineurs sur le plan de la croissance des bélugas au cours de la série temporelle pourraient être le reflet de changements caractérisant l’écosystème, changements qui ont eu pour effet de réduire la disponibilité ou la qualité et la quantité des proies des baleines ces dernières années. Des recherches plus poussées, prenant notamment la forme du profilage des isotopes et des acides gras, aideraient à valider la tendance à la baisse en matière de croissance et à élucider les facteurs causals

Ringed Seals and Sea Ice in Canada’s Western Arctic: Harvest-Based Monitoring 1992–2011

We examined the relationship between ringed seal body condition and reproduction and spring sea ice conditions in prime ringed seal habitat in Canada’s western Arctic during 1992 – 2011. Since 1970, ice conditions in east Amundsen Gulf and west Prince Albert Sound have shown only a slight trend toward earlier ice clearance (breakup) in spring (3 – 7 days per decade) (p < 0.10) and no trend toward later freeze-up or increased variability in timing of spring ice clearance. A subsistence harvest – based sample of 2281 ringed seals was obtained during 1992 – 2011 from Masoyak, a traditional hunting camp located on the northwest shore of west Prince Albert Sound and less than 5 km from east Amundsen Gulf. The results revealed a statistically significant trend of decreasing mean annual body condition of ringed seals (using an index of length-mass-blubber depth [LMD]: adults, 0.14 m1.5/kg0.5/y; subadults, 0.24 m1.5/kg0.5/y) over the past two decades. A parallel result was that mean annual body condition of adults and subadults was correlated with the timing of fast ice clearance in spring (later ice clearance = worse condition). This correlation was most obvious in the extreme ice years in all sex/age groupings and was statistically significant for subadults. In mature females sampled since 1992, annual ovulation rates averaged 92.4 ± 16.3% (SD) and were greater than 80%, and mostly at 100%, in all years but two. Failure to ovulate was obvious in 2005, the most extreme late ice clearance year in our series, when only 30.0% of the mature adult females sampled ovulated. At the same time, values for seal body condition indices (adult females, LMD = 11.3; adult males, LMD = 12.4) and percent pups in the harvest (3.3%) were among the lowest recorded, and spring ice clearance was 38 d later than the 1992 – 2011 average. While this and previous studies indicate that the seal population in this core habitat has recovered from natural and extreme-year sea ice fluctuations over the past four decades, the potentially magnified effect of several consecutive extreme ice years, compounded by the concurrent decline in seal body condition that we have now detected over the past 20 years, is of particular concern.Nous avons examiné le lien qui existe entre l’état corporel du phoque annelé, l’état de reproduction de ce phoque et l’état de la glace de mer printanière dans son habitat d’élection de l’ouest de l’Arctique canadien et ce, entre 1992 et 2011. Depuis 1970, l’état de la glace dans l’est du golfe Amundsen et dans l’ouest du détroit de Prince-Albert n’a affiché qu’une petite tendance vers une débâcle printanière plus hâtive (de 3 à 7 jours par décennie) (p < 0,10) et aucune tendance vers un englacement plus tardif ou une variabilité accrue caractérisant la période de la débâcle du printemps. Un échantillon recueilli à partir de 2 281 phoques annelés ayant fait l’objet d’une récolte de subsistance a été obtenu entre 1992 et 2011 à Masoyak, un camp de chasse traditionnel situé sur la côte nord-ouest de l’ouest du détroit de Prince-Albert et à moins de cinq kilomètres de l’est du golfe Amundsen. Les résultats ont permis de constater une tendance statistiquement significative sur le plan de la décroissance de l’état corporel annuel moyen des phoques annelés (en fonction d’un indice de la profondeur et de la longueur de la masse du petit lard [LMD] : reproducteurs, 0,14 m1,5/kg0,5/a; préreproducteurs, 0,24 m1,5/kg0,5/a) au cours des deux dernières décennies. Un résultat parallèle a permis de corréler l’état corporel annuel moyen des reproducteurs et des préreproducteurs à la période d’une débâcle printanière rapide (débâcle tardive = pire état). Cette corrélation était plus évidente au cours des années où la glace était extrême chez tous les groupements en fonction du sexe ou de l’âge, et elle était statistiquement significative chez les préreproducteurs. Parmi les femelles matures échantillonnées depuis 1992, les taux d’ovulation annuels atteignaient 92,4 ± 16,3 % (DS) en moyenne, et étaient plus grands que 80 %, et à près de 100 % au cours de toutes les années, sauf deux. L’anovulation était évidente en 2005, ce qui correspondait à l’année de notre série où la débâcle a été la plus tardive, lorsque seulement 30,0 % des femelles adultes et matures qui avaient été échantillonnées ont ovulé. En même temps, les valeurs relatives aux indices de l’état corporel des phoques (femelles adultes, LMD = 11,3; mâles adultes, LMD = 12,4) et au pourcentage de petits faisant partie de la récolte (3,3 %) figuraient parmi les valeurs les plus basses à n’avoir jamais été enregistrées, et la débâcle printanière était plus tardive de 38 jours par rapport à la moyenne de 1992-2011. Bien que cette étude et des études antérieures laissent croire que la population de phoques de cet habitat important a réussi à se remettre des fluctuations naturelles et extrêmes des conditions de glace des quatre dernières décennies, l’effet potentiellement grossissant de plusieurs années consécutives de glace extrême, allié au déclin concurrent de l’état corporel des phoques que nous avons décelé au cours des 20 dernières années, présente une source d’inquiétude particulière

New insights into the genetic etiology of Alzheimer's disease and related dementias

Characterization of the genetic landscape of Alzheimer's disease (AD) and related dementias (ADD) provides a unique opportunity for a better understanding of the associated pathophysiological processes. We performed a two-stage genome-wide association study totaling 111,326 clinically diagnosed/'proxy' AD cases and 677,663 controls. We found 75 risk loci, of which 42 were new at the time of analysis. Pathway enrichment analyses confirmed the involvement of amyloid/tau pathways and highlighted microglia implication. Gene prioritization in the new loci identified 31 genes that were suggestive of new genetically associated processes, including the tumor necrosis factor alpha pathway through the linear ubiquitin chain assembly complex. We also built a new genetic risk score associated with the risk of future AD/dementia or progression from mild cognitive impairment to AD/dementia. The improvement in prediction led to a 1.6- to 1.9-fold increase in AD risk from the lowest to the highest decile, in addition to effects of age and the APOE ε4 allele

Multiancestry analysis of the HLA locus in Alzheimer’s and Parkinson’s diseases uncovers a shared adaptive immune response mediated by HLA-DRB1*04 subtypes

Across multiancestry groups, we analyzed Human Leukocyte Antigen (HLA) associations in over 176,000 individuals with Parkinson’s disease (PD) and Alzheimer’s disease (AD) versus controls. We demonstrate that the two diseases share the same protective association at the HLA locus. HLA-specific fine-mapping showed that hierarchical protective effects of HLA-DRB1*04 subtypes best accounted for the association, strongest with HLA-DRB1*04:04 and HLA-DRB1*04:07, and intermediary with HLA-DRB1*04:01 and HLA-DRB1*04:03. The same signal was associated with decreased neurofibrillary tangles in postmortem brains and was associated with reduced tau levels in cerebrospinal fluid and to a lower extent with increased Aβ42. Protective HLA-DRB1*04 subtypes strongly bound the aggregation-prone tau PHF6 sequence, however only when acetylated at a lysine (K311), a common posttranslational modification central to tau aggregation. An HLA-DRB1*04-mediated adaptive immune response decreases PD and AD risks, potentially by acting against tau, offering the possibility of therapeutic avenues

Identification and analysis of a glutaryl-CoA dehydrogenase-encoding gene and its cognate transcriptional regulator from Azoarcus sp. CIB

9 páginas, 3 figuras, 1 tabla -- PAGS nros. 474-482In this work, the gcdH gene from the denitrifying β-proteobacterium Azoarcus sp. CIB was shown to encode a glutaryl-CoA dehydrogenase, which is essential for the anaerobic catabolism of many aromatic compounds and some alicyclic and dicarboxylic acids. The primary structure of the GcdH protein is highly conserved in many organisms. The divergently transcribed gcdR gene, encoding a LysR-type transcriptional regulator, accounts for the glutaconate/glutarate-specific activation of the Pg promoter driving expression of gcdH. The Azoarcus sp. CIBdgcdH mutant strain harbouring a disrupted gcdH gene was used as host to identify heterologous gcdH genes, such as that from Pseudomonas putida KT2440. Moreover, the expression of gcdH from P. putida can be efficiently controlled by the GcdR activator in Azoarcus sp. CIB, demonstrating the existence of cross-talk between GcdR regulators and gcdH promoters from members of different phylogenetic subgroups of proteobacteriaThis work was supported by Grants BIO2003-01482, BIO2006-05957, VEM2003-20075-CO2-02 and GEN2006-27750-C5-3-E/SYS from the Spanish Ministerio de Educación y Ciencia, and by Grant P-AMB-259–0505 from the Comunidad Autónoma de Madrid. B. Blázquez was supported by a predoctoral fellowship associated to Projects BIO2003-01482 and CSIC2006 2 0I 069Peer reviewe