Genetic relationships of the Yucatan black hairless pig with Iberian breeds using single nucleotide polymorfisms

Para realizar programas de conservação ex-situ de suínos crioulos, é importante determinar quais animais serão criados, preferencialmente aqueles com maior componente de genética ibérica, para preservar sua origem. Uma subpopulação de porco preto calvo de Yucatán (YBHP) foi usada para estimar sua diversidade genética e estrutura populacional. Um total de 104 suínos adultos foram selecionados levando-se em consideração características como ausência de pelos, pele preta (sem manchas), casco preto e focinho reto. O painel GGP-50K foi utilizado para a genotipagem dos SNPs em animais YBHP, e informações de porcos sem pelos ibéricos e de Yucatán dos Estados Unidos (USYU) foram retiradas de bancos de dados. Todas as análises foram realizadas com o software PLINK v1.9 e v2.1. Os valores dos índices de endogamia e fixação foram menores em YBHP, com altos valores de índice de heterozigosidade e alogamia observados, que concordam com os obtidos nas populações de Canárias e Chato Murciano. De acordo com os clusters gerados pela análise “GenomaWide Identity By State”, quatro grupos foram identificados, um dos quais incluiu porcos de Guadyerbas, USYU e YBHP. Entre as populações, YBHP estava intimamente relacionado com os porcos sem pelo de Guadyerbas, USYU e Canárias. A análise de componentes principais mostrou o mesmo resultado. De acordo com os resultados obtidos nas corridas de investigação de homozigose, visando obter consenso de pools de regiões de sobreposição, foram identificados 119 SNPs associados a genes e processos biológicos. Os genes BMP7 e NSUN2 foram associados à diferenciação de células epiteliais, morfogênese e desenvolvimento epitelial. Para metabolismo de nutrientes: energia, os genes HADHA, PPARA, ADD1/ SREBF1 e FAT1 foram identificados.  To conduct ex-situ creole pig conservation programs, it is essential to determine which breeding animals will be used, preferentially those with a more significant Iberian genetic component to preserve their origin. This study used a Yucatan black hairless pigs (YBHP) subpopulation to estimate its genetic diversity and population structure. One hundred four adult pigs were selected for the absence of hair, black skin (without spots), black hoof, and straight snout. The porcine-GGP-50K chip was used for SNP genotyping in YBHP, and information on Iberian and Yucatán hairless pigs from the United States (USYU) was taken from databases. All analysis was performed using PLINK v1.9 and v2.1 software. Inbreeding and fixation index values were lower in YBHP, with high observed heterozygosity and allogamy index values, which agree with those obtained in the populations of Canarias and Chato Murciano. According to the clusters generated by the “Genome-Wide Identity by State” analysis, four groups were identified, one of which included pigs from Guadyerbas, USYU, and YBHP. Between populations, YBHP was closely related to the hairless pigs from Guadyerbas, USYU, and Canarias. Principal component analysis showed the same result. According to the results obtained from the runs of homozygosity investigation, aimed to get pools consensus of regions of overlapping, 119 SNPs associated with genes and biological processes were identified. The BMP7 and NSUN2 genes were associated with epithelial cell differentiation, morphogenesis, and epithelial development. For nutrient metabolism: energy, the HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1, and FAT1genes were identified

Valoración nutricional química proximal de las plantas arbóreas Morera (Morus alba), Moringa (Moringa oleífera) y Chaya (Cnidoscolus aconitifolius) como alternativa nutricional para cerdos: Evaluación nutricional química proximal de árboles de Morera (Morus alba), Moringa (Moringa oleifera) y Chaya (Cnidoscolus aconitifolius) como alternativa nutricional para cerdos

Se realizaron los análisis químicos proximales (AQP): Materia Seca (MS), Materia Orgánica (MO), Humedad, Cenizas, Proteína Cruda (PC), Fibra Cruda (FC), Extracto Etéreo (EE), Extracto Libre de Nitrógeno (ELN) y se calculó la Energía Metabolizable (EM) a las harinas de Morera (Morus alba), Moringa (Moringa oleífera) y Chaya (Cnidoscolus aconitifolius) con el objetivo de determinar si las arbóreas, pudieran ser consideradas como alternativa para la alimentación de cerdos. Mediante una prueba de T-Student (p˂ 0.05) se compararon los resultados, con los reportes publicados por autores de otros países. Los valores que aportaron los AQP para MS, MO, Humedad, Cenizas, PC, FC, EE, ELN y la EM realizados a la harina de Moringa y Chaya demostraron que no existen diferencias significativas con los reportes de otros autores, únicamente la PC de la harina de Morera fue el único valor que resultó significativamente mayor (p <0.05). Al comparar las harinas analizadas presentaron mayor contenido de PC (14.7 al 32.09 %), de FC (6 al 33.02 %) y menor contenido de EM (1.22 al 1.85 Kcal/g), por lo que pudieran ser consideradas como una alternativa para sustituir al Maíz y disminuir el contenido de Soya en la alimentación de los cerdos, con una inclusión sugerida entre el 5 y el 30 % de la harina de estas arbóreas, considerando su elevado contenido de FC