Prediction of virus-host protein-protein interactions mediated by short linear motifs

Table S4. Supplement information describing the previous files. (Supplement - Prediction of Virus-Host Protein-Protein interactions based on Short Linear Motifs.pdf) available at https://figshare.com/articles/Supplement_-_Prediction_of_Virus-Host_Protein-Protein_interactions_based_on_Short_Linear_Motifs/4667461 . (PDF 166 kb

Evaluación Automática de Resultados de Aprendizaje como un Nuevo Paradigma en la enseñanza de un Curso de Programación: La ingeniería en la sociedad 5.0

Programming education goes through the transition from the content model to the learning outcomes model and the integration of technology, where automatic assessment tools allow students to support them in practice; This makes learning inclusive by proposing a transversal approach so that the necessary programming skills are achieved. In this sense, this paper presents a strategy that evaluates the source code and analyzes it using software metrics to identify students' learning results in a programming course. A strategy was developed that integrates an automatic source code evaluation tool, which allowed us to identify How an evaluation-based approach supports the learning process, time, and impact in a computer programming course? The results show that the strategy helps the transition from a programming course to a learning outcomes model and reduces the evaluation time without affecting students' grades, compared to the traditional way. Finally, it is essential to highlight that the development of strategies that integrate tools that support the teaching-learning and evaluation process in programming courses has a positive impact on academic training and decision-making, seeking to improve students' weaknesses through the analysis of the outcomes obtained

Tradução automática de um conjunto de treinamento para extração semântica de relações

Machine translation (MT) is used to obtain annotated corpus of English corpus which can be applicable to different natural language processing (NLP) tasks. Considering that there are more resources or data sets for training NLP models inEnglish language, this paper explores the application of MT to automate NLP tasks inSpanish. Thus, the article describes a dataset for the extraction of generic relations (reACE) and the construction of a semantic extraction model of relations in Spanish (ER), based on the set of samples translated from English to Spanish. The results show that for the MT task it is necessary to implement a corpus preediting process in English to avoid translation and post-editing errors and maintain the original corpus annotations. The ER models in Spanish achieve measures of accuracy, completeness, and F-value comparable to those obtained by the model in the English language, which suggests that machine translation is a useful tool to perform NLP tasks in the Spanish language.La traducción automática (TA) se utiliza para obtener corpus anotados a partir de corpus provenientes del idioma inglés, los cuales pueden ser aplicables a diferentes tareas de procesamiento de lenguaje natural (PLN). Teniendo en cuenta que existen más recursos o conjuntos de datos para entrenamiento de modelos de PLN en idioma inglés, en este trabajo se explora la aplicación de la TA para automatizar tareas de PLN en el idioma español. De esta forma, en el artículo se describe un conjunto dedatos para la extracción de relaciones genéricas (reACE) y la construcción de un modelo extracción semántica de relaciones en español (ER), basado en el conjunto de muestras traducidas del idioma inglés al español. Los resultados muestran que para la tarea de TA es necesario implementar un proceso de preedición del corpus en inglés, con el fin de evitar errores de traducción, posedición y mantener las anotaciones del corpus original. Los modelos ER en español alcanzan medidas de precisión,exhaustividad y valor-F comparables con las obtenidas por el modelo en el lenguaje de inglés, lo que sugiere que la traducción automática es una herramienta útil pararealizar tareas de PLN en el idioma españolLa traduction automatique (TA) est utilisée pour obtenir des corpus annotés à partir de corpus de langue anglaise, qui peuvent être applicables à différents travaux de traitement du langage naturel (NLP). En tenant compte du fait qu'il existe davantage de ressources ou d'ensembles de données pour la formation de modèlesPLN en langue anglaise, cet article explore l'application de la TA pour automatiserles travaux PLN en langue espagnole. Ainsi, l'article décrit un ensemble de donnéespour le prélèvement de relations génériques (reACE) et la construction d'un modèle de prélèvement de relations sémantiques en espagnol (ER), basé sur l'ensemble des échantillons traduits de l'anglais à l'espagnol. Les résultats montrent que pour le travail de TA, il est nécessaire de mettre en oeuvre un processus de pré-édition du corpus anglais, afin d'éviter les erreurs post-édition de traduction et de garder les annotations du corpus original. Les modèles ER en espagnol atteignent des mesuresde précision, de complétude et de valeur F comparables à celles obtenues par le modèle en langue anglaise, ce qui suggère que la traduction automatique est un outilutile pour accomplir des travaux PLN en langue espagnole.A tradução automática (TA) é usada para obter corpus anotados partindo de corpus da língua inglesa, que podem ser aplicáveis a diferentes tarefas de processamento de linguagem natural (PLN). Levando em conta que existem mais recursos ou conjuntos de dados para treinamento de modelos PLN em inglês, este artigo explora a aplicação da TA para automatizar tarefas PLN em espanhol. Desta forma, o artigo descreve um conjunto de dados para extração de relações genéricas (reACE) e a construção de um modelo de extração semântica de relações em espanhol(ER), baseado no conjunto de amostras traduzidas do inglês para o espanhol. Osresultados mostram que para a tarefa de TA é necessário implementar um processode pré-edição do corpus em inglês, a fim de evitar erros de tradução e pós-ediçãoe manter as anotações do corpus original. Os modelos ER em espanhol alcançammedidas de acurácia, completude e valor F comparáveis às obtidas pelo modelo nalíngua inglesa, o que sugere que a tradução automática é uma ferramenta útil pararealizar tarefas de PLN na língua espanhola

Additional file 1 of Prediction of virus-host protein-protein interactions mediated by short linear motifs

Table S1. Candidate interactions between human and HIV-1 (interactions.zip) available at https://figshare.com/articles/interactions_zip/4648714 . (ZIP 2549.76 kb

Additional file 3 of Prediction of virus-host protein-protein interactions mediated by short linear motifs

Table S3. SLiM sets C,D,R and derived for HIV-1 proteins. (SLiM_sets.zip) available at https://figshare.com/articles/Short_Linear_Motif_Sets_common_to_human_and_HIV-1/4648732 . (ZIP 145 kb

Neotropical Otter Lontra longicaudis

A species closely related to the North American river otter, the Neotropical otter is widely distributed across Latin America. Often found in areas inhabited by the Giant otter, the two species appear to coexist.Fil: Rheingantz, Marcelo. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Valenzuela, Alejandro Eduardo Jorge. Universidad Nacional de Tierra del Fuego; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; ArgentinaFil: Botero Botero, A. Universidad del Quindio; ColombiaFil: de Thoisy, Benoit. No especifíca;Fil: Trujillo, Fernando. No especifíca;Fil: González, Ildemaro. No especifíca;Fil: Gallo Reynoso, Juan Pablo. No especifíca;Fil: Marmontel, Miriam. No especifíca;Fil: Hernández Romero, Pablo Cesar. Laboratorio de Ecologia y Conservacion de Fauna Silvestre ; Instituto de Ecologia ; Universidad Nacional Autonoma de Mexico;Fil: Rosas Ribeiro, Patricia F. Universidade do Estado do Rio Grande do Norte; BrasilFil: Wallace, Robert. Wildlife Conservation Society; Estados UnidosFil: Utreras Bucheli, Victor Manuel. Wildlife Conservation Society; Estados Unido