Análise Genética da Hibridação em Gatos

Trabalho desenvolvido no Campus da Faculdade Dr. Francisco Maeda - FAFRAM, de Ituverava, SP., com o objetivo de elaborar um protocolo para análise da ocorrência de cruzamentos entre espécies de gatos doméstico e selvagem, além de buscar a confirmação científica dessa ocorrência, ainda não registrada no Brasil. Foram analisados os materiais genéticos de duas ninhadas de gatos com suspeita de serem resultado de cruzamento natural entre gatas domésticas com um gato selvagem. Para as análises, utilizou-se dois marcadores associados ao cromossomo Y, sendo eles o SMCY e o SRY, para identificação genética da linhagem paterna, e um marcador mitocondrial ATP6, para identificação da linhagem materna. Os resultados mostraram que os marcadores utilizados são adequados e suficientes para a confirmação ou exclusão da ocorrência de hibridação, tanto na linhagem paterna como na materna, podendo ser utilizado como protocolo para essas análises. Com o protocolo utilizado, concluiu-se que os animais em estudo pertencem à espécie doméstica (Felis silvestris catus), descartando qualquer possibilidade de hibridação com gatos selvagens da fauna brasileira

Demografia e diversidade genética de onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica de Caetetus SP e sua importância para a conservação desses felinos

The loss and fragmentation of habitat due to intensive human intervention are the main threats to natural populations. Species with low density and large home range, like felids, are the most threatened species by these changes. In an attempt to minimize this impact, detection of population density and genetic characterization are necessary to propose conservation measures. Thus, the main objective of this study was to characterize the populations of two species of felines, cougars (Puma concolor) and ocelots (Leopardus pardalis) of Caetetus Ecological Station (EEC - SP, one of the last remnants of Atlantic Forest within the state of São Paulo), about their demographic and genetic characteristics from non-invasive samples (feces and hairs).We collected the samples on EEC tracks and identified the species, individualized each sample, sexed each individual and calculated the genetic diversity of the population using molecular markers. Abundance was estimated from the capture-recapture historic, with opened and closed population models. We identified 17 samples of feces cougar and 12 of ocelot. Of these samples, six individuals were individualized as cougar and five as ocelot, these numbers represent the minimum population sizes for the entire sample period (18 months). The values of abundance and density estimated using the model of closed population was more similar to that found in genetic individualization, five individuals for each species and densities of 4.92/100 km2 (P. concolor) and 19.51/100 km2 (L. pardalis). The genetic diversity of the two species was lower than that from other studies, probably due the landscape´s fragmentation, which reduces the gene flow with others populations. Also, the genetic diversity for L. pardalis was lower than P. concolor, which is possibly related to the ocelot behavior of avoid opened and disturbed areas, which can reduce the potential for gene flow. Furthermore, we also observed structure of P. concolor from EEC with populations from other locations, but we also identified gene flow, including relatedness. Thus, the results of genetic diversity and demographics demonstrate the importance of the Ecological Station Caetetus for these species and also underscores the importance of establishing measures to enable the viability of its populations over long term, as facilitating gene flow with individuals from others locations.Universidade Federal de Minas GeraisA perda e fragmentação do habitat, decorrentes da intensa intervenção antrópica, estão entre as principais ameaças às populações naturais. Espécies com baixa densidade e grandes áreas de vida, como os felinos, são ainda mais prejudicadas por essas mudanças. Na tentativa de minimizar esse impacto, a detecção da densidade populacional e a caracterização genética são necessárias para que medidas de conservação sejam propostas. Nesse sentido, o objetivo principal deste trabalho foi caracterizar populações de duas espécies de felinos, onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis) da Estação Ecológica dos Caetetus (EEC SP, um dos últimos remanescentes de Mata Atlântica no interior do estado de São Paulo), quanto às suas características demográficas e genéticas, a partir de amostras não invasivas (fezes e pelos). Coletamos as amostras nas trilhas da EEC, das quais pudemos identificar as espécies, individualizar, sexar cada indivíduo e calcular a diversidade genética da população utilizando marcadores moleculares. A abundância foi estimada a partir do histórico de captura-recaptura com modelos de população aberta e fechada. Identificamos geneticamente 17 amostras de fezes de onça-parda e 12 de jaguatirica. Dessas amostras, individualizamos seis indivíduos de onça-parda e cinco de jaguatirica, sendo esses os tamanhos populacionais mínimos para todo o período de amostragem (18 meses, entre dezembro de 2010 a maio de 2013). Os valores de estimativa de abundância e densidade utilizando o modelo de população fechada foram mais próximos ao encontrado na individualização genética, sendo cinco indivíduos para cada espécie e densidades de 4,92/100 km2 (P. concolor) e 19,51/100 km2 (L. pardalis). A diversidade genética encontrada para as duas espécies foi menor quando comparada com outros trabalhos, provavelmente ao menor fluxo gênico com outras populações devido à fragmentação da paisagem. Além disso, a diversidade genética encontrada para L. pardalis foi menor quando comparada a P. concolor, possivelmente relacionado ao hábito da espécie em evitar áreas mais abertas e antropizadas, o que pode reduzir o potencial de fluxo gênico. Já para P. concolor foi encontrada estruturação com populações de outras localidades, mas também identificamos fluxo gênico, inclusive com relações de parentesco. Dessa forma, os resultados obtidos de demografia e diversidade genética demostram a importância da Estação Ecológica dos Caetetus para essas espécies e também ressalta a importância da criação de medidas que permitam a viabilidade de suas populações a longo prazo, como as que facilitem fluxo gênico com indivíduos de outras localidades

Polimorfismo genético-molecular de diferentes populações de cateto (Mammalia – Dicotylidae – Tayassu tajacu), Brasil

O estudo de populações naturais é imprescindível para compreendermos melhor a sua dinâmica, importância no ecossistema, necessidade de recursos, nível de preservação das espécies, entre outras. O cateto (Tayassu tajacu), apesar de possuir ampla distribuição geográfica e ocupar diversos tipos de habitats, pode sofrer alterações no equilíbrio de suas populações devido às grandes pressões sofridas pela caça e alterações ambientais. Vale lembrar que o sucesso reprodutivo de muitas espécies vegetais está ligado à disseminação de frutos e sementes realizada pelo cateto. Considerando a necessidade de preservação das espécies silvestres, a aplicação de metodologias moleculares é uma das formas de sabermos como se encontra a diversidade genética dessas populações e, a partir daí, criarmos medidas para trabalhos conservacionistas. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi identificar o nível de polimorfismo genético-molecular entre diferentes populações de Tayassu tajacu no Brasil, demonstrando como essas populações, sujeitas a tantas interferências, encontram-se na natureza. Foram analisadas amostras de 17 indivíduos referentes a oito localidades do Brasil (Cascavel - PR, Foz do Iguaçu - PR, Cuiabá - MT, Ariquemes - RO, Rio Branco - AC, Manaus - AM, Belém - PA, e Carajás - PR). O polimorfismo foi identificado com marcadores de RAPD. Foram testados 38 primers, sendo que desses apenas nove forneceram as 30 marcas polimórficas para o estudo. Foi possível notar que a maioria dos indivíduos da mesma população ou de populações próximas não são os mais semelhantes entre si. Indivíduos de localidade distantes, como os de Foz de Iguaçu (PR) e Manaus (AM) mostraram-se mais semelhantes entre si do que com os animais das suas próprias populações. A variabilidade entre os indivíduos...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo

Genética populacional de felinos e as ameaças para Puma concolor: estruturação populacional recente e atropelamentos

Species around the world are increasingly exposed to new threats due to human activities. The main threat is the landscape modification by human activities, resulting in demographic and genetic pattern changes of species populations. Habitat loss and fragmentation may promote the reduction of population size and thus can result in changes in species community. In addition, the modification of landscape can act as a barrier to the individuals movement, limiting gene flow and the population viability. In addition, the needs of searching for new areas to the establishment of territories, may expose individuals to new threats, such as road killing, which is currently considered an important threat to species. In this scenario, some groups are even more sensitive, for example carnivores, which already occur naturally in low densities and require large home ranges. In this sense, this work had as main objectives to evaluate the demographic aspects (minimum population size, abundance and density) of the feline community in four study areas in São Paulo state (Estação Ecológica dos Caetetus, Fazenda Rio Claro da Duratex, Floresta Nacional de Capão Bonito e Parque Estadual Carlos Botelho) using non-invasive sampling and molecular technics. In addition, considering P. concolor as a model, we verified the distribution of its genetic diversity and the occurrence of population structuring in a fragmented landscape within São Paulo and Minas Gerais states. We also evaluated the impact of the loss of individuals due to road killing for the population viability of Puma concolor. The results show an influence of the characteristics of the areas for the occurrence of feline species directly related to their characteristics and requirements. In addition, the results indicate that the loss and fragmentation of the habitat already may represent an important factor for the dispersion of individuals of P. concolor, resulting in the structuring of their populations. This species also suffers the impact of road killing on the loss of individuals which, in long term, also may represent a loss of genetic diversity in their populations. In this way, this work demonstrates, under different aspects, the demographic and genetic impacts on feline species in an increasingly modified environment.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)As espécies em todo o mundo estão cada vez mais expostas à novas ameaças devido às atividades antrópicas. A principal ameaça atualmente corresponde à modificação da paisagem, resultando em alterações nos padrões demográficos e genéticos das populações das espécies. A perda e fragmentação do habitat pode levar à redução do tamanho populacional e, dessa forma, alterar as relações entre as espécies que compõe uma comunidade. A mudança na paisagem também pode impor barreiras ao deslocamento dos indivíduos, limitando o fluxo gênico entre as populações. Além disso, a necessidade de buscar novas áreas para estabelecer territórios, devido a diminuição de seus habitats naturais, expõe as espécies a novas ameaças, entre elas, o atropelamento, considerada hoje uma grande ameaça para as espécies. Nesse cenário, alguns grupos são ainda mais sensíveis, por exemplo os carnívoros, que já ocorrem naturalmente em baixas densidades e necessitam de grandes áreas de vida. Nesse sentido, este trabalho teve como principais objetivos avaliar os aspectos demográficos (tamanho populacional mínimo, abundância e densidade) da comunidade de felinos em quatro áreas no estado de São Paulo (Estação Ecológica dos Caetetus, Fazenda Rio Claro da Duratex, Floresta Nacional de Capão Bonito e Parque Estadual Carlos Botelho) através da coleta de amostras não invasivas (fezes) em conjunto com técnicas moleculares. Além disso, tendo a espécie P. concolor como modelo, verificamos a distribuição da sua diversidade genética e ocorrência de estruturação populacional em uma paisagem fragmentada no estado de São Paulo e Minas Gerais. Também avaliamos o impacto da perda de indivíduos por atropelamentos em uma população local de P. concolor utilizando os dados genéticos para uma análise de viabilidade populacional. Os resultados mostram uma influência das características das áreas para a ocorrência das espécies de felinos diretamente relacionadas às suas características e necessidades. Os resultados também indicam que a perda e fragmentação do habitat já podem estar influenciando na dispersão de indivíduos de Puma concolor, resultando na estruturação de suas populações. Espécie essa que também sofre o impacto dos atropelamentos na perda de indivíduos, e em longo prazo, pode também trazer impactos na diversidade genética nas suas populações. Dessa forma, este trabalho demonstra, sob diferentes aspectos, os impactos demográficos e genéticos sofridos pelas espécies de felinos em um ambiente cada vez mais alterado.FAPESP: 2013/24453-

Redescobrindo a onça-pintada em um remanescente de mata atlântica costeira no sudeste do Brasil por análise não-invasiva de DNA

Jaguar populations have been declining in Brazil mostly due to habitat loss and fragmentation, conflict with humans, poaching and reduction of prey. This is dramatically true in the Atlantic Forest, where occurrence of this large felid is now restricted to very few remaining areas. We used a non-invasive DNA analysis to search through felid scats collected in the Santa Virginia Unit (SVU) of the Serra do Mar State Park, to test for the potential presence of jaguar there. Our results indicated at least three individuals (two females and one male) inside SVU, thus confirming at least temporary presence of this top predator in this important protected area. It is now crucial to intensify studies in that area and surroundings, to evaluate the status of these individuals and identify conservation needs to urgently improve the prospects for the establishment of a resident population, allowing it to expand to adjoining units of the Serra do Mar State Park and Serra da Bocaina National Park.As populações de onça-pintada têm sofrido declínio populacional devido a perda e fragmentação de habitat, por conflito com humanos, através da caça e pela redução da disponibilidade de suas presas. Isso é particularmente drástico no bioma Mata Atlântica, onde a ocorrência desse grande felino está atualmente restrita a poucos remanescentes. Utilizamos análise de DNA a partir de amostras de fezes para verificar a pontencial presença da espécie no Núcleo Santa Virgínia (NSV) do Parque Estadual da Serra do Mar. Os resultados indicaram a ocorrência pelo menos esporádica de três indivíduos (duas fêmas e um macho) no interior do NSV. Com isso, se torna crucial agora intensificar estudos naquela unidade e em áreas adjacentes, para avaliar a situação desses indivíduos e identificar as necessidades mais urgentes de conservação para melhorar a probabilidade de estabelecimento de uma população residente da espécie, permitindo que ela possa expandir para unidades de conservação vizinhas, como outros núcleos do Parque Estadual da Serra do Mar e o Parque Nacional Serra da Bocaina.Fil: Moraes De Castro Souza, Andiara Silos. Universidade Federal do São Carlos; BrasilFil: Saranholi, Bruno Henrique. Universidade Federal do São Carlos; BrasilFil: Crawshaw, Peter Gransden. Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Mamíferos Carnívoro; BrasilFil: Paviolo, Agustin Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Puerto Iguazú | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Puerto Iguazú; ArgentinaFil: Rampim, Lilian Elaine. Projeto Onçafari; BrasilFil: Sartorello, Leonardo. Projeto Onçafari; BrasilFil: Galetti, Pedro Manoel. Universidade Federal do São Carlos; Brasi

NEOTROPICAL ALIEN MAMMALS: a data set of occurrence and abundance of alien mammals in the Neotropics

Biological invasion is one of the main threats to native biodiversity. For a species to become invasive, it must be voluntarily or involuntarily introduced by humans into a nonnative habitat. Mammals were among first taxa to be introduced worldwide for game, meat, and labor, yet the number of species introduced in the Neotropics remains unknown. In this data set, we make available occurrence and abundance data on mammal species that (1) transposed a geographical barrier and (2) were voluntarily or involuntarily introduced by humans into the Neotropics. Our data set is composed of 73,738 historical and current georeferenced records on alien mammal species of which around 96% correspond to occurrence data on 77 species belonging to eight orders and 26 families. Data cover 26 continental countries in the Neotropics, ranging from Mexico and its frontier regions (southern Florida and coastal-central Florida in the southeast United States) to Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay, and the 13 countries of Caribbean islands. Our data set also includes neotropical species (e.g., Callithrix sp., Myocastor coypus, Nasua nasua) considered alien in particular areas of Neotropics. The most numerous species in terms of records are from Bos sp. (n = 37,782), Sus scrofa (n = 6,730), and Canis familiaris (n = 10,084); 17 species were represented by only one record (e.g., Syncerus caffer, Cervus timorensis, Cervus unicolor, Canis latrans). Primates have the highest number of species in the data set (n = 20 species), partly because of uncertainties regarding taxonomic identification of the genera Callithrix, which includes the species Callithrix aurita, Callithrix flaviceps, Callithrix geoffroyi, Callithrix jacchus, Callithrix kuhlii, Callithrix penicillata, and their hybrids. This unique data set will be a valuable source of information on invasion risk assessments, biodiversity redistribution and conservation-related research. There are no copyright restrictions. Please cite this data paper when using the data in publications. We also request that researchers and teachers inform us on how they are using the data

NEOTROPICAL CARNIVORES: a data set on carnivore distribution in the Neotropics

Mammalian carnivores are considered a key group in maintaining ecological health and can indicate potential ecological integrity in landscapes where they occur. Carnivores also hold high conservation value and their habitat requirements can guide management and conservation plans. The order Carnivora has 84 species from 8 families in the Neotropical region: Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Otariidae; Phocidae; Procyonidae; and Ursidae. Herein, we include published and unpublished data on native terrestrial Neotropical carnivores (Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Procyonidae; and Ursidae). NEOTROPICAL CARNIVORES is a publicly available data set that includes 99,605 data entries from 35,511 unique georeferenced coordinates. Detection/non-detection and quantitative data were obtained from 1818 to 2018 by researchers, governmental agencies, non-governmental organizations, and private consultants. Data were collected using several methods including camera trapping, museum collections, roadkill, line transect, and opportunistic records. Literature (peer-reviewed and grey literature) from Portuguese, Spanish and English were incorporated in this compilation. Most of the data set consists of detection data entries (n = 79,343; 79.7%) but also includes non-detection data (n = 20,262; 20.3%). Of those, 43.3% also include count data (n = 43,151). The information available in NEOTROPICAL CARNIVORES will contribute to macroecological, ecological, and conservation questions in multiple spatio-temporal perspectives. As carnivores play key roles in trophic interactions, a better understanding of their distribution and habitat requirements are essential to establish conservation management plans and safeguard the future ecological health of Neotropical ecosystems. Our data paper, combined with other large-scale data sets, has great potential to clarify species distribution and related ecological processes within the Neotropics. There are no copyright restrictions and no restriction for using data from this data paper, as long as the data paper is cited as the source of the information used. We also request that users inform us of how they intend to use the data