Bases moléculaires de l'activité "hybride" de l'ADN gyrase de mycobacterium tuberculosis

PARIS-BIUP (751062107) / SudocSudocFranceF

L'hémoglobine glyquée : un marqueur de choix en Toxicologie Médico-Légale

Le dosage de l'hémoglobine glyquée (HbA1C) est considéré comme un élément objectif du contrôle de l'équilibre glycémique du malade diabétique. Ce paramètre caractérise toute fixation non enzymatique de glucose sur l'hémoglobine. Il est le reflet de la glycémie moyenne des 60 derniers jours et complète donc utilement les mesures ponctuelles de glycémie. C'est en quelque sorte “le cheveu du glucose”. Nous avons étudié la conservation de l'HbA1C à + 4° C au cours du temps avec différents anticoagulants ou conservateurs (3 mois, 6 mois, 1 an). 106 dosages ont été réalisés sur un ensemble CLHP dédié à l'analyse semi-automatique de l'hémoglobine A1C (Biorad). La technique a été appliquée à des cas médico-légaux. Les résultats montrent que la conservation est bonne jusqu'à 3 mois dans les échantillons prélevés sur fluorure, 6 mois dans ceux prélevés sur tube sec ou sur tube hépariné. Chez des sujets non diabétiques, les valeurs de référence obtenues sur les prélèvements médico-légaux sont identiques à celles de témoins vivants (3,5-6,25 % d'hémoglobine totale). Les résultats positifs ont tous été confirmés par l'enquête médicale. La technique a été appliquée avec succès à quatre observations médico-légales. Son augmentation permet, en cas d'acétonémie élevée d'exclure une intoxication par l'acétone ou l'isopropanol mais également de différencier l'acidocétose alcoolique ou de jeûne de l'acidocétose diabétique. L'hémoglobine glyquée constitue un marqueur de choix du diabète dont l'interprétation est valide en post-mortem

Inventory and comparative analysis of rice and arabidopsis ATP-binding cassette (ABC) systems.

ATP-binding cassette (ABC) proteins constitute a large superfamily found in all kingdoms of living organisms. The recent completion of two draft sequences of the rice (Oryza sativa) genome allowed us to analyze and classify its ABC proteins and to compare to those in Arabidopsis thaliana. We identified a similar number of ABC proteins in rice and Arabidopsis (121 versus 120), despite the rice genome being more than three times the size of Arabidopsis. Both Arabidopsis and rice have representative members in all seven major subfamilies of ABC ATPases (A to G) commonly found in eukaryotes. This comparative analysis allowed the detection of 29 potential orthologous sequences in Arabidopsis and rice. However, plant share with prokaryotes a specific set of ABC systems that is not detected in animals. These ABC systems might be inherited from the cyanobacterial ancestor of chloroplasts. The present work provides the first complete inventory of rice ABC proteins and an updated inventory of those proteins in Arabidopsis

Validation d'une technique de dosage multiélémentaire des métaux et métalloïdes dans les ongles par ICP-MS. Valeurs usuelles chez 130 sujets volontaires

Nous décrivons une technique de dosage simultané de trente deux éléments minéraux dans les ongles, par plasma à couplage inductif relié à un détecteur de masse (ICP-MS). L'appareil utilisé est un spectromètre X7CCT Thermo Elemental, sans la cellule dynamique de réaction. Cent trente volontaires des deux sexes, indemnes de toute affection et sans traitement médical constituent les témoins. Des fragments d'ongles sont recueillis lors de la coupe de ceux-ci. Après décontamination de 20 mg d'ongles, puis minéralisation acide, trente deux métaux et métalloïdes sont quantifiés simultanément par dilution de la solution acide obtenue. L'étalonnage est réalisé en milieu aqueux. Les dosages sont validés pour les trente deux éléments suivants : Li, Be, B, Al, V, Cr, Mn, Co, Ni, Cu, Zn, Ga, Ge, As, Se, Rb, Sr, Mo, Pd, Ag, Cd, Sn, Sb, Te, Ba, W, Pt, Hg, Tl, Pb, Bi, U. Les coefficients de régression sont supérieurs à 0,999 dans la gamme de linéarité considérée. Les limites de détection s'échelonnent de 0,04 pg/mg ou ng/g (U) à 0,1 ng/mg ou $\mu$g/g (B). Les résultats obtenus sont présentés et discutés à la lumière des concentrations publiées antérieurement. Les progrès récents de l'ICP-MS constituent un apport déterminant en biologie clinique et plus particulièrement dans le domaine de l'analyse toxicologique en raison de la puissance de l'outil. Son application à l'analyse multiélémentaire des métaux dans les ongles offre des perspectives complémentaires à l'analyse des ongles pour la recherche d'expositions au long cours ou d'intoxications chroniques. De plus, en raison de la structure particulière de l'ongle, ce phanère pourrait être proposé pour la surveillance professionnelle, environnementale ou domestique aux éléments métalliques, ainsi que pour la réalisation d'études épidémiologiques

Valeurs usuelles des métaux et métalloïdes dans le sang total et les urines par ICP-MS chez cinquante-quatre sujets décédés

Chez un quart des sujets pour lesquels une autopsie médicolégale est demandée, une cause toxique de décès est identifiée. La recherche des causes toxiques de la mort fait appel à des techniques chromatographiques couplées : barrette de diodes, spectrométrie de masse. Il s'agit de méthodes très performantes pour de nombreux xénobiotiques organiques (médicaments, pesticides, substances variées), mais elles ne permettent pas de mettre en évidence des poisons minéraux. Pour ces derniers, un certain nombre d'analyses spécifiques, longues et fastidieuses sont nécessaires avec au minimum les dosages des cyanures et du lithium dans le cadre de l'expertise toxicologique de référence. Parmi les investigations complémentaires, la mesure des métaux et des métalloïdes est le plus souvent effectuée par spectrométrie d'absorption atomique en mode monoélémentaire. Aussi nous proposons le dosage simultané d'une trentaine de métaux et métalloïdes dans les prélèvements autopsiques sanguins et urinaires par plasma à couplage inductif relié à un spectromètre de masse (ICP-MS) pour rechercher une exposition à l'un de ces éléments. Les mesures sont réalisées sur spectromètre X7CCT Thermo Elemental (ThermoOptek, Courtabœuf, France), équipé d'un passeur d'échantillon et du logiciel PlasmaLab selon une technique déjà décrite. Trente et un éléments sont quantifiés simultanément dans du sang prélevé sur fluorure et dans les urines : Li, Be, B, A1, Mn, Co, Ni, Cu, Zn, Ga, Ge, As, Se, Br, Rb, Sr, Mo, Pd, Ag, Cd, Sn, Sb, Te, Ba, W, Pt, Hg, Tl, Pb, Bi, U. Le vanadium est le trente deuxième élément mesuré dans les urines. La détermination du brome est effectuée de manière semi-quantitative. Les dosages sont réalisés dans le sang total et les urines selon la méthode des ajouts dosés par dilution des échantillons en milieu acide en présence de butanol et de triton. Des valeurs fréquentes dans nos conditions de recueil sont établies chez des sujets dont le décès n'est pas imputable à l'un de ces minéraux. L'impact des contenants sur les résultats obtenus a également été évalué. La validité des résultats est garantie par la participation de notre laboratoire au contrôle de la qualité par ICP-MS dans le sang total, les urines et les cheveux, organisé par l'institut National de Santé Publique du Québec (Sainte-Foy, Canada). Les limites de détection et de quantification calculées sont excellentes et les scores obtenus au contrôle de qualité sont bons. Les valeurs fréquentes dans le sang total et les urines de 54 sujets décédés sont établies pour l'ensemble des éléments. Les applications sont nombreuses : le dosage multiélémentaire permet au cours d'une même analyse de rechercher une exposition à des poisons métalloïdiques ou métalliques (As, Tl), à des métaux lourds (Pb, Cd, Hg), à des métaux variés (Al, Co, Ni, Mo, W), à des médicaments (Li, Pt, Bi, Al), à des pesticides (As, Pb, Br, Al, Ba, Hg, Se, Cu), à des bombes fumigènes (Zn, Al), à des halogénures (Br, I), à des lanthanides (Ce, La, Gd), ou à des uranides (Th, U). L'intérêt de la détermination du strontium et du brome dans le diagnostic de noyade en milieu contaminé par ces éléments est rappelé. La technique est également applicable à d'autres matrices biologiques : cheveux et ongles en particulier. L'ICP-MS offre ainsi des perspectives réellement nouvelles en toxicologie médico-légale. Le dosage multiélémentaire des métaux et métalloïdes devrait donc être réalisé dans tous les cas de décès inexpliqués par l'autopsie et pour lesquels l'expertise toxicologique de référence s'avère négative

Comparative Analysis of Superintegrons: Engineering Extensive Genetic Diversity in the Vibrionaceae

Integrons are natural tools for bacterial evolution and innovation. Their involvement in the capture and dissemination of antibiotic-resistance genes among Gram-negative bacteria is well documented. Recently, massive ancestral versions, the superintegrons (SIs), were discovered in the genomes of diverse proteobacterial species. SI gene cassettes with an identifiable activity encode proteins related to simple adaptive functions, including resistance, virulence, and metabolic activities, and their recruitment was interpreted as providing the host with an adaptive advantage. Here, we present extensive comparative analysis of SIs identified among the Vibrionaceae. Each was at least 100 kb in size, reaffirming the participation of SIs in the genome plasticity and heterogeneity of these species. Phylogenetic and localization data supported the sedentary nature of the functional integron platform and its coevolution with the host genome. Conversely, comparative analysis of the SI cassettes was indicative of both a wide range of origin for the entrapped genes and of an active cassette assembly process in these bacterial species. The signature attC sites of each species displayed conserved structural characteristics indicating that symmetry rather than sequence was important in the recognition of such a varied collection of target recombination sequences by a single site-specific recombinase. Our discovery of various addiction module cassettes within each of the different SIs indicates a possible role for them in the overall stability of large integron cassette arrays. [Supplemental material is available online at www.genome.org. The sequence data from this study have been submitted to GenBank under accession nos. listed in Table 1.

Intérêt du dosage de quatre éléments minéraux dans les eaux usées pour le suivi des activités médicales

Objectif : La contamination environnementale par les rejets de médicaments est un sujet d’actualité. Plutôt qu’un suivi métrologique des molécules médicamenteuses dans les eaux usées difficile à mettre en œuvre d’un point de vue analytique, nous avons cherché à valider l’intérêt d’un dosage de différents éléments métalliques marqueurs d’activités médicales. Méthode : Les eaux usées issues du Centre Hospitalier Universitaire de Rouen et celles prélevées en trois points de la station d’épuration de cette agglomération (entrée, milieu, sortie), ont été analysées quotidiennement pendant 29 jours. Quatre éléments minéraux utilisés en médecine et pouvant être considérés comme des marqueurs d’activités médicales ont été retenus : l’argent (Ag), l’iode (I), le platine (Pt) et le gadolinium (Gd). Les dosages ont été réalisés par la technique du plasma à couplage inductif équipé d’un détecteur de masse (ICP-MS). Résultats : Les limites de quantification pour ces quatre éléments sont les suivantes : 107Ag  =  0,58 μg/L – 127I  =  0,2 μg/L – 157Gd  =  0,004 μg/L – 195Pt  =  0,01 μg/L. En sortie d’hôpital, les concentrations médianes mesurées pour ces 4 métaux sont respectivement 3, 13, 13, et 27 fois plus importantes que celles relevées dans les eaux usées de l’agglomération dans lesquelles les eaux usées hospitalières sont rejetées. Dans les eaux usées hospitalières, les concentrations mesurées pour ces métaux les jours ouvrés et les jours non ouvrés (fin de semaine et jours fériés), correspondant à des périodes respectivement de forte et de faible activité médicale, montrent des différences significatives quant à l’élimination moyenne de ces éléments (1,0 × 10-5 < p < 2,0 × 10-4). Conclusion : L’argent, l’iode, le gadolinium et le platine sont des marqueurs pertinents d’activités médicales hospitalières. Ce sont des éléments du diagnostic radiologique pour l’argent nécessaire au développement des mammographies et pour le gadolinium produit de contraste injecté dans les IRM. L’iode est largement utilisé dans le domaine médical et le platine est prescrit en thérapeutique anticancéreuse

Validation d'une technique de dosage multiélémentaire des métaux et métalloïdes dans les cheveux par ICP-MS. Valeurs de référence chez 45 témoins

Nous décrivons une technique de dosage simultané de trente deux éléments minéraux dans les cheveux, par plasma à couplage inductif relié à un détecteur de masse (ICP-MS). L'appareil utilisé est un spectromètre X7CCT Thermo Elemental, sans cellule dynamique de réaction. Quarante cinq volontaires des deux sexes, indemnes de toute affection et sans traitement médical constituent les témoins. Une mèche de cheveux est prélevée au niveau du vertex postérieur: Après decontamination de 25 mg de cheveux, puis minéralisation acide, trente deux métaux et métalloïdes sont quantifiés simultanément par dilution de la solution acide obtenue. L'étalonnage est réalisé en milieu aqueux. Les dosages sont validés pour les métaux suivants : Li, Be, B, Al, V, Cr; Mn, Co, Ni, Cu, Zn, Ga, Ge, As, Se, Rb, Sr; Mo, Pd, Ag, Cd, Sri, Sb, Te, Ba, W, Pt, Hg, Tl, Pb, Bi, U. Les coefficients de régression sont supérieurs à 0,999 dans la gamme de linéarité considérée. Les limites de quantification s'échelonnent de 0,2 pg/mg (Tl, Pt, U) à 0,5 ng/mg (B). Les valeurs obtenues sont présentées et discutées à la lumière des rares données disponibles. Les progrès récents de VICP-MS constituent un apport déterminant en biologie clinique et plus particulièrement dans le domaine de l'analyse toxicologique en raison de la puissance de l'outil. Son application à l'analyse multiélémentaire des métaux dans les cheveux offre des perspectives nouvelles tant pour la. recherche d'intoxications en toxicologie clinique ou judiciaire que pour la surveillance d'expositions professionnelles ou environnementales