Estudios computacionales de sistemas orgánicos y bioorgánicos

Tesis (Doctor en Ciencias Químicas) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2016El trabajo expuesto en la presente tesis doctoral se llevó a cabo aplicando métodos y modelos de la química computacional. Específicamente, los sistemas abordados se modelaron y simularon utilizando métodos de la mecánica molecular clásica como docking molecular y dinámica molecular (DM), y métodos cuánticos como la teoría del funcional de la densidad (DFT). Estos métodos se presentan en forma general en el Capítulo 1 de esta tesis. El trabajo de tesis gira en torno de dos ejes principales. El primero está vinculado al estudio de complejos formados entre la enzima acetilcolinesterasa (AChE) e inhibidores de la misma. Además, en esta parte se expone el desarrollo de un modelo lineal de predicción de actividad de inhibidores duales de dicha enzima. Por otra parte, el segundo eje está relacionado al estudio del desempeño de distintos funcionales y modelos de DFT en el modelado de aniones orgánicos inestables. Particularmente, el primer eje temático se encuentra dividido en tres temas fundamentales. En el primero: “Estudio de interacciones entre AChE y alcaloides del Lycopodium extraídos de la Huperzia Saururus” (Capítulo 3) se describen y comparan los modos de unión de inhibidores alcaloides de Lycopodium y huperzina A con AChE. Para cada complejo obtenido se determinó la energía de unión con los métodos MM-PBSA y MM-GBSA. Se encontró que la unión en el sitio activo se ve favorecida en todos los compuestos activos. Además, el método MM-GBSA predijo los valores de energía de unión en concordancia con los valores de actividad experimental. En la segunda parte, titulada “Derivados de Solanocapsina como Potenciales Inhibidores de la Enzima AChE” (Capítulo 4) se estudian las interacciones globales de inhibidores duales con la enzima. Para el conjunto de ligandos estudiados, se encontraron dos modos de unión principales, y mediante DM y una descomposición de la energía de unión se pudo demostrar que los residuos Trp84, Phe330, Trp279, Phe331, Asp72, Tyr334 y Ser286 son fundamentales para la actividad de los mismos. Por último, en el tercer tema: “Modelo Lineal de Predicción de Inhibidores duales de la enzima AChE” (Capítulo 5) se busca un modelo de predicción de inhibidores duales empleando un conjunto de entrenamiento de inhibidores informados en bibliografía. El modelo fue construido correlacionando de manera lineal los valores de energía de unión e índices de eficiencia con la actividad biológica. Por otro lado, en el segundo eje, titulado “Estudio del Desempeño de Funcionales de DFT para el Modelado de Aniones” (Capítulo 7) se evaluó la capacidad de 23 funcionales de DFT y el método ab initio MP2 para modelar correctamente aniones inestables. Para encontrar los mejores funcionales y evaluar sus ventajas y limitaciones se emplearon como indicadores las propiedades de afinidad electrónica (AE) y potenciales de reducción de moléculas orgánicas de tamaño medio. En términos generales, se encontró que los funcionales híbridos son los mejores para el cálculo de AEs. En cambio, en el cómputo de potenciales de reducción los funcionales GGA funcionaron realmente bien. Como se puede notar, durante la tesis se estudiaron sistemas de tamaño pequeño (menor a 50 átomos), los cuales fueron modelados con métodos de la química cuántica explorando distintas metodologías modernas para el cómputo de propiedades como la AE y los potenciales de reducción. Además, se abordaron sistemas de tamaño más grande (16000 átomos aproximadamente) con métodos de mecánica molecular aplicados al entendimiento de la unión de inhibidores de distinta naturaleza de la AChE y la propuesta de un modelo lineal de inhibidores duales.Borioni, José Luis. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentina.Pierini, Adriana Beatriz. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Orgánica; Argentina.Puiatti, Marcelo.Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Fisicoquímica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoquímica de Córdoba; Argentina.Quevedo, Mario Alfredo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Ciencias Farmacéuticas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Investigación y Desarrollo en Tecnología Farmacéutica; Argentina.Borosky, Gabriela Leonor. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Físico – Química de Córdoba; Argentina.Enriz, Ricardo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Investigaciones Biológicas de San Luis; Argentina

Study of the interaction of Huperzia saururus Lycopodium alkaloids with the Acetylcholinesterase enzyme

In the present study, we describe and compare the binding modes of three Lycopodium alkaloids (sauroine, 6-hydroxylycopodine and sauroxine; isolated from Huperzia saururus) and huperzine A with the enzyme acetylcholinesterase. Refinement and rescoring of the docking poses (obtained with different programs) with an all atom force field helped to improve the quality of the protein?ligand complexes. Molecular dynamics simulations were performed to investigate the complexes and the alkaloid´s binding modes. The combination of the latter two methodologies indicated that binding in the active site is favored for the active compounds. On the other hand, similar binding energies in both the active and the peripheral sites were obtained for sauroine, thus explaining its experimentally determined lack of activity. MM-GBSA predicted the order of binding energies in agreement with the experimental IC50 valuesFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; ArgentinaFil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; ArgentinaFil: Vallejo, Mariana Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Cabrera, Jose Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Agnese, Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Ortega, María Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; Argentin

Clinanthus microstephium, an Amaryllidaceae species with Cholinesterase Inhibitor Alkaloids: Structure−Activity analysis of Haemanthamine skeleton derivatives

Plants of the Amaryllidaceae family are well-known (not only) for their ornamental value but also for the alkaloids that they produce. In this report, the first phytochemical study of Clinanthus genus was carried out. The chemical composition of alkaloid fractions from Clinanthus microstephium was analyzed by GC/MS and NMR. Seven known compounds belonging to three structural types of Amaryllidaceae alkaloids were identified. An epimeric mixture of a haemanthamine-type compound (6-hydroxymaritidine) was tested as an inhibitor against acetyl- and butyrylcholinesterase enzymes (AChE and BChE, respectively), two enzymes relevant in the treatment of Alzheimer's disease, with good results. Structure–activity relationships through molecular docking studies with this alkaloid and other structurally related compounds were discussed.Fil: Adessi Cofré, Tonino Graziano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Borioni, José Luis. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Pigni, Natalia Belen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Ciencia y Tecnología de Alimentos Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Ciencia y Tecnología de Alimentos Córdoba; ArgentinaFil: Bastida, Jaume. Universidad de Barcelona; EspañaFil: Cavallaro, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Murray, Ana Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Oberti, Juan Carlos María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Leiva González, Segundo. Universidad Privada Atenor Orrego. Museo de Historia Natural; PerúFil: Nicotra, Viviana Estela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: García, Manuela Emila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentin

Insecticidal activity of the essential oil of Schinus areira against Rhipibruchus picturatus (F.) (Coleoptera: Bruchinae), and its inhibitory effects on acetylcholinesterase

During the storage of Prosopis alba pods, substantial quantitative and qualitative losses were observed. One of the main factors is the seed beetle Rhipibruchus picturatus. A key strategy to develop new pest control management is the use of essential oils (EOs) due they are efficient, less toxic, and less persistent in the environment compared to synthetic pesticides. In this context, seeds and leaves of Schinus areira L. (Anacardiaceae) EOs and Citrus spp. EO were studied in the present work. In the leaves of S. areira EO, 1-epi-cadinol, sesquiterpenoid alcohol, was the major compound. On the other hand, the main compounds of the EO extracted from S. areira seeds are the monoterpenes sabinene, and α-pinene. Finally, in the Citrus EO, limonene is the principal component. The three EOs obtained exhibited insecticidal activity against R. picturatus, being the first report of the use of EOs against this insect pest. The best insecticidal results were obtained with the leaves of S. areira EO. Moreover, this EO inhibits the acetylcholinesterase enzyme in vitro assays. Molecular docking studies on acetylcholinesterase (AChE) suggest that the main components of the leaves of S, areira EOs, bind to the active site of the enzyme, in good agreement with in vitro competitive inhibition against AChE observed for this EO. The data obtained demonstrate the potential use of Schinus areira EOs in the development of new storage pest control strategies.Fil: Tapia Mattar, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Agronomía y Agroindustrias; ArgentinaFil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Hollmann, Axel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet Noa Sur. Centro de Investigación en Biofísica Aplicada y Alimentos. - Universidad Nacional de Santiago del Estero. Centro de Investigación en Biofísica Aplicada y Alimentos; ArgentinaFil: Rodríguez, Sergio Antonio. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Agronomía y Agroindustrias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

1-Substituted Perylene Derivatives by Anionic Cyclodehydrogenation: Analysis of the Reaction Mechanism

Perylene derivatives constitute a promising class of compounds with technological applications mainly due to their optoelectronic properties. One mechanism proposed to synthesize them, starting from binaphthyl derivatives, is anionic cyclodehydrogenation (under reductive conditions). However, the scope of this reaction is limited. In the present study, we report a theoretical and experimental analysis of this particular reaction mechanism for its use in the synthesis of 1-substituted perylenes. Different substituents at position 2 of 1,1′-binaphthalene were evaluated: -OCH3, -OSi(CH3)2C(CH3)3, and -N(CH3)2. Based on density functional theory (DFT) calculations on the proposed mechanism, we suggest that the cyclization takes place from binaphthyl dianion instead of its radical anion. This dianion has an open-shell diradical nature, and this could be the species that was detected by EPR in previous studies. The O-substituted derivatives could not afford the perylene derivatives since their radical anions fragment and the necessary binaphthyl dianion could not be formed. On the other hand, 49% of N,N-dimethylperylen-1-amine was obtained starting from the N-substituted 2-binapthyl derivative as a substrate, employing a simpler experimental methodology.Fil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Baumgartner, Maria Teresa del V.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Jimenez, Liliana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentin

Synthesis of triaryls: hydroxy and amine dinaphthyl anddiphenanthryl aryls by one-pot electron-transfer nucleophilicsubstitution reactions

A new one-pot synthetic route to achieve the preparation of hydroxy and amine binaphthyl and biphenanthryl aryls is here reported. This approach involves the reaction of 1,4-bromoiodobenzene, 4,4′-diiodobiphenyl, and 1,4- and 1,5-diiodonaphthalene with the anions of 2-naphthylamine, 2-naphthol, and 9-phenanthrylamine under irradiation in liquid ammonia. The reactions proceed to afford triaryl derivatives in moderate to good yields (∼45% of 1,4-phenylene- and 1,4-naphthylene-1,1′-dinaphthalen-2-ols as well as 1,4-phenylene-1,1′-dinaphthalen-2-amine and 10,10′-diphenanthren-9-amine). Lower yields (27%) of polyaryl derivatives are obtained by reaction of 4,4′-diiodobiphenyl with anions of 2-naphthol and 9-phenanthrylamineFil: Jimenez, Liliana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; ArgentinaFil: Torres, Natalia Vanesa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones en Ciencias de la Tierra; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentin

In search of the best DFT functional for dealing wi th organic anionic species

Quantum chemical computational methods are thought to have problems in dealing with unstable organic anions. This work assesses the ability of different Density Functional Theory (DFT) functionals to reproduce the electron affinity and reduction potential of organic compounds. The performance of 23 DFT functionals was evaluated by computing the negative electron affinities (from 0 eV to −3.0 eV) and reduction potentials in acetonitrile (from 0 to −2.7 V). In general, most of the hybrid GGA functionals work fine in the prediction of electron affinities, BPW91, B3PW91 and M06 being the best in each class of functionals (pure, hybrid and meta-GGA functionals, respectively). On the other hand, the ab initio post-Hartree–Fock methods, MP2 and coupled-cluster (CCSD(T)), as well as the double hybrid functionals, B2PLYP and mPW2PLYP, usually fail. For compounds with EAs lower than −1.75 eV, a method for stabilizing the anion, based on solvation with the IEFPCM model, was employed. In this case, BPW91, PBE0 and M06-HF could be the recommended option for the pure, hybrid and meta-GGA functionals, respectively. The situation improves for the evaluation and prediction of redox potentials. In this case the performance of the DFT functionals is better, in part because the solvent assists in the stabilization of the anions. Nevertheless, there is a systematic bias in the calculation of absolute redox potentials, which could be corrected by using a redox partner that helps by the cancellation of errors. In this case, the hybrid and meta-GGA functionals B3PW91, PBE0, TPSSh and M06 are also among the best for computing redox potentials with a mean absolute deviation (MAD) lower than 0.13 V.Fil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Vera, Domingo Mariano Adolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología; ArgentinaFil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentin

Design, synthesis and evaluation of cholinesterase hybrid inhibitors using a natural steroidal alkaloid as precursor

To date, Alzheimers disease is the most alarming neurodegenerative disorder worldwide. This illness is multifactorialin nature and cholinesterase inhibitors have been the ones used in clinical treatments. In this context,many of these drugs selectively inhibit the acetylcholinesterase enzyme interacting in both the active site and theperipheric anionic site. Besides, some agents have exhibited extensive benefits being able to co-inhibitbutyrylcholinesterase.In this contribution, a strategy previously explored by numerous authors is reported; the synthesis of hybridcholinesterase inhibitors. This strategy uses a molecule of recognized high inhibitory activity (tacrine) togetherwith a steroidal alkaloid of natural origin using different connectors. The biological assays demonstrated theimprovement in the inhibitory activity compared to the alkaloidal precursor, together with the reinforcement ofthe interactions in multiple sites of the enzymatic cavity. This strategy should be explored and exploited in thisarea.Docking and molecular dynamic studies were performed to explain enzyme-ligand interactions, assisting astructure activity relationship analysis.Fil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Cavallaro, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Murray, Ana Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Peñeñory, Alicia Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: García, Manuela Emila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentin

An activity prediction model for steroidal and triterpenoidal inhibitors of acetylcholinesterase enzyme

Nowadays, the importance of computational methods in the design of therapeutic agents in a more efficient way is indisputable. Particularly, these methods have been important in the design of novel acetylcholinesterase enzyme inhibitors related to Alzheimer’s disease. In this sense, in this report a computational model of linear prediction of acetylcholinesterase inhibitory activity of steroids and triterpenes is presented. The model is based in a correlation between binding energies obtained from molecular dynamic simulations (after docking studies) and IC50 values of a training set. This set includes a family of natural and semi-synthetic structurally related alkaloids reported in bibliography. These types of compounds, with some structural complexity, could be used as building blocks for the synthesis of many important biologically active compounds Therefore, the present study proposes an alternative based on the use of conventional and easily accessible tools to make progress on the rational design of molecules with biological activity.Fil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Cavallaro, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Murray, Ana Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Química del Sur. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química. Instituto de Química del Sur; ArgentinaFil: Peñeñory, Alicia Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: García, Manuela Emila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentin