Genetic variation in tropical Meloidogyne spp. as shown by RAPDs

La technique des RAPD a été utilisée pour évaluer la variabilité intra- et inter-spécifique chez des lignées de #Meloidogyne tropicaux. La reproductibilité de la technique a été évaluée ; pour chaque couple "amorce - ADN testé", l'ADN des différentes lignées de #Meloidogyne testées n'est pas en cause pour expliquer les différences de reproductibilité ; ce sont les amorces qui en sont responsables, certaines se révélant meilleures que d'autres en terme de reproductibilité des résultats et donc de fiabilité. #M. arenaria montre la variabilité intraspécifique la plus importante ; quelques amorces seulement suffisent à distinguer les espèces bien que les données produites par certaines d'entre elles révèlent plus de similitude entre certaines lignées de #M. arenaria et de #M. javanica qu'au sein même du groupe de lignées de #M. arenaria. Trois lignées virulentes de #M. arenaria peuvent être distinguées tant des autres lignées, non virulentes, de #M. arenaria que des autres lignées de #M. javanica, #M. incognita, #M. mayaguensis et #M. hapla. La comparaison des données obtenues sur le même jeu de lignées par RFLP et RAPD révèle des valeurs équivalentes en terme de différence interspécifique mais la technique des RAPD met en évidence une variation plus importante au niveau intraspécifique. (Résumé d'auteur

An RFLP study of relationships between species, populations and resistance-breaking lines of tropical species of Meloidogyne

Afin d'établir l'identité de certaines espèces de #Meloidogyne, caractérisées par le phénotype estérasique pVI et pouvant se développer sur certains cultivars résistants, six de ces lignées sont comparées par RFLP à dix lignées de #M. incognita, sept de #M. arenaria, quatre de #M. javanica, une de #M. hapla et une de #M. mayaguensis. Deux groupes très homogènes sont identifiés : le premier comprend les lignées de #M. incognita, le deuxième les lignées pVI et la lignée de #M. mayaguensis; un troisième, plus variable, regroupe les lignées appartenant à #M. arenaria et à #M. javanica. Les lignées se développant sur cultivars résistants et dotées du phénotype pVI apparaissent comme une espèce distincte, #M. mayaguensis$, et non comme la conséquence de la sélection, par l'usage de cultivars résistants, de variants parmi les espèces tropicales. (Résumé d'auteur

Dark Energy and Extending the Geodesic Equations of Motion: Connecting the Galactic and Cosmological Length Scales

Recently, an extension of the geodesic equations of motion using the Dark Energy length scale was proposed. Here, we apply this extension to the analyzing the motion of test particles at the galactic scale and longer. A cosmological check of the extension is made using the observed rotational velocity curves and core sizes of 1393 spiral galaxies. We derive the density profile of a model galaxy using this extension, and with it, we calculate $\sigma_8$ to be $0.73_{\pm 0.12}$; this is within experimental error of the WMAP value of $0.761_{-0.048}^{+0.049}$. We then calculate $R_{200}$ to be $206_{\pm 53}$ kpc, which is in reasonable agreement with observations.Comment: 25 pages. Accepted for publication in General Relativity and Gravitation. Paper contains the published version of the second half of arXiv:0711.3124v2 with corrections include

Population dynamics of the potato cyst nematode, Globodera pallida , in relation to temperature, potato cultivar and nematicide application

The impact of increasing temperatures on the population dynamics of the soil‐dwelling nematode Globodera pallida, a persistent and economically important pest of potatoes, was investigated. The reproductive factor (final population⁄initial population) and length of life cycle were found to be temperature sensitive. Pot experiments performed over 4 months allowed comparison of the effect on development of G. pallida of two temperature regimes: an average temperature comparable to current field conditions (14.3 °C) and an average temperature above current field conditions (17.3 °C). A larger second generation of juveniles was observed at 17.3 °C compared to 14.3 °C. Multiplication of G. pallida at field sites in Shropshire and East Lothian (average soil temperatures of 15.5 and 14.1 °C, respectively, during potato cropping) was also examined. A quantitative PCR assay and visual examination of roots were used to monitor the dynamics of the G. pallida populations in both field sites at 4‐weekly intervals. Four cultivars, Desirée, Cara, Maris Piper and Estima, were grown with and without nematicide treatments. Nematicide treatments suppressed population increases at both sites. Females were observed on the roots of cvs Cara and Desirée at the end of the growing season in Shropshire, but not at East Lothian, and are likely to represent a second generation

Resolution of dark matter problem in f(T) gravity

In this paper, we attempt to resolve the dark matter problem in f(T) gravity. Specifically, from our model we successfully obtain the flat rotation curves of galaxies containing dark matter. Further, we obtain the density profile of dark matter in galaxies. Comparison of our analytical results shows that our torsion-based toy model for dark matter is in good agreement with empirical data-based models. It shows that we can address the dark matter as an effect of torsion of the space.Comment: 14 pages, 3 figure

Understanding Galaxy Formation and Evolution

The old dream of integrating into one the study of micro and macrocosmos is now a reality. Cosmology, astrophysics, and particle physics intersect in a scenario (but still not a theory) of cosmic structure formation and evolution called Lambda Cold Dark Matter (LCDM) model. This scenario emerged mainly to explain the origin of galaxies. In these lecture notes, I first present a review of the main galaxy properties, highlighting the questions that any theory of galaxy formation should explain. Then, the cosmological framework and the main aspects of primordial perturbation generation and evolution are pedagogically detached. Next, I focus on the ``dark side'' of galaxy formation, presenting a review on LCDM halo assembling and properties, and on the main candidates for non-baryonic dark matter. It is shown how the nature of elemental particles can influence on the features of galaxies and their systems. Finally, the complex processes of baryon dissipation inside the non-linearly evolving CDM halos, formation of disks and spheroids, and transformation of gas into stars are briefly described, remarking on the possibility of a few driving factors and parameters able to explain the main body of galaxy properties. A summary and a discussion of some of the issues and open problems of the LCDM paradigm are given in the final part of these notes.Comment: 50 pages, 10 low-resolution figures (for normal-resolution, DOWNLOAD THE PAPER (PDF, 1.9 Mb) FROM http://www.astroscu.unam.mx/~avila/avila.pdf). Lectures given at the IV Mexican School of Astrophysics, July 18-25, 2005 (submitted to the Editors on March 15, 2006

The use of repeat sequence primers for investigating genetic diversity between populations of potato cyst nematodes with differing virulence

De nombreuses techniques biochimiques et moléculaires ont été utilisées pour l'étude de la variabilité génétique des nématodes à kystes de la pomme de terre en vue de trouver des marqueurs liés aux pathotypes ou de définir des groupements à caractéristiques biologiques. Au cours de la présente étude ont été utilisées des amorces en séquence répétitive simple (SSR) appliquées à des populations de #Globodera rostochiensis et #G. pallida. Huit de ces SSR ont été testées dont trois donnent des résultats reproductibles. Les résultats obtenus permettent une séparation nette des deux espèces de même qu'une différenciation entre populations d'une même espèce. Certains des groupements obtenus paraissent plus liés à l'origine géographique qu'aux caractéristiques de virulence. (Résumé d'auteur