Epigenome-wide association study and epigenetic age acceleration associated with cigarette smoking among Costa Rican adults

Smoking-associated DNA methylation (DNAm) signatures are reproducible among studies of mostly European descent, with mixed evidence if smoking accelerates epigenetic aging and its relationship to longevity. We evaluated smoking-associated DNAm signatures in the Costa Rican Study on Longevity and Healthy Aging (CRELES), including participants from the high longevity region of Nicoya. We measured genome-wide DNAm in leukocytes, tested Epigenetic Age Acceleration (EAA) from five clocks and estimates of telomere length (DNAmTL), and examined effect modification by the high longevity region. 489 participants had a mean (SD) age of 79.4 (10.8) years, and 18% were from Nicoya. Overall, 7.6% reported currently smoking, 35% were former smokers, and 57.4% never smoked. 46 CpGs and five regions (e.g. AHRR, SCARNA6/SNORD39, SNORA20, and F2RL3) were differentially methylated for current smokers. Former smokers had increased Horvath’s EAA (1.69-years; 95% CI 0.72, 2.67), Hannum’s EAA (0.77-years; 95% CI 0.01, 1.52), GrimAge (2.34-years; 95% CI1.66, 3.02), extrinsic EAA (1.27-years; 95% CI 0.34, 2.21), intrinsic EAA (1.03-years; 95% CI 0.12, 1.94) and shorter DNAmTL (− 0.04-kb; 95% CI − 0.08, − 0.01) relative to non-smokers. There was no evidence of effect modification among residents of Nicoya. Our findings recapitulate previously reported and novel smoking-associated DNAm changes in a Latino cohort

Epigenome-Wide Association Study and Epigenetic Age Acceleration Associated with Cigarette Smoking among Costa Rican Adults

Smoking-associated DNA methylation (DNAm) signatures are reproducible among studies of mostly European descent, with mixed evidence if smoking accelerates epigenetic aging and its relationship to longevity. We evaluated smoking-associated DNAm signatures in the Costa Rican Study on Longevity and Healthy Aging (CRELES), including participants from the high longevity region of Nicoya. We measured genome-wide DNAm in leukocytes, tested Epigenetic Age Acceleration (EAA) from five clocks and estimates of telomere length (DNAmTL), and examined effect modification by the high longevity region. 489 participants had a mean (SD) age of 79.4 (10.8) years, and 18% were from Nicoya. Overall, 7.6% reported currently smoking, 35% were former smokers, and 57.4% never smoked. 46 CpGs and five regions (e.g. AHRR, SCARNA6/SNORD39, SNORA20, and F2RL3) were differentially methylated for current smokers. Former smokers had increased Horvath’s EAA (1.69-years; 95% CI 0.72, 2.67), Hannum’s EAA (0.77-years; 95% CI 0.01, 1.52), GrimAge (2.34-years; 95% CI1.66, 3.02), extrinsic EAA (1.27-years; 95% CI 0.34, 2.21), intrinsic EAA (1.03-years; 95% CI 0.12, 1.94) and shorter DNAmTL (− 0.04-kb; 95% CI − 0.08, − 0.01) relative to non-smokers. There was no evidence of effect modification among residents of Nicoya. Our findings recapitulate previously reported and novel smoking-associated DNAm changes in a Latino cohort.UC Berkeley Center on the Economics and Demography of Aging/[]//Estados UnidosUnited States National Institutes of Health/[]//Estados UnidosUCR::Vicerrectoría de Docencia::Salud::Facultad de Medicina::Escuela de Tecnologías en SaludUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Sociales::Centro Centroamericano de Población (CCP

A Strong B-cell Response Is Part of the Immune Landscape in Human High-Grade Serous Ovarian Metastases

In high-grade serous ovarian cancer (HGSOC), higher densities of both B cells and the CD8 + T-cell infiltrate were associated with a better prognosis. However, the precise role of B cells in the antitumor response remains unknown. As peritoneal metastases are often responsible for relapse, our aim was to characterize the role of B cells in the antitumor immune response in HGSOC metastases. Unmatched pre and post-chemotherapy HGSOC metastases were studied. B-cell localization was assessed by immunostaining. Their cytokines and chemokines were measured by a multiplex assay, and their phenotype was assessed by flow cytometry. Further in vitro and in vivo assays highlighted the role of B cells and plasma cell IgGs in the development of cytotoxic responses and dendritic cell activation. B cells mainly infiltrated lymphoid structures in the stroma of HGSOC metastases. There was a strong B-cell memory response directed at a restricted repertoire of antigens and production of tumor-specific IgGs by plasma cells. These responses were enhanced by chemotherapy. Interestingly, transcript levels of CD20 correlated with markers of immune cytolytic responses and immune complexes with tumor-derived IgGs stimulated the expression of the costimulatory molecule CD86 on antigen-presenting cells. A positive role for B cells in the antitumor response was also supported by B-cell depletion in a syngeneic mouse model of peritoneal metastasis. Our data showed that B cells infiltrating HGSOC omental metastases support the development of an antitumor response. Clin Cancer Res; 1-13. ©2016 AACR

Characterization of cell lines derived from breast cancers and normal mammary tissues for the study of the intrinsic molecular subtypes

Five molecular subtypes (luminal A, luminal B, HER2-enriched, basal-like, and claudin-low) with clinical implications exist in breast cancer. Here, we evaluated the molecular and phenotypic relationships of (1) a large in vitro panel of human breast cancer cell lines (BCCLs), human mammary fibroblasts (HMFs), and human mammary epithelial cells (HMECs); (2) in vivo breast tumors; (3) normal breast cell subpopulations; (4) human embryonic stem cells (hESCs); and (5) bone marrow-derived mesenchymal stem cells (hMSC). First, by integrating genomic data of 337 breast tumor samples with 93 cell lines we were able to identify all the intrinsic tumor subtypes in the cell lines, except for luminal A. Secondly, we observed that the cell lines recapitulate the differentiation hierarchy detected in the normal mammary gland, with claudin-low BCCLs and HMFs cells showing a stromal phenotype, HMECs showing a mammary stem cell/bipotent progenitor phenotype, basal-like cells showing a luminal progenitor phenotype, and luminal B cell lines showing a mature luminal phenotype. Thirdly, we identified basal-like and highly migratory claudin-low subpopulations of cells within a subset of triple-negative BCCLs (SUM149PT, HCC1143, and HCC38). Interestingly, both subpopulations within SUM149PT were enriched for tumor-initiating cells, but the basal-like subpopulation grew tumors faster than the claudin-low subpopulation. Finally, claudin-low BCCLs resembled the phenotype of hMSCs, whereas hESCs cells showed an epithelial phenotype without basal or luminal differentiation. The results presented here help to improve our understanding of the wide range of breast cancer cell line models through the appropriate pairing of cell lines with relevant in vivo tumor and normal cell counterparts.Electronic supplementary materialThe online version of this article (doi:10.1007/s10549-013-2743-3) contains supplementary material, which is available to authorized users

Peptide/MHC Tetramer-Based Sorting of CD8+ T Cells to a Leukemia Antigen Yields Clonotypes Drawn Nonspecifically from an Underlying Restricted Repertoire

Testing of T cell-based cancer therapeutics often involves measuring cancer antigen-specific T-cell populations with the assumption that they arise from in vivo clonal expansion. This analysis, using peptide/MHC tetramers, is often ambiguous

Characterization of cell lines derived from breast cancers and normal mammary tissues for the study of the intrinsic molecular subtypes

Five molecular subtypes (luminal A, luminal B, HER2-enriched, basal-like, and claudin-low) with clinical implications exist in breast cancer. Here, we evaluated the molecular and phenotypic relationships of (1) a large in vitro panel of human breast cancer cell lines (BCCLs), human mammary fibroblasts (HMFs), and human mammary epithelial cells (HMECs); (2) in vivo breast tumors; (3) normal breast cell subpopulations; (4) human embryonic stem cells (hESCs); and (5) bone marrow-derived mesenchymal stem cells (hMSC). First, by integrating genomic data of 337 breast tumor samples with 93 cell lines we were able to identify all the intrinsic tumor subtypes in the cell lines, except for luminal A. Secondly, we observed that the cell lines recapitulate the differentiation hierarchy detected in the normal mammary gland, with claudin-low BCCLs and HMFs cells showing a stromal phenotype, HMECs showing a mammary stem cell/bipotent progenitor phenotype, basal-like cells showing a luminal progenitor phenotype, and luminal B cell lines showing a mature luminal phenotype. Thirdly, we identified basal-like and highly migratory claudin-low subpopulations of cells within a subset of triple-negative BCCLs (SUM149PT, HCC1143, and HCC38). Interestingly, both subpopulations within SUM149PT were enriched for tumor-initiating cells, but the basal-like subpopulation grew tumors faster than the claudin-low subpopulation. Finally, claudin-low BCCLs resembled the phenotype of hMSCs, whereas hESCs cells showed an epithelial phenotype without basal or luminal differentiation. The results presented here help to improve our understanding of the wide range of breast cancer cell line models through the appropriate pairing of cell lines with relevant in vivo tumor and normal cell counterparts. ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL: The online version of this article (doi:10.1007/s10549-013-2743-3) contains supplementary material, which is available to authorized users

Bridging Social Capital through the Techno-subsystem: A Qualitative Analysis of GoFundMe Requests for Hurricane Relief

Disaster planning and risk communication are not always effective in preparation for devastating storms, and families are left to pick up the pieces as they rebuild their lives. Social capital theory poses that social connectedness and bonds between family members and friends are especially important in times of need. Recently, requesting financial assistance via crowdfunding has emerged as an alternative method for seeking assistance after a hurricane. Drawing from social capital and ecological systems theories, we qualitatively explore how requests for hurricane relief are framed via the crowdfunding website, GoFundMe.com. Among our sample (N = 26), we find that requests for financial assistance following Hurricane Florence were framed around discussions of need and worthiness of help. We also discover that rather than emphasize their own personal needs, requesters focused their narratives on their relationships with others and others’ needs. Our findings point to how crowdfunding websites, such as GoFundMe.com have the potential to help bridge social capital through the techno-subsystem to provide disaster relief for individuals and their families

Asegurar un mañana más saludable en Centroamérica: proteger la salud sexual y reproductiva de la juventud de hoy

libro -- Universidad de Costa Rica, Instituto de Investigaciones en Salud. 2008. Libro publicado por Guttmacher Institute, New York.Es urgente proteger la salud sexual y reproductiva de la juventud centroamericana de hoy. Las tasas de maternidad adolescente en El Salvador, Guatemala, Honduras y Nicaragua son, por mucho, las tasas más altas de toda América Latina. Además, la actual prevalencia del VIH ha sobrepasado el umbral de 1% para convertirse en una epidemia generalizada en Honduras; y se está acercando a ese nivel en El Salvador y Guatemala. Preservar la salud de los jóvenes no es sólo importante para la juventud misma; también es una prioridad vital para el desarrollo. Este informe, basado en encuestas nacionales recientes, presenta patrones y tendencias clave en la conducta sexual y reproductiva de jóvenes de 15–24 años en esos cuatro países, e identifica brechas y necesidades importantes. Las normas tradicionales de género socavan la salud de ambos sexos En un clima cultural en donde la actividad sexual es mal vista para las mujeres solteras pero permitida o incluso alentada para los hombres solteros, los niveles reportados de actividad sexual de la gente joven difieren ampliamente según el sexo. Altas proporciones de personas de 20–24 años (58–67% de mujeres y 79–92% de hombres) inician la actividad sexual antes de cumplir los 20 años. Para las mujeres jóvenes, la mayor parte de la actividad sexual actual ocurre dentro de una unión (formal o consensual); pero tiene lugar fuera de ella para los hombres jóvenes. En general, los hombres se involucran en conductas sexuales más riesgosas que las mujeres. De un cuarto a dos quintos de los hombres jóvenes han tenido al menos dos parejas sexuales en el último año, en comparación con proporciones insignificantes en el caso de las mujeres. Han bajado las proporciones que se unen durante la adolescencia Las uniones tempranas siguen siendo comunes para las mujeres en la subregión, pero los datos muestran que en cada uno de los cuatro países, las jóvenes han comenzado a posponer sus primeras uniones. En contraste, no ha surgido una tendencia uniforme similar en el retraso de la primera relación sexual. Actualmente, 45–60% de las mujeres de 20–24 años establecen una unión durante la adolescencia; y esta proporción es consistentemente más alta entre las mujeres con menor educación, mayor pobreza y de residencia rural. Una importante mayoría (aproximadamente tres cuartas partes) de las uniones en tres de los cuatro países son uniones consensuales en lugar de matrimonios legales. Guatemala es la excepción, donde menos de la mitad (47%) de las uniones son consensuales. Apenas ha cambiado el momento del primer embarazo Aunque las tasas de fecundidad adolescente han disminuido recientemente en los cuatro países, los niveles actuales todavía son iguales o mayores que el promedio para África; y, con mucho, exceden las tasas de América Latina en su conjunto. Las disminuciones ocurridas reflejan que en lugar de posponer un primer embarazo hasta los 20 años o más, las mujeres están teniendo menos segundos embarazos durante la adolescencia. Las posibles razones por las cuales el momento de los primeros nacimientos no ha cambiado apreciablemente, incluyen la falta de oportunidades económicas para las mujeres quealcancen mayor escolaridad y las normas tradicionales que continúan respaldando la maternidad temprana. De dos quintos a la mitad de las mujeres tienen su primer hijo en la adolescencia; estas proporciones son mucho más altas entre las mujeres del área rural, las más pobres y las de menor escolaridad. Importantes proporciones de nacimientos de adolescentes son no planeados (desde un tercio en Guatemala a casi la mitad en Honduras); y esas proporciones representan aumentos de apenas hace unos pocos años en los cuatro países, habiendo ocurrido el mayor aumento en Nicaragua. La mayoría de las mujeres solteras sexualmente activas desean evitar el embarazo. Adicionalmente, muchas mujeres jóvenes que viven en unión desean posponer el embarazo, especialmente una vez que ya se han convertido en madres (i.e., 83–92% de las mujeres unidas que ya han tenido un hijo vs. 32–68% de las que no lo han tenido). La necesidad insatisfecha de anticonceptivos modernos es muy alta Las altas proporciones de nacimientos que son no planeados demuestran que el uso que hacen las mujeres jóvenes de anticonceptivos efectivos, no corresponde con su deseo de posponer su primer embarazo o de espaciar embarazos posteriores. La proporción de mujeres sexualmente activas que actualmente usa un método moderno es más alta en Nicaragua (55%) y más baja en Guatemala (25%). Las inyecciones y la píldora son los métodos modernos que predominan en estos países. El uso de cada uno de ellos es aproximadamente igual en Nicaragua y Honduras, pero el uso de inyecciones es tres a cinco veces más alto que el de la píldora en El Salvador y Guatemala. Sin embargo, de un tercio a la mitad de las mujeres jóvenes sexualmente activas tienen una necesidad insatisfecha de anticoncepción moderna, nivel que es apreciablemente mayor entre las mujeres solteras que entre las unidas; y usualmente mayor entre las adolescentes, comparadas con las mujeres de 20–24 años. La juventud necesita más información para protegerse de las infecciones Honduras tiene la más alta prevalencia de la infección por VIH en personas de 15–24 años en esos países (1.8%) y Nicaragua, la más baja (0.2%). Sin embargo, la percepción de estar en riesgo fue exactamente la opuesta, por lo menos en los hombres (i.e., más baja en Honduras en 16%, y más alta en Nicaragua en 56%). Aproximadamente una cuarta parte de las mujeres en cada país creía estar en riesgo. En los cuatro países, fueron bajas las proporciones de jóvenes que espontáneamente mencionaron la abstinencia como medio para evitar la infección (4–22%); y algo más altas fueron las proporciones que citaron el limitar el número de parejas sexuales (17–54%). Alrededor de 49–68% de todos los hombres citaron usar condón, pero menos de un tercio de las mujeres en El Salvador y Guatemala dieron esta respuesta. Fueron relativamente bajas las proporciones que usaron condón la última vez que tuvieron relaciones sexuales— solamente 11–26% de las mujeres jóvenes sexualmente activas y 43–66% de los hombres similares. Considerando el alto riesgo de infección vinculado con las múltiples parejas sexuales, el hallazgo de que solamente 40–55% de los hombres con dos o más parejas sexuales en el año anterior usaron condón, indica que estos jóvenes están inadecuadamente protegidos. La evidencia sugiere varios pasos para salvaguardar el futuro Hacer más accesibles los servicios de salud reproductiva, especialmente para la juventud que más los necesita. Fortalecer los servicios en general, a través de esfuerzos amplios para aumentar recursos, expandir infraestructura y promover una mayor aceptación entre la gente adulta de las necesidades de información y servicios que tiene la gente joven. Los servicios amigables y ofrecidos a un precio accesible pueden llegar mejor a la gente joven que no busca los servicios, ya sea porque no pueden pagarlos o porque temen ser juzgados. Integrar los servicios de infecciones de transmisión sexual y planificación familiar para optimizar el uso de recursos limitados. Proveer consejería en planificación familiar y aumentar el acceso a una amplia variedad de métodos, especialmente condones, para ayudar a que la gente joven tenga éxito en prevenir el embarazo no planeado y la infección. Implementar la educación sexual integral y promover la equidad de género. Tanto las mujeres como los hombres jóvenes necesitan informarse y desarrollar las habilidades para poder retrasar el debut sexual, resistir la presión por tener relaciones sexuales y practicar el sexo seguro. Apoyar la capacitación de profesores, dirigir acciones tempranas a las y los adolescentes, y ayudar a la gente joven a permanecer en la escuela el mayor tiempo posible. Desarrollar estrategias alternativas para proporcionar educación sexual a la gente joven que ya no asiste a la escuela. Dar prioridad a las necesidades de la juventud y armonizar las disposiciones contradictorias entre las políticas. Proporcionar recursos y ejercer apoyo político para asegurar la aplicación de leyes, normas y políticas nuevas y existentes, que permitan que la gente joven proteja su salud. Coordinar la administración de programas y servicios para evitar la duplicación ineficiente de esfuerzos entre los ministerios y departamentos responsables.Universidad de Costa Rica, Instituto de Investigaciones en Salud. Guttmacher Institute.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Instituto de Investigaciones en Salud (INISA