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Lien entre une taxonomie des évènements potentiellement traumatiques et le trouble d'anxiété généralisée
Des études antérieures sur des évènements tels le « World Trade Center », des accidents automobiles ou bien des désastres naturels, ont reconnu le lien entre l'expérience d'évènement potentiellement traumatique (EPT) et le développement et maintien des symptômes du Trouble d'Anxiété Généralisée (TAG). Peu d'études ont tenté de mieux définir et discriminer ce lien en utilisant une taxonomie des EPT et la présence ou l'absence du TAG (inquiétudes, symptômes somatiques) ainsi que les vulnérabilités cognitives associées au TAG (intolérance à l'incertitude, évitement cognitif et attitude négative face aux problèmes). Cette étude a utilisé une taxonomie basée sur trois critères: EPT de type interpersonnel, EPT de type accident et EPT de type catastrophe naturelle pour déterminer la nature du lien entre différents types d'EPT et le TAG, postulant l'existence de liens significatifs entre eux. Un échantillon de 419 participants a été recruté parmi une population adulte dans trois établissements scolaires. Les participants ont répondu à des questionnaires. Des analyses de variance (ANOVA) ainsi que des tests de khi carré, ont été faits pour apporter des réponses aux questions de recherche de la thèse. Les résultats confirment une relation significative entre une taxonomie des traumatismes, les manifestations du TAG et les vulnérabilités cognitives. L'exposition à un cumul d'accidents est impliquée dans l'étiologie du TAG. Les résultats suggèrent que l'exposition à la violence interpersonnelle induit davantage de symptômes somatiques et que ce type d'exposition favorise la tendance à s'inquiéter exagérément. La violence psychologique, par un effet de cumul, augmente également la tendance à s'inquiéter. L'intolérance à l'incertitude a des liens avec l'exposition à des traumatismes interpersonnels et des liens avec l'effet cumulatif d'accidents. L'attitude négative face aux problèmes est en lien avec les traumatismes de violence physique ou sexuelle. L'évitement cognitif est en lien avec les traumatismes interpersonnels, avec la sous-catégorie de violence sexuelle et avec les catastrophes. Il semble que la violence sexuelle ait un grand impact sur les vulnérabilités cognitives dans le TAG et sur la tendance à s'inquiéter
La réception par les hommes de la campagne "My Strength" visant à les mobiliser contre les agressions sexuelles, étudiée au prisme du genre
Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2016-2017Ce mémoire porte sur la réception par des hommes de publicités sociales développées dans le cadre de la campagne My Strength is Not for Hurting par l'organisme américain Men Can Stop Rape. Le but était de comprendre le sens qu'ils donnent à des messages publicitaires conçus pour les interpeller par une caractéristique traditionnellement associée au masculin afin qu'ils se mobilisent dans la prévention des agressions sexuelles. Le concept de genre, élaboré en référence au système normatif qui crée les sexes et les hiérarchise, les notions de masculinité hégémonique et de masculinités plurielles ont servi de cadre théorique à cette étude féministe, tout comme la réception médiatique. Les propos de sept hommes engagés politiquement ou socialement ont été analysés avec l'approche de la psychologie discursive en analyse de discours. L'analyse qualitative réalisée montre que les participants articulent une réception négociée du message publicitaire. Ils en captent le sens sans s'y identifier, critiquent le discours hégémonique sur la masculinité perçu dans le message publicitaire, et s'engagent dans un processus d'altérisation pour résoudre leur malaise à l'égard du viol en construisant une subjectivité masculine spécifique et opposée à celle d'hommes qu'ils considèrent à risque de commettre ce crime. Les rapports de pouvoir femmes-hommes sont évacués de la discussion, bien que les participants tiennent, hors de la discussion sur My Strength, un propos avisé sur la mobilisation des hommes pour prévenir les agressions sexuelles. Cette analyse qualitative met au jour le caractère pluriel et hiérarchique de la masculinité et l'obligation d'en tenir compte dans un processus de persuasion visant à mobiliser les hommes pour prévenir les agressions sexuelles. Elle souligne également la nécessité d'éviter la reconduction de la masculinité hégémonique dans les messages pour que soient mis au jour les rapports de pouvoir qui forgent l'agression sexuelle, enjeu dévoilé par le mouvement féministe
Detection limits of several commercial reverse transcriptase enzymes: impact on the low- and high-abundance transcript levels assessed by quantitative RT-PCR
<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>In functional genomics, transcript measurement is of fundamental importance. Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) assays are the most popular technology and depend on the initial molecular step, the reverse transcription (RT). This study provides a complex overview of the influence of elements such as RT systems, amount of background RNA, and transcript abundance on the efficiency of qRT-PCR. Using qRT-PCR, we compared the efficiency of some commonly used RT systems and measured the production of PCR-amplifiable products and the influence of PCR inhibitor contents.</p> <p>Results</p> <p>The qRT-PCR assays were conducted using the TaqMan system, although we also tested the SYBR Green I chemistry, which is not compatible with all the RT systems. When dealing with low-abundance transcripts, the SuperScript II system generated more detectable molecules than the four other systems tested: Sensiscript, Omniscript, SuperScript III and PowerScript (<it>P </it>< 0.05). However, the Sensiscript and PowerScript systems were more efficient for detecting high-abundance transcripts in the presence of 1 to 2 μg background RNA (<it>P </it>< 0.05). The most striking aspect was the influence of the dilution of the RT reaction on the subsequent PCR. Indeed, some inhibition was released when diluted RT reactions were used for the quantitative PCR measurements. Furthermore, the amount of background RNA in the RT reaction was also a major component influencing a downstream step in qRT-PCR, the PCR reaction. Whereas Sensiscript was less biased, the other systems contained an important source of PCR inhibitors, interfering as much as 70% with the qRT-PCR.</p> <p>Conclusion</p> <p>This study provides a complex overview of the influence of elements such as RT systems, qRTPCR chemistry, amount of background RNA, and transcript abundance on the efficiency of qRT-PCR. Whereas the most significant influencing factor is the presence of inhibitors in the RT systems, total background RNA is also a major influencing component that affects the PCR reaction. Whenever the aim of a study is to obtain a precise gene expression measurement or to profile the global transcriptome (e.g. microarray), the RT step is critical and should be examined with care.</p
Osteopontin: an early innate immune marker of Escherichia coli mastitis harbors genetic polymorphisms with possible links with resistance to mastitis
<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Mastitis is the most important disease in dairy cows and it causes significant lost of profit to producers. Identification of the genes, and their variants, involved in innate immune responses is essential for the understanding of this inflammatory disease and to identify potential genetic markers for resistance to mastitis. The progeny of dairy cows would benefit from receiving favourable alleles that support greater resistance to infection, thus reducing antibiotic use. This study aims to identify a key gene in the innate immune response to mastitis, led us to evaluate its genetic association with somatic cell score (SCS), which is an indicator of clinical mastitis, and to evaluate its impact on other traits related to milk production.</p> <p>Results</p> <p>The osteopontin transcript (<it>SPP1</it>) was identified in the somatic cells from cows experimentally infected with <it>Escherichia coli</it>. By selecting bulls with extreme estimated breeding values (EBVs) for SCS, which is an indicator of mammary gland health, four DNA polymorphisms in the <it>SPP1 </it>genomic sequence were found. Statistical analysis revealed that the SNP <it>SPP1c.-1301G>A </it>has an impact on EBV for SCS (<it>P </it>< 0.001) Using an allele substitution model, <it>SPP1c.-1251C>T</it>, <it>SPP1c.-430G>A</it>, and <it>SPP1c.*40A>C </it>have an impact on SCS whereas <it>SPP1c.-1301G>A </it>has an effect on the EBVs for milk yield (second and third lactations), fat and protein percentages (all three lactations). Analysis revealed statistically significant differences between haplotype groups at a comparison-wise level with sire EBVS for SCS for the first (<it>P </it>= 0.012), second (<it>P </it>< 0.001), and third (<it>P </it>< 0.001) lactations.</p> <p>Conclusion</p> <p>This study reports the link between DNA polymorphisms of <it>SPP1</it>, the number of milk immune cells and, potentially, the susceptibility to mastitis. These SNPs were identified by <it>in silico </it>search to be located in transcription factor recognition sites which factors are presumably involved in the Th1 immune response and in the Th2 regulation pathway. Indeed, one SNP abolished the SP1 recognition site, whereas another SNP affected the transcription binding factor IKAROS. All together, these findings support the genetic potential of these variants in terms of selection for the improvement of mastitis resistance in dairy cows.</p
Transcriptome adaptation of the bovine mammary gland to diets rich in unsaturated fatty acids shows greater impact of linseed oil over safflower oil on gene expression and metabolic pathways
Differentially expressed genes implicated in apoptosis of cows in LSO treatment as compared to the same cows on the control diet. Expression direction of several genes predicted to decrease apoptosis. (DOCX 35Â kb
Administration of probiotics influences F4 (K88)-positive enterotoxigenic Escherichia coli attachment and intestinal cytokine expression in weaned pigs
This study evaluated the effect of the probiotics Pediococcus acidilactici and Saccharomyces cerevisiae boulardii on the intestinal colonization of O149 enterotoxigenic Escherichia coli harbouring the F4 (K88) fimbriae (ETEC F4) and on the expression of ileal cytokines in weaned pigs. At birth, different litters of pigs were randomly assigned to one of the following treatments: 1) control without antibiotics or probiotics (CTRL); 2) reference group in which chlortetracycline and tiamulin were added to weanling feed (ATB); 3) P. acidilactici; 4) S. cerevisiae boulardii; or 5) P. acidilactici + S. cerevisiae boulardii. Probiotics were administered daily (1 × 109 CFU per pig) during the lactation period and after weaning (day 21). At 28 days of age, all pigs were orally challenged with an ETEC F4 strain, and a necropsy was performed 24 h later. Intestinal segments were collected to evaluate bacterial colonization in the small intestine and ileal cytokine expressions. Attachment of ETEC F4 to the intestinal mucosa was significantly reduced in pigs treated with P. acidilactici or S. cerevisiae boulardii in comparison with the ATB group (P = 0.01 and P = 0.03, respectively). In addition, proinflammatory cytokines, such as IL-6, were upregulated in ETEC F4 challenged pigs treated with P. acidilactici alone or in combination with S. cerevisiae boulardii compared with the CTRL group. In conclusion, the administration of P. acidilactici or S. cerevisiae boulardii was effective in reducing ETEC F4 attachment to the ileal mucosa, whereas the presence of P. acidilactici was required to modulate the expression of intestinal inflammatory cytokines in pigs challenged with ETEC F4
Association of genetic polymorphisms related to Johne’s disease with estimated breeding values of Holstein sires for milk ELISA test scores
peer-reviewedBackground
Johne’s disease (JD) is a chronic intestinal inflammatory disease caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) infection in ruminants. Since there are currently no effective vaccine or treatment options available to control JD, genetic selection may be an alternative strategy to enhance JD resistance. Numerous Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) have been reported to be associated with MAP infection status based on published genome-wide association and candidate gene studies. The main objective of this study was to validate these SNPs that were previously identified to be associated with JD by testing their effect on Holstein bulls’ estimated breeding values (EBVs) for milk ELISA test scores, an indirect indicator of MAP infection status in cattle.
Results
Three SNPs, rs41810662, rs41617133 and rs110225854, located on Bos taurus autosomes (BTA) 16, 23 and 26, respectively, were confirmed as significantly associated with Holstein bulls’ EBVs for milk ELISA test score (FDR < 0.01) based on General Quasi Likelihood Scoring analysis (GQLS) analysis. Single-SNP regression analysis identified four SNPs that were associated with sire EBVs (FDR < 0.05). This includes two SNPs that were common with GQLS (rs41810662 and rs41617133), with the other two SNPs being rs110494981 and rs136182707, located on BTA9 and BTA16, respectively.
Conclusions
The findings of this study validate the association of SNPs with JD MAP infection status and highlight the need to further investigate the genomic regions harboring these SNPs
Functional analysis of bovine interleukin-10 receptor alpha in response to Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis lysate using CRISPR/Cas9
peer-reviewedBackground
The interleukin-10 receptor alpha (IL10RA) gene codes for the alpha chain of the IL-10 receptor which binds the cytokine IL-10. IL-10 is an anti-inflammatory cytokine with immunoregulatory function during the pathogenesis of many inflammatory disorders in livestock, including Johne’s disease (JD). JD is a chronic enteritis in cattle caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) and is responsible for significant economic losses to the dairy industry. Several candidate genes including IL10RA have been found to be associated with JD. The aim of this study was to better understand the functional significance of IL10RA in the context of immune stimulation with MAP cell wall lysate.
Results
An IL10RA knock out (KO) bovine mammary epithelial cell (MAC-T) line was generated using the CRISPR/cas9 (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated protein 9) gene editing system. These IL10RA KO cells were stimulated with the immune stimulant MAP lysate +/− IL-10, or with LPS as a positive control. In comparison to unedited cells, relative quantification of immune-related genes after stimulation revealed that knocking out IL10RA resulted in upregulation of pro-inflammatory cytokine gene expression (TNFA, IL1A, IL1B and IL6) and downregulation of suppressor of cytokine signaling 3 (SOCS3), a negative regulator of pro-inflammatory cytokine signaling. At the protein level knocking out IL10RA also resulted in upregulation of inflammatory cytokines - TNF-α and IL-6 and chemokines - IL-8, CCL2 and CCL4, relative to unedited cells.
Conclusions
The findings of this study illustrate the broad and significant effects of knocking out the IL10RA gene in enhancing pro-inflammatory cytokine expression and further support the immunoregulatory role of IL10RA in eliciting an anti-inflammatory response as well as its potential functional involvement during the immune response associated with JD
Deep sequencing shows microRNA involvement in bovine mammary gland adaptation to diets supplemented with linseed oil or safflower oil
Réparation de l'ADN dans les séquences codantes et non-codantes de cellules humaines normales et de type Xeroderma pigmentosum du groupe C
L'ADN est constamment exposé à des dommages endogènes comme la dépurination spontanée ou exogènes causés par différents agents incluant les agents chimiothérapeutiques, les radiations et les agents carcinogènes. Ces dommages non-réparés ou réparés non adéquatement peuvent mener à une transformation maligne, en partie via des mutations dans certains oncogènes et dans certains gènes suppresseurs de tumeur. La plupart de ces dommages sont enlevés via les processus de réparation de l'ADN. Ce mémoire présente une élaboration et une optimisation de techniques permettant l'étude quantitative de la réparation dans les séquences codantes actives et dans les séquences inactives chez les cellules humaines normales et de type Xeroderma pigmentosum du groupe C. Pour l'étude de la réparation dans des séquences inactives, nous avons utilisé les séquences non-codantes alphoïdes hautement répétées, soit des millions d'unités répétées en tandem qu'on appelle LINES pour "long interspersed repeated sequences". La séquence étudiée de la famille a-satellite appartient à la famille XbaI et se compose d'une unité de 341 paires de bases composée de deux monomères divergents (171 et 170 pb), qui est répétée en tandem sur des centaines de kilopaires de bases et que l'on retrouve dans la région centromérique des chromosomes autosomales (14, 20, 22, 15, 2, 4 et 18). Également, nous avons utilisé les séquences appartenant à la famille ?-actine. Cette famille prend avantage par le fait qu'elle comporte un gène actif situé sur le chromosome 7 qui est transcrit et qui peut être stimulé par du sérum ou des facteurs de croissance comme les facteurs de croissance épidermiques ou le cycloheximide. En plus, cette famille de la ?-actine comporte 19 séquences pseudogènes, qui sont distribués sur plusieurs chromosomes et qui sont détectables par buvardage de Southern à l'aide d'une sonde appropriée. La quantification de la réparation s'inspire d'une méthode initialement décrite par Bohr et al. 1985, (Cell 40:359-369) dans le cas de dimères cyclobutyliques induits par les rayons ultraviolets pour l'étude de la réparation dans le gène de la dihydrofolate réductase (DHRF) amplifié environ 100 fois. Cette technique fait appel à la fraction de fragments non-touchés par l'agent dommageable (classe "0") en utilisant la distribution Poisson. Nous avons quantifié la réparation de lésions induites par le N-méthyl-N-nitrosourée. De plus, en présence d'inhibiteurs de la synthèse réparatrice (aphidicoline, inhibiteur de la polymérase ?, ? et ?; hydroxyurée, inhibiteur de la ribonucléotide réductase), nous avons observé une accumulation de sites incisés dans les séquences inertes a-satellites des cellules humaines normales et de type XP-C exposées aux rayons uv, suggérant un potentiel de réparation de lésions induites par les rayons uv dans la chromatine inactive chez les deux types cellulaires
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