Persistence in milk, fat and protein production of primiparous Holstein cows by random regression models.

Total numbers of 56,508, 35,091 and 8,326 records of milk, fat, and protein test-day yields, respectively, were used to estimate genetic parameters for six persistency measures on milk, fat and protein productions of Holstein cows reared in Minas Gerais state. Covariance components for additive genetic effects and permanent environmental effects were estimated by REML in random regression models using Legendre polynomials from the third to the sixth order. Overall, models with the highest orders of Legendre polynomials showed the best quality of adjustments of these productive records. Heritability estimates obtained by the models for persistence in milk, fat, and protein yields ranged from 0.04 to 0.32, from 0.00 to 0.23, and from 0.00 to 0.27, respectively. Values of genetic correlation estimates between persistence and total 305-day milk, fat, and protein yields ranged from -0.38 to 0.54, from -0.39 to 0.97, and from -0.78 to 0.67, respectively. Persistence measurement proposed by Jakobsen (PS2) is preferential for using in further genetic evaluations for persistence in milk, fat and protein yields of Holstein cows in Minas Gerais state

Random regression models in the genetic parameters estimation for production and persistency in the productive traits from the cows of the holstein breed

Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para as produções no dia do controle e para seis medidas para a persistência nas produções de leite, de gordura e de proteína, de vacas da raça Holandesa, do Estado de Minas Gerais, foram usados 56.508, 35.091 e 8.326 registros, de 7.015, 4.476 e 1.114 vacas, filhas de 6.089, 3.875 e 984 mães e 359, 246 e 90 touros, respectivamente para as produções no dia do controle, de leite, de gordura e de proteína. Foram ajustados modelos de regressão aleatória usando-se polinômios de Legendre com a ordem de 3 a 6. As herdabilidades variaram de 0,14 a 0,31, 0,03 a 0,21 e 0,09 a 0,33 para as produções de leite, de gordura e de proteína, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,02 a 1,00, 0,34 a 1,00 e 0,42 a 1,00 e as correlações de ambiente permanente variaram de 0,02 a 0,99, -0,34 a 0,99 e -0,10 a 0,99, respectivamente para as produções de leite, de gordura e de proteína. As estimativas de herdabilidade para as persistências nas produções de leite, de gordura e de proteína variaram, respectivamente, de 0,04 a 0,32, 0,00 a 0,23 e 0,00 a 0,27. Os valores de correlações genéticas entre as medidas de persistência e as produções totais de leite, de gordura e de proteína variaram de -0,38 a 0,54, -0,39 a 0,97 e -0,78 a 0,67, respectivamente. Os modelos ajustados por polinômios de Legendre de maior ordem foram os mais adequados para as três características produtivas e a medida PS2 foi a mais apropriada para avaliação para a persistência das produções de leite, de gordura e de proteína, para animais da raça Holandesa em Minas Gerais.With the objective to estimate genetic parameters for the test-day yields and for six measures for the persistencies for milk, fat and protein yields from the cows of the Holstein breeds, in the State of Minas Gerais, were used 56,508, 35,091 and 8,326 records, from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, sired by 6,089, 3,875 and 984 dams and 359, 246 and 90 bulls, respectively for milk, fat and protein test-day yields. Random regression models were adjusted by using Legendre polynomial with order from 3 to 6. The heritabilities ranged from 0.14 to 0.31, 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for the milk, fat and protein yields, respectively. The genetic correlations ranged from 0.02 to 1.00, 0.34 to 1.00 and 0.42 to 1.00 and the permanent environmental correlations ranged from 0.02 to 0.99, -0.34 to 0.99 and -0.10 to 0.99, respectively for milk, fat and protein yields. The heritability estimates for the persistencies in the milk, fat and protein yields ranged, respectively, from 0.04 to 0.32, 0.00 to 0.23 and 0.00 to 0.27. The values of the genetic correlations among persistency measures and total milk, fat and protein yields ranged from -0.38 to 0.54, -0.39 to 0.97 and -0.78 to 0.67, respectively. The models adjusted for Legendre polynomials of higher order were the most adequated for the three productive traits and the PS2 measure was the most appropriated for evaluation for the persistencies for milk, fat and protein yields, for the animals of Holstein breed in the State of Minas Gerais

Random regression models in the genetic parameters estimation for production and persistency in the productive traits from the cows of the holstein breed

Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para as produções no dia do controle e para seis medidas para a persistência nas produções de leite, de gordura e de proteína, de vacas da raça Holandesa, do Estado de Minas Gerais, foram usados 56.508, 35.091 e 8.326 registros, de 7.015, 4.476 e 1.114 vacas, filhas de 6.089, 3.875 e 984 mães e 359, 246 e 90 touros, respectivamente para as produções no dia do controle, de leite, de gordura e de proteína. Foram ajustados modelos de regressão aleatória usando-se polinômios de Legendre com a ordem de 3 a 6. As herdabilidades variaram de 0,14 a 0,31, 0,03 a 0,21 e 0,09 a 0,33 para as produções de leite, de gordura e de proteína, respectivamente. As correlações genéticas variaram de 0,02 a 1,00, 0,34 a 1,00 e 0,42 a 1,00 e as correlações de ambiente permanente variaram de 0,02 a 0,99, -0,34 a 0,99 e -0,10 a 0,99, respectivamente para as produções de leite, de gordura e de proteína. As estimativas de herdabilidade para as persistências nas produções de leite, de gordura e de proteína variaram, respectivamente, de 0,04 a 0,32, 0,00 a 0,23 e 0,00 a 0,27. Os valores de correlações genéticas entre as medidas de persistência e as produções totais de leite, de gordura e de proteína variaram de -0,38 a 0,54, -0,39 a 0,97 e -0,78 a 0,67, respectivamente. Os modelos ajustados por polinômios de Legendre de maior ordem foram os mais adequados para as três características produtivas e a medida PS2 foi a mais apropriada para avaliação para a persistência das produções de leite, de gordura e de proteína, para animais da raça Holandesa em Minas Gerais.With the objective to estimate genetic parameters for the test-day yields and for six measures for the persistencies for milk, fat and protein yields from the cows of the Holstein breeds, in the State of Minas Gerais, were used 56,508, 35,091 and 8,326 records, from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, sired by 6,089, 3,875 and 984 dams and 359, 246 and 90 bulls, respectively for milk, fat and protein test-day yields. Random regression models were adjusted by using Legendre polynomial with order from 3 to 6. The heritabilities ranged from 0.14 to 0.31, 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for the milk, fat and protein yields, respectively. The genetic correlations ranged from 0.02 to 1.00, 0.34 to 1.00 and 0.42 to 1.00 and the permanent environmental correlations ranged from 0.02 to 0.99, -0.34 to 0.99 and -0.10 to 0.99, respectively for milk, fat and protein yields. The heritability estimates for the persistencies in the milk, fat and protein yields ranged, respectively, from 0.04 to 0.32, 0.00 to 0.23 and 0.00 to 0.27. The values of the genetic correlations among persistency measures and total milk, fat and protein yields ranged from -0.38 to 0.54, -0.39 to 0.97 and -0.78 to 0.67, respectively. The models adjusted for Legendre polynomials of higher order were the most adequated for the three productive traits and the PS2 measure was the most appropriated for evaluation for the persistencies for milk, fat and protein yields, for the animals of Holstein breed in the State of Minas Gerais

Parâmetros genéticos para características produtivas de vacas primíparas da raça Holandesa estimados por modelos de regressão aleatória

The objective of this study was to estimate genetic parameters for milk, fat and protein yields of Holstein cows using 56,508; 35,091 and 8,326 test-day milk records from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, calves of 359, 246 and 90 bulls, respectively. The additive genetic and permanent environmental effects were estimated using REML. Random regression models with Legendre polynomials from order 3 to 6 were used. Residual variances were considered homogeneous over the lactation period. The estimates of variance components showed similar trends, with an increase of the polynomial order for each trait. The heritability estimates ranged from 0.14 to 0.31; 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for milk, fat and protein yield, respectively. Genetic correlations among milk, fat and protein yields ranged from 0.02 to 1.00; 0.34 to 1.00 and 0.42 to 1.00, respectively. Models with higher order Legendre polynomials are the best suited to adjust test-day data for the three production traits studied.Esta pesquisa foi realizada com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para as produções de leite, gordura e proteína do leite de vacas da raça Holandesa usando, respectivamente, 56.508, 35.091 e 8.326 registros leiteiros no dia do controle de 7.015, 4.476 e 1.114 vacas, filhas de 359, 246 e 90 touros. Os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram estimados por REML. Utilizaram-se modelos de regressão aleatória com polinômios de Legendre de ordem 3 a 6. As variâncias residuais foram consideradas homogêneas ao longo da lactação. As estimativas dos componentes de variância apresentaram tendências semelhantes com o aumento da ordem do polinômio em cada característica. As estimativas de herdabilidade variaram, respectivamente, de 0,14 a 0,31; 0,03 a 0,21; e 0,09 a 0,33 para as produções de leite, de gordura e de proteína. As correlações genéticas entre produções de leite, gordura e proteína do leite variaram de 0,02 a 1,00; 0,34 a 1,00 e 0,42 a 1,00, respectivamente. Os modelos com polinômio de Legendre de maior ordem são os mais adequados para ajuste da produção no dia do controle das três características produtivas

Persistência na produção de leite, de gordura e de proteína de vacas primíparas da raça Holandesa via modelos de regressão aleatória

Total numbers of 56,508, 35,091 and 8,326 records of milk, fat, and protein test-day yields, respectively, were used to estimate genetic parameters for six persistency measures on milk, fat and protein productions of Holstein cows reared in Minas Gerais state. Covariance components for additive genetic effects and permanent environmental effects were estimated by REML in random regression models using Legendre polynomials from the third to the sixth order. Overall, models with the highest orders of Legendre polynomials showed the best quality of adjustments of these productive records. Heritability estimates obtained by the models for persistence in milk, fat, and protein yields ranged from 0.04 to 0.32, from 0.00 to 0.23, and from 0.00 to 0.27, respectively. Values of genetic correlation estimates between persistence and total 305-day milk, fat, and protein yields ranged from -0.38 to 0.54, from -0.39 to 0.97, and from -0.78 to 0.67, respectively. Persistence measurement proposed by Jakobsen (PS₂) is preferential for using in further genetic evaluations for persistence in milk, fat and protein yields of Holstein cows in Minas Gerais state.Os totais de 56.508, 35.091 e 8.326 registros, respectivamente, de produção de leite, de gordura e de proteína no dia do controle foram usados para estimar parâmetros genéticos para seis medidas de persistência na produção de leite, de gordura e de proteína de vacas da raça Holandesa criadas em rebanhos do Estado de Minas Gerais. Os componentes de covariância para os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram estimados via REML por modelos de regressão aleatória com polinômios de Legendre de ordens 3 a 6. Em geral, os modelos com as mais altas ordens dos polinômios de Legendre apresentaram a melhor qualidade no ajuste desses registros produtivos. As estimativas de herdabilidade obtidas pelos modelos para as persistências nas produções de leite, de gordura e de proteína variaram, respectivamente, de 0,04 a 0,32; 0,00 a 0,23; e 0,00 a 0,27. Os valores das estimativas de correlação genética entre persistência e produções de leite, de gordura e de proteína, em 305 dias, variaram de -0,38 a 0,54; -0,39 a 0,97; e -0,78 a 0,67, respectivamente. A medida de persistência proposta por Jakobsen (PS₂) é preferencial para uso em futuras avaliações genéticas para persistências nas produções de leite, de gordura e de proteína de animais da raça Holandesa no Estado de Minas Gerais

Modelos hierárquicos bayesianos para estimativas de interação genótipo × ambiente em ganho pós-desmama de bovinos Hereford via normas de reação

It was evaluated statistical models with different assumptions to define the one that best describes the presence of genotype × environment interaction on adjusted post-weaning weight gain (PWG345) of Hereford cattle, through the study of reactions norms to the environment, obtained by random regression using a Bayesian approach. Four reaction norms hierarchical models (RNHM) were used through the INTERGEN program. The RNHMK uses the solutions of contemporary groups previously estimated by the standard animal model (AM) and considers them as environmental level for predicting the reaction norms and the RNHMS, which jointly estimate these two sets of unknowns. For both models, two versions were considered, one with a homogeneous (hm) and another with a heterogeneous (ht) residual variance. Based on the deviance information criterion and Bayes factor, RNHMshm showed the best fit to the data, and by the deviance based on conditional predictive ordinate, the best fit was the RNHMKht, whereas, by all the three criteria used, the worst fit was obtained by using the standard animal model. Heritabilities estimated on RNHM were increasing in the environmental gradients for PWG345, at -60 kg, 0 and +60 kg. The genetic correlation estimated between the level and slope of reaction norms was high, from 0.97 to 0.99, characterizing a scale effect on genotype × environment interaction. The reaction norms hierarchical models are efficient to describe the changes in variance components due to the environment and to describe the presence of genotype × environment interaction on PWG345 trait of Hereford cattle.Avaliaram-se modelos estatísticos com diferentes pressuposições para definir o que melhor descreva a presença de interação genótipo × ambiente no ganho de peso pós-desmama ajustado (GPD345) de bovinos Hereford, mediante o estudo de normas de reação ao ambiente, obtidas por regressão aleatória, usando uma abordagem bayesiana. Quatro modelos hierárquicos de normas de reação (MHNR) foram empregados por meio do programa INTERGEN. O MHNRK utiliza as soluções de grupos contemporâneos estimadas previamente pelo modelo animal padrão (MA) e as considera como nível ambiental para predizer as normas de reação e o MHNRS, que estima simultaneamente esses dois conjuntos de incógnitas. Para ambos os modelos, foram consideradas duas versões, uma com variância residual homogênea (hm) e outra heterogênea (ht). Pelo critério de informação da deviance e fator de Bayes, o MHRNShm apresentou melhor ajuste aos dados e, pela deviance baseada na ordenada preditiva condicional, o melhor ajuste foi do MHNRKht, enquanto, pelos três critérios, o pior ajuste foi obtido pelo modelo animal padrão. As herdabilidades estimadas nos MHNR foram crescentes nos gradientes ambientais em GPD345 de -60; 0 e +60 kg. As correlações genéticas estimadas entre o nível e inclinação das normas de reação foram de alta magnitude, entre 0,97 e 0,99, caracterizando efeito de escala em interação genótipo × ambiente. Os modelos hierárquicos de normas de reação são eficientes para descrever as alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de interação genótipo × ambiente na característica GPD345 em bovinos Herefor

Parâmetros genéticos para características produtivas de vacas primíparas da raça Holandesa estimados por modelos de regressão aleatória

The objective of this study was to estimate genetic parameters for milk, fat and protein yields of Holstein cows using 56,508; 35,091 and 8,326 test-day milk records from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, calves of 359, 246 and 90 bulls, respectively. The additive genetic and permanent environmental effects were estimated using REML. Random regression models with Legendre polynomials from order 3 to 6 were used. Residual variances were considered homogeneous over the lactation period. The estimates of variance components showed similar trends, with an increase of the polynomial order for each trait. The heritability estimates ranged from 0.14 to 0.31; 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for milk, fat and protein yield, respectively. Genetic correlations among milk, fat and protein yields ranged from 0.02 to 1.00; 0.34 to 1.00 and 0.42 to 1.00, respectively. Models with higher order Legendre polynomials are the best suited to adjust test-day data for the three production traits studied.Esta pesquisa foi realizada com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para as produções de leite, gordura e proteína do leite de vacas da raça Holandesa usando, respectivamente, 56.508, 35.091 e 8.326 registros leiteiros no dia do controle de 7.015, 4.476 e 1.114 vacas, filhas de 359, 246 e 90 touros. Os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram estimados por REML. Utilizaram-se modelos de regressão aleatória com polinômios de Legendre de ordem 3 a 6. As variâncias residuais foram consideradas homogêneas ao longo da lactação. As estimativas dos componentes de variância apresentaram tendências semelhantes com o aumento da ordem do polinômio em cada característica. As estimativas de herdabilidade variaram, respectivamente, de 0,14 a 0,31; 0,03 a 0,21; e 0,09 a 0,33 para as produções de leite, de gordura e de proteína. As correlações genéticas entre produções de leite, gordura e proteína do leite variaram de 0,02 a 1,00; 0,34 a 1,00 e 0,42 a 1,00, respectivamente. Os modelos com polinômio de Legendre de maior ordem são os mais adequados para ajuste da produção no dia do controle das três características produtivas

Modelos hierárquicos bayesianos para estimativas de interação genótipo × ambiente em ganho pós-desmama de bovinos Hereford via normas de reação

It was evaluated statistical models with different assumptions to define the one that best describes the presence of genotype × environment interaction on adjusted post-weaning weight gain (PWG345) of Hereford cattle, through the study of reactions norms to the environment, obtained by random regression using a Bayesian approach. Four reaction norms hierarchical models (RNHM) were used through the INTERGEN program. The RNHMK uses the solutions of contemporary groups previously estimated by the standard animal model (AM) and considers them as environmental level for predicting the reaction norms and the RNHMS, which jointly estimate these two sets of unknowns. For both models, two versions were considered, one with a homogeneous (hm) and another with a heterogeneous (ht) residual variance. Based on the deviance information criterion and Bayes factor, RNHMshm showed the best fit to the data, and by the deviance based on conditional predictive ordinate, the best fit was the RNHMKht, whereas, by all the three criteria used, the worst fit was obtained by using the standard animal model. Heritabilities estimated on RNHM were increasing in the environmental gradients for PWG345, at -60 kg, 0 and +60 kg. The genetic correlation estimated between the level and slope of reaction norms was high, from 0.97 to 0.99, characterizing a scale effect on genotype × environment interaction. The reaction norms hierarchical models are efficient to describe the changes in variance components due to the environment and to describe the presence of genotype × environment interaction on PWG345 trait of Hereford cattle.Avaliaram-se modelos estatísticos com diferentes pressuposições para definir o que melhor descreva a presença de interação genótipo × ambiente no ganho de peso pós-desmama ajustado (GPD345) de bovinos Hereford, mediante o estudo de normas de reação ao ambiente, obtidas por regressão aleatória, usando uma abordagem bayesiana. Quatro modelos hierárquicos de normas de reação (MHNR) foram empregados por meio do programa INTERGEN. O MHNRK utiliza as soluções de grupos contemporâneos estimadas previamente pelo modelo animal padrão (MA) e as considera como nível ambiental para predizer as normas de reação e o MHNRS, que estima simultaneamente esses dois conjuntos de incógnitas. Para ambos os modelos, foram consideradas duas versões, uma com variância residual homogênea (hm) e outra heterogênea (ht). Pelo critério de informação da deviance e fator de Bayes, o MHRNShm apresentou melhor ajuste aos dados e, pela deviance baseada na ordenada preditiva condicional, o melhor ajuste foi do MHNRKht, enquanto, pelos três critérios, o pior ajuste foi obtido pelo modelo animal padrão. As herdabilidades estimadas nos MHNR foram crescentes nos gradientes ambientais em GPD345 de -60; 0 e +60 kg. As correlações genéticas estimadas entre o nível e inclinação das normas de reação foram de alta magnitude, entre 0,97 e 0,99, caracterizando efeito de escala em interação genótipo × ambiente. Os modelos hierárquicos de normas de reação são eficientes para descrever as alterações nos componentes de variância decorrentes do ambiente e para descrever a presença de interação genótipo × ambiente na característica GPD345 em bovinos Herefor